| Autore | Intervento |
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 Prof. Riccardo Percudani
docente |
Trovare l'omologo più significativo in Rattus norvegicus della proteina di fungo XP_001396522.
Riportare:
% di somiglianza e significatività del Blast
% di somiglianza e punteggio dell'allineamento globale (needle)
% di somiglianza e punteggio dell'allineamento locale (water)
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CECILIA NOLLI
studente |
Trovare l'omologo più significativo in Rattus norvegicus della proteina di fungo XP_001396522.
Riportare:
% di somiglianza e significatività del Blast 39% E=6e-14
% di somiglianza e punteggio dell'allineamento globale (needle) 23.4% e 211
% di somiglianza e punteggio dell'allineamento locale (water) 44,7% e 228,5
La somiglianza è più locale che globale.
Gloria Spagnoli
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ALESSANDRA MUSIARI
studente |
% di somiglianza=45% e significatività=6e-14
% di somiglianza=23.4% e punteggio dell'allineamento globale (needle)=211
% di somiglianza=44.7% e punteggio dell'allineamento locale (water)=228.5
L'allinemento è locale perchè i valori sono abbastanza distanti
Alessandra Musiari
Serena Rabaglia
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EMILIO PERFETTO
studente |
Trovare l'omologo più significativo in Rattus norvegicus della proteina di fungo XP_001396522.
Riportare:
% di somiglianza e significatività del Blast
Expect = 1e-14
% di somiglianza e punteggio dell'allineamento globale (needle)
Length: 607
# Identity: 79/607 (13.0%)
# Similarity: 142/607 (23.4%)
# Gaps: 340/607 (56.0%)
# Score: 211.0
% di somiglianza e punteggio dell'allineamento locale (water)
Length: 295
# Identity: 76/295 (25.8%)
# Similarity: 132/295 (44.7%)
# Gaps: 57/295 (19.3%)
# Score: 228.5
Emilio Perfetto, Michele Pastorelli
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ALESSIO SARDELLA
studente |
Trovare l'omologo più significativo in Rattus norvegicus della proteina di fungo XP_001396522.
Riportare:
% di somiglianza e significatività del Blast
Positives = 132/291 (45%) Expect = 6e-14
% di somiglianza e punteggio dell'allineamento globale (needle)
Similarity: 142/607 (23.4%)
Score: 211.0
usando blosum62
% di somiglianza e punteggio dell'allineamento locale (water)
Similarity: 132/295 (44.7%)
Score: 228.5
usando blosum62
Alessio Sardella
Francesca Di Stefano
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ANGELA VOLPE
studente |
Trovare l'omologo più significativo in Rattus norvegicus della proteina di fungo XP_001396522.
Riportare:
% di somiglianza e significatività del Blast
nitrilase family, member 2 [Rattus norvegicus]
%somiglianza = 45%
% di somiglianza e punteggio dell'allineamento globale (needle)
142/607 (23.4%)
% di somiglianza e punteggio dell'allineamento locale (water)
132/295 (44.7%)
Volpe Angela
Paladino Orsola Letizia
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LUCA STRAGLIATI
studente |
Trovare l'omologo più significativo in Rattus norvegicus della proteina di fungo XP_001396522.
Riportare:
% di somiglianza e significatività del Blast
nitrilase family, member 2 [Rattus norvegicus]
%somiglianza= 132/291 (45%)
Expect = 6e-14
% di somiglianza e punteggio dell'allineamento globale (needle)
Similarity: 142/607 (23.4%)
Score: 211.0
% di somiglianza e punteggio dell'allineamento locale (water)
Similarity: 132/295 (44.7%)
Score: 228.5
L'allineamento è locale
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ADRIANA VITIELLO
studente |
Trovare l'omologo più significativo in Rattus norvegicus della proteina di fungo XP_001396522.
Riportare:
% di somiglianza e significatività del Blast
nitrilase family, member 2 [Rattus norvegicus]
significatività= 6e-14
%somiglianza= 45%
% di somiglianza e punteggio dell'allineamento globale (needle)
Similarity: 142/607 (23.4%)
Score: 211.0
% di somiglianza e punteggio dell'allineamento locale (water)
Similarity: 132/295 (44.7%)
Score: 228.5
Alice Salviati
Adriana Vitiello
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MATTIA AGOSTI
studente |
Trovare l'omologo più significativo in Rattus norvegicus della proteina di fungo XP_001396522.
Riportare:
% di somiglianza e significatività del Blast
% di somiglianza e punteggio dell'allineamento globale (needle)
% di somiglianza e punteggio dell'allineamento locale (water)
RISPOSTE:
1)% di somiglianza e significatività del Blast 39% E=6e-14
2)Global
Similarity: 142/607 (23.4%)
Score: 211.0
3)Local
Similarity: 132/295 (44.7%)
Score: 228.5
L'allineamento è più locale.
Agosti Mattia.
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SHARON FABIOLA SCOLARI
studente |
Trovare l'omologo più significativo in Rattus norvegicus della proteina di fungo XP_001396522.
