Classe delle Lauree in Scienze Biologiche

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Forum > Corso 2009/2010 (M-Z) > Esercizio ricerca di omologia 2 (M-Z)

Autore

Intervento

Prof. Riccardo Percudani
docente

	Esercizio ricerca di omologia 2 (M-Z)
	10/11/2009 11:12

Fate una ricerca di omologia usando il database Refseq con il seguente peptide:

VEALYLVCGERGFFYTPKTRREAEDLQVGQVE
1) A quale tipo di proteina corrisponde questa sequenza?
2) Si trovano somiglianze significative nell'uomo?
3) Riportare le sequenze complete trovate in cane e ratto

GLORIA SPAGNOLI
studente

	Re: Esercizio ricerca di omologia 2 (M-Z)
	Replay #1 - 10/11/2009 14:16

Fate una ricerca di omologia usando il database Refseq con il seguente peptide:

VEALYLVCGERGFFYTPKTRREAEDLQVGQVE
1) A quale tipo di proteina corrisponde questa sequenza?
precursore dell'insulina
2) Si trovano somiglianze significative nell'uomo?
si, la più significativa 2x10-10
3) Riportare le sequenze complete trovate in cane e ratto
cane: 
malwmrllpl lallalwapa ptrafvnqhl cgshlvealy lvcgergffy tpkarreved
       61 lqvrdvelag apgegglqpl alegalqkrg iveqcctsic slyqlenycn

Ratto: 1 malwirflpl lallilwepr paqafvkqhl cgshlvealy lvcgergffy tpmsrreved
       61 pqvaqlelgg gpgagdlqtl alevarqkrg ivdqcctsic slyqlenycn

Cecilia Nolli

ALESSANDRO PINELLI
studente

	Re: Esercizio ricerca di omologia 2 (M-Z)
	Replay #1 - 10/11/2009 14:17

Fate una ricerca di omologia usando il database Refseq con il seguente peptide:

VEALYLVCGERGFFYTPKTRREAEDLQVGQVE
1) A quale tipo di proteina corrisponde questa sequenza?
2) Si trovano somiglianze significative nell'uomo?
3) Riportare le sequenze complete trovate in cane e ratto 

1) La proteina corrisponde al precursore dell'insulina di pan troglodytes e di Uomo, molecola coinvolta nel metabolismo glucidico.
2) Certo, somiglianza significativa al 100%, cioè identità completa
3) Cane: >gi|194272230|ref|NP_001123565.1| proinsulin precursor [Canis lupus familiaris]
MALWMRLLPLLALLALWAPAPTRAFVNQHLCGSHLVEALYLVCGERGFFYTPKARREVEDLQVRDVELAG
APGEGGLQPLALEGALQKRGIVEQCCTSICSLYQLENYCN
Ratto:
>gi|9506815|ref|NP_062002.1| insulin 1 precursor [Rattus norvegicus]
MALWMRFLPLLALLVLWEPKPAQAFVKQHLCGPHLVEALYLVCGERGFFYTPKSRREVEDPQVPQLELGG
GPEAGDLQTLALEVARQKRGIVDQCCTSICSLYQLENYCN

Alessandro Pinelli

ALESSIO SARDELLA
studente

	Re: Esercizio ricerca di omologia 2 (M-Z)
	Replay #1 - 10/11/2009 14:18

Fate una ricerca di omologia usando il database Refseq con il seguente peptide:

VEALYLVCGERGFFYTPKTRREAEDLQVGQVE
1) A quale tipo di proteina corrisponde questa sequenza?

proinsulin precursor 
Pan troglodytes
2) Si trovano somiglianze significative nell'uomo?

E=2e-10

3) Riportare le sequenze complete trovate in cane e ratto 

>gi|194272230|ref|NP_001123565.1| proinsulin precursor [Canis lupus familiaris]
MALWMRLLPLLALLALWAPAPTRAFVNQHLCGSHLVEALYLVCGERGFFYTPKARREVEDLQVRDVELAG
APGEGGLQPLALEGALQKRGIVEQCCTSICSLYQLENYCN


>gi|9506815|ref|NP_062002.1| insulin 1 precursor [Rattus norvegicus]
MALWMRFLPLLALLVLWEPKPAQAFVKQHLCGPHLVEALYLVCGERGFFYTPKSRREVEDPQVPQLELGG
GPEAGDLQTLALEVARQKRGIVDQCCTSICSLYQLENYCN

