Tipologia: Discussione
Autore: Prof. Riccardo Percudani - docente
Data: 06/10/2009 09:01

Considerate le sequenze:

>HBB_HUMAN  - Homo sapiens
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKV
KAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGK
EFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
>HBA_GORGO - Gorilla gorilla
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGDYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAV
AHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKY
R
>HBB_MACRU Macropus rufus (Red kangaroo)
VHLTAEEKNAITSLWGKVAIEQTGGEALGRLLIVYPWTSRFFDHFGDLSNAKAVMGNPKV
LAHGAKVLVAFGDAIKNLDNLKGTFAKLSELHCDKLHVDPENFKLLGNIIVICLAEHFGK
EFTIDTQVAWQKLVAGVANALAHKYH

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla :
Homo - Macropus :
Macropus - Gorilla:

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?

Tipologia: Forum
Autore: Prof. Riccardo Percudani - docente
Data: 19/10/2009 16:56

Tipologia: Intervento
Autore: SERENA MONTALBANO - studente
Replay #1
Data: 20/10/2009 12:22

Human-Gorgo 41%

Human-Macru 74%

Macru-Gorgo 36%

I geni sono paraloghi perchè la percentuale di somiglianza è troppo bassa e non sono d'accordo con la filogenesi dell'organismo.

Serena Montalbano

Tipologia: Intervento
Autore: THEKLA LEONE - studente
Replay #1
Data: 20/10/2009 12:22

homo-gorilla 41% identità

homo-macropus 74% identità

macropus-gorilla 36% identità

pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?

sono presenti geni paraloghi.si noti la percentuale d'identità tra homo e gorilla che che si discosta molto dalla filogenesi degli organismi

Tipologia: Intervento
Autore: IVANA GALLO - studente
Replay #1
Data: 20/10/2009 12:22

1-IDENTITà PERCENTUALE:

homo-gorilla:41% di identità

homo-macropus:74% di identità

macropus-gorilla:36% di identità

2-ORTOLOGHE O PARALOGHE:

Sono presenti geni paraloghi in quanto si nota che questi risultati non rispecchiano la filogenesi degli organismi,poichè ad esempio tra uomo e gorilla la percentuale di identità dovrebbe essere circa il 90%

Tipologia: Intervento
Autore: CLAUDIA CANNETIELLO - studente
Replay #1
Data: 20/10/2009 12:22

1 identità percentuale

homo-gorilla 41%

homo-macropus 74%

macropus-gorilla 36%

2 tipologia dei geni

Sono presenti geni paraloghi perchè sono diversi tra di loro

Si osserva una somiglianza maggiore tra uomo e canguro piuttosto che tra uomo e gorilla.

Federica Cassinelli - Claudia Cannetiello

Tipologia: Intervento
Autore: LUCA BARBATO - studente
Replay #1
Data: 20/10/2009 12:22

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla : 41%
Homo - Macropus : 74%
Macropus - Gorilla: 36%

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?

Noi sappiamo che l'uomo e il gorilla dovrebbero essere simili, ma l'identità percentuale dell'uomo-gorilla è molto inferiore a quello che ci aspettiamo e quindi i geni sono paraloghi perchè non ci fornisce informazioni riguardo la storia evolutiva degli organismi.

Luca Barbato

Monia Fronzuti

Valentina Ferrari

Tipologia: Intervento
Autore: LUCA GARGIULO - studente
Replay #1
Data: 20/10/2009 12:22

Percentuale identità uomo gorilla       41%

                             uomo canguro    74%

                             canguro gorilla    36%

I geni sono paraloghi perchè sono molto diversi tra loro e quindi probabilmente derivano dalla mutazione di un unico gene ancestore.

I geni di canguro e uomo sono più simili tra loro, quindi probabilmente si sono divisi in tempi più recenti.

GARGIULO LUCA

Tipologia: Intervento
Autore: CHIARA ALIANI - studente
Replay #1
Data: 20/10/2009 12:22

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla :41%
Homo - Macropus :74%
Macropus - Gorilla:36%

2) sono paraloghi perchè le somiglianze percentuali hanno valori troppo bassi;se fossero ortologhi avrebbero una struttura, e quindi somiglianze percentuali,più simili.

chiara aliani e ambra dondi

Tipologia: Intervento
Autore: SILVIA GIUPPONI - studente
Replay #1
Data: 20/10/2009 12:27

1)

Homo - Gorilla : 41%
Homo - Macropus : 74%
Macropus - Gorilla: 36%

2)

uomo e gorilla sono paraloghi per discrepanza tra la % e la somiglianza filogenetica;

uomo e canguro sono paraloghi infatti la % non rispecchia la realtà appartenendo i due individui a 2 classi differenti:marsupiali e mammiferi;

gorilla e canguro sono paraloghi per i motivi precedenti.

