Classe delle Lauree in Scienze Biologiche
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Forum > AB - Corso 2010/2011 (M-Z) > Esercizio banche dati

AutoreIntervento
Prof. Riccardo Percudani
docente
Esercizio banche datiRispondi
26/10/2010 13:02Invia email

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_MOUSE

1) Riportare la descrizione della proteina

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

 

GIANLUCA SPAGNOLI
studente
Re: Esercizio banche datiRispondi
Replay #1 - 26/10/2010 14:08Invia email

funnzione:Catalizza l'ossidazione di acido urico a 5-hydroxyisourate, che si decompone spontaneamente per formare allantoina.

Apparteneza :Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Glires › Rodentia › Sciurognathi › Muroidea › Muridae › Murinae › Mus › Mus (topo)

 

sequenza amminoacid: 909 nucleotidi 304

Microbody targeting signal: SRL 301-303

 

 

FRANCESCA TENCA
studente
Re: Esercizio banche datiRispondi
Replay #1 - 26/10/2010 14:09Invia email

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_MOUSE

1) Riportare la descrizione della proteina

Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin.

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

Mus musculus. Topo

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

lunghezza aminoacidi: 303

lunghezza nucleotidi: 909

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

301 - 303 

SRL 
Tenca Francesca e Salsi Giorgia

 

FRANCESCA ZICCA
studente
Re: Esercizio banche datiRispondi
Replay #1 - 26/10/2010 14:11Invia email

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_MOUSE

1) Riportare la descrizione della proteina

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

1)Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin.

 2)Mus musculus (Mouse)

3)303 aa,909 bp

4) SRL (301-303)

 

Francesca Zicca

Danilo Sgura

Michele Pastorelli

 

ILARIA PAGANINI
studente
Re: Esercizio banche datiRispondi
Replay #1 - 26/10/2010 14:12Invia email

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_MOUSE

1) Riportare la descrizione della proteina

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

 

 

1)Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin.

2)Mus musculus (Mouse)

3)303 aminoacidi e (303*3)+3 (codone di stop)=912 nucleotidi

4)si trova in posizione 301-303 e la sequenza è SRL

 

Fregnan Giulia, Tonarelli Marika, Paganini Ilaria

 

 

 

ENRICO TAGLIAFERRI
studente
Re: Esercizio banche datiRispondi
Replay #1 - 26/10/2010 14:12Invia email

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_MOUSE

1) Riportare la descrizione della proteina: Catalizza l'ossidazione dell'acido urico a 5-idrossiurato

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune) Mus musculus, Topo

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante. In amminoacidi 303, in nucleotidi 910 (piu il codone di stop)

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi.  posizione 301-303, sequenza SRL

 

 

 

GIUSEPPE MARCOSANO
studente
Re: Esercizio banche dati. Marcosano-MagrìRispondi
Replay #1 - 26/10/2010 14:12Invia email

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_MOUSE

1) Riportare la descrizione della proteina

Catalizza l'ossidazione di acido urico a 5-hydroxyisourate, che si decompone per formare allantoina.

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

Mus Musculus (topo)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

AA 303

Nt 912

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

301-303 SRL

 

Marcosano-Magrì

 

 

Prof. Riccardo Percudani
docente
Re: Esercizio banche datiRispondi
Replay #1 - 26/10/2010 14:13Invia email

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_MOUSE

1) Riportare la descrizione della proteina

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

RISPOSTA:

1 proteina  cinvolta nel metabolismo , degradazione urea

2 mus musculus mouse

3 303 aa e  909 bp

4 301-303 e srl

 

ELIA NODARI
studente
Re: Esercizio banche datiRispondi
Replay #1 - 26/10/2010 14:13Invia email

 

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_MOUSE

1) Riportare la descrizione della proteina

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

(2)   Mus musculus (topo)

(1) Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin.

