| Autore | Intervento |
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 Prof. Riccardo Percudani
docente |
Fare una ricerca di omologia nella banca dati di proteine usando la transtiretina umana (NP_000362).
1) quante sono le sequenze con somiglianza significativa (E<10-5)?
2) quale è la percentuale di identità e di somiglianza con la sequenza più significativa di topo?
3) Sono presenti sequenze omologhe nei batteri?
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CHIARA BOCCONI
studente |
Fare una ricerca di omologia nella banca dati di proteine usando la transtiretina umana (NP_000362).
1) quante sono le sequenze con somiglianza significativa (E<10-5)? 236
2) quale è la percentuale di identità e di somiglianza con la sequenza più significativa di topo? Identità = 82%, Somiglianza = 92%
3) Sono presenti sequenze omologhe nei batteri? no, perchè la prima sequenza trovata è YP_003095583.1 che ha un valore di e fuori dai limiti di significatività (0.89).
Cristina Attrotto
Chiara Bocconi
Beatrice Biasini
Alex Bersellini Farinotti
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VALERIO FRANCESCO PISCITELLI
studente |
Fare una ricerca di omologia nella banca dati di proteine usando la transtiretina umana (NP_000362).
1) quante sono le sequenze con somiglianza significativa (E<10-5)?
236
2) quale è la percentuale di identità e di somiglianza con la sequenza più significativa di topo?
Identità = (82%), Somiglianza = (92%)
3) Sono presenti sequenze omologhe nei batteri?
sì (ad esempio ZP_05969572.1)
Lorenzo Bertolone
Piscitelli Valerio Francesco
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ANGELO ANTONIO DE FABRIZIO
studente |
Fare una ricerca di omologia nella banca dati di proteine usando la transtiretina umana (NP_000362).
1) quante sono le sequenze con somiglianza significativa (E<10-5)? 236
2) quale è la percentuale di identità e di somiglianza con la sequenza più significativa di topo?
Identities = 120/147 (82%), Positives = 135/147 (92%)
3) Sono presenti sequenze omologhe nei batteri? si (esempio Enterobacter cancerogenus ATCC 35316)
Angelo De Fabrizio
Andrea Dinoi
Pietro Ferrari
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TOMMASO LIUZZI
studente |
Fare una ricerca di omologia nella banca dati di proteine usando la transtiretina umana (NP_000362).
1) quante sono le sequenze con somiglianza significativa (E<10-5)?
2) quale è la percentuale di identità e di somiglianza con la sequenza più significativa di topo?
3) Sono presenti sequenze omologhe nei batteri?
1)236(E<10-5)
2)92%(POSITIVITà)-82%(IDENTITA')
3)SI(|EFC55014.1|
TOMMASO LIUZZI-NUNZIO LAPOLLA-VALENTINA GASPARINI
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CHIARA BOCCONI
studente |
Rettifichiamo la risposta alla terza domanda:
Ci sono sequenze batteriche significative
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SARA DALLA GHIRARDA
studente |
Fare una ricerca di omologia nella banca dati di proteine usando la transtiretina umana (NP_000362).
1) quante sono le sequenze con somiglianza significativa (E<10-5)? 236
2) quale è la percentuale di identità e di somiglianza con la sequenza più significativa di topo? id=82%, som=92%
3) Sono presenti sequenze omologhe nei batteri? sì (ad es. enterobacter cancerogenus)
Sara Dalla Ghirarda Agnese Fratta
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VALENTINA BOBBI
studente |
Fare una ricerca di omologia nella banca dati di proteine usando la transtiretina umana (NP_000362).
1) quante sono le sequenze con somiglianza significativa (E<10-5)? 236
2) quale è la percentuale di identità e di somiglianza con la sequenza più significativa di topo?
Identities = 120/147 (82%), Positives = 135/147 (92%)
3) Sono presenti sequenze omologhe nei batteri?sì esempio YP_003126375.1
E=6e-13
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GAIA BERANTI
studente |
Fare una ricerca di omologia nella banca dati di proteine usando la transtiretina umana (NP_000362).
1) quante sono le sequenze con somiglianza significativa (E<10-5)? 236
2) quale è la percentuale di identità e di somiglianza con la sequenza più significativa di topo? 82% identità, 92% somiglianza
3) Sono presenti sequenze omologhe nei batteri? Sì per es.
YP_003126375.1
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GRETA GIOVENALI
studente |
Fare una ricerca di omologia nella banca dati di proteine usando la transtiretina umana (NP_000362).
1) quante sono le sequenze con somiglianza significativa (E<10-5)? 254
2) quale è la percentuale di identità e di somiglianza con la sequenza più significativa di topo?%id: 82% %som:92%
3) Sono presenti sequenze omologhe nei batteri? sì (es:hydroxyisourate hydrolase [Chitinophaga pinensis DSM 2588] )
agata faroldi
greta giovenali
viviana aguilera
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CHIARA CASTELLINI
studente |
Fare una ricerca di omologia nella banca dati di proteine usando la transtiretina umana (NP_000362).
