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Classe delle Lauree in Scienze Biologiche

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Forum > AB - Corso 2010/2011 (A-L) > Esercizio evoluzione

Autore

Intervento

Prof. Riccardo Percudani
docente

	Esercizio evoluzione	Rispondi
	19/10/2010 10:41	Invia email

Considerate le sequenze:

>HBB_HUMAN  - Homo sapiens
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKV
KAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGK
EFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
>HBA_GORGO - Gorilla gorilla
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGDYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAV
AHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKY
R
>HBB_MACRU Macropus rufus (Red kangaroo)
VHLTAEEKNAITSLWGKVAIEQTGGEALGRLLIVYPWTSRFFDHFGDLSNAKAVMGNPKV
LAHGAKVLVAFGDAIKNLDNLKGTFAKLSELHCDKLHVDPENFKLLGNIIVICLAEHFGK
EFTIDTQVAWQKLVAGVANALAHKYH

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla :
Homo - Macropus :
Macropus - Gorilla:

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?

ALEKSANDRA BONINI
studente

	Re: Esercizio evoluzione	Rispondi
	Replay #1 - 19/10/2010 12:56	Invia email

>HBB_HUMAN  - Homo sapiens
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKV
KAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGK
EFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
>HBA_GORGO - Gorilla gorilla
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGDYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAV
AHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKY
R
>HBB_MACRU Macropus rufus (Red kangaroo)
VHLTAEEKNAITSLWGKVAIEQTGGEALGRLLIVYPWTSRFFDHFGDLSNAKAVMGNPKV
LAHGAKVLVAFGDAIKNLDNLKGTFAKLSELHCDKLHVDPENFKLLGNIIVICLAEHFGK
EFTIDTQVAWQKLVAGVANALAHKYH

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla : 41%
Homo - Macropus : 74%
Macropus - Gorilla: 36%

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?

Sono geni paraloghi perchè non hanno seguito il processo di speciazione!

Bonini Aleksandra & Iacono Calogeraelisa

VALERIO FRANCESCO PISCITELLI
studente

	Re: Esercizio evoluzione	Rispondi
	Replay #1 - 19/10/2010 12:58	Invia email

Considerate le sequenze:

>HBB_HUMAN  - Homo sapiens
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKV
KAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGK
EFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
>HBA_GORGO - Gorilla gorilla
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGDYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAV
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R
>HBB_MACRU Macropus rufus (Red kangaroo)
VHLTAEEKNAITSLWGKVAIEQTGGEALGRLLIVYPWTSRFFDHFGDLSNAKAVMGNPKV
LAHGAKVLVAFGDAIKNLDNLKGTFAKLSELHCDKLHVDPENFKLLGNIIVICLAEHFGK
EFTIDTQVAWQKLVAGVANALAHKYH

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla : 74%
Homo - Macropus : 41%
Macropus - Gorilla: 36%

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?

sono ortologhi perchè la funzione è la stessa

CRISTINA ATTROTTO
studente

	Re: Esercizio evoluzione	Rispondi
	Replay #1 - 19/10/2010 12:58	Invia email

Considerate le sequenze:

>HBB_HUMAN  - Homo sapiens
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKV
KAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGK
EFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
>HBA_GORGO - Gorilla gorilla
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>HBB_MACRU Macropus rufus (Red kangaroo)
VHLTAEEKNAITSLWGKVAIEQTGGEALGRLLIVYPWTSRFFDHFGDLSNAKAVMGNPKV
LAHGAKVLVAFGDAIKNLDNLKGTFAKLSELHCDKLHVDPENFKLLGNIIVICLAEHFGK
EFTIDTQVAWQKLVAGVANALAHKYH

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla : 41%
Homo - Macropus :74%
Macropus - Gorilla:36%

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?

Sono paraloghi perchè Uomo e Gorilla sono vicini evolutivamente ma non dal punto di vista delle sequenze (scarsa somiglianza genica).

SOFIA CAVALLARI
studente

	Re: Esercizio evoluzione	Rispondi
	Replay #1 - 19/10/2010 12:58	Invia email

	Esercizio evoluzione	Rispondi
	19/10/2010 10:41	Invia email

Considerate le sequenze:

>HBB_HUMAN  - Homo sapiens
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKV
KAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGK
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>HBA_GORGO - Gorilla gorilla
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGDYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAV
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R
>HBB_MACRU Macropus rufus (Red kangaroo)
VHLTAEEKNAITSLWGKVAIEQTGGEALGRLLIVYPWTSRFFDHFGDLSNAKAVMGNPKV
LAHGAKVLVAFGDAIKNLDNLKGTFAKLSELHCDKLHVDPENFKLLGNIIVICLAEHFGK
EFTIDTQVAWQKLVAGVANALAHKYH

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla : 41%
Homo - Macropus : 74%
Macropus - Gorilla: 36%

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?I geni sono paraloghi perchè non seguono la stessa evoluzione della specie.

