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Forum > Corso 2009/2010 > Esercizi caratteristiche biochimiche

AutoreIntervento
Prof. Riccardo Percudani
docente
Esercizi caratteristiche biochimiche
12/01/2010 11:38

 

Esercizio Caratteristiche biochimiche
20/01/2009 11:24

Trovare in Swissprot la proteina corrispondente all'identificativo DNLI1_HUMAN
1) Qual'è la funzione della proteina?
2) Riportare peso molecolare e coefficiente di estinzione. Scrivere se la proteina è acida, basica o neutra.
3) Fare una ricerca in Prosite e riportare i Pattern contenuti nella proteina.

 

OLGA CHIESA
studente
Re: Esercizi caratteristiche biochimiche
Replay #1 - 12/01/2010 12:49

Trovare in Swissprot la proteina corrispondente all'identificativo DNLI1_HUMAN
1) Qual'è la funzione della proteina?

DNA ligase that seals nicks in double-stranded DNA during DNA replication, DNA recombination and DNA repair.

DNA ligasi


2) Riportare peso molecolare e coefficiente di estinzione. Scrivere se la proteina è acida, basica o neutra.

Molecular weight: 101736.1

Ext. coefficient 65945

Theoretical pI: 5.49 quindi la proteina è acida


3) Fare una ricerca in Prosite e riportare i Pattern contenuti nella proteina.

Due possibili pattern, entrambi delle DNA ligasi

EYKYDGQRA

EGLMVKtldvdat.YEiakrs.Hnwl..KLK

 

CHIESA OLGA E SILVIA LAZZERINI

 

ARIANNA MOLINARI
studente
Re: Esercizi caratteristiche biochimiche
Replay #1 - 12/01/2010 12:53

Trovare in Swissprot la proteina corrispondente all'identificativo DNLI1_HUMAN
1) Qual'è la funzione della proteina?
2) Riportare peso molecolare e coefficiente di estinzione. Scrivere se la proteina è acida, basica o neutra.
3) Fare una ricerca in Prosite e riportare i Pattern contenuti nella proteina.

 

1) DNAligasi1: salda nick nel DNa a doppio filamento durante la replicazione del DNA, la ricombinazione e la riparazione. 

2) peso molecolare: 101736.1

    coefficiente di estinzione: 65945

    pI: 5.49 quindi è da considerarsi acida

3) 2 pattern:

 E - G - [LIVMA] - [LIVM] - [LIVMA] - [KR] - x(5,8) - [YW] - [QNEKTI] - x(2,6) - [KRH] - x(3,5) - K - [LIVMFY] - K

 

[EDQH] - {K} - K - {VEDI} - [DN] - G - {GLYN} - R - [GACIVM]

 

Arianna Molinari

Claudia Romanelli

 

PIETRO CRAVEDI
studente
Re: Esercizi caratteristiche biochimiche
Replay #1 - 12/01/2010 12:53

1- La proteina è una DNA Ligasi

2-Peso Molecolare=101736

Coeff. Estinzione=65945 (con ponti disolfuro)/65320 (senza ponti disolfuro)

PI=5,49 La proteina è acida

3-Pattern trovati

EYKYDGQRA DNA Ligasi A1

EGLMVKtldvdat.YEiakrs.Hnwl..KLK DNA Ligasi A2

 

GIULIANA CIRILLO
studente
Re: Esercizi caratteristiche biochimiche
Replay #1 - 12/01/2010 12:54

1) Qual'è la funzione della proteina? This protein is DNA ligase that seals nicks in double-stranded DNA during DNA replication, DNA recombination and DNA repair.

2) Riportare peso molecolare e coefficiente di estinzione. Scrivere se la proteina è acida, basica o neutra.

Molecular weight: 101736.1
Ext. coefficient 65945
La proteina è acida ( p.to isolettrico 5.49)

 


3) Fare una ricerca in Prosite e riportare i Pattern contenuti nella proteina.

due pattern possibili:

  EYKYDGQRA

  EGLMVKtldvdat.YEiakrs.Hnwl..KLK

 

 

FABIO PERINI
studente
Re: Esercizi caratteristiche biochimiche
Replay #1 - 12/01/2010 12:56

1_ Dna ligasi 

 

2_  Peso molecolare: 101736

     Coefficiente di estinzione: 65945

     La proteina è acida (pl 5.49)

 

3_ Possibili pattern:

  [EDQH] - {K} - K - {VEDI} - [DN] - G - {GLYN} - R - [GACIVM]

     E - G - [LIVMA] - [LIVM] - [LIVMA] - [KR] - x(5,8) - [YW] - [QNEKTI] - x(2,6) - [KRH] - x(3,5) - K - [LIVMFY] - K

 

Perini Fabio

 

VALENTINA FERRARI
studente
Re: Esercizi caratteristiche biochimiche
Replay #1 - 12/01/2010 12:57

Trovare in Swissprot la proteina corrispondente all'identificativo DNLI1_HUMAN
1) Qual'è la funzione della proteina?
2) Riportare peso molecolare e coefficiente di estinzione. Scrivere se la proteina è acida, basica o neutra.
3) Fare una ricerca in Prosite e riportare i Pattern contenuti nella proteina.