1) quante sono le sequenze con somiglianza significativa (E<10-5)? 236 (E<10-5)
2) quale è la percentuale di identità e di somiglianza con la sequenza più significativa di topo? id=82% som=92%
3) Sono presenti sequenze omologhe nei batteri? sì. ES ( Chitinophaga pinensis)
Castellini Chiara
Cavallari Sofia
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ALESSIA CAPETTA
studente |
Fare una ricerca di omologia nella banca dati di proteine usando la transtiretina umana (NP_000362).
1) quante sono le sequenze con somiglianza significativa (E<10-5)? 254
2) quale è la percentuale di identità e di somiglianza con la sequenza più significativa di topo? id: 82% som: 92%
3) Sono presenti sequenze omologhe nei batteri? sì (es:Chitinophaga pinensis DSM 2588)
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GIULIA MARIA GRECO
studente |
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ELISA UGHINI
studente |
Fare una ricerca di omologia nella banca dati di proteine usando la transtiretina umana (NP_000362).
1) quante sono le sequenze con somiglianza significativa (E<10-5)?
236
2) quale è la percentuale di identità e di somiglianza con la sequenza più significativa di topo?
identità=82% somiglianza;92%
3) Sono presenti sequenze omologhe nei batteri?
si
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TATIANA ALEXSANDROVNA LASITSA
studente |
Fare una ricerca di omologia nella banca dati di proteine usando la transtiretina umana (NP_000362).
1) quante sono le sequenze con somiglianza significativa (E<10-5)? 254
2) quale è la percentuale di identità e di somiglianza con la sequenza più significativa di topo? Percentuale di identità 82%; percentuale di somiglianza 92%
3) Sono presenti sequenze omologhe nei batteri? Sì, ad esempio YP_003126375.1
Tatiana Lasitsa
Paolo Abondio
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ANDREA BERTINELLI
studente |
Fare una ricerca di omologia nella banca dati di proteine usando la transtiretina umana (NP_000362).
1) quante sono le sequenze con somiglianza significativa (E<10-5)? 254
2) quale è la percentuale di identità e di somiglianza con la sequenza più significativa di topo? 82% 3e-66
3) Sono presenti sequenze omologhe nei batteri? Sì (es.Chitinophaga pinensis DSM 2588)
Bertinelli Andrea, Ferrari Emanuele
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ROSSELLA BONAFEDE
studente |
Fare una ricerca di omologia nella banca dati di proteine usando la transtiretina umana (NP_000362).
1) quante sono le sequenze con somiglianza significativa (E<10-5)? 236
2) quale è la percentuale di identità e di somiglianza con la sequenza più significativa di topo? 92%
3) Sono presenti sequenze omologhe nei batteri? si enterobacter cancerogenus ATCC 35316
Rossella Bonafede
Sonia Figuccia
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GIULIA GIANNINI
studente |
Fare una ricerca di omologia nella banca dati di proteine usando la transtiretina umana (NP_000362).
1) quante sono le sequenze con somiglianza significativa (E<10-5)?
2) quale è la percentuale di identità e di somiglianza con la sequenza più significativa di topo?
3) Sono presenti sequenze omologhe nei batteri?
1)236
2)id%=82%
sim%= 92%
3)Sì (es:Chitinophaga pinensis DSM 2588)
Giannini Giulia e Luperto Martina
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Elena Paini
studente |
Fare una ricerca di omologia nella banca dati di proteine usando la transtiretina umana (NP_000362).
1) quante sono le sequenze con somiglianza significativa (E<10-5)? 236
2) quale è la percentuale di identità e di somiglianza con la sequenza più significativa di topo? id 82% som 92%
3) Sono presenti sequenze omologhe nei batteri? sì esempio
Chitinophaga pinensis DSM 2588
Elena Paini, Giacometti Valentina ,Ghisoni Silvia, Luigi Iorio
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ELENA IERVASI
studente |
Fare una ricerca di omologia nella banca dati di proteine usando la transtiretina umana (NP_000362).
1) quante sono le sequenze con somiglianza significativa (E<10-5)? 236
2) quale è la percentuale di identità e di somiglianza con la sequenza più significativa di topo? 82%; 92%
3) Sono presenti sequenze omologhe nei batteri? sì
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ROBERTA BRIGIDO
studente |
1. 236
2. id= 82% som= 92%
3. Sì per es. Chitinophaga pinensis E= 6e-13
Roberta Brigido
Enrica Citignola
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FEDERICA CATTINI
studente |
Fare una ricerca di omologia nella banca dati di proteine usando la transtiretina umana (NP_000362).
