| Autore | Intervento |
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Prof. Riccardo Percudani
docente |
Considerate le sequenze:
>HBB_HUMAN - Homo sapiens VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKV KAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGK EFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH >HBA_GORGO - Gorilla gorilla VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGDYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAV AHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKY R >HBB_MACRU Macropus rufus (Red kangaroo) VHLTAEEKNAITSLWGKVAIEQTGGEALGRLLIVYPWTSRFFDHFGDLSNAKAVMGNPKV LAHGAKVLVAFGDAIKNLDNLKGTFAKLSELHCDKLHVDPENFKLLGNIIVICLAEHFGK EFTIDTQVAWQKLVAGVANALAHKYH
1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla :
Homo - Macropus :
Macropus - Gorilla:
2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?
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OLGA CHIESA studente |
1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla : 41%
Homo - Macropus : 74%
Macropus - Gorilla: 36%
2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?
i geni sono paraloghi perchè le differenze amminoacidiche sono localizzate tutte negli stessi punti, quindi è probabile che le mutazioni siano avvenute per eventi di duplicazione
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SERENA MONTALBANO studente |
Human-Gorgo 41%
Human-Macru 74%
Macru-Gorgo 36%
I geni sono paraloghi perchè la percentuale di somiglianza è troppo bassa e non sono d'accordo con la filogenesi dell'organismo.
Serena Montalbano
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Prof. Riccardo Percudani
docente |
1-identità percentuale
Homo-Gorilla:41 %
Homo-Macropus:74%
Macropus-Gorilla:36%
2-tipologia dei geni
ci sono dei geni tra loro paraloghi poichè non vi è accordo con la filogenesi dell'organismo
Virginia Ingrosso
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THEKLA LEONE studente |
homo-gorilla 41% identità
homo-macropus 74% identità
macropus-gorilla 36% identità
pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?
sono presenti geni paraloghi.si noti la percentuale d'identità tra homo e gorilla che che si discosta molto dalla filogenesi degli organismi
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MICOL GILBERTI studente |
identità uomo-gorilla: 41%
uomo-canguro: 74%
canguro-gorilla: 36%
Uomo e gorilla dovremmero somigliarsi molto di più (circa il 90%).queste somiglianze non sono d'accordo con la filogenesi degli organismi. Questo significa che ci sono geni paraloghi.
Micol Gilberti
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IVANA GALLO studente |
1-IDENTITà PERCENTUALE:
homo-gorilla:41% di identità
homo-macropus:74% di identità
macropus-gorilla:36% di identità
2-ORTOLOGHE O PARALOGHE:
Sono presenti geni paraloghi in quanto si nota che questi risultati non rispecchiano la filogenesi degli organismi,poichè ad esempio tra uomo e gorilla la percentuale di identità dovrebbe essere circa il 90%
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ILARIA BOTRUGNO studente |
1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla : 41%
Homo - Macropus : 74%
Macropus - Gorilla: 36%
2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?
Dall'allimeamento si osserva che il gene uomo e il gene gorilla non si sono divisi per speciazione, ma molto prima cioè 400.000.000 di anni fa e per questo motivo sono paraloghi.
Il fatto che siano paraloghi si evidenzia anche dalle percentuali riscontrate: tra uomo e gorilla ci si aspetterebbe un'elevata percentuale d'identità invece è pari al 41%. proprio perchè sono paraloghi e si sono divisi molto prima, si evidenzia una strana elevata percentuale d'identità tra uomo e canguro.
Botrugno Ilaria
Lezzi Ludovica
Dosi Beatrice
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CLAUDIA CANNETIELLO studente |
1 identità percentuale
homo-gorilla 41%
homo-macropus 74%
macropus-gorilla 36%
2 tipologia dei geni
Sono presenti geni paraloghi perchè sono diversi tra di loro
Si osserva una somiglianza maggiore tra uomo e canguro piuttosto che tra uomo e gorilla.
Federica Cassinelli - Claudia Cannetiello
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PIETRO CRAVEDI studente |
Homo - Gorilla : 41%
Homo - Macropus : 74%
Macropus - Gorilla: 36%
HBB_HUMAN e HBB_MACRU sono sequenze di proteine codificate da geni ortologhi tra loro per via dell'elevata identità e del fatto che sono entrambe catene di beta-emoglobina (stessa funzione)
HBA_GORGO è una proteina da un gene paralogo rispetto agli altri due perchè la sua identità rispetto agli altri è bassa (rispetto all'identità che sussite tra gli altri due). Inoltre (dal nome) è una catena di alfa-emoglobina, quindi il suo gene è stato originato per duplicazione genica del gene della beta-emoglobina (o viceversa)
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LUCA BARBATO studente |
1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla : 41%
Homo - Macropus : 74%
Macropus - Gorilla: 36%
2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?
