| Autore | Intervento |
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 Prof. Riccardo Percudani
docente |
Trovare in Swissprot la proteina corrispondente all'identificativo DNLI1_HUMAN
1) Qual'è la funzione della proteina?
2) Riportare peso molecolare e coefficiente di estinzione. Scrivere se la proteina è acida, basica o neutra.
3) Fare una ricerca in Prosite e riportare i Pattern contenuti nella proteina.
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DAVIDE CARNEVALI
studente |
1) Questa proteina ripara i tagli nel DNA a doppio filamento durante la replicazione, ricombinazione e riparo del DNA. 2) Peso molecolare = 101736.1 3) Coefficiente di estinzione = 65945 4) la poteina è leggermente acida (P.I. = 5.49 ) 5) DNA_LIGASE_A1 (EYKYDGQRA) e DNA_LIGASE_A2 (EGLMVKtldvdat.YEiakrs.Hnwl..KL) Davide carnevali e Stefano Forcina
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PATRIZIA FERRARI
studente |
FERRARI PATRIZIA E VIRGINIA INGROSSO Trovare in Swissprot la proteina corrispondente all'identificativo DNLI1_HUMAN
1) Qual'è la funzione della proteina? dna ligasi I
2) Riportare peso molecolare e coefficiente di estinzione. peso molecolare=101736.1 = 10 KDa circa coefficiente di estinzione = 65945 Scrivere se la proteina è acida, basica o neutrapI = 5,49 quindi la proteina è leggermente acida
.
3) Fare una ricerca in Prosite e riportare i Pattern contenuti nella proteina.
ha 2 patterns:
PS00697
DNA_LIGASE_A1
ATP-dependent DNA ligase AMP-binding site
:
PS00333
DNA_LIGASE_A2
ATP-dependent DNA ligase signature 2
:
| 720 - 746: |
EGLMVKtldvdat.YEiakrs.Hnwl..KLK
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MARTINA DI PIETRO
studente |
1 la Proteina è una ligasi, enzima preposto a legare porzioni di Dna 2 il coefficiente di estinzione è 65945, il peso molecolare è 101736,1 3 il punto isoelettrico è 5,49: quindi la proteina è acida | |
[EDQH] - {K} - K - {VEDI} - [DN] - G - {GLYN} - R - [GACIVM]
K is the active site residue ATP-dependent DNA ligase AMP-binding site DNA_LIGASE_A1 DNA:LIGASI A2 ATP-dependent DNA ligase signature 2E - G - [LIVMA] - [LIVM] - [LIVMA] - [KR] - x(5,8) - [YW] - [QNEKTI] - x(2,6) - [KRH] - x(3,5) - K - [LIVMFY] - Kmartina di pietro marta fragnito |
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ALICE STRAZER
studente |
1) DNA ligasi 2) . P.M. 101736 Da . Coeff. di estinzione 65495 . Acida, 10.9% di Glu, 5,49 il punto isoelettrico 3)Pattern a1 [EDQH] - {K} - K - {VEDI} - [DN] - G - {GLYN} - R - [GACIVM] a2 E - G - [LIVMA] - [LIVM] - [LIVMA] - [KR] - x(5,8) - [YW] - [QNEKTI] - x(2,6) - [KRH] - x(3,5) - K - [LIVMFY] - K
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ELISA GIUFFREDI
studente |
1) la proteina ricongiunge i nicks nel DNA a doppia elica durante i processi di replicazione,ricombinazione e riparazione del DNA. 2)P.M=101736.1 E= 65945 a 280nm la proteina è acida, perchè il PI<10 3) DNA_LIGASE_A1: EYKYDGQRA DNA_LIGASE_A2: EGLMVKtldvdat.YEiakrs.Hnwl..KLK Gianlorenzi Martina e Giuffredi Elisa
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ALEKSANDRA BONINI
studente |
1. La proteina serve a legare i frammenti di DNA, durante la fase di replicazione. 2. Peso molecolare = 101736,1 Coefficiente di estinzione = 65945 La proteina è acida 3. Pattern : [EDQH] - {K} - K - {VEDI} - [DN] - G - {GLYN} - R - [GACIVM] Aleksandra Bonini e Maria Longo
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Cecilia Balestreri
studente |
Trovare in Swissprot la proteina corrispondente all'identificativo DNLI1_HUMAN
1) Qual'è la funzione della proteina?