1) quante sono le sequenze con somiglianza significativa (E<10-5)? 236
2) quale è la percentuale di identità e di somiglianza con la sequenza più significativa di topo?
Identities = 120/147 (82%)
Positives = 135/147 (92%)
3) Sono presenti sequenze omologhe nei batteri? Sì (es. Chitinophaga pinensis)
Federica Cattini
Laura Chiapponi
Chiara Griffoni
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ANGELA GILARDONI
studente |
Fare una ricerca di omologia nella banca dati di proteine usando la transtiretina umana (NP_000362).
1) quante sono le sequenze con somiglianza significativa (E<10-5)?
2) quale è la percentuale di identità e di somiglianza con la sequenza più significativa di topo?
3) Sono presenti sequenze omologhe nei batteri?
1. 237
2. 81% identity positives 92%
3. sí Chitinophaga pinensis DSM 2588
ANgela Gilardoni
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ELISA BORASCHI
studente |
Fare una ricerca di omologia nella banca dati di proteine usando la transtiretina umana (NP_000362).
1) quante sono le sequenze con somiglianza significativa (E<10-5)? 236
2) quale è la percentuale di identità e di somiglianza con la sequenza più significativa di topo? 82% e 92%
3) Sono presenti sequenze omologhe nei batteri? sì
bottazzini boraschi
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CATERINA BASILE
studente |
Fare una ricerca di omologia nella banca dati di proteine usando la transtiretina umana (NP_000362).
1) quante sono le sequenze con somiglianza significativa (E<10-5)? 236
2) quale è la percentuale di identità e di somiglianza con la sequenza più significativa di topo? 82% identità, 92% somiglianza
3) Sono presenti sequenze omologhe nei batteri? sì
caterina basile, alessandra formai
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ELISABETTA GHIA
studente |
Fare una ricerca di omologia nella banca dati di proteine usando la transtiretina umana (NP_000362).
1) quante sono le sequenze con somiglianza significativa (E<10-5)? 236
2) quale è la percentuale di identità e di somiglianza con la sequenza più significativa di topo?
id% (82%), som% (92%)
3) Sono presenti sequenze omologhe nei batteri? sí, come ad esempio YP_003126375.1
elisa ambroggi, maddalena dall asta, elisabetta ghia
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ROSSELLA BONAFEDE
studente |
Fare una ricerca di omologia nella banca dati di proteine usando la transtiretina umana (NP_000362).
1) quante sono le sequenze con somiglianza significativa (E<10-5)? 236
2) quale è la percentuale di identità e di somiglianza con la sequenza più significativa di topo? somiglianza 92% identita 82%
3) Sono presenti sequenze omologhe nei batteri? si enterobacter cancerogenus ATCC 35316
Rossella Bonafede
Sonia Figuccia
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Prof. Riccardo Percudani
docente |
Fare una ricerca di omologia nella banca dati di proteine usando la transtiretina umana (NP_000362).
1) quante sono le sequenze con somiglianza significativa (E<10-5)? 236
2) quale è la percentuale di identità e di somiglianza con la sequenza più significativa di topo? 97%
3) Sono presenti sequenze omologhe nei batteri? sì es:Chitinopaga pinensis DSM 2588
Iacono Calogeraelisa
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ILARIA BOTRUGNO
studente |
Fare una ricerca di omologia nella banca dati di proteine usando la transtiretina umana (NP_000362).
1) quante sono le sequenze con somiglianza significativa (E<10-5)? 236
2) quale è la percentuale di identità e di somiglianza con la sequenza più significativa di topo? 82% identità 92% somiglianza
3) Sono presenti sequenze omologhe nei batteri?sì, es ZP_05969572.1
Ilaria Botrugno, Italiano Rossana
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LEANDRA CANZONERI
studente |
Fare una ricerca di omologia nella banca dati di proteine usando la transtiretina umana (NP_000362).
1) quante sono le sequenze con somiglianza significativa (E<10-5)? 236
2) quale è la percentuale di identità e di somiglianza con la
sequenza più significativa di topo? Identità = 82%, Somiglianza = 92%
3) Sono presenti sequenze omologhe nei batteri? no, perchè la prima sequenza trovata è YP_003095583.1 che ha un valore di e fuori dai limiti di significatività (0.89).
leandra canzoneri
annalisa bruno
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ZULENA STELLA VILLA
studente |
Fare una ricerca di omologia nella banca dati di proteine usando la transtiretina umana (NP_000362).
1) quante sono le sequenze con somiglianza significativa (E<=10-5)? 254
2) quale è la percentuale di identità e di somiglianza con la sequenza più significativa di topo? identità 81% somiglianza 92%
3) Sono presenti sequenze omologhe nei batteri? si' es enterobacter cancerogenus
Aleksandra bonini e Zulena stella villa
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