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Classe delle Lauree in Scienze Biologiche

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Forum > Corso 2009/2010 (M-Z) > Esercizio banchedati (M-Z)

Autore

Intervento

Prof. Riccardo Percudani
docente

	Esercizio banchedati (M-Z)
	27/10/2009 11:22

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_MOUSE

1) Riportare la descrizione della proteina

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

GLORIA SPAGNOLI
studente

	Re: Esercizio banchedati
	Replay #1 - 27/10/2009 14:12

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_MOUSE

1) Riportare la descrizione della proteina

Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin.

Catalizza l'ossidazione dell'ac.urico.

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

Mus musculus e Mouse (Topo)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

303 aa e 912 nucleotidi compreso lo stop

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acid

posizione 301-303 e la sequenza è SRL

Cecilia Nolli

ANDREA ZAGARELLA
studente

	Re: Esercizio banchedati
	Replay #1 - 27/10/2009 14:13

1) Riportare la descrizione della proteina

Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin

catalizza l'0ssidazione dell'acido urico

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

topo, Mus musculus

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

303aa 909nucleotidi(912 con stop)

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

301-303 srl

andrea zagarella

Prof. Riccardo Percudani
docente

	Re: Esercizio banchedati
	Replay #1 - 27/10/2009 14:13

1) Riportare la descrizione della proteina

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

---

1) urato ossidasi:

catalizza l'ossidazione di acido urico a 5-idrossiisourato, che spontaneamente si decompone formando allantoin.

2)Mus musculus (topo)

3) aa: 303 nt: 909

4) 301-303: SRL

Fabio Stracci

LAURA MALTRAVERSI
studente

	Re: Esercizio banchedati
	Replay #1 - 27/10/2009 14:14

1- Catalizza l'ossidazione dell'acido Urico in 5- idrossiisourato che spontaneamente decompone alla forma di allantoina

2-Mus musculus (Mouse=topo)

3- lunghezza in AA= 303. Lunghezza in nucleotidi 909 + 3 (codone di stop)

4- Posizione da 301 a 303. Sequenza: SRL

Ylenia Aura Minafò. Michele Picci. Laura Maltraversi

EMILIO PERFETTO
studente

	Re: Esercizio banchedati
	Replay #1 - 27/10/2009 14:14

Descrizione della proteina: Catalizza l'ossidazione dell'acido urico.

Nome dell'organismo: Mus musculus ( Topo )

Lunghezza amminoacidi: 303

Lunghezza nucleotidi : 909

sequenza targeting : 301-303 SRL

FABIO STRACCI
studente

	Re: Esercizio banchedati
	Replay #1 - 27/10/2009 14:15

1) Urato ossidasi: catalizza l'ossidazione di acido urico a 5-idrossiisourato, che si decompone spontaneamente formando allantoina.

2) Mus musculus (Topo)

3) 303 aminoacidi, includendo almeno un codone di stop 912 nucleotidi

4) 301-303 corrispondente a SRL

Scolari Sharon Fabiola

MONIKA BACO
studente

	Re: Esercizio banchedati
	Replay #1 - 27/10/2009 14:15

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_MOUSE

1) Riportare la descrizione della proteina

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in aminoacidi

1)Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin(catalizza l'ossidazione dell'acido urico a 5-idrossisurato)

2)Mus musculus(topo)

3)lunghezza in aa 303. lunghezza in nucleotidi 909

4)posizione 301-303 sequenza srl

balzani giuseppe baco monika

CRISTINA RIZZO
studente

	Re: Esercizio banchedati
	Replay #1 - 27/10/2009 14:15

Descrizione:

Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin.

catalisi dell'acido urico

Organismo:Mus musculus(Mouse) Topo

lunghezza in amminoacidi:303 AA

lunghezza in nucleotidi:909 nucleotidi.

sequenza targeting: SRL

posizione 301- 303

MARIA CARLA TERESI
studente

	Re: Esercizio banchedati
	Replay #1 - 27/10/2009 14:15

1) Riportare la descrizione della proteina

Urate oxidase(enzima),catalizza l'ossidazione dell'acido ureico

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

Mus musculus topo

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante 303 AA 912 nt

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

301-303 SRL

EGLANTINA CELISLAMI
studente

	Re: Esercizio banchedati
	Replay #1 - 27/10/2009 14:15

1) Riportare la descrizione della proteina

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

1)Uricasi catalizza l'ossidazione dell'acido urico a 5 hydroxyisourateche si decompone spontaneamente per formare allantoina.