(3)Length 303 aminoacids 912 nucleotidi

(4) srl 301-303

 

 

STEFANO MAGGI
studente
Re: Esercizio banche datiRispondi
Replay #1 - 26/10/2010 14:14Invia email

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_MOUSE

1) Riportare la descrizione della proteina

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

 

1) catalizza l'ossidazione di acido urico

2)Mus Musculus Topo

3)303 909

4)dal 301-303 SRL

 

CLAUDIO LO CASCIO
studente
Re: Esercizio banche datiRispondi
Replay #1 - 26/10/2010 14:14Invia email

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_MOUSE

1) Riportare la descrizione della proteina

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

1_Catalizza l'ossidazione dell'acido urico ad acido 5 idrossiurato, che spontaneamente si decompone nella forma di allantoina

2_Mus musculus (Mouse)

3- 303 AA  909 nucleotidi

4- 301 – 303 

 

VERONICA MUTTI
studente
Re: Esercizio banche datiRispondi
Replay #1 - 26/10/2010 14:14Invia email

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_MOUSE

1) Riportare la descrizione della proteina

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

  1:è un enzima catalizza l'ossidazione dell'acido urico

  2: è un roditore (mus musculus,mouse)

  3: è lungo 303 amminoacidi

  4 : >P25688|2-303
AHYHDNYGKNDEVEFVRTGYGKDMVKVLHIQRDGKYHSIKEVATSVQLTLRSKKDYLHGD
NSDIIPTDTIKNTVHVLAKLRGIRNIETFAMNICEHFLSSFNHVTRAHVYVEEVPWKRFE
KNGIKHVHAFIHTPTGTHFCEVEQMRNGPPVIHSGIKDLKVLKTTQSGFEGFLKDQFTTL
PEVKDRCFATQVYCKWRYQRRDVDFEAIWGAVRDIVLQKFAGPYDKGEYSPSVQKTLYDI
QVLSLSQLPEIEDMEISLPNIHYFNIDMSKMGLINKEEVLLPLDNPYGKITGTVKRKLPS
RL

 10         20         30         40         50         60 
MAHYHDNYGK NDEVEFVRTG YGKDMVKVLH IQRDGKYHSI KEVATSVQLT LRSKKDYLHG 

        70         80         90        100        110        120 
DNSDIIPTDT IKNTVHVLAK LRGIRNIETF AMNICEHFLS SFNHVTRAHV YVEEVPWKRF 

       130        140        150        160        170        180 
EKNGIKHVHA FIHTPTGTHF CEVEQMRNGP PVIHSGIKDL KVLKTTQSGF EGFLKDQFTT 

       190        200        210        220        230        240 
LPEVKDRCFA TQVYCKWRYQ RRDVDFEAIW GAVRDIVLQK FAGPYDKGEY SPSVQKTLYD 

       250        260        270        280        290        300 
IQVLSLSQLP EIEDMEISLP NIHYFNIDMS KMGLINKEEV LLPLDNPYGK ITGTVKRKLP 


SRL

 

MATILDE MONTI
studente
Re: Esercizio banche datiRispondi
Replay #1 - 26/10/2010 14:15Invia email

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_MOUSE

1) Riportare la descrizione della proteina

Urato ossidasi, catallizza l'ossidazione dell'acido urico a 5-idrossiisurato.

Si trova nei perossisomi.

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

Mus Musculus, Topo

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

303 AA e 912 nucleotidi

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

301-303 SRL

 

Matilde Monti

Alice Masserdotti

 

Silvia Tommasi
studente
Re: Esercizio banche datiRispondi
Replay #1 - 26/10/2010 14:16Invia email

1) Riportare la descrizione della proteina

Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin.

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

Mus musculus (Mouse)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

303 AA.  909 nucleotidi

 4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

301-303, SRL      elisa ambroggi Marco Taglietti

 

BRUNO MAURO
studente
Re: Esercizio banche datiRispondi
Replay #1 - 26/10/2010 14:16Invia email

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_MOUSE

1) Riportare la descrizione della proteina

Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin., which spontaneously decomposes to form allantoin.

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

 Mus musculus (Mouse)

 

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

303 AA.

909 Nucleotidi

 

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

SRL 301-303

 

 

 

ELENA TOSI
studente
Re: Esercizio banche datiRispondi
Replay #1 - 26/10/2010 14:17Invia email

1) Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin.