Noi sappiamo che l'uomo e il gorilla dovrebbero essere simili, ma l'identità percentuale dell'uomo-gorilla è molto inferiore a quello che ci aspettiamo e quindi i geni sono paraloghi perchè non ci fornisce informazioni riguardo la storia evolutiva degli organismi.
Luca Barbato
Monia Fronzuti
Valentina Ferrari
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DANIELE BULGARI studente |
1)
Homo - Gorilla : 41%
Homo - Macropus :74%
Macropus - Gorilla: 36%
2)
ci sono dei geni tra loro paraloghi poichè non rispettano la filogenesi, dato l'uomo e il gorilla condividono oltre il 90% del materiale genetico.
christian bozzetti daniele bulgari
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LUCA GARGIULO studente |
Percentuale identità uomo gorilla 41%
uomo canguro 74%
canguro gorilla 36%
I geni sono paraloghi perchè sono molto diversi tra loro e quindi probabilmente derivano dalla mutazione di un unico gene ancestore.
I geni di canguro e uomo sono più simili tra loro, quindi probabilmente si sono divisi in tempi più recenti.
GARGIULO LUCA
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NICOLANNA FILOMENA studente |
1)La percentuale di identità tra
Homo-gorilla è del 41%
Homo-Macropus è del 74%
Macropus-Gorilla è del 36%
2)Dalle percentuali si osserva una somiglianza maggiore tra uomo e canguro che tra uomo e gorilla quindi ci sono geni paraloghi
FILOMENA NICOLANNA-LEANDRA CANZONERI-ANNALISA BRUNO
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CHIARA ALIANI studente |
1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla :41%
Homo - Macropus :74%
Macropus - Gorilla:36%
2) sono paraloghi perchè le somiglianze percentuali hanno valori troppo bassi;se fossero ortologhi avrebbero una struttura, e quindi somiglianze percentuali,più simili.
chiara aliani e ambra dondi
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PATRIZIA CHERUBINI studente |
2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?
human- gorgo: 41%
human- macru:74%
macru- gorgo: 36%
Ci sono dei geni paraloghi perchè l'identità in percentuale tra uomo e gorilla è molto poca mentre conoscendo la filogenesi degli organismi la somiglianza, nel caso di geni ortologhi, avrebbe dovuto essere molto maggiore.
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SILVIA GIUPPONI studente |
1)
Homo - Gorilla : 41% Homo - Macropus : 74% Macropus - Gorilla: 36%
2)
uomo e gorilla sono paraloghi per discrepanza tra la % e la somiglianza filogenetica;
uomo e canguro sono paraloghi infatti la % non rispecchia la realtà appartenendo i due individui a 2 classi differenti:marsupiali e mammiferi;
gorilla e canguro sono paraloghi per i motivi precedenti.
Silvia Giupponi e Antonella Falconieri
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FRANCESCA PAOLA SCARDINA studente |
1-Identità percentuale
Homo-gorilla:41%
Homo-Macropus:74%
Macropus-Gorilla:36%
sono geni fra loro paraloghi in quanto non rispettano la filagenesi dell'organismo.
Ambra Incorvaia
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ILARIA AZZINI studente |
uomo-gorilla 41%
uomo-macru 74%
macru-gorilla 36%
le sequenze sono paraloghe perchè tra uomo e macru c'è una percentuale maggiore di identita. se fossero ortologhe la percentuale maggiore dovrebbe essere tra uomo e gorilla.
Alessandra Biondi e Ilaria Azzini
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GIULIANA CIRILLO studente |
uomo gorilla: 41%
uomo macropus: 74%
gorilla macropus: 36%
i geni dell'uomo e del macropus sono probabilmente ortologhi in quanto hanno maggiore identità e probabilmente derivano dallo stesso gene ancestrale.
confrontando i geni uomo-gorilla e gorilla-macropus si nota una identità inferiore al 50 %, quindi più bassa, e per questo possiamo pensare che siano paraloghi.
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ELISA AMBROGGI studente |
1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla :41%
Homo - Macropus :74%
Macropus - Gorilla:36%
I geni sono paraloghi perchè le differenze amminoacidiche sono localizzate negli stessi punti, quindi è probabile che siano avvenute mutazioni per eventi di duplicazione.