ROBERTA BRIGIDO
studente

	Re: Esercizio evoluzione	Rispondi
	Replay #1 - 19/10/2010 12:59	Invia email

	Esercizio evoluzione	Rispondi
	19/10/2010 10:41	Invia email

Considerate le sequenze:

>HBB_HUMAN  - Homo sapiens
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKV
KAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGK
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>HBA_GORGO - Gorilla gorilla
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>HBB_MACRU Macropus rufus (Red kangaroo)
VHLTAEEKNAITSLWGKVAIEQTGGEALGRLLIVYPWTSRFFDHFGDLSNAKAVMGNPKV
LAHGAKVLVAFGDAIKNLDNLKGTFAKLSELHCDKLHVDPENFKLLGNIIVICLAEHFGK
EFTIDTQVAWQKLVAGVANALAHKYH

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla : 41%
Homo - Macropus :74%
Macropus - Gorilla: 36%

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?

PARALOGHI, perchè c'è troppa somiglianza tra canguro e uomo, i quali non sono vicini nella storia evolutiva.

LEANDRA CANZONERI
studente

	Re: Esercizio evoluzione	Rispondi
	Replay #1 - 19/10/2010 12:59	Invia email

Considerate le sequenze:

>HBB_HUMAN  - Homo sapiens
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKV
KAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGK
EFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
>HBA_GORGO - Gorilla gorilla
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGDYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAV
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>HBB_MACRU Macropus rufus (Red kangaroo)
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EFTIDTQVAWQKLVAGVANALAHKYH

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla : 41%
Homo - Macropus : 74%
Macropus - Gorilla: 36%

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?

paraloghi; non seguono la filogenesi degli organismi.

ANNALISA BRUNO

LEANDRA CANZONERI

LAURA CHIAPPONI

EMANUELE FERRARI

ALESSIA CAPETTA
studente

	Re: Esercizio evoluzione	Rispondi
	Replay #1 - 19/10/2010 13:00	Invia email

>HBB_HUMAN  - Homo sapiens
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKV
KAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGK
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>HBA_GORGO - Gorilla gorilla
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGDYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAV
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>HBB_MACRU Macropus rufus (Red kangaroo)
VHLTAEEKNAITSLWGKVAIEQTGGEALGRLLIVYPWTSRFFDHFGDLSNAKAVMGNPKV
LAHGAKVLVAFGDAIKNLDNLKGTFAKLSELHCDKLHVDPENFKLLGNIIVICLAEHFGK
EFTIDTQVAWQKLVAGVANALAHKYH

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla :41%
Homo - Macropus :74%
Macropus - Gorilla:36%

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?le sequenze sono paraloghe perchè non seguono la filogenesi degli organismi.

GIULIA GIANNINI
studente

	Re: Esercizio evoluzione	Rispondi
	Replay #1 - 19/10/2010 13:00	Invia email

Esercizio evoluzione Rispondi

19/10/2010 10:41 Invia email

Considerate le sequenze:

>HBB_HUMAN - Homo sapiens
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKV
KAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGK
EFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
>HBA_GORGO - Gorilla gorilla
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGDYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAV
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>HBB_MACRU Macropus rufus (Red kangaroo)
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LAHGAKVLVAFGDAIKNLDNLKGTFAKLSELHCDKLHVDPENFKLLGNIIVICLAEHFGK
EFTIDTQVAWQKLVAGVANALAHKYH

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla :41%
Homo - Macropus :74%
Macropus - Gorilla:57%

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?

