| Autore | Intervento |
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 Prof. Riccardo Percudani
docente |
Trovare l'omologo più significativo in Homo sapiens della proteina di fungo XP_001396522.
Riportare:
% di somiglianza e significatività del Blast
% di somiglianza e di identità dell'allineamento globale (needle)
% di somiglianza e di identità dell'allineamento locale (water)
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PIETRO CRAVEDI
studente |
Omologo più significativo: membro 2 della famiglia delle nitrilasi
Blast:
E=4e-15
somiglianza= 45%
needle (globale):
identità= 13,1%
somiglianza= 54,6%
water (locale):
identità= 25,7%
somiglianza= 46,2%
Somiglianza Locale
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ALESSIA MARMORINO
studente |
Trovare l'omologo più significativo in Homo sapiens della proteina di fungo XP_001396522.
Riportare:
% di somiglianza e significatività del Blast
% di somiglianza e di identità dell'allineamento globale (needle)
% di somiglianza e di identità dell'allineamento locale (water)
1)è significativa in Blast in quanto E= 4e-15
2)Identity: 79/601 (13.1%)
Similarity: 145/601 (24.1%)
Gaps: 328/601 (54.6%)
Score: 221.5
3)Identity: 74/288 (25.7%)
Similarity: 133/288 (46.2%)
Gaps: 47/288 (16.3%)
Score: 235.5
4)tra le due sequenze la somiglianza è locale è verificabile notando che i valori si discostano di molto.
infatti sia l'identità che lo score sono aumentati in modo significativo.
francesco diroma e alessia marmorino.
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DENISE LANDOLFI
studente |
1) la proteina omologa dell'uomo più significativa è membro della famiglia delle nitrilasi (E= 4e-15)
somiglianza del blast:
Identities = 73/290 (25%), Positives = 133/290 (45%)
2)Allineamento globale:
Identity: 79/601 (13.1%)
Similarity: 145/601 (24.1%)
3)Allineamento locale:
Identity: 74/288 (25.7%)
Similarity: 133/288 (46.2%)
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IVANA GALLO
studente |
La significatività ricavata con Blast è di : 4e-15.
La percentuale di somiglianza è del 45 %.
La percentuale globale di identità è di 13,1%.
La percentuale globale di somiglianza è di 24,1%.
La percentuale locale di identità è di 25,7%.
La percentuale locale di somiglianza è del 46,2%.
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GIADA MONICA
studente |
Trovare l'omologo più significativo in Homo sapiens della proteina di fungo XP_001396522.
Riportare:
% di somiglianza e significatività del Blast
% di somiglianza e di identità dell'allineamento globale (needle)
% di somiglianza e di identità dell'allineamento locale (water)
significatibilità blast E= 4e-15
needle somiglianza= 24.1% identità= 13.1%
water somiglianza= 46,2% identità=25.7%
La somiglianza è locale.
Monica Giada
Aliani Chiara
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CHRISTIAN BOZZETTI
studente |
Significatività Blast : E=4e-15
Needle Somiglianza 24.1%
Identità 13.1%
Water Somiglianza 46.2%
Identità 25.7%
Somiglianza locale
Christian Bozzetti, Daniele Bulgari
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LUCA BARBATO
studente |
Trovare l'omologo più significativo in Homo sapiens della proteina di fungo XP_001396522.
Riportare:
% di somiglianza e significatività del Blast E=4e-15
% di somiglianza e di identità dell'allineamento globale (needle)
Identity: 79/601 (13.1%)
Similarity: 145/601 (24.1%)
% di somiglianza e di identità dell'allineamento locale (water)
Identity: 74/288 (25.7%)
Similarity: 133/288 (46.2%)
La somiglianza tra le 2 sequenze è LOCALE
LUCA BARBATO
MONIA FRONZUTI
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SERENA MONTALBANO
studente |
significatività: E=4e-15
Needle identità:13,1%
somiglianza: 26,1%
Water identità 25,7%
somiglianza 46,2%
La somiglianza è locale perchè i valori si discostano molto l'uno rispetto all'altro.