Silvia Giupponi e Antonella Falconieri

Tipologia: Intervento
Autore: ILARIA AZZINI - studente
Replay #2
Data: 20/10/2009 12:31

uomo-gorilla 41%

uomo-macru 74%

macru-gorilla 36%

le sequenze sono paraloghe perchè tra uomo e macru c'è una percentuale maggiore di identita. se fossero ortologhe la percentuale maggiore dovrebbe essere tra uomo e gorilla.

Alessandra Biondi e Ilaria Azzini

Tipologia: Intervento
Autore: ELISA AMBROGGI - studente
Replay #2
Data: 20/10/2009 12:32

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla :41%
Homo - Macropus :74%
Macropus - Gorilla:36%

I geni sono paraloghi perchè le differenze amminoacidiche sono localizzate negli stessi punti, quindi è probabile che siano avvenute mutazioni per eventi di duplicazione.

Inoltre, tra uomo e gorilla la percentuale di identità è molto bassa , quando invece dovrebbe essere molto alta dato che derivano dalla stessa filogenesi:di conseguenza i geni sono paraloghi. Gli altri due sono paraloghi per gli stessi motivi.

Elisa Ambroggi Ghielmi Caterina

Tipologia: Intervento
Autore: FRANCESCO DIROMA - studente
Replay #2
Data: 20/10/2009 12:33

Homo - Gorilla :  41%
Homo - Macropus : 74%
Macropus - Gorilla: 36%

Tipologia: Intervento
Autore: ENZA VALENTINA CARUSO - studente
Replay #3
Data: 20/10/2009 12:34

1-identità percentuale.

Homo-Gorilla 41%

Homo-Macropus 74%

Macropus-Gorilla 36%

2.tipologia di geni

Ci sono dei geni paraloghi dato che  sono separati per duplicazione genica e gli organismi sono filogeneticamente differenti.

Enza Caruso e Ilaria Clarizio

Tipologia: Intervento
Autore: ELISA IRONI - studente
Replay #4
Data: 20/10/2009 12:36

1) homo gorilla:41%

    homo macropus: 74%

    macropus gorilla: 36%

2) I geni dell' uomo e del gorilla sono sicuramente paraloghi in quanto sono in disaccordo con la filogenesi; i risultati differiscono dalle aspettative che prevedono una percentuale di indentità molto maggiore di quella ottenuta.

Elisa Ironi

Maria Chiara Guidone

Tipologia: Intervento
Autore: VANESSA CATALDI - studente
Replay #5
Data: 20/10/2009 12:37

1-identita percentuale

homo-gorilla:41%

homo-macropus:74%

macropus-gorilla:36%

2-tipologia dei geni

sono presenti dei geni tra loro paraloghi poiche non c è accordo con la filogenesi degli organismi

vanessa cataldi

Tipologia: Intervento
Autore: SILVIA LAZZERINI - studente
Replay #5
Data: 20/10/2009 12:38

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla : 41%
Homo - Macropus : 74%
Macropus - Gorilla: 36%

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?

  i geni sono paraloghi perchè le differenze amminoacidiche sono localizzate tutte negli stessi punti, quindi è probabile che le mutazioni siano avvenute per eventi di duplicazione

Tipologia: Intervento
Autore: LAURA GOBBI - studente
Replay #6
Data: 20/10/2009 12:39

1)

Homo-Gorilla 41%

Homo-Macropus 74%

Macropus-Gorilla 36%

2)

I geni sono paraloghi poichè fra uomo e canguro c'è una percentuale di identità maggiore che tra uomo e gorilla; se fossero ortologhi dovrebbe essere il contrario.

Tipologia: Intervento
Autore: ALESSIA MARMORINO - studente
Replay #6
Data: 20/10/2009 12:42

Sono presenti dei paraloghi e ciò è visibile dalle percentuali che mostrano grande diversità intendendo che questi derivino da una mutazione di un gene ancestrale.

