Tipologia: Intervento
Autore: LUCA STRAGLIATI - studente
Replay #1
Data: 27/10/2009 12:58

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_ARATH

1) Riportare la descrizione della proteina

ossidoreduttasi localizzata nei perossisomi coinvolta nal metabolismo delle purine

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

nome scientifico: Arabidopsis thaliana

nome comune: arabetta comune (mouse-ear cress)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

309 AA

927 nucleotidi

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

posizione nella proteina: 307-309

sequenza target: SKL

Luca Stragliati

Alessio Sardella

Tipologia: Intervento
Autore: ALESSANDRA D'ARELLI - studente
Replay #1
Data: 27/10/2009 12:58

1) The proteine is an uricase(or  Urate oxidase) and catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin.

2)Arabidopsis thaliana- arabetta comune

3)  Sequence length :309 AA

     Nucleotides number: 927+codone di stop

4)The position in the protein is 307-309 and the aminoacids sequence is SKL

Tipologia: Intervento
Autore: SILVIA LAZZERINI - studente
Replay #1
Data: 27/10/2009 12:59

Descrizione della proteina:Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin.

Nome dell'organismo: Arabidopsis thaliana - arabetta comune

lunghezza aa:309

lunghezza nucleotidi:957

Segnale di targeting-posizione:307-309   -sequenza:SKL

Tipologia: Intervento
Autore: ILARIA CLARIZIO - studente
Replay #2
Data: 27/10/2009 12:59

Descrizione:Catalizza l'ossidazione dell'acido urico a 5-hydroxyisourate, che spontaneamente si decompone nella forma di Allantoina

organismo di appartenenza: nome scientifico:Arabidopsis thaliana detta comunemente arabetta comune

la lunghezza in aminoacidi:309

lunghezza in nucleotidi: 927 piu il codone di stop

il segnale di targeting sequenza amminoacidi: SKL

la posizione è 307-309

Ilaria Clarizio e Alessia Marmorino

Tipologia: Intervento
Autore: ANTONELLA FALCONIERI - studente
Replay #2
Data: 27/10/2009 12:59

1) E' una proteina presente nei perossisomi,coinvolta nel metabolismo delle purine funziona attraverso  ossidoriduttasi

2) nome scientifico: Aradopsis thaliana

    nome comune: arabetta comune

3) 309 aa quindi 927 nucleotidi + possibili 3 codoni di stop

4) 307-309  skl

annalisa bruno e falconieri antonella

Tipologia: Intervento
Autore: MARIA CHIARA GUIDONE - studente
Replay #1
Data: 27/10/2009 13:00

1) Function:Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin.

2) scientific name: Arabidopsis thaliana

    Common name: Mouse-ear cress

3) Sequence length: 309 AA

     per trovare la lunghezza in nucleotidi devo moltipilicare il numero degli AA per    3,  quindi 309x3=927nucleotidi

4) posizione nella proteina: 307-309

    sequenza in AA: SKL

Maria Chiara Guidone

Elisa Ironi

Tipologia: Intervento
Autore: CHIARA ALIANI - studente
Replay #2
Data: 27/10/2009 13:01

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_ARATH

1) Riportare la descrizione della proteina

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

1)Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin.

2)Arabidopsis thaliana- arabetta comune.

3) 309 amminoacidi. 927 nucleotidi più il codone di stop.

4) 307-309. SKL

chiara aliani   monica giada

Tipologia: Intervento
Autore: GABRIELLA COTTONE - studente
Replay #2
Data: 27/10/2009 13:01

descrizione della proteina: Uricasi

organismo d'origine: arabidopsis thaliana

lunghezza in amminoacidi: 309

lunghezza in nucleotidi della regione codificante:927

segnale di targeting: 307-309 SKL

Tipologia: Intervento
Autore: ROSSANA ITALIANO - studente
Replay #1
Data: 27/10/2009 13:02

1) La proteina è implicata nel metabolismo delle purine. E' presente nei perossisomi ed è un'ossidoriduttasi (quindi è un'enzima).