L' uomo e il gorilla differiscono in percentuale maggiore rispetto agli altri. I geni sono paraloghi perchè non rispecchiano la filogenesi degli organismi in quanto l'uomo è un discendente del gorilla

MATTHIAS BOZZA
studente

	Re: Esercizio evoluzione	Rispondi
	Replay #1 - 19/10/2010 13:00	Invia email

Considerate le sequenze:

>HBB_HUMAN  - Homo sapiens
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKV
KAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGK
EFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
>HBA_GORGO - Gorilla gorilla
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGDYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAV
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>HBB_MACRU Macropus rufus (Red kangaroo)
VHLTAEEKNAITSLWGKVAIEQTGGEALGRLLIVYPWTSRFFDHFGDLSNAKAVMGNPKV
LAHGAKVLVAFGDAIKNLDNLKGTFAKLSELHCDKLHVDPENFKLLGNIIVICLAEHFGK
EFTIDTQVAWQKLVAGVANALAHKYH

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla : 41%
Homo - Macropus : 74%
Macropus - Gorilla: 36%

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo? Sono paraloghi perchè non seguono la filogenesi che ci aspetteremmo pensando al fatto che il gorilla è un placentato mentre il canguro è un marsupiale. Questo è in accordo col fatto che del gorilla è presa in considerazione la catena alfa dell'emoglobina rispetto alla beta degli altri due.

Biasini Beatrice

Bersellini Farinotti Alex

TOMMASO LIUZZI
studente

	Re: Esercizio evoluzione	Rispondi
	Replay #1 - 19/10/2010 13:00	Invia email

>HBB_HUMAN  - Homo sapiens
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKV
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>HBA_GORGO - Gorilla gorilla
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>HBB_MACRU Macropus rufus (Red kangaroo)
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EFTIDTQVAWQKLVAGVANALAHKYH

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla : 41%
Homo - Macropus :74%
Macropus - Gorilla:36%

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?

Sono paraloghi poichè non seguono la filogenesi, evidenziati dalle maggiori somiglianze tra uomo e canguro piuttosto che tra uomo e gorilla (due primati).

Antonio Candela
studente

	Re: Esercizio evoluzione	Rispondi
	Replay #2 - 19/10/2010 13:01	Invia email

74% homo sapiens / macru

41% homo sapiens / gorgo

sono paraloghi poichè i dati non sono in accordo con la filogenesi evolutiva

NICOLAS CLEMENTE
studente

	Re: Esercizio evoluzione	Rispondi
	Replay #1 - 19/10/2010 13:01	Invia email

Considerate le sequenze:

>HBB_HUMAN  - Homo sapiens
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKV
KAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGK
EFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
>HBA_GORGO - Gorilla gorilla
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGDYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAV
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>HBB_MACRU Macropus rufus (Red kangaroo)
VHLTAEEKNAITSLWGKVAIEQTGGEALGRLLIVYPWTSRFFDHFGDLSNAKAVMGNPKV
LAHGAKVLVAFGDAIKNLDNLKGTFAKLSELHCDKLHVDPENFKLLGNIIVICLAEHFGK
EFTIDTQVAWQKLVAGVANALAHKYH

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla : 41%
Homo - Macropus : 74%
Macropus - Gorilla: 36%

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?

Paraloghi perchè non rispetta la storia evolutiva degli organismi.

PAOLO ABONDIO
studente

	Re: Esercizio evoluzione	Rispondi
	Replay #1 - 19/10/2010 13:01	Invia email

Considerate le sequenze:

>HBB_HUMAN  - Homo sapiens
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKV
KAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGK
EFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
>HBA_GORGO - Gorilla gorilla
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGDYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAV
AHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKY
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>HBB_MACRU Macropus rufus (Red kangaroo)
VHLTAEEKNAITSLWGKVAIEQTGGEALGRLLIVYPWTSRFFDHFGDLSNAKAVMGNPKV
LAHGAKVLVAFGDAIKNLDNLKGTFAKLSELHCDKLHVDPENFKLLGNIIVICLAEHFGK
EFTIDTQVAWQKLVAGVANALAHKYH

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla : 41%
Homo - Macropus : 74%
Macropus - Gorilla: 36%

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo? Deduciamo che i geni possano essere paraloghi perché osserviamo che non vi è una corrispondenza tra l'evoluzione del gene considerato e l'evoluzione delle specie.

ANDREA BERTINELLI
studente

	Re: Esercizio evoluzione	Rispondi
	Replay #1 - 19/10/2010 13:01	Invia email

Considerate le sequenze:

>HBB_HUMAN  - Homo sapiens
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKV
KAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGK
EFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
>HBA_GORGO - Gorilla gorilla
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGDYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAV
AHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKY
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>HBB_MACRU Macropus rufus (Red kangaroo)
VHLTAEEKNAITSLWGKVAIEQTGGEALGRLLIVYPWTSRFFDHFGDLSNAKAVMGNPKV
LAHGAKVLVAFGDAIKNLDNLKGTFAKLSELHCDKLHVDPENFKLLGNIIVICLAEHFGK
EFTIDTQVAWQKLVAGVANALAHKYH

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla :41%
Homo - Macropus :74%
Macropus - Gorilla:36%

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?