Riportare:
% di somiglianza e significatività del Blast
% di somiglianza e punteggio dell'allineamento globale (needle)
% di somiglianza e punteggio dell'allineamento locale (water)
1) somiglianza = 132/291 (45%)
significatività = 6e-14
2) somiglianza = 142/607 (23.4%)
Score: 211.0
3) somiglianza = 132/295 (44.7%)
Score: 228.5
Stracci Fabio
Scolari Sharon Fabiola
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ALESSANDRO PINELLI
studente |
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Riportare:
% di somiglianza e significatività del Blast
% di somiglianza e punteggio dell'allineamento globale (needle)
% di somiglianza e punteggio dell'allineamento locale (water)
1) somiglianza e significatività nel Blast:
Score = 77.0 bits (188), Expect = 4e-14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 72/291 (24%), Positives = 132/291 (45%), Gaps = 49/291 (16%)
2)Allineamento globale (needle):
Identity: 77/604 (12.7%)
# Similarity: 143/604 (23.7%)
# Gaps: 334/604 (55.3%)
# Score: 189.0
3) Allineamento locale (water):
Identity: 74/292 (25.3%)
# Similarity: 133/292 (45.5%)
# Gaps: 51/292 (17.5%)
# Score: 207.0
Alessandro Pinelli
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STEFANO BRANCA
studente |
% di somiglianza e significatività del Blast
somiglianza 45%
significatività 6e-14
% di somiglianza e punteggio dell'allineamento globale (needle)
somiglianza 23.4 %
% di somiglianza e punteggio dell'allineamento locale (water)
somiglianza 44.7%
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FRANCESCA SANDRINI
studente |
Trovare l'omologo più significativo in Rattus norvegicus della proteina di fungo XP_001396522.
Riportare:
% di somiglianza e significatività del Blast
39% E=6e-14
% di somiglianza e punteggio dell'allineamento globale (needle)
23.4% e 211
% di somiglianza e punteggio dell'allineamento locale (water)
44.7 e 228.5
martina galli
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ANGELA SANSONE
studente |
Trovare l'omologo più significativo in Rattus norvegicus della proteina di fungo XP_001396522.
Riportare:
% di somiglianza e significatività del Blast.
Positives = 132/291 (45%)
6e-14 significatività
% di somiglianza e punteggio dell'allineamento globale (needle)
142/607 (23.4%)somiglianza
211 score
% di somiglianza e punteggio dell'allineamento locale (water)
132/295 (44.7%)somiglianza
228.5 score
l'allinemento è locale
Maria Carla Teresi
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LAURA RAFFELINI
studente |
Trovare l'omologo più significativo in Rattus norvegicus della proteina di fungo XP_001396522.
Riportare:
% di somiglianza e significatività del Blast
nitrilase family, member 2 [Rattus Norvegicus]
132/291 (45%)
Expect= 6e-4
% di somiglianza e punteggio dell'allineamento globale (needle)
similarity 142/607 (23,4%)
score 211.0
% di somiglianza e punteggio dell'allineamento locale (water)
similarity 132/295 (44,7%)
score 228.5
L'allineamento è locale
SCARDINA FRANCESCA PAOLA - RAFFELINI LAURA
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MATTEO PEDEGANI
studente |
1) Positives = 132/291 (45%)
NP_001029298 E=6e-14
2) % somiglianza= 23.4%
punteggio= 211
3) % somiglianza= 44.7%
punteggio= 228.5
Matteo Pedegani
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MATTIA AGOSTI
studente |
Agosti Mattia
Correzione: % di somiglianza 45%
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LAURA GOBBI
studente |
Trovare l'omologo più significativo in Rattus norvegicus della proteina di fungo XP_001396522.
Riportare:
1) % di somiglianza 45%
significatività: 6e-14
2)% di somiglianza= 23,4%
punteggio dell'allineamento globale (needle) 211
3) % di somiglianza 44,7%
punteggio dell'allineamento locale (water) 228,5
Elisa Taccia, Laura Gobbi
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GIUSEPPE BALZANI
studente |
Trovare l'omologo più significativo in Rattus norvegicus della proteina di fungo XP_001396522.
Riportare:
1)% di somiglianza e significatività del Blast
Expect=9e-19
% somiglianza= 132/291 (45%)
2)% di somiglianza e punteggio dell'allineamento globale (needle)
% di somiglianza: 23,4%
Score: 211
3)% di somiglianza e punteggio dell'allineamento locale (water)
% di somiglianza: 44,7%
Score: 228.5
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ANNALISA SISTO
studente |
Trovare l'omologo più significativo in Rattus norvegicus della proteina di fungo XP_001396522.
Riportare:
% di somiglianza e significatività del Blast
% di somiglianza e punteggio dell'allineamento globale (needle)
% di somiglianza e punteggio dell'allineamento locale (water)
L'omologo più significativo è nitrilase family, member 2
% somiglianza= 132/291 (45%)
% significatività= 6e-14
% somiglianza allineamento globale= 142/607 (23.4%)
score allineamento globale= 211.0
% somiglianza allineamento locale= 132/255 (44.7%)
score allineamento locale= 228.5
l'allineamento è con ogni probabilità locale.