2) Arabidopsis Thaliana, detta Arabetta comune.

3) 309 amminoacidi, 927 nucleotidi (oppure 930 se consideriamo il codone di stop)

4) Il segnale di targeting è l'ultimo amminoacido. La sequenza amminoacidica è SKL.

Tipologia: Intervento
Autore: LUDOVICA LEZZI - studente
Replay #1
Data: 27/10/2009 13:02

1 Riportare la descrizione della proteina

La proteina è un ossidoriduttasi, quindi un enzima che catalizza le reazioni di ossido riduzione (ossidazione acido urico) coinvolte nel metabolismo delle purine. E' presente nei perossisomi.

2 Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune

Nome scientifico: Arabidopsis thaliana

Nome comune: Arabetta comune

3 Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

309 aa

Nucleotidi: 309*3= 927

4Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

Il segnale di targeting è sull'aminoacido 310 SLK (sequenza amminoacidica)

Lezzi Ludovica

Botrugno Ilaria

Tipologia: Intervento
Autore: MARIA CHIARA VENUTI - studente
Replay #1
Data: 27/10/2009 13:02

1) Descrizione proteina: Uricase. Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin.

2) Organismo di appartenenza: nome scentifico: Arabidopsis thaliana, nome comune: Arabetta comune.

3) Lunghezza in aminoacidi: 309aa. lunghezza in nucleotidi della regione codificante: (309*3)+3(codone di stop)=927 +3= 930.

4) Targeting signal:posizione nella proteina: 307-309. sequenza in aa: SKL

Alice Zuccoli.

Tipologia: Intervento
Autore: LUCA BARBATO - studente
Replay #1
Data: 27/10/2009 13:02

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_ARATH

1) Riportare la descrizione della proteina

Il nome della proteina è URICASE. La funzione di questa proteina catalizza l'ossidazione dell'acido urico a 5-idrossisourato, che spontaneamente si decompone in una forma 

2) Riportare l'organismo di appartenenza nome scientifico e nome comune)+

Arabidopsis thaliana   ARABETTA COMUNE

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

Lunghezza in aminoacidi 309 e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante è di 930 nucleotidi

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

LUCA BARBATO

MONIA FRONZUTI

Tipologia: Intervento
Autore: MARTINA INORETTI - studente
Replay #2
Data: 27/10/2009 13:05

1) Riportare la descrizione della proteina

Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

Arabidopsis thaliana, detta comunemente arabetta comune

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

Lunghezza aa: 309

Lunghezza nucleotidi: 309 x 3 = 927

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

La posizione nella proteina é 307- 309

La sequenza di aa: slk

Chiara Coruzzi

Tipologia: Intervento
Autore: ANDREA ZAGARELLA - studente
Replay #1
Data: 27/10/2009 14:13

1) Riportare la descrizione della proteina

Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin

catalizza l'0ssidazione dell'acido urico

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

topo, Mus musculus

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

303aa   909nucleotidi(912 con stop)

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

301-303   srl

andrea zagarella

Tipologia: Intervento
Autore: LAURA MALTRAVERSI - studente
Replay #1
Data: 27/10/2009 14:14

1- Catalizza l'ossidazione dell'acido Urico in 5- idrossiisourato che spontaneamente decompone alla forma di allantoina

 2-Mus musculus (Mouse=topo)

3- lunghezza in AA= 303. Lunghezza in nucleotidi 909 + 3 (codone di stop)

4- Posizione da 301 a 303. Sequenza: SRL

Ylenia Aura Minafò. Michele Picci. Laura Maltraversi

Tipologia: Intervento
Autore: FABIO STRACCI - studente
Replay #1
Data: 27/10/2009 14:15

1) Urato ossidasi: catalizza l'ossidazione di acido urico a 5-idrossiisourato, che si decompone spontaneamente formando allantoina.