2)Mus musculus (Mouse)

3)aa: 303 nt: 909

4)301-303: SRL

LAURA RAFFELINI

ARIANNA MOLINARI
studente

	Re: Esercizio banchedati
	Replay #1 - 27/10/2009 14:16

funzione: Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin.

catalizza l'ossidazione dell'acido urico a 5 idrossiisourato, il quale decompone spontaneamente a formare allantoina.

organismo: Mus musculus (topo)

lunghezza in aa: 303

lunghezza in nucleotidi: 303*3 = 909 (più eventualmente nucleotidi di stop)

sequenza target: SRL posizione: 301-303

Ester Oliva - Arianna Molinari

ORSOLA LETIZIA PALADINO
studente

	Re: Esercizio banchedati
	Replay #1 - 27/10/2009 14:17

	Esercizio banchedati	Rispondi
	27/10/2009 11:22	Invia email

1) Riportare la descrizione della proteina

Catalizza l'ossidazione dell'acido urico

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

Mus musculus (topo)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

Lunghezza sequenza 303 AA

Lunghezza in nucleotidi 100

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

Da 301 a 303 SRL

BRUNELLA VENEZIA
studente

	Re: Esercizio banchedati
	Replay #1 - 27/10/2009 14:17

LUNGHEZZA: 303 AA.

Recommended name:
    Uricase
    EC=1.7.3.3
Alternative name(s):
    Urate oxidase

ORGANISMO DI APPARTENEZA:MUS MUSCULUS(MOUSE)

Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin. CATALIZZA L'OSSIDAZIONE DELL'ACIDO URICO.

LUNGHEZZA NUCLEOTIDI:100

301-303 SRL

BRUNELLA VENEZIA

FABIO PEZZONI
studente

	Re: Esercizio banchedati
	Replay #1 - 27/10/2009 14:17

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_MOUSE

1) Riportare la descrizione della proteina

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

RISPOSTE:

1) Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin;

TRAD: Catalizza l'ossidazione dell'acido urico a 5-idrossiisourato, che poi spontaneamente si decompone formando allantoin;

2) Mus musculus (Mouse);

3) aa: 303. Nucleotidi: 909; (912 con stop)

4) 301-303; la sequenza è: "srl".

Agosti Mattia, Pezzoni Fabio.

SILVIA GUGLIERI
studente

	Re: Esercizio banchedati
	Replay #1 - 27/10/2009 14:18

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_MOUSE

1) Riportare la descrizione della proteina

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

1) La proteina è localizzata nei perossisomi e catalizza l'ossidazione dell'acido urico a 5-idrossiurato. Il prodotto della reazione è instabile e si trasforma spontaneamente in allantoina.

2)Mus musculus (Topo comune)

3) lunghezza: 303 aminoacidi; 909 nucleotidi

4) 301-303

SRL (serina, arginina, leucina)

ELISA MILIOTO
studente

	Re: Esercizio banchedati
	Replay #1 - 27/10/2009 14:18

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_MOUSE

1) Riportare la descrizione della proteina

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

RISPOSTE

1)Urato Ossidasi: catalizza l'ossidazione dell' acido urico a 5-idrossiurato che spontaneamente si decompone formando allantoin.

2)Mus Musculus

3)303 nt:909

4)301-303 srl

Milioto Elisa

ELISA RATTOTTI
studente

	Re: Esercizio banchedati
	Replay #2 - 27/10/2009 14:19

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_MOUSE

1) Riportare la descrizione della proteina

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

1) La proteina è localizzata nei perossisomi e catalizza l'ossidazione dell'acido urico a 5-idrossiurato. Il prodotto della reazione è instabile e si trasforma spontaneamente in allantoina.

2)Mus musculus (Topo comune)

3) lunghezza: 303 aminoacidi; 909 nucleotidi

4) 301-303

SRL (serina, arginina, leucina)

LUCIA ISETTI
studente

	Re: Esercizio banchedati
	Replay #1 - 27/10/2009 14:19

Isetti Lucia

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_MOUSE

1) Riportare la descrizione della proteina

Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin.

catalizza l'ossidazione dell'acido urico a 5-idrossiisourato, che spontaneamente si decompone formando allantoina

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

Mus musculus (Mouse)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

303 AA 909 nucleotidi + 3 nucleotidi di stop

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

301 - 303

SRL

MICHELE PASTORELLI
studente

	Re: Esercizio banchedati
	Replay #2 - 27/10/2009 14:20

1)Function:Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin

2)MUS Musculus(mouse)

3)303 aa, 909 nucleotidi

4) POSIZIONE:301 303

SEQUENZA IN AA:SRL

ALICE SALVIATI
studente

	Re: Esercizio banchedati
	Replay #1 - 27/10/2009 14:20

1) La proteina è un enzima, uricasi, che catalizza l'ossidazione dell'acido urico a 5-idrossiisurato, che spontaneamente si decompone per formare allantoina.