Alessio Sardella
Luca Stragliati

ANTONINO SAMMARTANO
studente

	Re: Esercizio ricerca di omologia 2 (M-Z)
	Replay #1 - 10/11/2009 14:19

1) A quale tipo di proteina corrisponde questa sequenza?
 precursore della proinsulina

2) Si trovano somiglianze significative nell'uomo? si 2e-10


3) Riportare le sequenze complete trovate in cane e ratto 
>gi|194272230|ref|NP_001123565.1| proinsulin precursor [Canis lupus familiaris]
MALWMRLLPLLALLALWAPAPTRAFVNQHLCGSHLVEALYLVCGERGFFYTPKARREVEDLQVRDVELAG
APGEGGLQPLALEGALQKRGIVEQCCTSICSLYQLENYCN

>gi|9506815|ref|NP_062002.1| insulin 1 precursor [Rattus norvegicus]
MALWMRFLPLLALLVLWEPKPAQAFVKQHLCGPHLVEALYLVCGERGFFYTPKSRREVEDPQVPQLELGG
GPEAGDLQTLALEVARQKRGIVDQCCTSICSLYQLENYCN

Maria Carla Teresi

ALESSANDRO PINELLI
studente

	Re: Esercizio ricerca di omologia 2 (M-Z)
	Replay #1 - 10/11/2009 14:19

Fate una ricerca di omologia usando il database Refseq con il seguente peptide:

VEALYLVCGERGFFYTPKTRREAEDLQVGQVE
1) A quale tipo di proteina corrisponde questa sequenza?
2) Si trovano somiglianze significative nell'uomo?
3) Riportare le sequenze complete trovate in cane e ratto 

1) La proteina corrisponde al precursore dell'insulina di pan troglodytes e di Uomo, molecola coinvolta nel metabolismo glucidico.
2) Certo, somiglianza significativa al 100%, cioè identità completa. Expect = 2e-10
3) Cane: 
>gi|194272230|ref|NP_001123565.1| proinsulin precursor [Canis lupus familiaris]
MALWMRLLPLLALLALWAPAPTRAFVNQHLCGSHLVEALYLVCGERGFFYTPKARREVEDLQVRDVELAG
APGEGGLQPLALEGALQKRGIVEQCCTSICSLYQLENYCN
Ratto:
>gi|9506815|ref|NP_062002.1| insulin 1 precursor [Rattus norvegicus]
MALWMRFLPLLALLVLWEPKPAQAFVKQHLCGPHLVEALYLVCGERGFFYTPKSRREVEDPQVPQLELGG
GPEAGDLQTLALEVARQKRGIVDQCCTSICSLYQLENYCN

Alessandro Pinelli

SHARON FABIOLA SCOLARI
studente

	Re: Esercizio ricerca di omologia 2 (M-Z)
	Replay #1 - 10/11/2009 14:19

Fate una ricerca di omologia usando il database Refseq con il seguente peptide:

VEALYLVCGERGFFYTPKTRREAEDLQVGQVE
1) A quale tipo di proteina corrisponde questa sequenza?
2) Si trovano somiglianze significative nell'uomo?
3) Riportare le sequenze complete trovate in cane e ratto 

1) proinsulin precursor [Pan troglodytes]

2) NP_000198.1   Expect = 2e-10

3)>gi|194272230|ref|NP_001123565.1| proinsulin precursor [Canis lupus familiaris]
MALWMRLLPLLALLALWAPAPTRAFVNQHLCGSHLVEALYLVCGERGFFYTPKARREVEDLQVRDVELAG
APGEGGLQPLALEGALQKRGIVEQCCTSICSLYQLENYCN

>gi|9506815|ref|NP_062002.1| insulin 1 precursor [Rattus norvegicus]
MALWMRFLPLLALLVLWEPKPAQAFVKQHLCGPHLVEALYLVCGERGFFYTPKSRREVEDPQVPQLELGG
GPEAGDLQTLALEVARQKRGIVDQCCTSICSLYQLENYCN

FABIO STRACCI
studente

	Re: Esercizio ricerca di omologia 2 (M-Z)
	Replay #1 - 10/11/2009 14:19

1) A quale tipo di proteina corrisponde questa sequenza?
2) Si trovano somiglianze significative nell'uomo?
3) Riportare le sequenze complete trovate in cane e ratto 