2) Mus musculus (Topo)

3) 303 aminoacidi, includendo almeno un codone di stop 912 nucleotidi

4) 301-303 corrispondente a SRL

Scolari Sharon Fabiola

Tipologia: Intervento
Autore: CRISTINA RIZZO - studente
Replay #1
Data: 27/10/2009 14:15

Descrizione:

Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin.

catalisi dell'acido urico

Organismo:Mus musculus(Mouse) Topo

lunghezza in amminoacidi:303 AA

lunghezza in nucleotidi:909 nucleotidi.

sequenza targeting: SRL

posizione 301- 303

Tipologia: Intervento
Autore: EGLANTINA CELISLAMI - studente
Replay #1
Data: 27/10/2009 14:15

1) Riportare la descrizione della proteina

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

1)Uricasi catalizza l'ossidazione dell'acido urico a 5  hydroxyisourateche si decompone spontaneamente per formare allantoina.

2)Mus musculus (Mouse)

3)aa: 303 nt: 909

4)301-303: SRL

LAURA RAFFELINI

Tipologia: Intervento
Autore: ORSOLA LETIZIA PALADINO - studente
Replay #1
Data: 27/10/2009 14:17

Prof. Riccardo Percudani
riccardo.percudani@unipr.it 0521-905140 Homepage

	Esercizio banchedati	Rispondi
	27/10/2009 11:22	Invia email

1) Riportare la descrizione della proteina

Catalizza l'ossidazione dell'acido urico

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

Mus musculus (topo)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

Lunghezza sequenza 303 AA

Lunghezza in nucleotidi 100

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

Da 301 a 303 SRL

Tipologia: Intervento
Autore: FABIO PEZZONI - studente
Replay #1
Data: 27/10/2009 14:17

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_MOUSE

1) Riportare la descrizione della proteina

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

RISPOSTE:

1) Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin;

  TRAD: Catalizza l'ossidazione dell'acido urico a 5-idrossiisourato, che poi spontaneamente si decompone formando allantoin;

2) Mus musculus (Mouse);

3) aa: 303. Nucleotidi: 909; (912 con stop)

4) 301-303; la sequenza è: "srl".

Agosti Mattia, Pezzoni Fabio.

Tipologia: Intervento
Autore: ELISA MILIOTO - studente
Replay #1
Data: 27/10/2009 14:18

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_MOUSE

1) Riportare la descrizione della proteina

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

RISPOSTE

1)Urato Ossidasi: catalizza l'ossidazione dell' acido urico a 5-idrossiurato che spontaneamente si decompone formando allantoin.

2)Mus Musculus

3)303 nt:909

4)301-303 srl

Milioto Elisa

Tipologia: Intervento
Autore: LUCIA ISETTI - studente
Replay #1
Data: 27/10/2009 14:19

Isetti Lucia

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_MOUSE

1) Riportare la descrizione della proteina

Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin.

catalizza l'ossidazione dell'acido urico a 5-idrossiisourato, che spontaneamente si decompone formando allantoina

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

 Mus musculus (Mouse)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

303 AA   909 nucleotidi + 3 nucleotidi di stop

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

301 - 303

SRL

Tipologia: Intervento
Autore: ALICE SALVIATI - studente
Replay #1
Data: 27/10/2009 14:20

1) La proteina è un enzima, uricasi, che catalizza l'ossidazione dell'acido urico a 5-idrossiisurato, che spontaneamente si decompone per formare allantoina.

2) Mus musculus (topo)

3) Lunghezza in aminoacidi: 303

    Lunghezza in nucleotidi: 909

4) La sequenza targeting si trova nella posizione 301-303 ed è SRL.

Elisa Ambroggi

Alice Salviati

Tipologia: Intervento
Autore: FABIO PERINI - studente
Replay #1
Data: 27/10/2009 14:21

1) Proteina coinvolta nel metabolismo delle purine, nei perossisomi. Più   precisamente catalizza l'ossidazione dell'acido urico ad acido 5-idrossiisurato, che si decompone spontaneamente a formare allantoina.

