| Autore | Intervento |
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 Prof. Riccardo Percudani
docente |
Considerate le sequenze:
>HBB_HUMAN - Homo sapiens
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKV
KAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGK
EFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
>HBA_pongo - Pongo pygmaeus
MVLSPADKTNVKTAWGKVGAHAGDYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDL
SHGSAQVKDHGKKVADALTNAVAHVDDMPNALSALSDL
HAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTP
AVHASLDKFLASVSTVLTSKYR
>HBB_MACRU Macropus rufus (Red kangaroo)
VHLTAEEKNAITSLWGKVAIEQTGGEALGRLLIVYPWTSRFFDHFGDLSNAKAVMGNPKV
LAHGAKVLVAFGDAIKNLDNLKGTFAKLSELHCDKLHVDPENFKLLGNIIVICLAEHFGK
EFTIDTQVAWQKLVAGVANALAHKYH
1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Pongo :
Homo - Macropus :
Macropus - Pongo:
2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?
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MATTIA AGOSTI
studente |
1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Pongo : 41%
Homo - Macropus :74%
Macropus - Pongo:36%
2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?
A livello di identità c'è più differenza tra Homo e Pongo che tra Homo e Macropus.
Deduco che i geni siano paraloghi perchè non si sono separati seguendo la filogenesi della specie (in quanto a livello filogenico l'Homo è più vicino al Pongo).
Agosti Mattia, Pezzoni Fabio.
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MARIA CARLA TERESI
studente |
1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Pongo : 41%
Homo - Macropus :74%
Macropus - Pongo:36%
2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?
I geni sono paraloghi perchè le identità tra le sequenze risultano basse quindi é molto probabile che i geni abbiano seguito vie evolutive diverse
Sammartano Antonino
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CLAUDIA ROMANELLI
studente |
1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Pongo : 41%
Homo - Macropus :74%
Macropus - Pongo:36%
2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?
Nonostante Homo e Pongo siano molto vicini filogeneticamente,l'evoluzione dei geni non ha seguito l'evoluzione della specie,data la minore percentuale (41%) di identità dei geni rispetto a quella tra Homo e Macropus(74%) . Per questo motivo sono presenti geni paraloghi.
Claudia Romanelli
Davide Sarra
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MICHELE PASTORELLI
studente |
1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Pongo : 41%
Homo - Macropus : 74%
Macropus - Pongo: 36%
2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?
Le sequenze di uomo e orango sono molto differenti tra loro nonostante la stretta vicinanza filogenetica delle due specie, mentre quelle di canguro e orango sono più simile nonostante siano specie imparentate in modo più distante; è possibile dunque che il gene di P. pygmaeus abbia seguito un altro percorso evolutivo rispetto a quello della specie.
Jacopo Sacquegno
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ELISA RATTOTTI
studente |
Homo - Pongo : 41%
Homo - Macropus : 74%
Macropus - Pongo: 36%
In questo gruppo ci sono geni paraloghi perchè non si sono separati seguendo la filogenesi delle specie
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ELISA UGHINI
studente |
1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Pongo : 41%
Homo - Macropus : 74%
Macropus - Pongo: 36%
2) Pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?
Sono geni paraloghi, perchè hanno una bassa identità. Dai dati si nota che l'uomo è più simile al canguro, ma è piu vicino filologicamente al Pongo quindi i geni derivano da eventi di duplicazione genica.
Elisa Ughini
Elena Ronda
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LUCA STRAGLIATI
studente |
1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Pongo : 41%
Homo - Macropus : 74%
Macropus - Pongo: 36%
2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?
I geni dell' emoglobina alfa (Pongo) e beta (Homo e Macropus) sono paraloghi fra loro , in quanto le percentuali di identità fra le sequenze suggeriscono un evento di duplicazione genica. I geni delle catene beta di Homo e Macropus sono ortologhi, avendo un 74% di identità. Probabilmente è avvenuto un evento di speciazione fra i geni di Homo e Macropus successivo alla duplicazione genica fra i geni delle catene alfa e beta.
