Classe delle Lauree in Scienze Biologiche
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Forum > Corso 2009/2010 > Esercizio evoluzione

AutoreIntervento
Prof. Riccardo Percudani
docente
Esercizio evoluzione
06/10/2009 09:01

 

Considerate le sequenze:

>HBB_HUMAN  - Homo sapiens
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKV
KAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGK
EFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
>HBA_GORGO - Gorilla gorilla
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGDYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAV
AHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKY
R
>HBB_MACRU Macropus rufus (Red kangaroo)
VHLTAEEKNAITSLWGKVAIEQTGGEALGRLLIVYPWTSRFFDHFGDLSNAKAVMGNPKV
LAHGAKVLVAFGDAIKNLDNLKGTFAKLSELHCDKLHVDPENFKLLGNIIVICLAEHFGK
EFTIDTQVAWQKLVAGVANALAHKYH

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla :
Homo - Macropus :
Macropus - Gorilla:

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?

 

OLGA CHIESA
studente
Re: Esercizio evoluzione
Replay #1 - 20/10/2009 12:17

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla : 41%
Homo - Macropus : 74%
Macropus - Gorilla: 36%

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?

  i geni sono paraloghi perchè le differenze amminoacidiche sono localizzate tutte negli stessi punti, quindi è probabile che le mutazioni siano avvenute per eventi di duplicazione

 

 

SERENA MONTALBANO
studente
Re: Esercizio evoluzione
Replay #1 - 20/10/2009 12:22

Human-Gorgo 41%

Human-Macru 74%

Macru-Gorgo 36%

I geni sono paraloghi perchè la percentuale di somiglianza è troppo bassa e non sono d'accordo con la filogenesi dell'organismo.

Serena Montalbano

 

 

Prof. Riccardo Percudani
docente
Re: Esercizio evoluzione
Replay #1 - 20/10/2009 12:22

1-identità percentuale

Homo-Gorilla:41 %

Homo-Macropus:74%

Macropus-Gorilla:36%

2-tipologia dei geni

ci sono dei geni tra loro paraloghi poichè non vi è accordo con la filogenesi dell'organismo

 

 

Virginia Ingrosso

 

THEKLA LEONE
studente
Re: Esercizio evoluzione
Replay #1 - 20/10/2009 12:22

homo-gorilla 41% identità

homo-macropus 74% identità

macropus-gorilla 36% identità

pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?

sono presenti geni paraloghi.si noti la percentuale d'identità tra homo e gorilla che che si discosta molto dalla filogenesi degli organismi

 

MICOL GILBERTI
studente
Re: Esercizio evoluzione
Replay #1 - 20/10/2009 12:22

identità uomo-gorilla: 41%

            uomo-canguro: 74%

            canguro-gorilla: 36%

 

Uomo e gorilla dovremmero somigliarsi molto di più (circa il 90%).queste somiglianze non sono d'accordo con la filogenesi degli organismi. Questo significa che ci sono geni paraloghi.

 

Micol Gilberti

 

 

 

IVANA GALLO
studente
Re: Esercizio evoluzione
Replay #1 - 20/10/2009 12:22

1-IDENTITà PERCENTUALE:

homo-gorilla:41% di identità

homo-macropus:74% di identità

macropus-gorilla:36% di identità

2-ORTOLOGHE O PARALOGHE:

Sono presenti geni paraloghi in quanto si nota che questi risultati non rispecchiano la filogenesi degli organismi,poichè ad esempio tra uomo e gorilla la percentuale di identità dovrebbe essere circa il 90%

 

 

ILARIA BOTRUGNO
studente
Re: Esercizio evoluzione
Replay #1 - 20/10/2009 12:22

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla : 41%
Homo - Macropus : 74%
Macropus - Gorilla: 36%

 

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?

  Dall'allimeamento si osserva che il gene uomo e il gene gorilla non si sono divisi per speciazione, ma molto prima cioè 400.000.000 di anni fa e per questo motivo sono paraloghi.

Il fatto che siano paraloghi si evidenzia anche dalle percentuali riscontrate: tra uomo e gorilla ci si aspetterebbe un'elevata percentuale d'identità invece è pari al 41%. proprio perchè sono paraloghi e si sono divisi molto prima, si evidenzia una strana elevata percentuale d'identità tra uomo e canguro.

