| Autore | Intervento |
|---|
 Prof. Riccardo Percudani
docente |
>HBB_HUMAN - Homo sapiens
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKV
KAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGK
EFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
>HBA_GORGO - Gorilla gorilla
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGDYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAV
AHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKY
R
>HBB_MACRU Macropus rufus (Red kangaroo)
VHLTAEEKNAITSLWGKVAIEQTGGEALGRLLIVYPWTSRFFDHFGDLSNAKAVMGNPKV
LAHGAKVLVAFGDAIKNLDNLKGTFAKLSELHCDKLHVDPENFKLLGNIIVICLAEHFGK
EFTIDTQVAWQKLVAGVANALAHKYH
>HBB_BALAC Hemoglobin subunit beta (Hemoglobin beta chain) (Beta-globin)
VHLTAEEKSAVTALWAKVNVEEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFEAFGDLSTADAVMKNPKVKAHGKKVLAS
FSDGLKHLDDLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVIVLARHFGKEFTPELQAAYQKVVAGVANA
LAHKYH
>HBB_PIG Hemoglobin subunit beta (Hemoglobin beta chain) (Beta-globin)
MVHLSAEEKEAVLGLWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSNADAVMGNPKVKAHGKKVLQ
SFSDGLKHLDNLKGTFAKLSELHCDQLHVDPENFRLLGNVIVVVLARRLGHDFNPNVQAAFQKVVAGVAN
ALAHKYH
1) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e gorilla?
2) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e canguro?
3) Ritenete che le sequenze siano ortologhe o paraloghe?
4) Quale sequenza poterbbe essere usata come outgroup?
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ALESSIA MARMORINO
studente |
>HBB_HUMAN - Homo sapiens
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKV
KAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGK
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>HBA_GORGO - Gorilla gorilla
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGDYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAV
AHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKY
R
>HBB_MACRU Macropus rufus (Red kangaroo)
VHLTAEEKNAITSLWGKVAIEQTGGEALGRLLIVYPWTSRFFDHFGDLSNAKAVMGNPKV
LAHGAKVLVAFGDAIKNLDNLKGTFAKLSELHCDKLHVDPENFKLLGNIIVICLAEHFGK
EFTIDTQVAWQKLVAGVANALAHKYH
>HBB_BALAC Hemoglobin subunit beta (Hemoglobin beta chain) (Beta-globin)
VHLTAEEKSAVTALWAKVNVEEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFEAFGDLSTADAVMKNPKVKAHGKKVLAS
FSDGLKHLDDLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVIVLARHFGKEFTPELQAAYQKVVAGVANA
LAHKYH
>HBB_PIG Hemoglobin subunit beta (Hemoglobin beta chain) (Beta-globin)
MVHLSAEEKEAVLGLWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSNADAVMGNPKVKAHGKKVLQ
SFSDGLKHLDNLKGTFAKLSELHCDQLHVDPENFRLLGNVIVVVLARRLGHDFNPNVQAAFQKVVAGVAN
ALAHKYH
1) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e gorilla? circa 70 PAM
2) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e canguro? circa 30 PAM
3) Ritenete che le sequenze siano ortologhe o paraloghe?paraloghe in riferimento a human e gorgo ,mentre ortologhe in riferimento a pig, macru e balac
4) Quale sequenza poterbbe essere usata come outgroup? HBA GORGO
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PIETRO CRAVEDI
studente |
Distanza Uomo-Gorilla: ca 50 PAM (e rotti)
Distanza Uomo-Canguro: ca 25 PAM
La sequenza HBA_GORGO è paraloga rispetto alle altre, le quali sono ortologhe fra loro.
HBA_GORGO potrebbe essere usata come outgroup.