Alice Salviati
Adriana Vitiello
Luca Stragliati
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ESTER OLIVA
studente |
HBB_HUMAN - HBB_MACRU 74 %
HBB_HUMAN - HBA_pongo 41 %
HBA_pongo - HBB_MACRU 36 %
Ciò che stupisce è la grande differenza esistente tra uomo e orango e la maggiore somiglianza tra uomo e canguro.
I geni sono paraloghi perchè la somiglianza non segue la speciazione.
Ester Oliva Arianna Molinari
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LAURA MALTRAVERSI
studente |
1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Pongo :41%
Homo - Macropus :74%
Macropus - Pongo:36%
2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?
Inizialmente i geni che codificano per la catena alfa e beta si sono divisi per un evento di duplicazione genica e quindi sono paraloghi e questo spiega le basse percentuali( 41% E 36%) tra catene alfa e beta di homo,pongo e macropus.In seguito la catena beta in homo e macropus si è separata per speciazione e quindi i geni per la catena beta dell'homo e macropus sono ortologhi e questo spiega l'alta percentualità( 74%).
Alessandra Musiari
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SILVIA REVERBERI
studente |
Serena Rabaglia
Francesca Sandrini
1) Indicare le % di identità:
Homo - Pongo :41%
Homo - Macropus :74%
Macropus - Pongo:36%
2) Pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?
Dall'analisi dei risultati ottenuti, è presente almeno un gene paralogo in quanto i geni in analisi non seguono la filogenesi delle specie.
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MARIA CHIARA VENUTI
studente |
1.Homo-Pongo 41%
Homo-Macropus 74%
Macropus-Pongo 36%
2.Homo-Macropus:ortologhi,perchè hanno un'alta percentuale di identità
Homo-Pongo:paraloghi,perchè hanno una bassa percentuale di identità
Macropus-Pongo:paraloghi,perchè anche essi hanno una bassa percentuale di identità
Lanzillotti Giusi
Barone Roberta
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MARIA CHIARA VENUTI
studente |
1.Homo-Pongo 41%
Homo-Macropus 74%
Macropus-Pongo 36%
2.I rapporti non sono in accordo con la filogenesi delle specie.
Dunque possiamo solo stabilire che si tratta di geni paraloghi.
Lanzillotti Giusi
Barone Roberta
|
MARIA CHIARA VENUTI
studente |
1.Homo-Pongo 41%
Homo-Macropus 74%
Macropus-Pongo 36%
2.I rapporti non sono in accordo con la filogenesi delle specie.
Dunque possiamo solo stabilire che si tratta di geni paraloghi.
Lanzillotti Giusi
Barone Roberta
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ALICE ZUCCOLI
studente |
1) Homo - Pongo :41%
Homo - Macropus :74%
Macropus - Pongo:36%
2) I dati mostrano che i rapporti non sono in accordo con la filogenesi delle specie; alcuni geni non stanno seguendo l'evoluzione delle specie, questi sono detti geni paraloghi.
Ilaria Tagliani
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GIADA MONICA
studente |
>HBB_HUMAN - Homo sapiens
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKV
KAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGK
EFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
>HBA_pongo - Pongo pygmaeus
MVLSPADKTNVKTAWGKVGAHAGDYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDL
SHGSAQVKDHGKKVADALTNAVAHVDDMPNALSALSDL
HAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTP
AVHASLDKFLASVSTVLTSKYR
>HBB_MACRU Macropus rufus (Red kangaroo)
VHLTAEEKNAITSLWGKVAIEQTGGEALGRLLIVYPWTSRFFDHFGDLSNAKAVMGNPKV
LAHGAKVLVAFGDAIKNLDNLKGTFAKLSELHCDKLHVDPENFKLLGNIIVICLAEHFGK
EFTIDTQVAWQKLVAGVANALAHKYH
1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Pongo : 41%
Homo - Macropus :74%
Macropus - Pongo:36%
2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?