Tipologia: Intervento
Autore: STELLA LO BARCO - studente
Replay #7
Data: 20/10/2009 12:44

Identità percentuale:

- tra uomo e gorilla 41%

- tra uomo e macropus 74%

- tra macropus e gorilla 36%

Ci sono tra loro geni paraloghi perchè non sono in accordo con la filogenesi degli organismi.

Tipologia: Intervento
Autore: LUCA GARGIULO - studente
Replay #7
Data: 20/10/2009 12:45

Oltre ad essersi divisi in tempi più recenti, i geni di uomo e canguro potrebbero essere ortologhi poichè le sequenze hanno una certa percentuale di identità.

GARGIULO LUCA

Tipologia: Intervento
Autore: CHIARA LAZZARINI - studente
Replay #8
Data: 20/10/2009 12:49

Human-Gorgo 41%

Human-Macru 74%

Macru-gorgo 36%

I geni sono tra loro paraloghi perchè non c'è accordo con la filogenesi degli organismi.

Chiara Lazzarini

Tipologia: Intervento
Autore: MATTIA AGOSTI - studente
Replay #1
Data: 20/10/2009 13:40

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Pongo : 41%
Homo - Macropus :74%
Macropus - Pongo:36%

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?

A livello di identità c'è più differenza tra Homo e Pongo che tra Homo e Macropus.

Deduco che i geni siano paraloghi perchè non si sono separati seguendo la filogenesi della specie (in quanto a livello filogenico l'Homo è più vicino al Pongo).

Agosti Mattia, Pezzoni Fabio.

Tipologia: Intervento
Autore: CLAUDIA ROMANELLI - studente
Replay #1
Data: 20/10/2009 13:40

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Pongo : 41%
Homo - Macropus :74%
Macropus - Pongo:36%

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?

Nonostante Homo e Pongo siano molto vicini filogeneticamente,l'evoluzione dei geni non ha seguito l'evoluzione della specie,data la minore percentuale (41%) di identità dei geni rispetto a quella tra Homo e Macropus(74%) . Per questo motivo sono presenti geni paraloghi.

Claudia Romanelli

Davide Sarra

Tipologia: Intervento
Autore: ELISA RATTOTTI - studente
Replay #1
Data: 20/10/2009 13:40

Homo - Pongo : 41%
Homo - Macropus : 74%
Macropus - Pongo: 36%

In questo gruppo ci sono geni paraloghi perchè non si sono separati seguendo la filogenesi delle specie

Tipologia: Intervento
Autore: LUCA STRAGLIATI - studente
Replay #1
Data: 20/10/2009 13:40

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Pongo : 41%
Homo - Macropus : 74%
Macropus - Pongo: 36%

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?

I geni dell' emoglobina alfa (Pongo) e beta (Homo e Macropus) sono paraloghi fra loro , in quanto le percentuali di identità fra le sequenze suggeriscono un evento di duplicazione genica. I geni delle catene beta di Homo e Macropus sono ortologhi, avendo un 74% di identità. Probabilmente è avvenuto un evento di speciazione fra i geni di Homo e Macropus successivo alla duplicazione genica fra i geni delle catene alfa e beta.

Alice Salviati

Adriana Vitiello

Luca Stragliati

Tipologia: Intervento
Autore: LAURA MALTRAVERSI - studente
Replay #1
Data: 20/10/2009 13:40

Prof. Riccardo Percudani
riccardo.percudani@unipr.it 0521-905140 Homepage

	Esercizio evoluzione (M-Z)	Rispondi
	06/10/2009 09:02	Invia email

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Pongo :41%
Homo - Macropus :74%
Macropus - Pongo:36%

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?

Inizialmente i geni che codificano per la catena alfa e beta si sono divisi per un evento di duplicazione genica e quindi sono paraloghi e questo spiega le basse percentuali( 41% E 36%) tra catene alfa e beta di homo,pongo e macropus.In seguito la catena beta in homo e macropus si è separata per speciazione e quindi i geni per la catena beta dell'homo e macropus sono ortologhi e questo spiega l'alta percentualità( 74%).