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FRANCESCO DIROMA
studente |
>HBB_HUMAN - Homo sapiens
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKV
KAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGK
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>HBA_GORGO - Gorilla gorilla
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGDYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAV
AHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKY
R
>HBB_MACRU Macropus rufus (Red kangaroo)
VHLTAEEKNAITSLWGKVAIEQTGGEALGRLLIVYPWTSRFFDHFGDLSNAKAVMGNPKV
LAHGAKVLVAFGDAIKNLDNLKGTFAKLSELHCDKLHVDPENFKLLGNIIVICLAEHFGK
EFTIDTQVAWQKLVAGVANALAHKYH
>HBB_BALAC Hemoglobin subunit beta (Hemoglobin beta chain) (Beta-globin)
VHLTAEEKSAVTALWAKVNVEEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFEAFGDLSTADAVMKNPKVKAHGKKVLAS
FSDGLKHLDDLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVIVLARHFGKEFTPELQAAYQKVVAGVANA
LAHKYH
>HBB_PIG Hemoglobin subunit beta (Hemoglobin beta chain) (Beta-globin)
MVHLSAEEKEAVLGLWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSNADAVMGNPKVKAHGKKVLQ
SFSDGLKHLDNLKGTFAKLSELHCDQLHVDPENFRLLGNVIVVVLARRLGHDFNPNVQAAFQKVVAGVAN
ALAHKYH
1) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e gorilla?
2) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e canguro?
3) Ritenete che le sequenze siano ortologhe o paraloghe?
4) Quale sequenza poterbbe essere usata come outgroup?
1)La distanza in PAM è di 60.
2)La distanza in PAM è di 30.
3)Le sequenze di uomo e gorilla sono paraloghe;le sequenze tra uomo e canguro sono ortologhe
4)E' il gorgo.
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ILARIA BOTRUGNO
studente |
1) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e gorilla?
2) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e canguro?
3) Ritenete che le sequenze siano ortologhe o paraloghe?
4) Quale sequenza poterbbe essere usata come outgroup?
___________________________________________________________________________
1) la distanza in PAM tra uomo e gorilla è 90, cioè 90 mutazioni per cento siti
2)la distanza in PAM tra uomo e canguro è 25, cioè 25 mutazioni per sito
3) le sequenze sono ortologhe tra di loro, tranne la sequenza di HBA GORGO che è paraloga rispetto alle altre.
4) la sequenza che potrebbe essere usata come outgroup è HBA GORGO
Rossana Italiano
Ilaria Botrugno
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LUCA GARGIULO
studente |
1) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e gorilla?
2) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e canguro?
3) Ritenete che le sequenze siano ortologhe o paraloghe?
4) Quale sequenza poterbbe essere usata come outgroup?
1) tra 80 e 90
2) tra 20 e 30
3) la sequenza di gorilla è molto probabilmente paraloga a tutte le altre
le altre sono ortologhe tra loro
4) la sequenza di gorilla potrebbe essere usata come outgroup
GARGIULO LUCA
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FABIO PERINI
studente |
1) Approssimativamente 105 PAM
2) Approssimativamente 30 PAM
3) L'alfa-globina è paraloga rispetto alle beta. Le beta-globina sono ortologhe tra loro.
4) La sequenza usata come outgroup è quella dell'alfa-globina di Gorilla
Fabio Perini e Stella Lo Barco
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DANIELE BULGARI
studente |
1) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e gorilla?
70 PAM circa
2) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e canguro?
25PAM circa
3) Ritenete che le sequenze siano ortologhe o paraloghe?
Le sequenze del gorilla e dell'uomo sono paraloghe, tra le altre potrebbe esserci una relazione ortologa.
4) Quale sequenza poterbbe essere usata come outgroup?
HBA GORGO
Beatrice Monti, Daniele Bulgari
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MARTA ZANTEDESCHI
studente |
1) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e gorilla?
2) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e canguro?
3) Ritenete che le sequenze siano ortologhe o paraloghe?
4) Quale sequenza poterbbe essere usata come outgroup?
1)90 pam
2)30 pam
3)le sequenze hba gorgo e hbb human sono paraloghe.Le altre 3 sono ortologhe
4) hba gorgo
valentina ferrari, antonella falconieri, marta zantedeschi
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ARIANNA MOLINARI
studente |
1) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e gorilla?
2) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e canguro?
3) Ritenete che le sequenze siano ortologhe o paraloghe?
4) Quale sequenza poterbbe essere usata come outgroup?
1) 0.8 - 0.9 mutazioni per sito, quindi 80-90 Pam
2) circa 20-30 Pam
3) La sequenza di HBA GORGO non è ortologa (quindi è paraloga)
4) outgroup: HBA GORGO
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LAURA GOBBI
studente |
1) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e gorilla?
la distanza in PAM tra uomo e gorilla è circa 100
2) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e canguro?
la distanza in PAM tra uomo e canguro è circa 30
3) Ritenete che le sequenze siano ortologhe o paraloghe?
HBA-GORGO è sicuramente una sequenza paraloga, data la sua
posizione anche HBB-HUMAN potrebbe essere paraloga
4) Quale sequenza potrebbe essere usata come outgroup?
si potrebbe usare come outgroup HBA-GORGO, perchè si tratta
di una globina alfa, mentre tutte le altre sono beta.
Roberta Barone e Laura Gobbi
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LUCA BARBATO
studente |
1) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e gorilla? 90 pam circa
2) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e canguro? 25 pam circa
3) Ritenete che le sequenze siano ortologhe o paraloghe? paraloghe l'uomo e il gorilla, le altre sono ortologhe
4) Quale sequenza poterbbe essere usata come outgroup?HBA_GORGO
LUCA BARBATO
MONIA FRONZUTI
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ERJOLA DJALA
studente |
La distanza tra le sequenze tra uomo e gorilla è di 90 Pam.
La distanza di sequenza tra uomo e canguro è di 40 Pam.
Le sequenze sono paraloghe.
la sequenza che viene usata come outgroup è HBA GORGO.
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JACOPO SACQUEGNO
studente |
1) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e gorilla?
2) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e canguro?
3) Ritenete che le sequenze siano ortologhe o paraloghe?
4) Quale sequenza poterbbe essere usata come outgroup?
1) tra 80 e 90
2) tra 20 e 30
3) la sequenza di gorilla è molto probabilmente paraloga a tutte le altre
le altre sono ortologhe tra loro
4) la sequenza di gorilla potrebbe essere usata come outgroup
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ELISA RATTOTTI
studente |
1) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e gorilla?
La distanza in PAM tra uomo e gorilla è di circa 100
2) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e canguro?
La distanza in PAM tra uomo e canguro è di circa 30
3) Ritenete che le sequenze siano ortologhe o paraloghe?
Paraloghe uomo-gorilla, perchè sono molto distanti.
Le sequenze uomo- canguro potrebbero essere omologhe.
4) Quale sequenza poterbbe essere usata come outgroup?
Quella di gorilla
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LUDOVICA LEZZI
studente |
1)La distanza tra uomo e gorilla è di circa 80 PAM
2)lA distanza tra uomno e canguro è di circa 40 PAM
3) SONO PARALOGHE
4)HBA GORGO
Lezzi Ludovica e Chiara Pasquini
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DANIELA MANDALARI
studente |
1) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e gorilla?
2) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e canguro?
3) Ritenete che le sequenze siano ortologhe o paraloghe?
4) Quale sequenza poterbbe essere usata come outgroup?
1)La distanza in PAM è circa di 90.
2)La distanza in PAM è circa di 30.
3)La sequenza di HBA_GORGO è paraloga; le altre sequenze tra loro sono ortologhe tra loro
4)HBA_GORGO.