I geni sono paraloghi perchè le loro identità non riflettono le somiglianze filogenetiche quindi non si sono divisi per speciazione, ma per un altro evento quale la duplicazione genica.
|
GIADA MONICA
studente |
>HBB_HUMAN - Homo sapiens
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKV
KAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGK
EFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
>HBA_pongo - Pongo pygmaeus
MVLSPADKTNVKTAWGKVGAHAGDYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDL
SHGSAQVKDHGKKVADALTNAVAHVDDMPNALSALSDL
HAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTP
AVHASLDKFLASVSTVLTSKYR
>HBB_MACRU Macropus rufus (Red kangaroo)
VHLTAEEKNAITSLWGKVAIEQTGGEALGRLLIVYPWTSRFFDHFGDLSNAKAVMGNPKV
LAHGAKVLVAFGDAIKNLDNLKGTFAKLSELHCDKLHVDPENFKLLGNIIVICLAEHFGK
EFTIDTQVAWQKLVAGVANALAHKYH
1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Pongo : 41%
Homo - Macropus :74%
Macropus - Pongo:36%
2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?
I geni sono paraloghi perchè le loro identità non riflettono le somiglianze filogenetiche quindi non si sono divisi per speciazione, ma per un altro evento quale la duplicazione genica.
Angela Sansone
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BEATRICE MONTI
studente |
1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Pongo : 41%
Homo - Macropus : 74%
Macropus - Pongo: 36%
2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?
I geni sono paraloghi, perché nella valutazione della percentuale d'identità si nota una maggiore percentuale nel confronto tra uomo e canguro rispetto a quello tra uomo e orango,quindi i geni non hanno seguito la filogenesi della specie.
Monti Beatrice, Verani Alessia.
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LAURA RAFFELINI
studente |
1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Pongo : 41%
Homo - Macropus : 74%
Macropus - Pongo: 36%
2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?
I geni Homo - Macropus sono ortologhi in quanto presentano un alto livello di affinità, indice di una probabile evoluzione per speciazione. Al contrario i geni Homo-Pongo e Macropus-Pongo sono paraloghi per la bassa somiglianza tra gli amminoacidi.
Laura Raffelini - Sharon Fabiola Scolari
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CHIARA CORUZZI
studente |
1) Homo - Pongo : 41%
Homo - Macropus :74%
Macropus - Pongo:36%
2) I geni sono paraloghi perchè le percentuali di identità non rispecchiano la filogenesi delle specie.
martina inoretti
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Prof. Riccardo Percudani
docente |
1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Pongo : 41%
Homo - Macropus : 74%
Macropus - Pongo: 36%
2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?
I geni sono paraloghi perchè hanno una bassa identità ed è molto probabile che abbiano seguito vie evolutive diverse, avendo la stessa funzione. Oltretutto, l'identità tra Homo e Macropus è molto più alta che tra questi due e il Pongo.
Alessandro Pinelli
|
LUCIA ISETTI
studente |
Lucia Isetti
1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Pongo : 41%
Homo - Macropus : 74%
Macropus - Pongo: 36%
pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?
Penso che igeni siano paraloghi, perchè le percentuali di identità genica sono più alte nelle specie filogeneticamente più lontane.
20-OCT-2009 13:46
HBB_MACRU
HBB_HUMAN HBA_pongo
1 2 3
146 74% 41%
1 0 84% 61%
0 0% 5%
109 146 36%
2 124 0 58%
0 0 5%
61 54 142
3 91 86 0
8 8 0
1 2 3
|
STEFANO BRANCA
studente |
Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Pongo :41%
Homo - Macropus :74%
Macropus - Pongo:36%
2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?
Homo-Pongo e Macropus-Pongo hanno geni ortologhi per la loro bassa identità quindi hanno subito un processo di speciazione.
Macropus-Homo hanno geni paraloghi,quindi hanno subito un processo di duplicazione.
Cristina Rizzo
|
ANNALISA SISTO
studente |
Homo - Pongo: 41%
Homo - Macropus: 74%
Macropus - Pongo: 36%
I geni di Homo e Macropus potrebbero essere ortologhi perchè nonostante io abbia soltanto due specie a confronto, presentano un'elevata percentuale di identità, e quindi potrebbero essersi separati per speciazione, svolgendo la stessa funzione in specie differenti.
I geni di Homo e Pongo e Macropus e Pongo potrebbero essere paraloghi in quanto le relazioni tra i geni non corrispondono alle relazioni tra le specie.
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ELISA MILIOTO
studente |
docente
1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Pongo :41%
Homo - Macropus :74%
Macropus - Pongo:36%
2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?
i geni sono paraloghi perchè le somiglianze non rispettano la filogenesi delle speci.