1) precursore della protoinsulina [Pan troglodytes]

2)sì: NP_000198 proinsulin precursor [Homo sapiens]:    2e-10

3)
>gi|9506815|ref|NP_062002.1| insulin 1 precursor [Rattus norvegicus]
MALWMRFLPLLALLVLWEPKPAQAFVKQHLCGPHLVEALYLVCGERGFFYTPKSRREVEDPQVPQLELGG
GPEAGDLQTLALEVARQKRGIVDQCCTSICSLYQLENYCN

>gi|194272230|ref|NP_001123565.1| proinsulin precursor [Canis lupus familiaris]
MALWMRLLPLLALLALWAPAPTRAFVNQHLCGSHLVEALYLVCGERGFFYTPKARREVEDLQVRDVELAG
APGEGGLQPLALEGALQKRGIVEQCCTSICSLYQLENYCN

Fabio Stracci

EMILIO PERFETTO
studente

	Re: Esercizio ricerca di omologia 2 (M-Z)
	Replay #1 - 10/11/2009 14:20

1) A quale tipo di proteina corrisponde questa sequenza?
2) Si trovano somiglianze significative nell'uomo?
3) Riportare le sequenze complete trovate in cane e ratto

1) Proinsulin precursor

2) Somiglianza in uomo

Expect = 2e-10

3)canis lupus familiaris: >gi|194272230|ref|NP_001123565.1| proinsulin precursor [Canis lupus familiaris]
MALWMRLLPLLALLALWAPAPTRAFVNQHLCGSHLVEALYLVCGERGFFYTPKARREVEDLQVRDVELAG
APGEGGLQPLALEGALQKRGIVEQCCTSICSLYQLENYCN

 rattus norvegicus: 
>gi|9506815|ref|NP_062002.1| insulin 1 precursor [Rattus norvegicus]
MALWMRFLPLLALLVLWEPKPAQAFVKQHLCGPHLVEALYLVCGERGFFYTPKSRREVEDPQVPQLELGG
GPEAGDLQTLALEVARQKRGIVDQCCTSICSLYQLENYCN

LAURA MALTRAVERSI
studente

	Re: Esercizio ricerca di omologia 2 (M-Z)
	Replay #1 - 10/11/2009 14:20

1) A quale tipo di proteina corrisponde questa sequenza? insulina
2) Si trovano somiglianze significative nell'uomo? siNP_000198.  con E=2e-10
3) Riportare le sequenze complete trovate in cane e ratto? 
cane
>gi|194272230|ref|NP_001123565.1| proinsulin precursor [Canis lupus familiaris]
MALWMRLLPLLALLALWAPAPTRAFVNQHLCGSHLVEALYLVCGERGFFYTPKARREVEDLQVRDVELAG
APGEGGLQPLALEGALQKRGIVEQCCTSICSLYQLENYCN
ratto
>gi|9506815|ref|NP_062002.1| insulin 1 precursor [Rattus norvegicus]
MALWMRFLPLLALLVLWEPKPAQAFVKQHLCGPHLVEALYLVCGERGFFYTPKSRREVEDPQVPQLELGG
GPEAGDLQTLALEVARQKRGIVDQCCTSICSLYQLENYCN
alessandra musiari

ELISA RATTOTTI
studente

	Re: Esercizio ricerca di omologia 2 (M-Z)
	Replay #1 - 10/11/2009 14:20

VEALYLVCGERGFFYTPKTRREAEDLQVGQVE
1) A quale tipo di proteina corrisponde questa sequenza?
2) Si trovano somiglianze significative nell'uomo?
3) Riportare le sequenze complete trovate in cane e ratto 

1) Precursore della proinsulina in Pan troglodytes 
2) Sì, con l'insulina umana. Identities = 32/32 (100%), Positives = 32/32 (100%), Gaps = 0/32 (0%)
3) Rattus norvegicus

>gi|149040367|gb|EDL94405.1| rCG57477 [Rattus norvegicus]
MRERERERERERNFLPLLALLVLWEPKPAQAFVKQHLCGPHLVEALYLVCGERGFFYTPKSRREVEDPQV
PQLELGGGPEAGDLQTLALEVARQKRGIVDQCCTSICSLYQLENYCN