Inoltre, tra uomo e gorilla la percentuale di identità è molto bassa , quando invece dovrebbe essere molto alta dato che derivano dalla stessa filogenesi:di conseguenza i geni sono paraloghi. Gli altri due sono paraloghi per gli stessi motivi.
Elisa Ambroggi Ghielmi Caterina
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ALESSANDRA D'ARELLI studente |
Identità % tra uomo-gorilla del 41%
tra uomo-macropus del 74%
tra macropus e gorilla del 36%
I geni tra loro non sono in accordo con la filogenesi, quindi sono presenti paraloghi.
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FRANCESCO DIROMA studente |
Homo - Gorilla : 41%
Homo - Macropus : 74%
Macropus - Gorilla: 36%
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ALESSIA MARMORINO studente |
Homo - Gorilla : 41%
Homo - Macropus : 74%
Macropus - Gorilla: 36%
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ENZA VALENTINA CARUSO studente |
1-identità percentuale.
Homo-Gorilla 41%
Homo-Macropus 74%
Macropus-Gorilla 36%
2.tipologia di geni
Ci sono dei geni paraloghi dato che sono separati per duplicazione genica e gli organismi sono filogeneticamente differenti.
Enza Caruso e Ilaria Clarizio
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MONIKA BACO studente |
1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla :41%
Homo - Macropus :74%
Macropus - Gorilla:36%
2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?
Sono presenti dei paraloghi, in quanto non seguono un evento di speciazione
Baco Monika, Isufi Elda, Balzani Giuseppe
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ELISA IRONI studente |
1) homo gorilla:41%
homo macropus: 74%
macropus gorilla: 36%
2) I geni dell' uomo e del gorilla sono sicuramente paraloghi in quanto sono in disaccordo con la filogenesi; i risultati differiscono dalle aspettative che prevedono una percentuale di indentità molto maggiore di quella ottenuta.
Elisa Ironi
Maria Chiara Guidone
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ALESSANDRA BIONDI studente |
uomo-gorilla 41%
uomo-macru 74%
macru-gorilla 36%
le sequenze sono paraloghe perchè tra uomo e macru c'è una
percentuale maggiore di identita. se fossero ortologhe la percentuale
maggiore dovrebbe essere tra uomo e gorilla.
Alessandra Biondi e Ilaria Azzini
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VANESSA CATALDI studente |
1-identita percentuale
homo-gorilla:41%
homo-macropus:74%
macropus-gorilla:36%
2-tipologia dei geni
sono presenti dei geni tra loro paraloghi poiche non c è accordo con la filogenesi degli organismi
vanessa cataldi
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FRANCESCO DIROMA studente |
I geni sono molto differenti tra loro perchè paraloghi, molto probabilmente possono derivare da una mutazione di un gene ancestrale che hanno in comune.
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SILVIA LAZZERINI studente |
1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla : 41%
Homo - Macropus : 74%
Macropus - Gorilla: 36%
2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?
i geni sono paraloghi perchè le differenze amminoacidiche sono
localizzate tutte negli stessi punti, quindi è probabile che le
mutazioni siano avvenute per eventi di duplicazione
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ALESSANDRA BETTUZZI studente |
Percentuale identità uomo gorilla 41%
uomo canguro 74%
canguro gorilla 36%
E' più probabile che i geni risultino essere paraloghi perchè le percentuali di identità sono molto bassi e quindi probabilmente derivano dalla mutazione di un unico gene ancestore.
I geni di canguro e uomo sono più simili tra loro, quindi probabilmente si sono divisi in tempi più recenti o sono ortologhi.
BETTUZZI ALESSANDRA
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LAURA GOBBI studente |
1)
Homo-Gorilla 41%
Homo-Macropus 74%
Macropus-Gorilla 36%
2)
I geni sono paraloghi poichè fra uomo e canguro c'è una percentuale di identità maggiore che tra uomo e gorilla; se fossero ortologhi dovrebbe essere il contrario.
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ALESSIA CAPETTA studente |
uomo-canguro identità 74%
uomo-gorilla identità 41%
canguro-gorilla 36%
L'identità percentuale mostrata fra uomo e gorilla è abbastanza bassa,quindi il gene si è separato per duplicazione genica e dà sequenze paraloghe.
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ALESSIA MARMORINO studente |
Sono presenti dei paraloghi e ciò è visibile dalle percentuali che mostrano grande diversità intendendo che questi derivino da una mutazione di un gene ancestrale.