è una DNA ligasi, serve per unire i frammenti di okazaky sul filam lento durante la replicaz 2) Riportare peso molecolare e coefficiente di estinzione. Scrivere se la proteina è acida, basica o neutra.
101736.1 Da coeff d'estinzione a 280 nm è 65945
la proteina è acida. ha punto isoelettrico 5.49
3) Fare una ricerca in Prosite e riportare i Pattern contenuti nella proteina. ATP-dependent DNA ligase AMP-binding site (PATTERN) [EDQH] - {K} - K - {VEDI} - [DN] - G - {GLYN} - R - [GACIVM] balestreri
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LUANA AUTULLO
studente |
La proteina è una Dna ligasi 1. Il peso molecolare è 101736.1, il coefficiente di estinzione è 65945 1/Mcm, il PI è 5.49 quindi la proteina è leggermente acida. La proteina ha 2 pattern:
PS00697
DNA_LIGASE_A1
ATP-dependent DNA ligase AMP-binding site
:
PS00333
DNA_LIGASE_A2
ATP-dependent DNA ligase signature 2
:
| 720 - 746: |
EGLMVKtldvdat.YEiakrs.Hnwl..KLK
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NADIA ADINOLFI
studente |
- La proteina è una DNA ligasi.
- Peso molecolare: 101736.1 Coefficiente di estinzione: 65945. La proteina è acida con punto isoelettrico: 5.49.
- Pattern per DNA ligasi A1: [EDQH] - {K} - K - {VEDI} - [DN] - G - {GLYN} - R - [GACIVM] Pattern per DNA ligasi A2: E - G - [LIVMA] - [LIVM] - [LIVMA] - [KR] - x(5,8) - [YW] - [QNEKTI] - x(2,6) - [KRH] - x(3,5) - K - [LIVMFY] - K
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BEATRICE FERMI
studente |
1)-La proteina è una DNA-ligasi ATP dipendente che lega, durante la replicazione, ricombinazione e riparo del DNA, nick sul doppio filamento. 2)- La proteina ha un PM di 101736.1 Da, un coefficiente di estinzione di 65945 ed è acida (pI=5.49)
3)- La proteina contiene i seguenti pattern: [EDQH] - {K} - K - {VEDI} - [DN] - G - {GLYN} - R - [GACIVM]
E - G - [LIVMA] - [LIVM] - [LIVMA] - [KR] - x(5,8) - [YW] - [QNEKTI] - x(2,6) - [KRH] - x(3,5) - K - [LIVMFY] - K Beatrice Fermi, Anastasia Conti
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ROBERTA BONAFEDE
studente |
1-è una DNA ligasi che unisce frammenti di okazaky durante la duplicazione 2- PM 101736.1 Da coeff estinzione 65945 la proteina è acida perchè pI è 5.49 3-il pattern è: DNA_ligasi_A1 PS00697 [EDQH] - {K} - K - {VEDI} - [DN] - G - {GLYN} - R - [GACIVM]
eseguito da LaTorre Angela e Bonafede Roberta
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FEDERICA LARI
studente |
1) la proteina è una DNA ligasi ATP-dipendente 2) PM = 101736.1; coefficiente di estizione= 65945; la proteina è acida 3) pattern della DNA ligasi A1:
[EDQH] - {K} - K - {VEDI} - [DN] - G - {GLYN} - R - [GACIVM]
K is the active site residue pattern della DNA ligasi A2: E - G - [LIVMA] - [LIVM] - [LIVMA] - [KR] - x(5,8) - [YW] - [QNEKTI] - x(2,6) - [KRH] - x(3,5) - K - [LIVMFY] - K
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NICOLO' BEGIONI
studente |
Trovare in Swissprot la proteina corrispondente all'identificativo DNLI1_HUMAN
1) Qual'è la funzione della proteina?