Canis lupus familiaris

>gi|194272230|ref|NP_001123565.1| proinsulin precursor [Canis lupus familiaris]
MALWMRLLPLLALLALWAPAPTRAFVNQHLCGSHLVEALYLVCGERGFFYTPKARREVEDLQVRDVELAG
APGEGGLQPLALEGALQKRGIVEQCCTSICSLYQLENYCN

ALESSANDRA BIONDI
studente

	Re: Esercizio ricerca di omologia 2 (M-Z)
	Replay #1 - 10/11/2009 14:21

VEALYLVCGERGFFYTPKTRREAEDLQVGQVE
1) A quale tipo di proteina corrisponde questa sequenza?
2) Si trovano somiglianze significative nell'uomo?
3) Riportare le sequenze complete trovate in cane e ratto 

1.Insulina
2.Si, con un valore di 7e-13
3.>gi|194272230|ref|NP_001123565.1| proinsulin precursor [Canis lupus familiaris]
MALWMRLLPLLALLALWAPAPTRAFVNQHLCGSHLVEALYLVCGERGFFYTPKARREVEDLQVRDVELAG
APGEGGLQPLALEGALQKRGIVEQCCTSICSLYQLENYCN

>gi|9506815|ref|NP_062002.1| insulin 1 precursor [Rattus norvegicus]
MALWMRFLPLLALLVLWEPKPAQAFVKQHLCGPHLVEALYLVCGERGFFYTPKSRREVEDPQVPQLELGG
GPEAGDLQTLALEVARQKRGIVDQCCTSICSLYQLENYCN

Biondi Alessandra
Azzini ilaria

DAVIDE SARRA
studente

	Re: Esercizio ricerca di omologia 2 (M-Z)
	Replay #2 - 10/11/2009 14:22

1) insulina

2)sì

ref|NP_000198.1|
Expect = 2e-10

3)

proinsulin precursor [Canis lupus familiaris]

>gi|194272230|ref|NP_001123565.1| proinsulin precursor [Canis lupus familiaris]
MALWMRLLPLLALLALWAPAPTRAFVNQHLCGSHLVEALYLVCGERGFFYTPKARREVEDLQVRDVELAG
APGEGGLQPLALEGALQKRGIVEQCCTSICSLYQLENYCN

insulin 1 precursor [Rattus norvegicus]

>gi|9506815|ref|NP_062002.1| insulin 1 precursor [Rattus norvegicus]
MALWMRFLPLLALLVLWEPKPAQAFVKQHLCGPHLVEALYLVCGERGFFYTPKSRREVEDPQVPQLELGG
GPEAGDLQTLALEVARQKRGIVDQCCTSICSLYQLENYCN

Claudia Romanelli 
Davide Sarra

MATTIA AGOSTI
studente

	Re: Esercizio ricerca di omologia 2 (M-Z)
	Replay #1 - 10/11/2009 14:22

Fate una ricerca di omologia usando il database Refseq con il seguente peptide:

VEALYLVCGERGFFYTPKTRREAEDLQVGQVE
1) A quale tipo di proteina corrisponde questa sequenza?
2) Si trovano somiglianze significative nell'uomo?
3) Riportare le sequenze complete trovate in cane e ratto 

RISPOSTE
1)Precursore della proinsulina nello scimpanzè (Pan Troglodytes)

2)Sì; (2e-10) 

3) >gi|194272230|ref|NP_001123565.1| proinsulin precursor [Canis lupus familiaris]
MALWMRLLPLLALLALWAPAPTRAFVNQHLCGSHLVEALYLVCGERGFFYTPKARREVEDLQVRDVELAG
APGEGGLQPLALEGALQKRGIVEQCCTSICSLYQLENYCN

  
  >gi|9506817|ref|NP_062003.1| insulin 2 precursor [Rattus norvegicus]
MALWIRFLPLLALLILWEPRPAQAFVKQHLCGSHLVEALYLVCGERGFFYTPMSRREVEDPQVAQLELGG
GPGAGDLQTLALEVARQKRGIVDQCCTSICSLYQLENYCN

Agosti Mattia.