PARALOGHI PERCHE' NON SEGUONO LA FILOGENESI DEGLI ORGANISMI

SILVIA GHISONI
studente

	Re: Esercizio evoluzione	Rispondi
	Replay #1 - 19/10/2010 13:02	Invia email

Considerate le sequenze:

>HBB_HUMAN  - Homo sapiens
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKV
KAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGK
EFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
>HBA_GORGO - Gorilla gorilla
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGDYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAV
AHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKY
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>HBB_MACRU Macropus rufus (Red kangaroo)
VHLTAEEKNAITSLWGKVAIEQTGGEALGRLLIVYPWTSRFFDHFGDLSNAKAVMGNPKV
LAHGAKVLVAFGDAIKNLDNLKGTFAKLSELHCDKLHVDPENFKLLGNIIVICLAEHFGK
EFTIDTQVAWQKLVAGVANALAHKYH

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla : 41%
Homo - Macropus :74%
Macropus - Gorilla:36%

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?

I geni del gorilla e uomo sono paraloghi perchè sono geni derivanti da duplicazione genica, mentre i geni del canguro con gorilla sono ortologhi in quanto rispecchiano la storia evolutiva.

Prof. Riccardo Percudani
docente

	Re: Esercizio evoluzione	Rispondi
	Replay #1 - 19/10/2010 13:02	Invia email

Considerate le sequenze:

>HBB_HUMAN  - Homo sapiens
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKV
KAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGK
EFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
>HBA_GORGO - Gorilla gorilla
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGDYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAV
AHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKY
R
>HBB_MACRU Macropus rufus (Red kangaroo)
VHLTAEEKNAITSLWGKVAIEQTGGEALGRLLIVYPWTSRFFDHFGDLSNAKAVMGNPKV
LAHGAKVLVAFGDAIKNLDNLKGTFAKLSELHCDKLHVDPENFKLLGNIIVICLAEHFGK
EFTIDTQVAWQKLVAGVANALAHKYH

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla : 41%
Homo - Macropus : 74%
Macropus - Gorilla: 36%

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?

A prima vista ci aspetteremmo una maggiore identità tra uomo e gorilla, cosa che invece non viene confermata dalla percentuale basata su dati genetici. La maggiore identità la otteniama tra uomo e canguro il che ci indica un maggior periodo di identità genetica di tale gene rispetto al gorilla

ILARIA BOTRUGNO
studente

	Re: Esercizio evoluzione	Rispondi
	Replay #1 - 19/10/2010 13:02	Invia email

Considerate le sequenze:

>HBB_HUMAN  - Homo sapiens
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKV
KAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGK
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>HBA_GORGO - Gorilla gorilla
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGDYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAV
AHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKY
R
>HBB_MACRU Macropus rufus (Red kangaroo)
VHLTAEEKNAITSLWGKVAIEQTGGEALGRLLIVYPWTSRFFDHFGDLSNAKAVMGNPKV
LAHGAKVLVAFGDAIKNLDNLKGTFAKLSELHCDKLHVDPENFKLLGNIIVICLAEHFGK
EFTIDTQVAWQKLVAGVANALAHKYH

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla :41%
Homo - Macropus :74%
Macropus - Gorilla:36%

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?i geni sono paraloghi perchè notiamo che la percentuale di identità tra Homo e Gorilla è più bassa rispetto a quella tra Homo e Macropus.

GAIA BERANTI
studente

	Re: Esercizio evoluzione	Rispondi
	Replay #1 - 19/10/2010 13:02	Invia email

Considerate le sequenze:

>HBB_HUMAN  - Homo sapiens
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKV
KAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGK
EFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
>HBA_GORGO - Gorilla gorilla
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGDYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAV
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>HBB_MACRU Macropus rufus (Red kangaroo)
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1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla :41%
Homo - Macropus :74%
Macropus - Gorilla:36%

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo? Ortologhi, perchè rispecchia la storia evolutiva

ROBERTA DE GIOIA
studente

	Re: Esercizio evoluzione	Rispondi
	Replay #1 - 19/10/2010 13:03	Invia email

>HBB_HUMAN  - Homo sapiens
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KAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGK
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>HBA_GORGO - Gorilla gorilla
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>HBB_MACRU Macropus rufus (Red kangaroo)
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1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla :41%
Homo - Macropus :74%
Macropus - Gorilla:36%