2) Mus Musculus; Topo

3) 303 aa; 912 nucleotidi compresi i 3 di stop

4) Posizione 301-303; Sequenza SRL

Perini Fabio

Tipologia: Intervento
Autore: GIULIA PESCARA - studente
Replay #2
Data: 27/10/2009 14:22

1) Riportare la descrizione della proteina

1) Catalizzatore dell'ossidazione dell'acido urico al 5-idrossiisurato, che si decompone spontaneamente per formare l'allantoina.

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

2) Mus musculus (Mouse)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

3) La lunghezza in amminoacidi è 303 aa, quella in nucleotidi di 909 più 1 codone di stop.

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

4) La posizione è 301-303 e la sequenza è SRL

Tipologia: Intervento
Autore: SILVIA REVERBERI - studente
Replay #1
Data: 27/10/2009 14:23

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_MOUSE

1) Riportare la descrizione della proteina

La proteina in analisi è una urato ossidasi un enzima appartenente alla classe delle ossidoreduttasi.

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

L'organismo di appartenenza è :Mus musculus (topo domestico)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante.

Lunghezza in aminoacidi:303

Lunghezza in nucleotidi: 303*3=909 + 3 di stop

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi.

La posizione nella proteina è 301-303 e la sequenza in aminoacidi è SRL.

Tipologia: Intervento
Autore: ELDA ISUFI - studente
Replay #2
Data: 27/10/2009 14:24

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_MOUSE

1) Riportare la descrizione della proteina

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

1)Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin.

2)Mus musculus(mouse)

3) 303 aa, 909 nucleotidi(+ 3 di stop)

4)Posizione:301-303 Sequenza srl

Tipologia: Intervento
Autore: Elena Paini - studente
Replay #2
Data: 27/10/2009 14:30

1) Riportare la descrizione della proteina

Catalizza l'ossidazione dell' acido urico a 5-idrossiisourato, che spontaneamente si decompone per formare allantoina.

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

Mus musculus (Mouse)  Topo

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

303AA  909 nucletidi (912 con stop)

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

301 – 303

SRL    

Elena Paini

Tipologia: Intervento
Autore: OLGA CHIESA - studente
Replay #4
Data: 27/10/2009 16:30

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_ARATH

1) Riportare la descrizione della proteina

Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

Nome Scientifico: Arabidopsis thaliana 

Nome Comune: Mouse-ear cress

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

309 amminoacidi;

927 nucleotidi più 3 dello stop codon

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amminoacidi

posizione: 307-309

sequenza: SKL

Tipologia: Intervento
Autore: SIMONE LANDI - studente
Replay #13
Data: 28/10/2009 21:12

1- a me è venuto cosi

human-macru= 73.3%; human-gorgo= 38.3%; macru-gorgo= 33.3%

2- non capisco come si riesce a capire se le sequenze sono paraloghe od ortologhe, mi fido di voi.

Simone Landi.

Tipologia: Discussione
Autore: Prof. Riccardo Percudani - docente
Data: 03/11/2009 11:03

Fare una ricerca di omologia nella banca dati di proteine usando la transtiretina umana (NP_000362).

1) quante sono le sequenze con somiglianza significativa (E<10-5)?
2) quale è la percentuale di identità e di somiglianza con la sequenza più significativa di topo?
3) Sono presenti sequenze omologhe nei batteri?

Tipologia: Intervento
Autore: PIETRO CRAVEDI - studente
Replay #1
Data: 03/11/2009 13:04

1- Numero di sequenze significative: 204

2- % somiglianza con topo: 98%

    % identità con topo: 98%

3- sequenze omologhe nei batteri? sì

Tipologia: Intervento
Autore: OLGA CHIESA - studente
Replay #1
Data: 03/11/2009 13:07

Fare una ricerca di omologia nella banca dati di proteine usando la transtiretina umana (NP_000362).