ANNALISA SISTO
studente

	Re: Esercizio ricerca di omologia 2 (M-Z)
	Replay #1 - 10/11/2009 14:22

1) proinsulin precursor [Pan troglodytes]

2) NP_000198.1   Expect = 2e-10

3)>gi|194272230|ref|NP_001123565.1| proinsulin precursor [Canis lupus familiaris]
MALWMRLLPLLALLALWAPAPTRAFVNQHLCGSHLVEALYLVCGERGFFYTPKARREVEDLQVRDVELAG
APGEGGLQPLALEGALQKRGIVEQCCTSICSLYQLENYCN

>gi|9506815|ref|NP_062002.1| insulin 1 precursor [Rattus norvegicus]
MALWMRFLPLLALLVLWEPKPAQAFVKQHLCGPHLVEALYLVCGERGFFYTPKSRREVEDPQVPQLELGG
GPEAGDLQTLALEVARQKRGIVDQCCTSICSLYQLENYCN

STEFANO BRANCA
studente

	Re: Esercizio ricerca di omologia 2 (M-Z)
	Replay #1 - 10/11/2009 14:22

1) A quale tipo di proteina corrisponde questa sequenza?
Proinsulin precursor
2) Si trovano somiglianze significative nell'uomo?
Si
3) Riportare le sequenze complete trovate in cane e ratto
VEALYLVCGERGFFYTPKARREVEDLQVRDVE : canis lupus familiaris

VEALYLVCGERGFFYTPKSRREVEDPQVPQLE  : rattus norvegicus

LUCIA ISETTI
studente

	Re: Esercizio ricerca di omologia 2 (M-Z)
	Replay #1 - 10/11/2009 14:23

Isetti Lucia

Paini Elena

Fate una ricerca di omologia usando il database Refseq con il seguente peptide:

VEALYLVCGERGFFYTPKTRREAEDLQVGQVE
1) A quale tipo di proteina corrisponde questa sequenza?
corrisponde al precursore della proinsulina 
2) Si trovano somiglianze significative nell'uomo?
sì ref|NP_000198.1|
GENE ID: 3630 INS
 Expect = 2e-10 

3) Riportare le sequenze complete trovate in cane e ratto
Cane:
proinsulin precursor [Canis lupus familiaris]

 
>gi|194272230|ref|NP_001123565.1| proinsulin precursor [Canis lupus familiaris]
MALWMRLLPLLALLALWAPAPTRAFVNQHLCGSHLVEALYLVCGERGFFYTPKARREVEDLQVRDVELAG
APGEGGLQPLALEGALQKRGIVEQCCTSICSLYQLENYCN


Ratto:

 insulin 1 precursor [Rattus norvegicus]

 
>gi|9506815|ref|NP_062002.1| insulin 1 precursor [Rattus norvegicus]
MALWMRFLPLLALLVLWEPKPAQAFVKQHLCGPHLVEALYLVCGERGFFYTPKSRREVEDPQVPQLELGG
GPEAGDLQTLALEVARQKRGIVDQCCTSICSLYQLENYCN

ANDREA ZAGARELLA
studente

	Re: Esercizio ricerca di omologia 2 (M-Z)
	Replay #2 - 10/11/2009 14:23

Fate una ricerca di omologia usando il database Refseq con il seguente peptide:
VEALYLVCGERGFFYTPKTRREAEDLQVGQVE
1) A quale tipo di proteina corrisponde questa sequenza?
2) Si trovano somiglianze significative nell'uomo?
3) Riportare le sequenze complete trovate in cane e ratto

1) proinsulin precursor [Pan troglodytes]

2) NP_000198.1 Expect = 2e-10

3)>gi|194272230|ref|NP_001123565.1| proinsulin precursor [Canis lupus familiaris]
MALWMRLLPLLALLALWAPAPTRAFVNQHLCGSHLVEALYLVCGERGFFYTPKARREVEDLQVRDVELAG
APGEGGLQPLALEGALQKRGIVEQCCTSICSLYQLENYCN

>gi|9506815|ref|NP_062002.1| insulin 1 precursor [Rattus norvegicus]
MALWMRFLPLLALLVLWEPKPAQAFVKQHLCGPHLVEALYLVCGERGFFYTPKSRREVEDPQVPQLELGG
GPEAGDLQTLALEVARQKRGIVDQCCTSICSLYQLENYCN

GIUSEPPE BALZANI
studente

	Re: Esercizio ricerca di omologia 2 (M-Z)
	Replay #1 - 10/11/2009 14:23

VEALYLVCGERGFFYTPKTRREAEDLQVGQVE
1) A quale tipo di proteina corrisponde questa sequenza?
2) Si trovano somiglianze significative nell'uomo?
3) Riportare le sequenze complete trovate in cane e ratto