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MONIKA BACO
studente |
1)
somiglianza 45 % (132/291)
significatività 9e-19
2)globale:
Similarity: 142/607 (23.4%)
Score: 211.0
3)locale:
Similarity: 132/295 (44.7%)
Score: 228.5
baco/isufi
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JONATHAN TODISCO
studente |
Trovare l'omologo più significativo in Rattus norvegicus della proteina di fungo XP_001396522.
Riportare:
% di somiglianza e significatività del Blast
nitrilase family, member 2 [Rattus norvegicus]
% di somiglianza = 132/291 (45%)
Expect = 6e-14
% di somiglianza e punteggio dell'allineamento globale (needle)
Similarity: 142/607 (23.4%)
Score: 211.0
% di somiglianza e punteggio dell'allineamento locale (water)
Similarity: 132/295 (44.7%)
Score: 228.5
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VINCENZA SPECIALE
studente |
% di somiglianza=45% e significatività=6e-14
% di somiglianza=23.4% e punteggio dell'allineamento globale=211
% di somiglianza=44.7% e punteggio dell'allineamento locale =228.5
L'allinemento è locale
GIUSI LANZILOTTI
ROBERTA BARONE
VINCENZA SPECIALE
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ARIANNA MOLINARI
studente |
Somiglianza = 6e-14
Allineamento needle
Identity: 79/607 (13.0%)
Similarity: 142/607 (23.4%)
Score: 211.0
Allineamento locale
Identity: 76/295 (25.8%)
Similarity: 132/295 (44.7%)
Score: 228.5
Arianna Molinari
Oliva Ester
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GIULIA PESCARA
studente |
Trovare l'omologo più significativo in Rattus norvegicus della proteina di fungo XP_001396522.
Riportare:
% di somiglianza e significatività del Blast
% di somiglianza e punteggio dell'allineamento globale (needle)
% di somiglianza e punteggio dell'allineamento locale (water)
L'omologo più significativo è nitrilase family, member 2
% somiglianza= 132/291 (45%)
% significatività= 6e-14
% somiglianza allineamento globale= 142/607 (23.4%)
score allineamento globale= 211.0
% somiglianza allineamento locale= 132/255 (44.7%)
score allineamento locale= 228.5
l'allineamento è con ogni probabilità locale.
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ALICE ZUCCOLI
studente |
Trovare l'omologo più significativo in Rattus norvegicus della proteina di fungo XP_001396522.
Riportare:
% di somiglianza e significatività del Blast
% di somiglianza e punteggio dell'allineamento globale (needle)
% di somiglianza e punteggio dell'allineamento locale (water)
L'omologo più significativo è nitrilase family, member 2
% somiglianza= 132/291 (45%)
% significatività= 6e-14
% somiglianza allineamento globale= 142/607 (23.4%)
score allineamento globale= 211.0
% somiglianza allineamento locale= 132/255 (44.7%)
score allineamento locale= 228.5
l'allineamento è con ogni probabilità locale.
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Elena Paini
studente |
Trovare l'omologo più significativo in Rattus norvegicus della proteina di fungo XP_001396522.
Riportare:
% di somiglianza e significatività del Blast
45% di somiglianza E= 6e-14 di significatività
% di somiglianza e punteggio dell'allineamento globale (needle)
(23.4%)di somiglianza e 211 di punteggio
% di somiglianza e punteggio dell'allineamento locale (water)
44,7% di somiglianza e 228.5 di punteggio
vista la grande differenza tra i due valori pertanto la somiglianza è di tipo locale.
Elena Paini
Lucia Isetti
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DAVIDE SARRA
studente |
Trovare l'omologo più significativo in Rattus norvegicus della proteina di fungo XP_001396522.
Riportare:
% di somiglianza e significatività del Blast
NP.001029298.1 nitrilase family member 2
%somiglianza 45%
significatività 6e-14
% di somiglianza e punteggio dell'allineamento globale (needle)
%somiglianza = 18.3%
score = 180
% di somiglianza e punteggio dell'allineamento locale (water)
%somiglianza = 46.5%
score = 186.5
conclusione = dai risultati si evince che le sequenze hanno una somiglianza locale
Claudia Romanelli
Davide Sarra
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VALENTINA ROSSI
studente |
Trovare l'omologo più significativo in Rattus norvegicus della proteina di fungo XP_001396522.
Riportare:
% di somiglianza e significatività del Blast
Somiglianza : 45%
Significatività : E=6e-14
% di somiglianza e punteggio dell'allineamento globale (needle)
Somiglianza 142/607 (23.4%)
Punteggio = 211.0
% di somiglianza e punteggio dell'allineamento locale (water)
Somiglianza 132/295 (44.7%)
Punteggio = 228.5
Ilaria Tagliani
Valentina Rossi
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