 

 

Botrugno Ilaria

Lezzi Ludovica

Dosi Beatrice

 

CLAUDIA CANNETIELLO
studente
Re: Esercizio evoluzione
Replay #1 - 20/10/2009 12:22

1 identità percentuale

homo-gorilla 41%

homo-macropus 74%

macropus-gorilla 36%

 

2 tipologia dei geni

Sono presenti geni paraloghi perchè sono diversi tra di loro

Si osserva una somiglianza maggiore tra uomo e canguro piuttosto che tra uomo e gorilla.

Federica Cassinelli - Claudia Cannetiello

 

PIETRO CRAVEDI
studente
Re: Esercizio evoluzione
Replay #1 - 20/10/2009 12:22

Homo - Gorilla :  41%
Homo - Macropus : 74%
Macropus - Gorilla: 36%

HBB_HUMAN e HBB_MACRU sono sequenze di proteine codificate da geni ortologhi tra loro per via dell'elevata identità e del fatto che sono entrambe catene di beta-emoglobina (stessa funzione)

HBA_GORGO è una proteina da un gene paralogo rispetto agli altri due perchè la sua identità rispetto agli altri è bassa (rispetto all'identità che sussite tra gli altri due). Inoltre (dal nome) è una catena di alfa-emoglobina, quindi il suo gene è stato originato per duplicazione genica del gene della beta-emoglobina (o viceversa)

 

LUCA BARBATO
studente
Re: Esercizio evoluzione
Replay #1 - 20/10/2009 12:22

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla : 41%
Homo - Macropus : 74%
Macropus - Gorilla: 36%

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?

Noi sappiamo che l'uomo e il gorilla dovrebbero essere simili, ma l'identità percentuale dell'uomo-gorilla è molto inferiore a quello che ci aspettiamo e quindi i geni sono paraloghi perchè non ci fornisce informazioni riguardo la storia evolutiva degli organismi.

 

Luca Barbato

Monia Fronzuti

Valentina Ferrari

 

DANIELE BULGARI
studente
Re: Esercizio evoluzione
Replay #1 - 20/10/2009 12:22

1)

Homo - Gorilla : 41%
Homo - Macropus :74%
Macropus - Gorilla: 36%

2)

ci sono dei geni tra loro paraloghi poichè non rispettano la filogenesi, dato l'uomo e il gorilla condividono oltre il 90% del materiale genetico.

 

 

christian bozzetti daniele bulgari

 

 

 

LUCA GARGIULO
studente
Re: Esercizio evoluzione
Replay #1 - 20/10/2009 12:22

Percentuale identità uomo gorilla       41%

                             uomo canguro    74%

                             canguro gorilla    36%

 

I geni sono paraloghi perchè sono molto diversi tra loro e quindi probabilmente derivano dalla mutazione di un unico gene ancestore.

I geni di canguro e uomo sono più simili tra loro, quindi probabilmente si sono divisi in tempi più recenti.

GARGIULO LUCA

 

 

NICOLANNA FILOMENA
studente
Re: Esercizio evoluzione
Replay #1 - 20/10/2009 12:22

1)La percentuale di identità tra

Homo-gorilla è del 41%

Homo-Macropus è del 74%

Macropus-Gorilla è del 36%

2)Dalle percentuali si osserva una somiglianza maggiore tra uomo e canguro che tra uomo e gorilla quindi ci sono geni paraloghi

FILOMENA NICOLANNA-LEANDRA CANZONERI-ANNALISA BRUNO

 

CHIARA ALIANI
studente
Re: Esercizio evoluzione
Replay #1 - 20/10/2009 12:22

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla :41%
Homo - Macropus :74%
Macropus - Gorilla:36%

 

 

2) sono paraloghi perchè le somiglianze percentuali hanno valori troppo bassi;se fossero ortologhi avrebbero una struttura, e quindi somiglianze percentuali,più simili.

 

 

chiara aliani e ambra dondi

 

PATRIZIA CHERUBINI
studente
Re: Esercizio evoluzione
Replay #1 - 20/10/2009 12:23

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?

  human- gorgo: 41%

  human- macru:74%

  macru- gorgo: 36%

 

Ci sono dei geni paraloghi perchè l'identità in percentuale tra uomo e gorilla è molto poca mentre conoscendo la filogenesi degli organismi la somiglianza, nel caso di geni ortologhi, avrebbe dovuto essere molto maggiore.