1) precursore proinsulina
2) significatività: 2e-10
3) rattus norvegicusQuery  1   VEALYLVCGERGFFYTPKTRREAEDLQVGQVE  32
           VEALYLVCGERGFFYTPK+RRE ED QV Q+E
Sbjct  36  VEALYLVCGERGFFYTPKSRREVEDPQVPQLE  67

4) canis lupus familiaris
Query  1   VEALYLVCGERGFFYTPKTRREAEDLQVGQVE  32
           VEALYLVCGERGFFYTPK RRE EDLQV  VE
Sbjct  36  VEALYLVCGERGFFYTPKARREVEDLQVRDVE  67

   giuseppe balzani, lorenzo gobbi, valentina berni

ALICE SALVIATI
studente

	Re: Esercizio ricerca di omologia 2 (M-Z)
	Replay #1 - 10/11/2009 14:23

1) A quale tipo di proteina corrisponde questa sequenza?
Al precursore della proinsulina.
2) Si trovano somiglianze significative nell'uomo?
Sì,è significativa con Expect = 2e-10, uguale a Pan troglodytes.
3) Riportare le sequenze complete trovate in cane e ratto 
>gi|194272230|ref|NP_001123565.1| proinsulin precursor [Canis lupus familiaris]
MALWMRLLPLLALLALWAPAPTRAFVNQHLCGSHLVEALYLVCGERGFFYTPKARREVEDLQVRDVELAG
APGEGGLQPLALEGALQKRGIVEQCCTSICSLYQLENYCN

>gi|9506815|ref|NP_062002.1| insulin 1 precursor [Rattus norvegicus]
MALWMRFLPLLALLVLWEPKPAQAFVKQHLCGPHLVEALYLVCGERGFFYTPKSRREVEDPQVPQLELGG
GPEAGDLQTLALEVARQKRGIVDQCCTSICSLYQLENYCN

Alice Salviati
Ilaria Tagliani
Adriana Vitiello

GIULIA PESCARA
studente

	Re: Esercizio ricerca di omologia 2 (M-Z)
	Replay #2 - 10/11/2009 14:23

1) proinsulin precursor [Pan troglodytes]

2) NP_000198.1   Expect = 2e-10

3)>gi|194272230|ref|NP_001123565.1| proinsulin precursor [Canis lupus familiaris]
MALWMRLLPLLALLALWAPAPTRAFVNQHLCGSHLVEALYLVCGERGFFYTPKARREVEDLQVRDVELAG
APGEGGLQPLALEGALQKRGIVEQCCTSICSLYQLENYCN

>gi|9506815|ref|NP_062002.1| insulin 1 precursor [Rattus norvegicus]
MALWMRFLPLLALLVLWEPKPAQAFVKQHLCGPHLVEALYLVCGERGFFYTPKSRREVEDPQVPQLELGG
GPEAGDLQTLALEVARQKRGIVDQCCTSICSLYQLENYCN

GRAZIA NARDELLA
studente

	Re: Esercizio ricerca di omologia 2 (M-Z)
	Replay #1 - 10/11/2009 14:23

Fate una ricerca di omologia usando il database Refseq con il seguente peptide:

VEALYLVCGERGFFYTPKTRREAEDLQVGQVE
1) A quale tipo di proteina corrisponde questa sequenza?
   Proinsulin Precursor
2) Si trovano somiglianze significative nell'uomo?
   Si
3) Riportare le sequenze complete trovate in cane e ratto 
 VEALYLVCGERGFFYTPMSRREVEDPQVAQLE:Rattus Norvegicus
 VEALYLVCGERGFFYTPKARREVEDLQVRDVE:canis lupus familiaris  

brunella venezia
grazia nardella
piera soccio

ANGELA VOLPE
studente

	Re: Esercizio ricerca di omologia 2 (M-Z)
	Replay #1 - 10/11/2009 14:24

Fate una ricerca di omologia usando il database Refseq con il seguente peptide:

VEALYLVCGERGFFYTPKTRREAEDLQVGQVE
1) A quale tipo di proteina corrisponde questa sequenza?