1) quante sono le sequenze con somiglianza significativa (E<10-5)?

le sequenze con somiglianza significativa sono 204
2) quale è la percentuale di identità e di somiglianza con la sequenza più significativa di topo?

Identità= 120/147 (81%), Somiglianza = 135/147 (91%)

3) Sono presenti sequenze omologhe nei batteri?

Sì, Mycobacterium vanbaalenii PYR... 62.4 2e-08

Tipologia: Intervento
Autore: MATTIA DANIELI - studente
Replay #1
Data: 03/11/2009 13:08

1) le sequenze sono 241

2)Identities = 120/147 (81%)
3) sì

laura bottoli
mattia danieli
alessia capetta

Tipologia: Intervento
Autore: DENISE LANDOLFI - studente
Replay #2
Data: 03/11/2009 13:08

le sequenze omologhe  con significatività inferiore a 10-5 sono 204

Identities = 120/147 (81% 
 Positives = 135/147 (91%)

si sono presenti omologie con i batteri (e.coli)

Tipologia: Intervento
Autore: ALESSIA MARMORINO - studente
Replay #1
Data: 03/11/2009 13:08

Fare una ricerca di omologia nella banca dati di proteine usando la transtiretina umana (NP_000362).

1) quante sono le sequenze con somiglianza significativa (E<10-5)? 204
2) quale è la percentuale di identità e di somiglianza con la sequenza più significativa di topo?

Identities = 120/147 (81%), Positives = 135/147 (91%)

3) Sono presenti sequenze omologhe nei batteri? si sono presenti sequenze omologhe nei batteri significative come ad esempio nella salmonella con valore 8e-08

Tipologia: Intervento
Autore: CHIARA CORUZZI - studente
Replay #1
Data: 03/11/2009 13:09

1) quante sono le sequenze con somiglianza significativa (E<10-5)?

204

2) quale è la percentuale di identità e di somiglianza con la sequenza più significativa di topo?

Identities = 120/147 (81%), Positives = 135/147 (91%)

3) Sono presenti sequenze omologhe nei batteri?

 Mycobacterium ulcerans Agy99 [high GC Gram+] taxid 362242
 ref|YP_904633.1| hypothetical protein MUL_0457 [Mycobacter...      61  3e-08
 ci sono sequenze omologhe nei batteri perche per es. mycobacterium ulceras ha un E= 3e-08 che è  un valore significativo

martina inoretti

Tipologia: Intervento
Autore: ALESSIA VERANI - studente
Replay #1
Data: 03/11/2009 13:09

Fare una ricerca di omologia nella banca dati di proteine usando la transtiretina umana (NP_000362).

1) quante sono le sequenze con somiglianza significativa (E<10-5)?
2) quale è la percentuale di identità e di somiglianza con la sequenza più significativa di topo?
3) Sono presenti sequenze omologhe nei batteri?

1) 204

2) identità:81% ( 120/147 ) somiglianza : 91% (135/147)

3) sì,Mycobacterium vanbaalenii

Alessia Verani,Beatrice Monti

Tipologia: Intervento
Autore: NICOLANNA FILOMENA - studente
Replay #1
Data: 03/11/2009 13:10

1) 204

2)identità 120/147(81 %) somiglianza 135/147(91%)

3)SI SONO PRESENTI SEQUENZE OMOLOGHE NEI BATTERI

BACO/FILOMENA

Tipologia: Intervento
Autore: CHIARA LAZZARINI - studente
Replay #1
Data: 03/11/2009 13:11

le sequenze con somiglianza significativa sono 204.

identità 120-147 (81%); 135-147 somiglianza (91%)

sì

Chiara Lazzarini,Enza Caruso, Serena Montalbano

Tipologia: Intervento
Autore: LUCA BARBATO - studente
Replay #1
Data: 03/11/2009 13:11

Fare una ricerca di omologia nella banca dati di proteine usando la transtiretina umana (NP_000362).