 

1)DNA ligasi

2)peso molecolare: 101736 Da

  coefficiente di estinzione: 65945

  la proteina è acida

3) 2 pattern: Dna ligasi A1 e DNA ligasi A2

 

 

Valentina Ferrari

Ramona Pace

 

ALESSIA MARMORINO
studente
Re: Esercizi caratteristiche biochimiche
Replay #2 - 12/01/2010 12:58

Trovare in Swissprot la proteina corrispondente all'identificativo DNLI1_HUMAN
1) Qual'è la funzione della proteina?
2) Riportare peso molecolare e coefficiente di estinzione. Scrivere se la proteina è acida, basica o neutra.
3) Fare una ricerca in Prosite e riportare i Pattern contenuti nella proteina.

 

1.DNA ligase I
    Polydeoxyribonucleotide synthase [ATP] 1

2.Peso molecolare 101736 Dalton

Coefficente di estinzione: 65945
Punto isoelettrico: 5.49 quindi la proteina è acida

3. due possibili pattern:

 

E - G - [LIVMA] - [LIVM] - [LIVMA] - [KR] - x(5,8) - [YW] - [QNEKTI] - x(2,6) - [KRH] - x(3,5) - K - [LIVMFY] - K

 

[EDQH] - {K} - K - {VEDI} - [DN] - G - {GLYN} - R - [GACIVM]

 

DENISE LANDOLFI
studente
Re: Esercizi caratteristiche biochimiche
Replay #1 - 12/01/2010 12:58

La proteina è la DNA ligasi 1. Ha la funzione di catalizzare la chiusura di nick presenti nel DNA durante la replicazione, ricombinazione e riparazione.

peso molecolare 101736.1

coefficiente di estinzione 65945

dato che il punto isoelettrico è a 5,49 la proteina è acida

la proteina contiene due pattern:

EYKYDGQRA

EGLMVKtldvdat.YEiakrs.Hnwl..KLK

 

MONIA FRONZUTI
studente
Re: Esercizi caratteristiche biochimiche
Replay #1 - 12/01/2010 12:58

Trovare in Swissprot la proteina corrispondente all'identificativo DNLI1_HUMAN
1) Qual'è la funzione della proteina? La proteina è una DNA ligasi che interviene nella replicazione del DNA


2) Riportare peso molecolare e coefficiente di estinzione. Scrivere se la proteina è acida, basica o neutra. 

Peso molecolare: 101736.1 Da o 10.2 KDa

coefficiente di estinzione: 65945
La proteina è acida perchè il punto isoelettrico è 5.49

3) Fare una ricerca in Prosite e riportare i Pattern contenuti nella proteina.

EYKYDGQRA

EGLMVKtldvdat.YEiakrs.Hnwl..KLK

 

 

 

 

FRONZUTI MONIA

BARBATO LUCA

 

PATRIZIA CHERUBINI
studente
Re: Esercizi caratteristiche biochimiche
Replay #1 - 12/01/2010 12:59

Trovare in Swissprot la proteina corrispondente all'identificativo DNLI1_HUMAN
1) Qual'è la funzione della proteina?
2) Riportare peso molecolare e coefficiente di estinzione. Scrivere se la proteina è acida, basica o neutra.
3) Fare una ricerca in Prosite e riportare i Pattern contenuti nella proteina.

 

1)E' una DNA ligasi.

2) P.M.= 101736.1 Da;

Ext. coefficient    65945; 
p.I= 5.49 la proteina è acida

3) DNA ligasi A1 566-574 EYKYDGQRA
DNA ligasi A2 720-746 EGLMVKtldvdat.YEiakrs.Hnwl..KLK



ANGELA SANSONE

 

DANIELA MANDALARI
studente
Re: Esercizi caratteristiche biochimiche
Replay #1 - 12/01/2010 13:00

Trovare in Swissprot la proteina corrispondente all'identificativo DNLI1_HUMAN
1) Qual'è la funzione della proteina?
2) Riportare peso molecolare e coefficiente di estinzione. Scrivere se la proteina è acida, basica o neutra.
3) Fare una ricerca in Prosite e riportare i Pattern contenuti nella proteina.