All'insulina

2) Si trovano somiglianze significative nell'uomo?
NP_000198.1  E= 2e-10 Somiglianza 32/32 (100%)

3) Riportare le sequenze complete trovate in cane e ratto

Cane

>gi|194272230|ref|NP_001123565.1| proinsulin precursor [Canis lupus familiaris]
MALWMRLLPLLALLALWAPAPTRAFVNQHLCGSHLVEALYLVCGERGFFYTPKARREVEDLQVRDVELAG
APGEGGLQPLALEGALQKRGIVEQCCTSICSLYQLENYCN



Ratto
>gi|9506815|ref|NP_062002.1| insulin 1 precursor [Rattus norvegicus]
MALWMRFLPLLALLVLWEPKPAQAFVKQHLCGPHLVEALYLVCGERGFFYTPKSRREVEDPQVPQLELGG
GPEAGDLQTLALEVARQKRGIVDQCCTSICSLYQLENYCN

Paladino Orsola Letizia
Volpe Angela

ELISA UGHINI
studente

	Re: Esercizio ricerca di omologia 2 (M-Z)
	Replay #1 - 10/11/2009 14:24

1) A quale tipo di proteina corrisponde questa sequenza?
precursore della proinsulina
2) Si trovano somiglianze significative nell'uomo?
si, identities=32/32

3) Riportare le sequenze complete trovate in cane e ratto
CANIS LUPUS FAMILIARIS: 
>gi|194272230|ref|NP_001123565.1| proinsulin precursor [Canis lupus familiaris]
MALWMRLLPLLALLALWAPAPTRAFVNQHLCGSHLVEALYLVCGERGFFYTPKARREVEDLQVRDVELAG
APGEGGLQPLALEGALQKRGIVEQCCTSICSLYQLENYCN

RATTUS NORVEGICUS:

>gi|9506815|ref|NP_062002.1| insulin 1 precursor [Rattus norvegicus]
MALWMRFLPLLALLVLWEPKPAQAFVKQHLCGPHLVEALYLVCGERGFFYTPKSRREVEDPQVPQLELGG
GPEAGDLQTLALEVARQKRGIVDQCCTSICSLYQLENYCN

Elisa Ughini e Elena ronda

MARTA ZANTEDESCHI
studente

	Re: Esercizio ricerca di omologia 2 (M-Z)
	Replay #1 - 10/11/2009 14:25

1) A quale tipo di proteina corrisponde questa sequenza?
Corrisponde al precursore della proinsulina

2) Si trovano somiglianze significative nell'uomo?
Sì, è 2e-10 



3) Riportare le sequenze complete trovate in cane e ratto
 *proinsulin precursor [Canis lupus familiaris]

>gi|194272230|ref|NP_001123565.1| proinsulin precursor [Canis lupus familiaris]
MALWMRLLPLLALLALWAPAPTRAFVNQHLCGSHLVEALYLVCGERGFFYTPKARREVEDLQVRDVELAG
APGEGGLQPLALEGALQKRGIVEQCCTSICSLYQLENYCN

 *insulin 1 precursor [Rattus norvegicus]

>gi|9506815|ref|NP_062002.1| insulin 1 precursor [Rattus norvegicus]
MALWMRFLPLLALLVLWEPKPAQAFVKQHLCGPHLVEALYLVCGERGFFYTPKSRREVEDPQVPQLELGG
GPEAGDLQTLALEVARQKRGIVDQCCTSICSLYQLENYCN

Ramona Pace, Marta Zantedeschi

ALICE ZUCCOLI
studente

	Re: Esercizio ricerca di omologia 2 (M-Z)
	Replay #1 - 10/11/2009 14:26

Fate una ricerca di omologia usando il database Refseq con il seguente peptide:

VEALYLVCGERGFFYTPKTRREAEDLQVGQVE
1) A quale tipo di proteina corrisponde questa sequenza?
2) Si trovano somiglianze significative nell'uomo?
3) Riportare le sequenze complete trovate in cane e ratto

1) proinsulin precursor [pan troglodites]

2) NP_000198 Expected = 2e-10

3)>gi|194272230|ref|NP_001123565.1| proinsulin precursor [Canis lupus familiaris]
MALWMRLLPLLALLALWAPAPTRAFVNQHLCGSHLVEALYLVCGERGFFYTPKARREVEDLQVRDVELAG
APGEGGLQPLALEGALQKRGIVEQCCTSICSLYQLENYCN

FRANCESCA SANDRINI
studente

	Re: Esercizio ricerca di omologia 2 (M-Z)
	Replay #2 - 10/11/2009 14:26

1) precursore dell'insulina.