Alessandra Musiari

Tipologia: Intervento
Autore: MARIA CHIARA VENUTI - studente
Replay #1
Data: 20/10/2009 13:40

1.Homo-Pongo 41%

   Homo-Macropus 74%

   Macropus-Pongo 36%

2.Homo-Macropus:ortologhi,perchè hanno un'alta percentuale di identità

   Homo-Pongo:paraloghi,perchè hanno una bassa percentuale di identità

   Macropus-Pongo:paraloghi,perchè anche essi hanno una bassa percentuale di    identità

Lanzillotti Giusi

Barone Roberta

Tipologia: Intervento
Autore: MARIA CHIARA VENUTI - studente
Replay #1
Data: 20/10/2009 13:40

1.Homo-Pongo 41%

   Homo-Macropus 74%

   Macropus-Pongo 36%

2.I rapporti non sono in accordo con la filogenesi delle specie.

   Dunque possiamo solo stabilire che si tratta di geni paraloghi.

Lanzillotti Giusi

Barone Roberta

Tipologia: Intervento
Autore: GIADA MONICA - studente
Replay #1
Data: 20/10/2009 13:40

>HBB_HUMAN  - Homo sapiens
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKV
KAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGK
EFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
>HBA_pongo - Pongo pygmaeus
MVLSPADKTNVKTAWGKVGAHAGDYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDL
SHGSAQVKDHGKKVADALTNAVAHVDDMPNALSALSDL
HAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTP
AVHASLDKFLASVSTVLTSKYR

>HBB_MACRU Macropus rufus (Red kangaroo)
VHLTAEEKNAITSLWGKVAIEQTGGEALGRLLIVYPWTSRFFDHFGDLSNAKAVMGNPKV
LAHGAKVLVAFGDAIKNLDNLKGTFAKLSELHCDKLHVDPENFKLLGNIIVICLAEHFGK
EFTIDTQVAWQKLVAGVANALAHKYH

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Pongo : 41%
Homo - Macropus :74%
Macropus - Pongo:36%

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?

I geni sono paraloghi perchè le loro identità non riflettono le somiglianze filogenetiche quindi non si sono divisi per speciazione, ma per un altro evento quale la duplicazione genica.

Tipologia: Intervento
Autore: BEATRICE MONTI - studente
Replay #1
Data: 20/10/2009 13:41

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Pongo : 41%
Homo - Macropus : 74%
Macropus - Pongo: 36%

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?

I geni sono paraloghi, perché nella valutazione della percentuale d'identità si nota una maggiore percentuale nel confronto tra uomo e canguro rispetto a quello tra uomo e orango,quindi i geni non hanno seguito la filogenesi della specie.

Monti Beatrice, Verani Alessia.

Tipologia: Intervento
Autore: CHIARA CORUZZI - studente
Replay #1
Data: 20/10/2009 13:41

1) Homo - Pongo : 41%
    Homo - Macropus :74%
    Macropus - Pongo:36%

2) I geni sono paraloghi perchè le percentuali di identità non rispecchiano la filogenesi delle specie.

martina inoretti

Tipologia: Intervento
Autore: LUCIA ISETTI - studente
Replay #1
Data: 20/10/2009 13:41

Lucia Isetti

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Pongo : 41%
Homo - Macropus :  74%
Macropus - Pongo:  36%

pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?

Penso che igeni siano paraloghi, perchè le percentuali di identità genica sono più alte nelle specie filogeneticamente più lontane.

20-OCT-2009  13:46
            HBB_MACRU

     HBB_HUMAN     HBA_pongo

            1      2      3

          146     74%    41%
1           0     84%    61%
            0      0%     5%

          109    146     36%
2         124      0     58%
            0      0      5%

           61     54    142
3          91     86      0
            8      8      0

            1      2      3

Tipologia: Intervento
Autore: ANNALISA SISTO - studente
Replay #1
Data: 20/10/2009 13:42

Homo - Pongo: 41%

Homo - Macropus: 74%

Macropus - Pongo: 36%

I geni di Homo e Macropus potrebbero essere ortologhi perchè nonostante io abbia soltanto due specie a confronto, presentano un'elevata percentuale di identità, e quindi potrebbero essersi separati per speciazione, svolgendo la stessa funzione in specie differenti.

I geni di Homo e Pongo e Macropus e Pongo potrebbero essere paraloghi in quanto le relazioni tra i geni non corrispondono alle relazioni tra le specie.