Serena Montalbano
Enza Valentina Caruso
Chiara Lazzarini
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GIULIANA CIRILLO
studente |
La % di somiglianza del Blast è: Positives = 133/290 (45%)
La significatività (E) è di 2e-20
Allineamento globale Identity: 79/601 (13.1%)
Similarity: 145/601 (24.1%)
Score: 221.5
Allineamento locale
Identity: 74/288 (25.7%)
Similarity: 133/288 (46.2%)
Score: 235.5
Somiglianza locale
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GABRIELLA COTTONE
studente |
La significatività ricavata con Blast è di : 4e-15.
La percentuale di somiglianza è del 45 %.
La percentuale globale di identità è di 13,1%.
La percentuale globale di somiglianza è di 24,1%.
La percentuale locale di identità è di 25,7%.
La percentuale locale di somiglianza è del 46,2%.
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LUCA GARGIULO
studente |
Significatività Blast: E= 4e-15
Needle Somiglianza: 24.1%
Identità: 13.1%
Water Somiglianza: 46.2%
Identità: 25.7%
La somiglianza è locale
GARGIULO LUCA
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SILVIA MIATELLO
studente |
Trovare l'omologo più significativo in Homo sapiens della proteina di fungo XP_001396522.
Riportare:
1) % di somiglianza e significatività del Blast
somiglianza: 133/290 (45%) e la significatività è di 2e-20
2) % di somiglianza e di identità dell'allineamento globale (needle)
la somiglianza è del 145/601 (24.1%) e l'identità è del 79/601 (13.1%)
3) % di somiglianza e di identità dell'allineamento locale (water)
la somiglianza è del 74/288 (25.7%) e l'identità è del 133/288 (46.2%)
La somiglianza è quindi locale.
Silvia Miatello
Thekla Leone
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DENISE LANDOLFI
studente |
1) la proteina omologa dell'uomo più significativa è membro della famiglia delle nitrilasi (E= 4e-15)
somiglianza del blast:
Identities = 73/290 (25%), Positives = 133/290 (45%)
2)Allineamento globale:
Identity: 79/601 (13.1%)
Similarity: 145/601 (24.1%)
3)Allineamento locale:
Identity: 74/288 (25.7%)
Similarity: 133/288 (46.2%)
Somiglianza locale
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ERJOLA DJALA
studente |
La significatività ricavata con Blast è di : 4e-15.
La percentuale di somiglianza è del 45 %.
La percentuale globale di identità è di 13,1%.
La percentuale globale di somiglianza è di 24,1%.
La percentuale locale di identità è di 25,7%.
La percentuale locale di somiglianza è del 46,2%.
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PATRIZIA CHERUBINI
studente |
% di somiglianza e significatività del Blast: E= 4e-15
% di somiglianza e di identità dell'allineamento globale (needle) blosum62
Identity: (13.1%)
Similarity: (24.1%)
% di somiglianza e di identità dell'allineamento locale (water) blosum62
Identity: 74/288 (25.7%)
Similarity: 133/288 (46.2%)
Patrizia Cherubini
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STELLA LO BARCO
studente |
La % di somiglianza del Blast è: Positives = 133/290 (45%)
La significatività (E) è di 2e-20
Allineamento globale
Identity: 79/601 (13.1%)
Similarity: 145/601 (24.1%)
Score: 221.5
Allineamento locale
Identity: 74/288 (25.7%)
Similarity: 133/288 (46.2%)
Score: 235.5
Somiglianza locale
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DANIELA MANDALARI
studente |
Trovare l'omologo più significativo in Homo sapiens della proteina di fungo XP_001396522.
Riportare:
% di somiglianza e significatività del Blast
% di somiglianza e di identità dell'allineamento globale (needle)
% di somiglianza e di identità dell'allineamento locale (water)
significatività in blast 4e-15.
globale %identità: 79/601 (13.1%)
% somiglianza: 145/601 (24.1%)
locale % identità: 74/288 (25.7%)
% somiglianza: 133/288 (46.2%)
l'allineamento è locale.