2)NP000198.1 Expect = 2e-10

3)cane:

>gi|194272230|ref|NP_001123565.1| proinsulin precursor [Canis lupus familiaris]
MALWMRLLPLLALLALWAPAPTRAFVNQHLCGSHLVEALYLVCGERGFFYTPKARREVEDLQVRDVELAG
APGEGGLQPLALEGALQKRGIVEQCCTSICSLYQLENYCN

ratto:

>gi|9506815|ref|NP_062002.1| insulin 1 precursor [Rattus norvegicus]
MALWMRFLPLLALLVLWEPKPAQAFVKQHLCGPHLVEALYLVCGERGFFYTPKSRREVEDPQVPQLELGG
GPEAGDLQTLALEVARQKRGIVDQCCTSICSLYQLENYCN

francesca sandrini martina galli

ALICE ZUCCOLI
studente

	Re: Esercizio ricerca di omologia 2 (M-Z)
	Replay #2 - 10/11/2009 14:27

>gi|9506815|ref|NP_062002.1| insulin 1 precursor [Rattus norvegicus]
MALWMRFLPLLALLVLWEPKPAQAFVKQHLCGPHLVEALYLVCGERGFFYTPKSRREVEDPQVPQLELGG
GPEAGDLQTLALEVARQKRGIVDQCCTSICSLYQLENYCN

MARIA CHIARA VENUTI
studente

	Re: Esercizio ricerca di omologia 2 (M-Z)
	Replay #1 - 10/11/2009 14:27

Fate una ricerca di omologia usando il database Refseq con il seguente peptide:

VEALYLVCGERGFFYTPKTRREAEDLQVGQVE
1) A quale tipo di proteina corrisponde questa sequenza?
2) Si trovano somiglianze significative nell'uomo?
3) Riportare le sequenze complete trovate in cane e ratto

1)Proinsulin precursor [Pan troglodytes],Corrisponde al precursore dell'insulina di Pan Troglodytes E DI UOMO

2)NP_000198.1 Expect = 2e-10

3)>gi|194272230|ref|NP_001123565.1| proinsulin precursor [Canis lupus familiaris]
MALWMRLLPLLALLALWAPAPTRAFVNQHLCGSHLVEALYLVCGERGFFYTPKARREVEDLQVRDVELAG
APGEGGLQPLALEGALQKRGIVEQCCTSICSLYQLENYCN

MARIA CHIARA VENUTI
studente

	Re: Esercizio ricerca di omologia 2 (M-Z)
	Replay #1 - 10/11/2009 14:27

Fate una ricerca di omologia usando il database Refseq con il seguente peptide:

VEALYLVCGERGFFYTPKTRREAEDLQVGQVE
1) A quale tipo di proteina corrisponde questa sequenza?
2) Si trovano somiglianze significative nell'uomo?
3) Riportare le sequenze complete trovate in cane e ratto

1)Proinsulin precursor [Pan troglodytes],Corrisponde al precursore dell'insulina di Pan Troglodytes E DI UOMO

2)NP_000198.1 Expect = 2e-10

3)>gi|9506815|ref|NP_062002.1| insulin 1 precursor [Rattus norvegicus]
MALWMRFLPLLALLVLWEPKPAQAFVKQHLCGPHLVEALYLVCGERGFFYTPKSRREVEDPQVPQLELGG
GPEAGDLQTLALEVARQKRGIVDQCCTSICSLYQLENYCN

ELISA MILIOTO
studente

	Re: Esercizio ricerca di omologia 2 (M-Z)
	Replay #1 - 10/11/2009 14:28

3)>gi|9506815|ref|NP_062002.1| insulin 1 precursor [Rattus norvegicus]

MALWMRFLPLLALLVLWEPKPAQAFVKQHLCGPHLVEALYLVCGERGFFYTPKSRREVEDPQVPQLELGG
GPEAGDLQTLALEVARQKRGIVDQCCTSICSLYQLENYCN
>gi|194272230|ref|NP_001123565.1| proinsulin precursor [Canis lupus familiaris]
MALWMRLLPLLALLALWAPAPTRAFVNQHLCGSHLVEALYLVCGERGFFYTPKARREVEDLQVRDVELAG
APGEGGLQPLALEGALQKRGIVEQCCTSICSLYQLENYCN

2)proinsulin precursor [Homo sapiens].
1)proinsulin precursor [Pan troglodytes]

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