2) Mus musculus (Mouse)

3)303 AA.   909nt

4)dall'AA 301 all'AA 303 : SRL

 

Maria Teresa Frontera
studente
Re: Esercizio banche datiRispondi
Replay #2 - 26/10/2010 14:17Invia email

 

Esercizio banche dati Rispondi
26/10/2010 13:02 Invia email

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_MOUSE

1) Riportare la descrizione della proteina

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

1)Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin.

2)Mus musculus,  topo

3) 303 aa 909 nucleotide

4) 303  301 SRL

 

 

MELANIA MISSERI
studente
Re: Esercizio banche datiRispondi
Replay #1 - 26/10/2010 14:18Invia email

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_MOUSE

1) Riportare la descrizione della proteina

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

RISPOSTA:

1) Proteina coinvolta nel metabolismo, degradazione urea

2) Mus musculus (Mouse)

3) Amminoacidi :303 Nucleotidi: 909

4) 301-303 SRL


 

CONCETTA MASDEA
studente
Re: Esercizio banche datiRispondi
Replay #1 - 26/10/2010 14:18Invia email

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_MOUSE

1) Riportare la descrizione della proteina Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)Mus musculus (Mouse)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante 303 AA e 909 bp.

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi 301-303 srl

 

SILVIA PERINI
studente
Re: Esercizio banche datiRispondi
Replay #1 - 26/10/2010 14:19Invia email

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_MOUSE

1) Riportare la descrizione della proteina

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

RISPOSTA:

1.Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin.

2.Mus musculus (Mouse) 

3.Lunghezza in aa. 303 Lunghezza in nucleotidi 909

4. 301-303 SRL

Silvia Perini e Lucia Mangeri

 

 

ALESSIA MILIZIANO
studente
Re: Esercizio banche datiRispondi
Replay #1 - 26/10/2010 14:19Invia email

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_MOUSE

1) Riportare la descrizione della proteina

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

RISPOSTE

1)Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin

2) Mus musculus (mouse)

3) lunghezza amminoacidi: 303;

    lunghezza nucleotidi :909

4) 301-303 SRL

ALESSIA MILIZIANO E LUCIA MAURELLA

 

LAURA MICCOLIS
studente
Re: Esercizio banche datiRispondi
Replay #1 - 26/10/2010 14:19Invia email

 

Esercizio banche dati Rispondi
26/10/2010 13:02 Invia email

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_MOUSE

1) Riportare la descrizione della proteina

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

  1. catalizza l-ossidazione dell-acido urico a 5-hydroxyisourate, che spontaneamente decompone per l-allantoina

 2.Mus musculus (Mouse)

3.303 909 +3

4. 301/303 srl

 

DEBORA POMARELLI
studente
Re: Esercizio banche datiRispondi
Replay #2 - 26/10/2010 14:19Invia email

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_MOUSE

1) Riportare la descrizione della proteina

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

1)Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin.

2)Mus musculus (Mouse)

3) lunghezza in aa:303 lunghezza in nucleotidii:909 bp

 4 301- 303 srl

 

PIETRO SQUERI
studente
Re: Esercizio banche datiRispondi
Replay #1 - 26/10/2010 14:21Invia email

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_MOUSE

1) Riportare la descrizione della proteina

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

1)catalizza l'ossidazione di acido urico a C5H4N4O4, che degrada spontaneamente alla forma di allantoina

2)Mus Musculus (topo domestico)

3)lunghezza aminoacidi:303

lunghezza nucleotidi:100

4)segnale targeting posizione:301-303

sequenza aminoacidica: SRL

 

GIULIA LEVATI
studente
Re: Esercizio banche datiRispondi
Replay #1 - 26/10/2010 14:24Invia email

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_MOUSE

1) Riportare la descrizione della proteina

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

 

 

1) Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin.
Catalytic activity

Urate + O2 + H2O = 5-hydroxyisourate + H2O2.

2) Mus musculus cioè topo domestico/comune

3)Lunghezza in aminoacidi 303;lunghezza in nucleotidi 909

4)301-303 srl


 

VINCENZO MANDICA
studente
Re: Esercizio banche datiRispondi
Replay #1 - 26/10/2010 14:29Invia email

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_MOUSE

1) Riportare la descrizione della proteina

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

 

1) Catalyzes t he oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate

2) Mus  Musculus, Topo

3) 303 Aa, 909 +3

4)

SRL

301-303

 

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