 

SILVIA GIUPPONI
studente
Re: Esercizio evoluzione
Replay #1 - 20/10/2009 12:27

1)

Homo - Gorilla : 41%
Homo - Macropus : 74%
Macropus - Gorilla: 36%

2)

uomo e gorilla sono paraloghi per discrepanza tra la % e la somiglianza filogenetica;

uomo e canguro sono paraloghi infatti la % non rispecchia la realtà appartenendo i due individui a 2 classi differenti:marsupiali e mammiferi;

gorilla e canguro sono paraloghi per i motivi precedenti.

Silvia Giupponi e Antonella Falconieri

 

 

 

FRANCESCA PAOLA SCARDINA
studente
Re: Esercizio evoluzione
Replay #1 - 20/10/2009 12:28

1-Identità percentuale

Homo-gorilla:41%

Homo-Macropus:74%

Macropus-Gorilla:36%

sono geni fra loro paraloghi in quanto non rispettano la filagenesi dell'organismo.

Ambra Incorvaia

 

ILARIA AZZINI
studente
Re: Esercizio evoluzione
Replay #2 - 20/10/2009 12:31

uomo-gorilla 41%

uomo-macru 74%

macru-gorilla 36%

le sequenze sono paraloghe perchè tra uomo e macru c'è una percentuale maggiore di identita. se fossero ortologhe la percentuale maggiore dovrebbe essere tra uomo e gorilla.

Alessandra Biondi e Ilaria Azzini

 

GIULIANA CIRILLO
studente
Re: Esercizio evoluzione
Replay #2 - 20/10/2009 12:31

uomo gorilla: 41%

uomo macropus: 74%

gorilla macropus: 36%

 

i geni dell'uomo e del macropus sono probabilmente ortologhi in quanto hanno maggiore identità e probabilmente derivano dallo stesso gene ancestrale.

confrontando i geni uomo-gorilla e gorilla-macropus si nota una identità inferiore al 50 %, quindi più bassa, e per questo possiamo pensare che siano paraloghi.

 

ELISA AMBROGGI
studente
Re: Esercizio evoluzione
Replay #2 - 20/10/2009 12:32

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla :41%
Homo - Macropus :74%
Macropus - Gorilla:36%

I geni sono paraloghi perchè le differenze amminoacidiche sono localizzate negli stessi punti, quindi è probabile che siano avvenute mutazioni per eventi di duplicazione.

Inoltre, tra uomo e gorilla la percentuale di identità è molto bassa , quando invece dovrebbe essere molto alta dato che derivano dalla stessa filogenesi:di conseguenza i geni sono paraloghi. Gli altri due sono paraloghi per gli stessi motivi.

 

Elisa Ambroggi Ghielmi Caterina

 

ALESSANDRA D'ARELLI
studente
Re: Esercizio evoluzione
Replay #2 - 20/10/2009 12:32

 

Identità % tra uomo-gorilla del 41%

                tra uomo-macropus del 74%

                tra macropus e gorilla del 36%

I geni tra loro non sono in accordo con la filogenesi, quindi sono presenti paraloghi.

 

FRANCESCO DIROMA
studente
Re: Esercizio evoluzione
Replay #2 - 20/10/2009 12:33

Homo - Gorilla :  41%
Homo - Macropus : 74%
Macropus - Gorilla: 36%

 

ALESSIA MARMORINO
studente
Re: Esercizio evoluzione
Replay #3 - 20/10/2009 12:34

Homo - Gorilla :  41%
Homo - Macropus : 74%
Macropus - Gorilla: 36%

 

ENZA VALENTINA CARUSO
studente
Re: Esercizio evoluzione
Replay #3 - 20/10/2009 12:34

1-identità percentuale.

Homo-Gorilla 41%

Homo-Macropus 74%

Macropus-Gorilla 36%

2.tipologia di geni

Ci sono dei geni paraloghi dato che  sono separati per duplicazione genica e gli organismi sono filogeneticamente differenti.

 

Enza Caruso e Ilaria Clarizio

 

MONIKA BACO
studente
Re: Esercizio evoluzione
Replay #4 - 20/10/2009 12:34

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla :41%
Homo - Macropus :74%
Macropus - Gorilla:36%

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?

Sono presenti dei paraloghi, in quanto non seguono un evento di speciazione

 

Baco Monika, Isufi Elda, Balzani Giuseppe

 

ELISA IRONI
studente
Re: Esercizio evoluzione
Replay #4 - 20/10/2009 12:36

1) homo gorilla:41%

    homo macropus: 74%

    macropus gorilla: 36%

2) I geni dell' uomo e del gorilla sono sicuramente paraloghi in quanto sono in disaccordo con la filogenesi; i risultati differiscono dalle aspettative che prevedono una percentuale di indentità molto maggiore di quella ottenuta.