1) quante sono le sequenze con somiglianza significativa (E<10-5)?204

2) quale è la percentuale di identità e di somiglianza con la sequenza più significativa di topo?

dentities = 120/147 (81%), Positives = 135/147 (91%), Gaps = 0/147 (0%)

3) Sono presenti sequenze omologhe nei batteri?

SI, Mycobacterium vanbaalenii 62.4

LUCA BARBATO

MONIA FRONZUTI

Tipologia: Intervento
Autore: ALESSANDRA D'ARELLI - studente
Replay #2
Data: 03/11/2009 13:11

Si sono trovate 204 sequenze omologhe con quella data.

La percentuale di identità è di 81% e somiglianza è di 91%.

Sono presenti omologie con i batteri

Tipologia: Intervento
Autore: ELISA IRONI - studente
Replay #1
Data: 03/11/2009 13:12

1) Le sequenze con somiglianza significativa sono 210

2) La percentuale di somiglianza è 91% ( 135/147)

    La percentuale di identità è 81% ( 120/147)

3)  Sì, sono presenti.

Elisa Ironi

Maria Chiara Guidone

Tipologia: Intervento
Autore: ERJOLA DJALA - studente
Replay #1
Data: 03/11/2009 13:13

Le sequenze significative sono 204 con E<e-05.

La percentuale di identità con la sequenza più significativa di topo é 81% mentre quella di somiglianza è di 91%.

Sì, sono presenti sequenze omologhe nei batteri.

Tipologia: Intervento
Autore: STELLA LO BARCO - studente
Replay #2
Data: 03/11/2009 13:14

Si sono trovate 204 sequenze omologhe con quella data.

La percentuale di identità è di 81% e somiglianza è di 91%.

Sono presenti omologie con i batteri

Tipologia: Intervento
Autore: CECILIA NOLLI - studente
Replay #1
Data: 03/11/2009 14:25

Fare una ricerca di omologia nella banca dati di proteine usando la transtiretina di pecora (NP_001009800).

1) quante sono le sequenze con somiglianza significativa (E<10-5)? 240 seq.

2) quale è la percentuale di identità e di somiglianza con la sequenza più significativa di uomo? 85%, 93%

3) Sono presenti sequenze omologhe nei batteri? sì

Alessandra Biondi

Gloria Spagnoli

Tipologia: Intervento
Autore: MARIA PIZZIMENTI - studente
Replay #2
Data: 03/11/2009 14:30

1) quante sono le sequenze con somiglianza significativa (E<10-5)?240
2) quale è la percentuale di identità e di somiglianza con la sequenza più significativa di uomo? 93%
3) Sono presenti sequenze omologhe nei batteri?si

Tipologia: Intervento
Autore: BRUNELLA VENEZIA - studente
Replay #2
Data: 03/11/2009 14:31

Prima domanda: 240 seq.

Seconda domanda: identità 85%,somiglianza 93%

Terza domanda: SI

GRAZIA NARDELLA

Tipologia: Intervento
Autore: GIADA MONICA - studente
Replay #1
Data: 03/11/2009 14:31

1) quante sono le sequenze con somiglianza significativa (E<10-5)?
2) quale è la percentuale di identità e di somiglianza con la sequenza più significativa di uomo?
3) Sono presenti sequenze omologhe nei batteri?

1)240;

2)identità 85%,somiglianza 93%

3)si ad esempio in Escherichia Coli ha un valore di 1e-06

Monica Giada

Aliani Chiara

Tipologia: Intervento
Autore: STEFANO BRANCA - studente
Replay #1
Data: 03/11/2009 14:32

1) quante sono le sequenze con somiglianza significativa (E<10-5)?

le proteine con somiglianza significativa sono 240.

2) quale è la percentuale di identità e di somiglianza con la sequenza più significativa di uomo?

la percentuale è 93%.

 
3) Sono presenti sequenze omologhe nei batteri?

si, sono presenti.