Milioto Elisa
|
ANDREA ZAGARELLA
studente |
1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Pongo :41%
Homo - Macropus :74%
Macropus - Pongo:36%
2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?
hbb Homo e macropus sono geni ortologhi
Hba pongus è paraloga rispetto alle altre due poichè l'emoglobina alfa si è differenziata prima. Se il gene del pongo fosse stato ortologo e quindi avesse seguito il percorso evolutivo questo sarebbe stato molto più simile al gene dell'uomo
Fabio Stracci
Andrea Zagarella
|
RAMONA PACE
studente |
1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Pongo : 41%
Homo - Macropus :74%
Macropus - Pongo:36%
2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?
I geni sono paraloghi perchè filogeneticamente l'uomo è più simile al Pongo rispetto al Macropus, mentre le percentuali di identità ci dimostrano che il gene della beta emoglobina di Macropus è più somigliante a quello di Homo rispetto al gene di Pongo.
Ramona Pace e Marta Zantedeschi
|
CECILIA NOLLI
studente |
1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Pongo :41%
Homo - Macropus :74%
Macropus - Pongo:36%
2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?
i geni sono paraloghi perchè in precedenza catena a e b dell'emoglobina si sono separate per duplicazione genica e questo è dimostrato dalle percentuali 36% e 41%. il 74% potrebbe dimostrare una successiva separazione per speciazione e quindi i geni che codificano per la catena b sono ortologhi.
Gloria Spagnoli
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ORNELLA SCANDALIATO
studente |
1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Pongo : 41%
Homo - Macropus : 74%
Macropus - Pongo: 36%
2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?
I geni sono paraloghi perchè dal confronto notiamo ch hanno una bassa identità e quindi non si sono separati seguendo la filogenesi della speciazione....
eglantina celislami
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ALESSIO SARDELLA
studente |
1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Pongo :41%
Homo - Macropus :74%
Macropus - Pongo:36%
2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?
i geni di HBB di uomo e canguro sono ortologhi perchè hanno percentuali di identità e somiglianza alte quindi possiamo assumere che le differenze siano dovute alla speciazione.
tra uomo e pongo, organismi molto vicini filogeneticamente, i geni HBB e HBA sono paraloghi perchè la percentuale di identità del 41%, mentre me la aspetterei almeno di un 85%, quindi le differenze non sono dovute a speciazione
|
LUCIA ISETTI
studente |
Valentina Rossi
1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Pongo : 41%
Homo - Macropus :74%
Macropus - Pongo:36%
2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?
I geni sono paraloghi perchè hanno bassa identità tra specie filogeneticamente più vicine.
20-OCT-2009 13:58
HBB_MACRU
HBB_HUMAN HBA_pongo
1 2 3
146 74% 41%
1 0 84% 61%
0 0% 5%
109 146 36%
2 124 0 58%
0 0 5%
61 54 142
3 91 86 0
8 8 0
1 2 3
|
LUCIA ISETTI
studente |
Valentina Rossi
1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Pongo : 41%
Homo - Macropus :74%
Macropus - Pongo:36%
2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?
I geni sono paraloghi perchè hanno bassa identità tra specie filogeneticamente più vicine.
20-OCT-2009 13:58
HBB_MACRU
HBB_HUMAN HBA_pongo
1 2 3
146 74% 41%
1 0 84% 61%
0 0% 5%
109 146 36%
2 124 0 58%
0 0 5%
61 54 142
3 91 86 0
8 8 0
1 2 3
|
ANGELA VOLPE
studente |
1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Pongo : 41%
Homo - Macropus :74%
Macropus - Pongo:36%
2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?