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DENISE LANDOLFI studente |
uomo gorilla: 41%
uomo macropus: 74%
gorilla macropus: 36%
Tenendo conto dell'evoluzione e delle somiglianze genetiche tra l'uomo e il gorilla si nota una incongruenza per quanto riguarda il gene in esame. infatti la somiglianza tra i prodotti genici di uomo e gorilla è piuttosto bassa; ciò fa pensare che si siano originati per duplicazione e che siano quindi paraloghi.
gorilla-macropus sono distanti dal punto di vista evolutivo quindi mi posso aspettare che i loro geni siano paraloghi con una bassa percentuale di identità.
per quanto riguarda uomo-macropus sono paraloghi per via dell'alta percentuale di identità che non mi sarei aspettata vista l'evoluzione.
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STELLA LO BARCO studente |
Identità percentuale:
- tra uomo e gorilla 41%
- tra uomo e macropus 74%
- tra macropus e gorilla 36%
Ci sono tra loro geni paraloghi perchè non sono in accordo con la filogenesi degli organismi.
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Valentina Berni studente |
human -macru 74%
human-gorgo 41%
macru-gorgo 36%
Notando la percentuale di identità tra human,macro e gorgo,abbiamo notato che tra human e macru è presente una sequenza paraloga ,ovvero originate da un singolo genoma per poi essersi duplicate successivamente.
valentina berni -martina galli
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LUCA GARGIULO studente |
Oltre ad essersi divisi in tempi più recenti, i geni di uomo e canguro potrebbero essere ortologhi poichè le sequenze hanno una certa percentuale di identità.
GARGIULO LUCA
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MARIA CARLA GERRA studente |
identità uomo-gorilla: 41%
uomo-canguro: 37%
gorilla canguro: 36%
I dati, in particolare gorilla-uomo 41%, sono in contrasto con la filogenesi degli organismi (gorilla uomo 90% circa). Da questo deduco che i geni sono paraloghi.
Maria Carla Gerra
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CHIARA LAZZARINI studente |
Human-Gorgo 41%
Human-Macru 74%
Macru-gorgo 36%
I geni sono tra loro paraloghi perchè non c'è accordo con la filogenesi degli organismi.
Chiara Lazzarini
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VALENTINA CARBOGNANI studente |
1,la percentuale di identità tra
Homo-Gorilla è del 41%
Homo-Macropus è del 74%
Macropus-Gorilla è del 36%
i geni sono tra loro paraloghi
Valentina Carbognani
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CHIARA PASQUINI studente |
HOMO-GORILLA: 41%
HOMO- MACROPUS:74%
MACROPUS- GORILLA: 36%
I GENI SONO PARALOGHIPERCHè, CONTRARIAMENTE A QUANTO CI SAREMMO ASPETTATI, I GENI DELL'UOMO E DEL GORILLA HANNO UNA PIù BASSA IDENTITà PERCENTUALE RISPETTO AI GENI DELL'UOMO E DEL CANGURO. QUINDI CONCLUDIAMO DICENDO CHE NON HANNO SEGUITO L'EVOLUZIONE DELLE SPECIE.
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GABRIELLA COTTONE studente |
1)
homo-gorilla: 41% di identà
homo-macropus: 74% di identità
macropus-gorilla: 36% di identità
2)
sono presenti dei geni paraloghi, in quanto il risultato dell'esercizio non rispecchia la filogenesi perchè ad esempio homo e gorilla dovrebbero assomigliarsi circa per il 90%.
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ERJOLA DJALA studente |
Le percentuali di identità sono:
Homo-Gorilla 41%
Homo-Macropus 74%
Macropus-Gorilla 36%
Osservando la percentuale di identità tra homo e gorilla si può notare ke è molto più bassa di quello ke dovrebbe essere in accordo con la filogenesi dell'organismo umano.Da questo si può dedurre che i geni sono paraloghi tra di loro e cioè sono geni originati per duplicazione in uno stesso genoma.
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SIMONE LANDI studente |
1- a me è venuto cosi
human-macru= 73.3%; human-gorgo= 38.3%; macru-gorgo= 33.3%
2- non capisco come si riesce a capire se le sequenze sono paraloghe od ortologhe, mi fido di voi.
Simone Landi.
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VINCENZA SPECIALE studente |
1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla : 41%
Homo - Macropus : 74%
Macropus - Gorilla: 36%
2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?
Dalle percentuali si osserva una somiglianza maggiore tra uomo e canguro
che tra uomo e gorilla quindi ci sono geni paraloghi. Tali geni si sono separati per evento di una duplicazione genica.
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