Tipologia: Intervento
Autore: CHIARA PASQUINI - studente
Replay #10
Data: 20/10/2009 13:43

HOMO-GORILLA: 41%

HOMO- MACROPUS:74%

MACROPUS- GORILLA: 36%

I GENI SONO PARALOGHIPERCHè, CONTRARIAMENTE A QUANTO CI SAREMMO ASPETTATI, I GENI DELL'UOMO E DEL GORILLA HANNO UNA PIù BASSA IDENTITà PERCENTUALE RISPETTO AI GENI DELL'UOMO E DEL CANGURO. QUINDI CONCLUDIAMO DICENDO CHE NON HANNO SEGUITO L'EVOLUZIONE DELLE SPECIE.

Tipologia: Intervento
Autore: RAMONA PACE - studente
Replay #1
Data: 20/10/2009 13:49

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Pongo : 41%
Homo - Macropus :74%
Macropus - Pongo:36%

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?

I geni sono paraloghi perchè filogeneticamente l'uomo è più simile al Pongo rispetto al Macropus, mentre le percentuali di identità ci dimostrano che il gene della beta emoglobina di Macropus è più somigliante a quello di Homo rispetto al gene di Pongo.

Ramona Pace e Marta Zantedeschi

Tipologia: Intervento
Autore: ORNELLA SCANDALIATO - studente
Replay #1
Data: 20/10/2009 13:52

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Pongo : 41%
Homo - Macropus : 74%
Macropus - Pongo: 36%

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?

I geni sono paraloghi perchè dal confronto notiamo ch hanno una bassa identità  e quindi non si sono separati seguendo la filogenesi della speciazione....

eglantina celislami

Tipologia: Intervento
Autore: LUCIA ISETTI - studente
Replay #2
Data: 20/10/2009 13:55

Valentina Rossi

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Pongo : 41%
Homo - Macropus :74%
Macropus - Pongo:36%

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?

I geni sono paraloghi perchè hanno bassa identità tra specie filogeneticamente più vicine.

20-OCT-2009  13:58
            HBB_MACRU

     HBB_HUMAN     HBA_pongo

            1      2      3

          146     74%    41%
1           0     84%    61%
            0      0%     5%

          109    146     36%
2         124      0     58%
            0      0      5%

           61     54    142
3          91     86      0
            8      8      0

            1      2      3

Tipologia: Intervento
Autore: ANGELA VOLPE - studente
Replay #2
Data: 20/10/2009 13:56

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Pongo : 41%
Homo - Macropus :74%
Macropus - Pongo:36%

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?

In  homo-pongo e macropus-pongo essendoci una bassa identità di sequenze omologhe, si deduce che siamo in presenza di uno stesso gene presente nei tre organismi diversi considerati; per questo motivo possono essere considerate sequenze ortologhe.Dall' elevato valore d' identità in homo-macropus, invece, è deducibile che questi derivino da uno stesso genoma, quindi sono  sequenze paraloghe.

Tipologia: Intervento
Autore: MATTEO PEDEGANI - studente
Replay #2
Data: 20/10/2009 13:59

HBB_HUMAN-HBB_MACRU  74%

HBB_HUMAN-HBA_pongo    41%

HBB_MACRU-HBA_pongo    36%

Per quanto riguarda i geni che codificano per la emoglobina beta dell'uomo e del canguro rosso questi risultano essere geni ortologhi poichè mostrano una elevata percentuale di identità( 74%) e, quindi, le proteine codificate hanno la stessa funzione (codificano per HBB).

Al contrario, se ci riferiamo ai geni che codificano per la emoglobina alfa del pongo, questi risultano essere paraloghi rispetto alle altre due specie in esame, poichè presentano una più bassa percentuale di identità nel confronto con quest'ultime e quindi le proteine codificate da essi hanno una funzione diversa (codificano per HBA).

Matteo Pedegani e Fabio Perini

Tipologia: Intervento
Autore: FABIO PERINI - studente
Replay #3
Data: 20/10/2009 14:11

HBB_HUMAN-HBB_MACRU  74%

HBB_HUMAN-HBA_pongo    41%

HBB_MACRU-HBA_pongo    36%

Per quanto riguarda i geni che codificano per la emoglobina beta dell'uomo e del canguro rosso questi risultano essere geni ortologhi poichè mostrano una elevata percentuale di identità( 74%) e, quindi, le proteine codificate hanno la stessa funzione (codificano per HBB).