1) ls proteina è una Dna ligasi e agisce nella replicazione.

2) peso molecolare 101736 coefficiente d'estinzione 65945 la proteina è acida.

3) DNA_LIGASE_A1 DNA_LIGASE_A2

 

Daniela Mandalari

Valentina Carbognani

 

FRANCESCO DIROMA
studente
Re: Esercizi caratteristiche biochimiche
Replay #1 - 12/01/2010 13:00

Trovare in Swissprot la proteina corrispondente all'identificativo DNLI1_HUMAN
1) Qual'è la funzione della proteina?

 DNA ligase I
 Polydeoxyribonucleotide synthase [ATP] 1


2) Riportare peso molecolare e coefficiente di estinzione. Scrivere se la proteina è acida, basica o neutra.

-101736 Da; 65945; acida perchè il punto isoelettrico è 5


3) Fare una ricerca in Prosite e riportare i Pattern contenuti nella proteina.

2 possibili patterns: EGLMVKtldvdat.YEiakrs.Hnwl..KLK ( DNA_LIGASE_A2)

                              EYKYDGQRA ( DNA_LIGASE_A1)

francesco e virginia

 

SIMONE LANDI
studente
Re: Esercizi caratteristiche biochimiche
Replay #1 - 12/01/2010 13:00

Trovare in Swissprot la proteina corrispondente all'identificativo DNLI1_HUMAN
1) Qual'è la funzione della proteina?
2) Riportare peso molecolare e coefficiente di estinzione. Scrivere se la proteina è acida, basica o neutra.
3) Fare una ricerca in Prosite e riportare i Pattern contenuti nella proteina.

1)DNA ligase that seals nicks in double-stranded DNA during DNA replication, DNA recombination and DNA repair.

2)peso molecolare:101736.1 coefficiente d'estinzione:65945
la proteina è:acida.
3)I 2 pattern sono: DNA_LIGASE_A1
DNA_LIGASE_A2
Filomena Nicolanna-Simone Landi

 

ELISA IRONI
studente
Re: Esercizi caratteristiche biochimiche
Replay #1 - 12/01/2010 13:01

Trovare in Swissprot la proteina corrispondente all'identificativo DNLI1_HUMAN


1) Qual'è la funzione della proteina?

DNA ligase that seals nicks in double-stranded DNA during DNA replication, DNA recombination and DNA repair.


2) Riportare peso molecolare e coefficiente di estinzione. Scrivere se la proteina è acida, basica o neutra.

Peso molecolare: 101736.1 Da 
Coefficiente di estinzione:65945
La proteina è acida.


3) Fare una ricerca in Prosite e riportare i Pattern contenuti nella proteina.

DNA_LIGASE_A1   ATP-dependent DNA ligase AMP-binding site:

[EDQH] - {K} - K - {VEDI} - [DN] - G - {GLYN} - R - [GACIVM]

DNA_LIGASE_A2   ATP-dependent DNA ligase signature 2 :

E - G - [LIVMA] - [LIVM] - [LIVMA] - [KR] - x(5,8) - [YW] - [QNEKTI] - x(2,6) - [KRH] - x(3,5) - K - [LIVMFY] - K

Ironi Elisa

Isufi Elda

 

IVANA GALLO
studente
Re: Esercizi caratteristiche biochimiche
Replay #1 - 12/01/2010 13:01

La DNA LIGASI è una proteina in grado di legarsi al DNA  a doppia elica durante la replicazione, ricombinazione e la riparazione del DNA.

Il pesa molecolare della proteina è di 101736.1 Da.

Il coefficiente di estinzione è di 65320.

La proteine risulta acida con un pI di 5.49

I pattern contenuti nella proteina sono 2.

 

 

ANTONELLA FALCONIERI
studente
Re: Esercizi caratteristiche biochimiche
Replay #2 - 12/01/2010 13:01

Trovare in Swissprot la proteina corrispondente all'identificativo DNLI1_HUMAN
1) Qual'è la funzione della proteina?
2) Riportare peso molecolare e coefficiente di estinzione. Scrivere se la proteina è acida, basica o neutra.
3) Fare una ricerca in Prosite e riportare i Pattern contenuti nella proteina.

1) La proteina è una DNA ligasi agisce durante la replicazione del DNA

2) peso molecolare 101736 dalton o 10,2 kDa

   coefficiente d'estinzione 65945

la proteina è acida perchè il punto isolelettrico è 5.