In
homo-pongo e macropus-pongo essendoci una bassa identità di sequenze omologhe, si deduce che siamo in presenza di uno stesso gene presente nei tre organismi diversi considerati; per questo motivo possono essere considerate sequenze ortologhe.Dall' elevato valore d' identità in homo-macropus, invece, è deducibile che questi derivino da uno stesso genoma, quindi sono sequenze paraloghe.
|
GRAZIA NARDELLA
studente |
1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Pongo :41%
Homo - Macropus :74%
Macropus - Pongo:36%
2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?
homo-pongo e macropus-pongo hanno i geni analizzati in questo caso ortologhi perchè hanno una bassa identità;invece homo-macropus hanno i geni analizzati in questo caso paraloghi perchè hanno elevata identità.Di conseguenza i geni ortologhi hanno subito un evento di speciazione mentre quelli paraloghi hanno subito un evento di duplicazione!
piera soccio
|
MATTEO PEDEGANI
studente |
HBB_HUMAN-HBB_MACRU 74%
HBB_HUMAN-HBA_pongo 41%
HBB_MACRU-HBA_pongo 36%
Per quanto riguarda i geni che codificano per la emoglobina beta dell'uomo e del canguro rosso questi risultano essere geni ortologhi poichè mostrano una elevata percentuale di identità( 74%) e, quindi, le proteine codificate hanno la stessa funzione (codificano per HBB).
Al contrario, se ci riferiamo ai geni che codificano per la emoglobina alfa del pongo, questi risultano essere paraloghi rispetto alle altre due specie in esame, poichè presentano una più bassa percentuale di identità nel confronto con quest'ultime e quindi le proteine codificate da essi hanno una funzione diversa (codificano per HBA).
Matteo Pedegani e Fabio Perini
|
SILVIA GUGLIERI
studente |
Homo - Pongo : 41%
Homo - Macropus : 74%
Macropus - Pongo: 36%
In questo gruppo ci sono geni paraloghi perchè non si sono separati seguendo la filogenesi delle specie
|
FABIO PERINI
studente |
HBB_HUMAN-HBB_MACRU 74%
HBB_HUMAN-HBA_pongo 41%
HBB_MACRU-HBA_pongo 36%
Per
quanto riguarda i geni che codificano per la emoglobina beta dell'uomo
e del canguro rosso questi risultano essere geni ortologhi poichè
mostrano una elevata percentuale di identità( 74%) e, quindi, le
proteine codificate hanno la stessa funzione (codificano per HBB).
Al
contrario, se ci riferiamo ai geni che codificano per la emoglobina
alfa del pongo, questi risultano essere paraloghi rispetto alle altre
due specie in esame, poichè presentano una più bassa percentuale di
identità nel confronto con quest'ultime e quindi le proteine codificate
da essi hanno una funzione diversa (codificano per HBA).
Fabio Perini e Matteo Pedegani
|
GIULIA PESCARA
studente |
Homo - Pongo: 41%
Homo - Macropus: 74%
Macropus - Pongo: 36%
I
geni di Homo e Macropus potrebbero essere ortologhi perchè nonostante
io abbia soltanto due specie a confronto, presentano un'elevata
percentuale di identità, e quindi potrebbero essersi separati per
speciazione, svolgendo la stessa funzione in specie differenti.
I
geni di Homo e Pongo e Macropus e Pongo potrebbero essere paraloghi in
quanto le relazioni tra i geni non corrispondono alle relazioni tra le specie.
|
SILVIA MIATELLO
studente |
Homo - Pongo: 41%
Homo - Macropus: 74%
Macropus - Pongo: 36%
I
geni di Homo e Macropus potrebbero essere ortologhi perchè nonostante
io abbia soltanto due specie a confronto, presentano un'elevata
percentuale di identità, e quindi potrebbero essersi separati per
speciazione, svolgendo la stessa funzione in specie differenti.
I
geni di Homo e Pongo e Macropus e Pongo potrebbero essere paraloghi in
quanto le relazioni tra i geni non corrispondono alle relazioni tra le specie.
|
VINCENZA SPECIALE
studente |
Homo - Pongo: 41%
Homo - Macropus: 74%
Macropus - Pongo: 36%
I
geni di Homo e Macropus potrebbero essere ortologhi perchè nonostante
io abbia soltanto due specie a confronto, presentano un'elevata
percentuale di identità, e quindi potrebbero essersi separati per
speciazione, svolgendo la stessa funzione in specie differenti.
I
geni di Homo e Pongo e Macropus e Pongo potrebbero essere paraloghi in
quanto le relazioni tra i geni non corrispondono alle relazioni tra le specie.
|
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