Daniela Mandalari Valentina Carbognani
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VANESSA CATALDI
studente |
1- l expect (E) corrisponde a 4e- 15
2- identità= 13.1% somiglianza=24,1%
3-somiglianza locale=46,2%
identità locale= 25,7%
la somiglianza è locale
vanessa cataldi e simone landi
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AMBRA DONDI
studente |
1. Blast
Valore E: 4*10^-15 (valore significativo)
Positives (somiglianza) = 133/290 (45%)
3. Allineamento locale
Identity: 74/288 (25.7%)
Similarity: 133/288 (46.2%)
Gaps: 47/288 (16.3%)
Score: 235.5
2. Allineamento globale
Identity: 79/601 (13.1%)
Similarity: 145/601 (24.1%)
Gaps: 328/601 (54.6%)
Score: 221.5
somiglianza locale
Ambra Dondi, Virginia Ingrosso
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ANTONELLA FALCONIERI
studente |
1) significatività : 4e-15
2) GLOBALE :% di identità 13,1
% di somiglianza 24,1
3) LOCALE : % di identità 25,7
% di somiglianza 46,2
DAI RISULTATI SI EVINCE CHE BISOGNA CONDURRE UN ALLINEAMENTO LOCALE.
FALCONIERI ANTONELLA
FERRARI VALENTINA
UGHINI ELISA
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SILVIA LAZZERINI
studente |
%somiglianza e significatività del blast: 4e-15
% di somiglianza e di identità dell'allineamento globale (needle):
-IDENTITà:13.1%
-SOMIGLIANZA:24.1%
% di somiglianza e di identità dell'allineamento locale (water):
-IDENTITà:25.7%
-SOMIGLIANZA:46.2%
La somiglianza è locale, aumenta la somiglianza e lo score.
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SILVIA GUGLIERI
studente |
Trovare l'omologo più significativo in Homo sapiens della proteina di fungo XP_001396522.
Riportare:
% di somiglianza e significatività del Blast
% di somiglianza e di identità dell'allineamento globale (needle)
% di somiglianza e di identità dell'allineamento locale (water)
Omologo in Homo sapiens: famiglia delle nitrilasi
1_ Somiglianza 133/290 (45%)
Significatività 2e-20
2_ Somiglianza: 145/601 (24,1%)
Identità: 79/601 (13,1%)
3_ Somiglianza: 133/288 (46,2%)
Identità: 74/288 (25,7%)
Somiglianza locale
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CHIARA CORUZZI
studente |
Trovare l'omologo più significativo in Homo sapiens della proteina di fungo XP_001396522.
Riportare:
% di somiglianza 23.6%
significatività del Blast E= 4e-15
% di somiglianza e di identità dell'allineamento globale (needle)
Identity: 78/601 (13.0%)
Similarity: 142/601 (23.6%)
% di somiglianza e di identità dell'allineamento locale (water)
Identity: 74/288 (25.7%)
Similarity: 133/288 (46.2%)
la somoglianza è locale
martina inoretti
martina grecch
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VERONICA BELLONI
studente |
Significatività del Blast: E=4e-15
Somiglianza: 45%
Globale:
Identità: 13.1%
Somiglianza:54.6%
Locale:
Identità: 25.7%
Somiglianza:46.2%
Sono evidenti le differenze tra Allineamento Locale e Globale, si individuano somiglianze locali.
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ILARIA CLARIZIO
studente |
%somiglianza e significatività del blast: 4e-15
% di somiglianza e di identità dell'allineamento globale (needle):
-IDENTITà:13.1%
-SOMIGLIANZA:24.1%
% di somiglianza e di identità dell'allineamento locale (water):
-IDENTITà:25.7%
-SOMIGLIANZA:46.2%
La somiglianza è locale, aumenta la somiglianza e lo score.