3) la proteina contiene 2 patterns: DNA ligasi A1 e DNA ligasi A2

falconieri antonella

 

ELISA RATTOTTI
studente
Re: Esercizi caratteristiche biochimiche
Replay #1 - 12/01/2010 13:02

Trovare in Swissprot la proteina corrispondente all'identificativo DNLI1_HUMAN
1) Qual'è la funzione della proteina?
2) Riportare peso molecolare e coefficiente di estinzione. Scrivere se la proteina è acida, basica o neutra.
3) Fare una ricerca in Prosite e riportare i Pattern contenuti nella proteina.

 

1) La proteina è una DNA ligasi

2) La proteina pesa 101736.1 Da, Il suo coefficiente di estinzione è 65945.

Il punto isoelettrico è di 5.49, proteina acida

3) Pattern: [EDQH] - {K} - K - {VEDI} - [DN] - G - {GLYN} - R - [GACIVM]

 

ALESSANDRA BIONDI
studente
Re: Esercizi caratteristiche biochimiche
Replay #1 - 12/01/2010 13:02

Trovare in Swissprot la proteina corrispondente all'identificativo DNLI1_HUMAN
1) Qual'è la funzione della proteina?
2) Riportare peso molecolare e coefficiente di estinzione. Scrivere se la proteina è acida, basica o neutra.
3) Fare una ricerca in Prosite e riportare i Pattern contenuti nella proteina.

1)La DNA ligasi si attacca alla forca replicativa permettendo l'apertura dei due filamenti e conseguentemente la ricombinazione e la riparazione.

2)Peso molecolare di 102 KDa 

   PI di 5.49

   Coefficiente di estinzione di 65945

   La proteina è acida.

3)E - G - [LIVMA] - [LIVM] - [LIVMA] - [KR] - x(5,8) - [YW] - [QNEKTI] - x(2,6) - [KRH] - x(3,5) - K - [LIVMFY] - K

 

[EDQH] - {K} - K - {VEDI} - [DN] - G - {GLYN} - R - [GACIVM]

 

Ilaria Azzini

Alessandra Biondi

 

 

 

 

DANIELE BULGARI
studente
Re: Esercizi caratteristiche biochimiche
Replay #1 - 12/01/2010 13:03

Trovare in Swissprot la proteina corrispondente all'identificativo DNLI1_HUMAN
1) Qual'è la funzione della proteina?

Dna ligasi che agisce durante la replicazione, la ricombinazione e la riparazione del DNA

2) Riportare peso molecolare e coefficiente di estinzione. Scrivere se la proteina è acida, basica o neutra.

101736 Dalton
65945 coefficente di estinzione

la proteina è acida perchè il punto isoelettrico è 5.49

3) Fare una ricerca in Prosite e riportare i Pattern contenuti nella proteina.

DNA_LIGASE_A1 e dna ligasi A2

 

Daniele Bulgari

 

BEATRICE MONTI
studente
Re: Esercizi caratteristiche biochimiche
Replay #2 - 12/01/2010 13:03

Trovare in Swissprot la proteina corrispondente all'identificativo DNLI1_HUMAN
1) Qual'è la funzione della proteina?
2) Riportare peso molecolare e coefficiente di estinzione. Scrivere se la proteina è acida, basica o neutra.
3) Fare una ricerca in Prosite e riportare i Pattern contenuti nella proteina.

 

 

1) DNA ligasi che agisce durante la replicazione,ricombinazione e riparazione DNA

2)peso molecolare= 101736.1 dalton

   coefficiente di estinzione= 65945

Theoretical pI: 5.49 ,quindi la proteina è acida.

3)pattern contenuti= 2 pattern, DNA ligasi A1 e DNA ligasi A2


Beatrice Monti,Alessia Verani.

 

VINCENZA SPECIALE
studente
Re: Esercizi caratteristiche biochimiche
Replay #3 - 28/05/2010 17:46

 

Trovare in Swissprot la proteina corrispondente all'identificativo DNLI1_HUMAN
1) Qual'è la funzione della proteina?
2) Riportare peso molecolare e coefficiente di estinzione. Scrivere se la proteina è acida, basica o neutra.
3) Fare una ricerca in Prosite e riportare i Pattern contenuti nella proteina.

 

 

1) DNA LIGASI che agisce durante la replicazione del DNA.

2) PESO MOLECOLARE= 101736.1

    COEFFICIENTE DI ESTINSIONE= 65945

    pI= 5.49, PROTEINA ACIDA

3) CI SONO 2 PATTERN

     DNA LIGASI A1

 

[EDQH] - {K} - K - {VEDI} - [DN] - G - {GLYN} - R - [GACIVM]

 

DNA LIGASI A2

  E - G - [LIVMA] - [LIVM] - [LIVMA] - [KR] - x(5,8) - [YW] - [QNEKTI] - x(2,6) - [KRH] - x(3,5) - K - [LIVMFY] - K

 

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