 

Elisa Ironi

Maria Chiara Guidone

 

ALESSANDRA BIONDI
studente
Re: Esercizio evoluzione
Replay #4 - 20/10/2009 12:37

uomo-gorilla 41%

uomo-macru 74%

macru-gorilla 36%

le sequenze sono paraloghe perchè tra uomo e macru c'è una percentuale maggiore di identita. se fossero ortologhe la percentuale maggiore dovrebbe essere tra uomo e gorilla.

Alessandra Biondi e Ilaria Azzini

 

VANESSA CATALDI
studente
Re: Esercizio evoluzione
Replay #5 - 20/10/2009 12:37

1-identita percentuale

homo-gorilla:41%

homo-macropus:74%

macropus-gorilla:36%

2-tipologia dei geni

sono presenti dei geni tra loro paraloghi poiche non c è accordo con la filogenesi degli organismi

 

 

vanessa cataldi

 

FRANCESCO DIROMA
studente
Re: Esercizio evoluzione
Replay #5 - 20/10/2009 12:38

I geni sono molto differenti tra loro perchè paraloghi, molto probabilmente possono derivare da una mutazione di un gene ancestrale che hanno in comune.

 

SILVIA LAZZERINI
studente
Re: Esercizio evoluzione
Replay #5 - 20/10/2009 12:38

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla : 41%
Homo - Macropus : 74%
Macropus - Gorilla: 36%

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?

  i geni sono paraloghi perchè le differenze amminoacidiche sono localizzate tutte negli stessi punti, quindi è probabile che le mutazioni siano avvenute per eventi di duplicazione

 

ALESSANDRA BETTUZZI
studente
Re: Esercizio evoluzione
Replay #6 - 20/10/2009 12:39

Percentuale identità uomo gorilla       41%

                             uomo canguro    74%

                             canguro gorilla    36%


E' più probabile che i geni risultino essere paraloghi perchè le percentuali di identità sono molto bassi e quindi probabilmente derivano dalla mutazione di un unico gene ancestore.

I geni di canguro e uomo sono più simili tra loro, quindi probabilmente si sono divisi in tempi più recenti o sono ortologhi.

BETTUZZI ALESSANDRA

 

LAURA GOBBI
studente
Re: Esercizio evoluzione
Replay #6 - 20/10/2009 12:39

1)

Homo-Gorilla 41%

Homo-Macropus 74%

Macropus-Gorilla 36%

2)

I geni sono paraloghi poichè fra uomo e canguro c'è una percentuale di identità maggiore che tra uomo e gorilla; se fossero ortologhi dovrebbe essere il contrario.

 

ALESSIA CAPETTA
studente
Re: Esercizio evoluzione
Replay #6 - 20/10/2009 12:40

uomo-canguro identità 74%

uomo-gorilla identità 41%

canguro-gorilla 36%

L'identità percentuale mostrata fra uomo e gorilla è abbastanza bassa,quindi il gene si è separato per duplicazione genica e dà sequenze paraloghe.

 

ALESSIA MARMORINO
studente
Re: Esercizio evoluzione
Replay #6 - 20/10/2009 12:42

Sono presenti dei paraloghi e ciò è visibile dalle percentuali che mostrano grande diversità intendendo che questi derivino da una mutazione di un gene ancestrale.

 

DENISE LANDOLFI
studente
Re: Esercizio evoluzione
Replay #7 - 20/10/2009 12:42

uomo gorilla: 41%

uomo macropus: 74%

gorilla macropus: 36%

 

Tenendo conto dell'evoluzione e delle somiglianze genetiche tra l'uomo e il gorilla si nota una incongruenza per quanto riguarda il gene in esame. infatti la somiglianza tra i prodotti genici di uomo e gorilla è piuttosto bassa; ciò fa pensare che si siano originati per duplicazione e che siano quindi paraloghi.

gorilla-macropus sono distanti dal punto di vista evolutivo quindi mi posso aspettare che i loro geni siano paraloghi con una bassa percentuale di identità.

per quanto riguarda uomo-macropus sono paraloghi per via dell'alta percentuale di identità che non mi sarei aspettata vista l'evoluzione.

 

STELLA LO BARCO
studente
Re: Esercizio evoluzione
Replay #7 - 20/10/2009 12:44

 

Identità percentuale:

- tra uomo e gorilla 41%

- tra uomo e macropus 74%

- tra macropus e gorilla 36%

 

Ci sono tra loro geni paraloghi perchè non sono in accordo con la filogenesi degli organismi.