2) Riportare peso molecolare e coefficiente di estinzione. Scrivere se la proteina è acida, basica o neutra.
3) Fare una ricerca in Prosite e riportare i Pattern contenuti nella proteina.
1) DNA ligasi 1, la proteina serve a legare i nucleotidi durante la replicazione del DNA 2) il peso è 101,736 Da e il coefficiente di estinzione è 65945 la proteina è leggermente acida 3) PS00697
DNA_LIGASE_A1
ATP-dependent DNA ligase AMP-binding site
:
PS00333
DNA_LIGASE_A2
ATP-dependent DNA ligase signature 2
:
| 720 - 746: |
EGLMVKtldvdat.YEiakrs.Hnwl..KLK |
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GRAZIA COTUGNO
studente |
This protein seals, during DNA replication, DNA recombination and DNA repair, nicks in double-stranded DNA - pm:101736,1da -pattern:DNA LIGASIA1:[EDQH] - {K} - K - {VEDI} - [DN] - G - {GLYN} - R - [GACIVM] -PATTERN:DNALIGASIA2:E - G - [LIVMA] - [LIVM] - [LIVMA] - [KR] - x(5,8) - [YW] - [QNEKTI] - x(2,6) - [KRH] - x(3,5) - K - [LIVMFY] - K -p.i.:5,49 leggermente acida -coeff estinzione 65945 grazia cotugno e di iasio maria
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MARIA FRATACCI
studente |
- la proteina è una DNA LIGASI I
- il peso molecolare: 101736.1; il coefficiente di estinzione: 65945; il punto isoelettrico: 5.49, quindi la proteina è acida
- dna ligasi A2: E - G - [LIVMA] - [LIVM] - [LIVMA] - [KR] - x(5,8) - [YW] - [QNEKTI] - x(2,6) - [KRH] - x(3,5) - K - [LIVMFY] - K
- dna ligasi A1: [EDQH] - {K} - K - {VEDI} - [DN] - G - {GLYN} - R - [GACIVM]
esercizio svolto da: Angelica Moro e Maria Fratacci
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ERICA FIORINI
studente |
trovare in Swissprot la proteina corrispondente all'identificativo DNLI1_HUMAN
1) Qual'è la funzione della proteina?
2) Riportare peso molecolare e coefficiente di estinzione. Scrivere se la proteina è acida, basica o neutra.
3) Fare una ricerca in Prosite e riportare i Pattern contenuti nella proteina.