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?sono paraloghi perchè non rispettano la storia evolutiva degli organismi

SARA DALLA GHIRARDA
studente

	Re: Esercizio evoluzione	Rispondi
	Replay #1 - 19/10/2010 13:03	Invia email

>HBB_HUMAN  - Homo sapiens
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKV
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>HBA_GORGO - Gorilla gorilla
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>HBB_MACRU Macropus rufus (Red kangaroo)
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1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla :74%
Homo - Macropus :41%
Macropus - Gorilla:36%

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?

paralogo perchè non segue la filogenesi degli organismi

ILARIA BOTRUGNO
studente

	Re: Esercizio evoluzione	Rispondi
	Replay #1 - 19/10/2010 13:03	Invia email

Considerate le sequenze:

>HBB_HUMAN  - Homo sapiens
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKV
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>HBA_GORGO - Gorilla gorilla
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>HBB_MACRU Macropus rufus (Red kangaroo)
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1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla :41%
Homo - Macropus :74%
Macropus - Gorilla:36%

Rossana Italiano

Ilaria Botrugno

ALESSIA RITA PUCE
studente

	Re: Esercizio evoluzione	Rispondi
	Replay #2 - 19/10/2010 13:26	Invia email

>HBB_HUMAN  - Homo sapiens
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKV
KAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGK
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>HBA_GORGO - Gorilla gorilla
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AHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKY
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>HBB_MACRU Macropus rufus (Red kangaroo)
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LAHGAKVLVAFGDAIKNLDNLKGTFAKLSELHCDKLHVDPENFKLLGNIIVICLAEHFGK
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1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla :41%
Homo - Macropus :74%
Macropus - Gorilla:36%

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo? sono paraloghi perchè l'uomo e il gorilla sono vicini evolutivmente. alessia rita puce & elena iervasi

ROSSELLA BONAFEDE
studente

	Re: Esercizio evoluzione	Rispondi
	Replay #3 - 19/10/2010 13:50	Invia email

Considerate le sequenze:

>HBB_HUMAN - Homo sapiens
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKV
KAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGK
EFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
>HBA_GORGO - Gorilla gorilla
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGDYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAV
AHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKY
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>HBB_MACRU Macropus rufus (Red kangaroo)
VHLTAEEKNAITSLWGKVAIEQTGGEALGRLLIVYPWTSRFFDHFGDLSNAKAVMGNPKV
LAHGAKVLVAFGDAIKNLDNLKGTFAKLSELHCDKLHVDPENFKLLGNIIVICLAEHFGK
EFTIDTQVAWQKLVAGVANALAHKYH

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla :41%
Homo - Macropus :74%
Macropus - Gorilla:36%

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?

date le percentueli possiamo dedurre che i geni siano paraloghi,poichè tra di loro riscontriamo una minore affinità.

Ci sorprende la percentuale relativa all'Homo - Gorilla in quanto visto il legame evolutivo ci saremmo aspettate una percentuale maggiore, che notiamo nel rapporto tra Homo- Macropus.

Rossella Bonafede & Rossella Impiccichè

ELISABETTA BERTINO
studente

	Re: Esercizio evoluzione	Rispondi
	Replay #4 - 19/10/2010 21:54	Invia email

Considerate le sequenze:

>HBB_HUMAN  - Homo sapiens
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKV
KAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGK
EFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
>HBA_GORGO - Gorilla gorilla
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGDYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAV
AHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKY
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>HBB_MACRU Macropus rufus (Red kangaroo)
VHLTAEEKNAITSLWGKVAIEQTGGEALGRLLIVYPWTSRFFDHFGDLSNAKAVMGNPKV
LAHGAKVLVAFGDAIKNLDNLKGTFAKLSELHCDKLHVDPENFKLLGNIIVICLAEHFGK
EFTIDTQVAWQKLVAGVANALAHKYH

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla : 41%
Homo - Macropus : 74%
Macropus - Gorilla: 36%

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?

I geni dell'uomo e del gorilla sono paraloghi perchè, nonostante appartengano a due specie vicine dal punto di vista evolutivo, non presentano molte omologie e svolgono funzioni diverse. I geni dell'uomo e del canguro sono ortologhi perchè presentano forti omologie e svolgono la stessa funzione.