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JACOPO SACQUEGNO
studente |
1) significatività Blast: 4e-15
2) needle: somiglianza: 24,1%
identità: 13,1%
2) water: somiglianza: 4621%
identità: 27,5%
Jacopo Sacquegno
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NICOLANNA FILOMENA
studente |
1) La percentuale di somiglianza per blast è del 45% con significativita
2e-20
2)la somiglianza 24.1%)identità 13.1% per allineamento globale
3)la somiglianza è di 46.6% e identità 25.7% per allineamento locale
canzoneri- filomena
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FABIO PERINI
studente |
Significatività in Blast: 4e-15
Somiglianza % in Blast: 45%
Allineamento globale:
# Identity: 79/601 (13.1%)
# Similarity: 145/601 (24.1%)
Allineamento locale:
Identity: 74/288 (25.7%)
# Similarity: 133/288 (46.2%)
Essendo i risultati tra allineamento globale e locale molto diversi,
deduciamo che la somiglianza è locale.
Fabio Perini, Elisa Ambroggi, Beatrice Dosi
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ALESSIA CAPETTA
studente |
locale: Identity: 74/288 (25.7%)
# Similarity: 133/288 (46.2%)
# Gaps: 47/288 (16.3%)
# Score: 235.5
globale: Identity: 79/601 (13.1%)
# Similarity: 145/601 (24.1%)
# Gaps: 328/601 (54.6%)
# Score: 221.5
E=2e-20
La significatività è locale.
A.CAPETTA M.DANIELI
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ALESSIA VERANI
studente |
Trovare l'omologo più significativo in Homo sapiens della proteina di fungo XP_001396522.
Riportare:
% di somiglianza e significatività del Blast
% di somiglianza e di identità dell'allineamento globale (needle)
% di somiglianza e di identità dell'allineamento locale (water)
1) % somiglianza= 45% significatività= 4e-15
2) % identità= 13.1% %somiglianza= 24,1%
3) % identità = 25.7% % somiglianza= 46.2%
Alessia Verani,Beatrice Monti,Caterina Ghielmi
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MARIA CARLA GERRA
studente |
identità 13.1%
somiglianza 24%
gaps 54.6% score 221.5
maria carla gerra
micol gilberti
alessandra bettuzzi
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VERONICA BELLONI
studente |
Significatività del Blast: E=4e-15
Somiglianza: 45%
Globale:
Identità: 13.1%
Somiglianza:54.6%
Locale:
Identità: 25.7%
Somiglianza:46.2%
Sono evidenti le differenze tra Allineamento Locale e Globale, si individuano somiglianze locali.
VERONICA BELLONI VALENTINA ALBERICI
|
FEDERICA CASSINELLI
studente |
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1) identità BLAST 25%
somiglianza BLAST 45%
2) Allineamento globale
identità: 13.1%
somiglianza: 24.1%
3) Allinemento locale
identità: 25.7%
somiglianza: 46.2%
Siccome le differenze tra allinemento locale e globale sono evidenti le
somiglianze sono locali.
Federica Cassinelli Maria Chiara Guidone
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LUDOVICA LEZZI
studente |
Trovare l'omologo più significativo in Homo sapiens della proteina di fungo XP_001396522.
Riportare:
% di somiglianza e significatività del Blast= E:4e-15
% di somiglianza e di identità dell'allineamento globale (needle)
=identità:13%/similarità:24%
locale: identità 26%, similarità:46,2%
La somiglianza tra le due sequenze è locale.
Lezzi Ludovica
Pasquini Chiara
Botrugno Ilaria
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OLGA CHIESA
studente |
Trovare l'omologo più significativo in Homo sapiens della proteina di fungo XP_001396522.
la proteina omologa dell'uomo più significativa è membro della famiglia delle nitrilasi (E= 4e-15)
Riportare:
% di somiglianza e significatività del Blast
Identities = 73/290 (25%), Positives = 133/290 (45%)
% di somiglianza e di identità dell'allineamento globale (needle)
Allineamento globale:
Identity: 79/601 (13.1%)
Similarity: 145/601 (24.1%)
% di somiglianza e di identità dell'allineamento locale (water)
Allineamento locale:
Identity: 74/288 (25.7%)
Similarity: 133/288 (46.2%)
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