Daniela Mandalari
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SIMONE LANDI
studente |
>HBB_HUMAN - Homo sapiens
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKV
KAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGK
EFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
>HBA_GORGO - Gorilla gorilla
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGDYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAV
AHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKY
R
>HBB_MACRU Macropus rufus (Red kangaroo)
VHLTAEEKNAITSLWGKVAIEQTGGEALGRLLIVYPWTSRFFDHFGDLSNAKAVMGNPKV
LAHGAKVLVAFGDAIKNLDNLKGTFAKLSELHCDKLHVDPENFKLLGNIIVICLAEHFGK
EFTIDTQVAWQKLVAGVANALAHKYH
>HBB_BALAC Hemoglobin subunit beta (Hemoglobin beta chain) (Beta-globin)
VHLTAEEKSAVTALWAKVNVEEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFEAFGDLSTADAVMKNPKVKAHGKKVLAS
FSDGLKHLDDLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVIVLARHFGKEFTPELQAAYQKVVAGVANA
LAHKYH
>HBB_PIG Hemoglobin subunit beta (Hemoglobin beta chain) (Beta-globin)
MVHLSAEEKEAVLGLWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSNADAVMGNPKVKAHGKKVLQ
SFSDGLKHLDNLKGTFAKLSELHCDQLHVDPENFRLLGNVIVVVLARRLGHDFNPNVQAAFQKVVAGVAN
ALAHKYH
1) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e gorilla?
2) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e canguro?
3) Ritenete che le sequenze siano ortologhe o paraloghe?
4) Quale sequenza poterbbe essere usata come outgroup?
1-distanza in pam e circa di 90.
2-distanza in pam è di circa 30
3-la sequenza di HBA di gorgo è paraloga le altre tre sono ortologhe
4-HBA_GORGO.
SIMONE LANDI
3-
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VANESSA CATALDI
studente |
1) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e gorilla?
2) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e canguro?
3) Ritenete che le sequenze siano ortologhe o paraloghe?
4) Quale sequenza poterbbe essere usata come outgroup?
1)la distanza in pam è di circa 90.
2) la distanza in pam è di circa 30.
3) il gorilla è paraloga, le altre sequenze tra loro sono ortologhe
4) la sequenza hba_gorgo
vanessa cataldi
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ELISA AMBROGGI
studente |
1) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e gorilla?
2) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e canguro?
3) Ritenete che le sequenze siano ortologhe o paraloghe?
4) Quale sequenza poterbbe essere usata come outgroup?
1) 70 PAM
2) 25 PAM
3) il rapporto tra le sequenze di uomo e gorilla ci fanno pensare che le sequenze siano paraloghe,in quanto distanti, le altre tra loro sono ortologhe.
4) HBA GORGO
Elisa Ambroggi,Beatrice Dosi,Alessia Verani.
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PATRIZIA CHERUBINI
studente |
1) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e gorilla?
circa 80 PAM
2) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e canguro?
circa 20 PAM
3) Ritenete che le sequenze siano ortologhe o paraloghe?
La sequenza di HBA_GORGO è paraloga, le altre sono ortologhe.
4) Quale sequenza poterbbe essere usata come outgroup?
La sequenza che possiamo usare è quella dell'emoglobina alfa del gorilla.
ANGELA SANSONE
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VALENTINA CARBOGNANI
studente |
1) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e gorilla?
la distanza è di circa 0,7 mutazioni per sito cioè 70 PAM
2) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e canguro?
la distanza è di circa 0,3 mutazioni per sito cioè 30 PAM
3) Ritenete che le sequenze siano ortologhe o paraloghe?
le saquenza di HBA gorgo è paraloga e le altre sequenze sono tra loro ortologhe
4) Quale sequenza poterbbe essere usata come outgroup?
HBBA_GORGO
Carbognani Valentina
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DENISE LANDOLFI
studente |
distanza tra uomo e gorilla: 105 PAM
tra uomo e canguro: 30 PAM
il gene dell'HBA del gorilla è paralogo, gli altri sono tra loro ortologhi
il gene dell'HBA può essere usato come outgroup
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GIULIANA CIRILLO
studente |
distanza tra uomo e gorilla: 105 PAM
tra uomo e canguro: 30 PAM
il gene dell'HBA del gorilla è paralogo, gli altri sono tra loro ortologhi
il gene dell'HBA può essere usato come outgroup
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