esercizio ricerca di omologia	Rispondi
	22/08/2009 17:41	Invia email

Buongiorno.Mi chiamo Miriam Gaudenzi, ho provato a risvolgere il seguente esercizio fatto gia a lezione

"

Fare una ricerca di omologia nella banca dati di proteine usando la transtiretina umana (NP_000362).

1) quante sono le sequenze con somiglianza significativa (E<10-5)?
2) quale è la percentuale di identità con la sequenza più significativa in topo?
3) Sono presenti sequenze omologhe nei batteri?"

Come risposta al primo punto però io trovo 202 sequenze al posto di 178 e non capisco dove sbaglio.

Vado a ricavare la sequenza in fasta della proteina e la incollo in blastp, dopodichè modifico a 250 il massimo numero di sequenze omologhe da visualizzare. Solo che incollando su notepad ne risultano 202. Grazie mille scusi per il disturbo