Al contrario, se ci riferiamo ai geni che codificano per la emoglobina alfa del pongo, questi risultano essere paraloghi rispetto alle altre due specie in esame, poichè presentano una più bassa percentuale di identità nel confronto con quest'ultime e quindi le proteine codificate da essi hanno una funzione diversa (codificano per HBA).

Fabio Perini e Matteo Pedegani

Tipologia: Intervento
Autore: SILVIA MIATELLO - studente
Replay #5
Data: 20/10/2009 14:14

Homo - Pongo: 41%

Homo - Macropus: 74%

Macropus - Pongo: 36%

I geni di Homo e Macropus potrebbero essere ortologhi perchè nonostante io abbia soltanto due specie a confronto, presentano un'elevata percentuale di identità, e quindi potrebbero essersi separati per speciazione, svolgendo la stessa funzione in specie differenti.

I geni di Homo e Pongo e Macropus e Pongo potrebbero essere paraloghi in quanto le relazioni tra i geni non corrispondono alle relazioni tra le specie.

Tipologia: Intervento
Autore: GABRIELLA COTTONE - studente
Replay #11
Data: 20/10/2009 15:21

1)

homo-gorilla: 41% di identà

homo-macropus: 74% di identità

macropus-gorilla: 36% di identità

2)

sono presenti dei geni paraloghi, in quanto il risultato dell'esercizio non rispecchia la filogenesi perchè ad esempio homo e gorilla dovrebbero assomigliarsi circa per il 90%.

Tipologia: Discussione
Autore: Prof. Riccardo Percudani - docente
Data: 27/10/2009 11:20

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_ARATH

1) Riportare la descrizione della proteina

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

Tipologia: Intervento
Autore: PIETRO CRAVEDI - studente
Replay #1
Data: 27/10/2009 12:51

DESCRIZIONE

"Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin."

"Catalizza l'ossidazione dell'acido urico a 5-idrossiisourato, che spontaneamente si decompone ad allantoina."

ORGANISMO

Arabidopsis thaliana - arabetta comune

LUNGHEZZA

309 aa - 927 nucleotidi + codone di stop

SEGNALE DI TARGETING

posizione: 307-309

sequenza: SKL

Tipologia: Intervento
Autore: DENISE LANDOLFI - studente
Replay #2
Data: 27/10/2009 12:53

la proteina indicata è una uricasi

l'organismo da cui proviene è Arabidopsis thaliana

il nome comune è  Mouse-ear cress

la lunghezza in AA

Tipologia: Intervento
Autore: ALESSANDRA BIONDI - studente
Replay #1
Data: 27/10/2009 12:54

1) Riportare la descrizione della proteina

La proteina è coinvolta nel metabolismo delle purine, situata nei perissosomi.

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

In AA è 309, in nucleotidi 930

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

Posizione 310, sequenza AA SKL

Alessandra Biondi

Ilaria Azzini

Tipologia: Intervento
Autore: ILARIA AZZINI - studente
Replay #2
Data: 27/10/2009 12:56

1) Riportare la descrizione della proteina

La proteina è coinvolta nel metabolismo delle purine, situata nei perissosomi.

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

In AA è 309, in nucleotidi 930

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

Posizione 310, sequenza AA SKL

Alessandra Biondi

Ilaria Azzini

Tipologia: Intervento
Autore: MICOL GILBERTI - studente
Replay #2
Data: 27/10/2009 12:57

1) Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin.

 "Catalizza l'ossidazione dell'acido urico a 5-idrossiisourato che spontaneamente si decompone per formare allantoina"

2) Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) "arabetta comune"

3) 309 AA; 927 nucleotidi + 3 dello stop codon

4) sequenza targeting 307 - 309: SKL

GILBERTI MICOL

Tipologia: Intervento
Autore: ALESSIA MARMORINO - studente
Replay #1
Data: 27/10/2009 12:58

Descrizione:Catalizza l'ossidazione dell'acido urico a 5-hydroxyisourate, che spontaneamente si decompone nella forma di Allantoina

organismo di appartenenza: nome scientifico:Arabidopsis thaliana detta comunemente arabetta comune

la lunghezza in aminoacidi:309

lunghezza in nucleotidi: 927 piu il codone di stop

il segnale di targeting sequenza amminoacidi: SKL

la posizione è 307-309

Alessia Marmorino e Ilaria Clarizio