1) DNA ligase I 2) Molecular weight: 101736.1 Da (101,7 KDa) Ext. coefficient 65945 M^-1 cm^-1 Theoretical pI: 5.49 (quindi la proteina è acida) 3) I pattern sono 2: DNA_LIGASE_A1
ATP-dependent DNA ligase AMP-binding site
:
e DNA_LIGASE_A2
ATP-dependent DNA ligase signature 2
:
| 720 - 746: |
EGLMVKtldvdat.YEiakrs.Hnwl..KLK |
FIORINI ERICA TOSCHI MARTA
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MARTINA BONACINI
studente |
1) é una DNA ligasi che durante la replicazione, ricombinazione e riparazione del DNA catalizza la ligazione dei nick nel DNA a doppio filamento 2)PM= 101736.1 PI=5.49 quindi è una proteina acida Coefficiente di estinzione molare= 65945 3)DNA ligasi A1 e DNA ligasi A2
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ALESSANDRO LEO
studente |
- La proteina è una DNA-LIGASI
(This protein seals, during DNA replication, DNA recombination and DNA repair,
nicks in double-stranded DNA)
- Peso Molecolare: 101736.1
- Coefficiente d'estinzione: 65945
- pI: 5.49 quindi sarà ACIDA
- Ha due PATTERN:
PS00697 DNA_LIGASE_A1 ATP-dependent DNA ligase AMP-binding site :
566 - 574: EYKYDGQRA
PS00333 DNA_LIGASE_A2 ATP-dependent DNA ligase signature 2 :
720 - 746: EGLMVKtldvdat.YEiakrs.Hnwl..KLK LEO ALESSANDRO
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MARIA CAZZATO
studente |
MARIA CAZZATO E GUARINO LORENA 1)LA PROTEINA è UNA DNA LIGASI ATP -DIPENDENTE 2) PESO MOLECOLARE: 101736.1 3)COEFF.ESTINZIONE : 65945 4) pI : 5.49 (LA PROTEINA è ACIDA) 5) I PATTERNS SONO DUE: | |
PS00697
DNA_LIGASE_A1
ATP-dependent DNA ligase AMP-binding site
:
PS00333
DNA_LIGASE_A2
ATP-dependent DNA ligase signature 2
:
| 240 - 266: |
EGLMVKtldvdat.YEiakrs.Hnwl..KLK
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ALETHEIA BLASI
studente |
1) DNA Ligasi 1 2) Peso molecolare: 101736.1 Coefficente di estinzione: 65945 la proteina è acida 3)DNA_LIGASE_A1
ATP-dependent DNA ligase AMP-binding site
:
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DNA_LIGASE_A2
ATP-dependent DNA ligase signature 2
:
| 720 - 746: |
EGLMVKtldvdat.YEiakrs.Hnwl..KLK |
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Giovanna Traina
studente |
la funzione della proteina é: DNA ligase 1 peso molecolare= 101736.1 = 10 KDa circa coefficiente di estinzione = 65945 pI: 5,4 la proteina è leggermente acida ha 2 patterns:
PS00697
DNA_LIGASE_A1
ATP-dependent DNA ligase AMP-binding site
:
PS00333
DNA_LIGASE_A2
ATP-dependent DNA ligase signature 2
:
| 720 - 746: |
EGLMVKtldvdat.YEiakrs.Hnwl..KLK |
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MIRIAM GAUDENZI
studente |
1) questa proteina agisce nella riparazione,nella replicazione e nella ricombinazione del DNA(è una ligasi quindi forma il legame tra gruppo fosfato e lo zucchero) 2) PM :101736,1 Da Coefficiente di estinzione: 65945 presenza di glutammato in una porzione del 10,9%,quindi la proteina è acida 3)Ci sono due pattern: DNA ligasi A2: E - G - [LIVMA] - [LIVM] - [LIVMA] - [KR] - x(5,8) - [YW] - [QNEKTI] - x(2,6) - [KRH] - x(3,5) - K - [LIVMFY] - K DNA ligasi A1:[EDQH] - {K} - K - {VEDI} - [DN] - G - {GLYN} - R - [GACIVM]
esercizio svolto da Chiara Forlini e MIriam Gaudenzi
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ALESSANDRO DONDI
studente |
1- Questa proteina interviene nei processi di Duplicazione,ricombinazione e riparazione del DNA saldando le rotture a doppio filamento del DNA . 2- peso Molecolare 101736 Da / coefficiente di estinzione 65945 a 280 nm si tratta di una proteina acida con PI di 5.49