 

Valentina Berni
studente
Re: Esercizio evoluzione
Replay #7 - 20/10/2009 12:44

human -macru 74%

human-gorgo 41%

macru-gorgo 36%

 

Notando la percentuale di identità tra human,macro e gorgo,abbiamo notato che tra human e macru è presente una sequenza paraloga ,ovvero originate da un singolo genoma per poi essersi duplicate successivamente.

 

valentina berni -martina galli

 

LUCA GARGIULO
studente
Re: Esercizio evoluzione
Replay #7 - 20/10/2009 12:45

Oltre ad essersi divisi in tempi più recenti, i geni di uomo e canguro potrebbero essere ortologhi poichè le sequenze hanno una certa percentuale di identità.

GARGIULO LUCA

 

MARIA CARLA GERRA
studente
Re: Esercizio evoluzione
Replay #7 - 20/10/2009 12:46

identità uomo-gorilla: 41%

            uomo-canguro: 37%

            gorilla canguro: 36%

 

I dati, in particolare gorilla-uomo 41%, sono in contrasto con la filogenesi degli organismi (gorilla uomo 90% circa). Da questo deduco che i geni sono paraloghi.

Maria Carla Gerra

 

CHIARA LAZZARINI
studente
Re: Esercizio evoluzione
Replay #8 - 20/10/2009 12:49

Human-Gorgo 41%

Human-Macru 74%

Macru-gorgo 36%

I geni sono tra loro paraloghi perchè non c'è accordo con la filogenesi degli organismi.

Chiara Lazzarini

 

VALENTINA CARBOGNANI
studente
Re: Esercizio evoluzione
Replay #9 - 20/10/2009 12:51

1,la percentuale di identità tra

Homo-Gorilla è del 41%

Homo-Macropus è del 74%

Macropus-Gorilla è del 36%

i geni sono tra loro paraloghi

 

Valentina Carbognani

 

CHIARA PASQUINI
studente
Re: Esercizio evoluzione
Replay #10 - 20/10/2009 13:43

HOMO-GORILLA: 41%

HOMO- MACROPUS:74%

MACROPUS- GORILLA: 36%

 

I GENI SONO PARALOGHIPERCHè, CONTRARIAMENTE A QUANTO CI SAREMMO ASPETTATI, I GENI DELL'UOMO E DEL GORILLA HANNO UNA PIù BASSA IDENTITà PERCENTUALE RISPETTO AI GENI DELL'UOMO E DEL CANGURO. QUINDI CONCLUDIAMO DICENDO CHE NON HANNO SEGUITO L'EVOLUZIONE DELLE SPECIE.

 

GABRIELLA COTTONE
studente
Re: Esercizio evoluzione
Replay #11 - 20/10/2009 15:21

1)

homo-gorilla: 41% di identà

homo-macropus: 74% di identità

macropus-gorilla: 36% di identità

2)

sono presenti dei geni paraloghi, in quanto il risultato dell'esercizio non rispecchia la filogenesi perchè ad esempio homo e gorilla dovrebbero assomigliarsi circa per il 90%.

 

ERJOLA DJALA
studente
Re: Esercizio evoluzione
Replay #12 - 26/10/2009 08:23

Le percentuali di identità sono:

Homo-Gorilla 41%

Homo-Macropus 74%

Macropus-Gorilla 36%

Osservando la percentuale di identità tra homo e gorilla si può notare ke è molto più bassa di quello ke dovrebbe essere in accordo con la filogenesi dell'organismo umano.Da questo si può dedurre che i geni sono paraloghi tra di loro e cioè sono geni originati  per duplicazione in uno stesso genoma.

 

SIMONE LANDI
studente
Re: Esercizio evoluzione
Replay #13 - 28/10/2009 21:12

1- a me è venuto cosi

human-macru= 73.3%; human-gorgo= 38.3%; macru-gorgo= 33.3%

2- non capisco come si riesce a capire se le sequenze sono paraloghe od ortologhe, mi fido di voi.

Simone Landi.

 

VINCENZA SPECIALE
studente
Re: Esercizio evoluzione
Replay #14 - 24/05/2010 18:44

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla : 41%
Homo - Macropus : 74%
Macropus - Gorilla: 36%

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?

Dalle percentuali si osserva una somiglianza maggiore tra uomo e canguro che tra uomo e gorilla quindi ci sono geni paraloghi. Tali geni si sono separati per evento di una duplicazione genica.

 

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