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CRISTINA COPPELLI
studente |
La proteina è una Dna ligasi 1. Il peso molecolare è 101736.1,
il coefficiente di estinzione è 65945 1/Mcm, il PI è 5.49 quindi la
proteina è leggermente acida. La proteina ha 2 pattern:
PS00697
DNA_LIGASE_A1
ATP-dependent DNA ligase AMP-binding site
:
PS00333
DNA_LIGASE_A2
ATP-dependent DNA ligase signature 2
:
| 720 - 746: |
EGLMVKtldvdat.YEiakrs.Hnwl..KLK |
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MARTINA BONACINI
studente |
Fatto da Bonacini Martina e Marchetti Marialaura
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SIMONA COVIELLO
studente |
funzione della proteina Dna Ligasi atp-dipendente peso molecolara:101736,1 coefficente di estinzione 65945 la proteina è acida (pI 5,49)
pattern: DNA_LIGASE_A1 EYKYDGQRA DNA_LIGASE_A2
EGLMVKtldvdat.YEiakrs.Hnwl..KLK
Simona Coviello , Marta Maghenzani
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FRANCESCA COLTELLACCI
studente |
1. dna-ligasi atp dipendente 2.pm=101736.1;coeff. di estinzione 65945; la proteina è acida 3.pattern:dna-ligasi A1EYKYDGQRA dna-ligasi A2EGLMVKtldvdat.YEiakrs.Hnwl.KLK caruso rosa maria e francesca coltellacci
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ILARIA FALVO
studente |
1.LA PROTEINA è UNA DNA LIGASI 1 2.PM 101736.1,COEFFICIENTE D'ESTINZIONE 65945,PI 5.49 QUINDI è ACIDA 3.SONO PRESENTI 2 PATTERN: DNA LIGASI A1 ([EDQH] - {K} - K - {VEDI} - [DN] - G - {GLYN} - R - [GACIVM])
E DNA LIGASI A2 (E - G - [LIVMA] - [LIVM] - [LIVMA] - [KR] - x(5,8) - [YW] - [QNEKTI] - x(2,6) - [KRH] - x(3,5) - K - [LIVMFY] - K)
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ALEKSANDRA BONINI
studente |
Correzione Pattern: E - G - [LIVMA] - [LIVM] - [LIVMA] - [KR] - x(5,8) - [YW] - [QNEKTI] - x(2,6) - [KRH] - x(3,5) - K - [LIVMFY] - K [EDQH] - {K} - K - {VEDI} - [DN] - G - {GLYN} - R - [GACIVM]
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GIULIA MORI
studente |
1)La proteina è una DNAligasi ATP-dipendente. Agisce nella
replicazione del DNA per legare covalentemente i frammenti di Okazaki
sul filamento lento. 2)PM: 101736.1 Coefficiente di estinzione:65945 La proteina è acida. 3)Pattern della DNAligasiA1: [EDQH] - {K} - K - {VEDI} - [DN] - G - {GLYN} - R - [GACIVM]Pattern della DNAligasi A2 : E - G - [LIVMA] - [LIVM] - [LIVMA] - [KR] - x(5,8) - [YW] - [QNEKTI] - x(2,6) - [KRH] - x(3,5) - K - [LIVMFY] - K
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LAURA ACCOGLI
studente |
1) DNA ligasi 2) questa proteina unisce nick sul doppio filamento durante la replicazione, ricombinazione e riparo del DNA. PM=101736,1. coeff estinzione=65945. Proteina leggermente acida 3) 2 patterns: [EDQH] - {K} - K - {VEDI} - [DN] - G - {GLYN} - R - [GACIVM]
E - G - [LIVMA] - [LIVM] - [LIVMA] - [KR] - x(5,8) - [YW] - [QNEKTI] - x(2,6) - [KRH] - x(3,5) - K - [LIVMFY] - K
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FEDERICA LARI
studente |
1) funzione proteina: DNA-ligasi che ripara i nick nella molecola di DNA a doppio filamento durante replicazione, rimbinazione e riparazione.
2)
PM: 101,736 Da
coeff. estinzione: 65945 considerando tutte le cys come ponti disolfuro
65320 considerando nessuna cys come ponte disolfuro
pI: 5.49 proteina acida
3) sequenza consenso:
[EDQH] - {K} - K - {VEDI} - [DN] - G - {GLYN} - R - [GACIVM]
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