2) Mus musculus (topo)

3) Lunghezza in aminoacidi: 303

Lunghezza in nucleotidi: 909

4) La sequenza targeting si trova nella posizione 301-303 ed è SRL.

Elisa Ambroggi

Alice Salviati

ANNALISA SISTO
studente

	Re: Esercizio banchedati
	Replay #1 - 27/10/2009 14:20

1) Riportare la descrizione della proteina

1) Catalizzatore dell'ossidazione dell'acido urico al 5-idrossiisurato, che si decompone spontaneamente per formare l'allantoina.

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

2) Mus musculus (Mouse)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

3) La lunghezza in amminoacidi è 303 aa, quella in nucleotidi di 909 più 1 codone di stop.

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

4) La posizione è 301-303 e la sequenza è SRL

FABIO PERINI
studente

	Re: Esercizio banchedati
	Replay #1 - 27/10/2009 14:21

1) Proteina coinvolta nel metabolismo delle purine, nei perossisomi. Più precisamente catalizza l'ossidazione dell'acido urico ad acido 5-idrossiisurato, che si decompone spontaneamente a formare allantoina.

2) Mus Musculus; Topo

3) 303 aa; 912 nucleotidi compresi i 3 di stop

4) Posizione 301-303; Sequenza SRL

Perini Fabio

MARTINA GALLI
studente

	Re: Esercizio banchedati
	Replay #1 - 27/10/2009 14:22

1)L'urato ossidasi catalizza l'ossidazione dell'acido urico a 5-hydroxyisourate, che spontaneamente si decompone formando allantoin.

2)Mus musculus (mouse)

3)La lunghezza in aminoacidi è 303, quella in nucleotidi è 909 più i 3 codoni di stop 912.

4)La posizione va da 301 a 303 e la sequenza è SRL.

Martina Galli

Francesca Sandrini

GIULIA PESCARA
studente

	Re: Esercizio banchedati
	Replay #2 - 27/10/2009 14:22

1) Riportare la descrizione della proteina

1) Catalizzatore dell'ossidazione dell'acido urico al 5-idrossiisurato, che si decompone spontaneamente per formare l'allantoina.

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

2) Mus musculus (Mouse)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

3) La lunghezza in amminoacidi è 303 aa, quella in nucleotidi di 909 più 1 codone di stop.

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

4) La posizione è 301-303 e la sequenza è SRL

ANGELA SANSONE
studente

	Re: Esercizio banchedati
	Replay #1 - 27/10/2009 14:22

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_MOUSE

1) Riportare la descrizione della proteina

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin.

Catalizza l'ossidazione di acido urico a 5-hydroxyisourate, che si decompone spontaneamente a forma allantoina.

2)Mus musculus (Mouse) Topo

3)303 aminoacidi.909 nucleotidi 912 con i codoni di stop.

4) 301-303 La sequenza in aa è SRL.

SILVIA REVERBERI
studente

	Re: Esercizio banchedati
	Replay #1 - 27/10/2009 14:23

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_MOUSE

1) Riportare la descrizione della proteina

La proteina in analisi è una urato ossidasi un enzima appartenente alla classe delle ossidoreduttasi.

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

L'organismo di appartenenza è :Mus musculus (topo domestico)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante.

Lunghezza in aminoacidi:303

Lunghezza in nucleotidi: 303*3=909 + 3 di stop

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi.

La posizione nella proteina è 301-303 e la sequenza in aminoacidi è SRL.

ALESSANDRO PINELLI
studente

	Re: Esercizio banchedati
	Replay #1 - 27/10/2009 14:24

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_MOUSE

1) Riportare la descrizione della proteina

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

Function	Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin.
Catalytic activity	Urate + O₂ + H₂O = 5-hydroxyisourate + H₂O₂.
Pathway	Purine metabolism; urate degradation; (S)-allantoin from urate: step 1/3.
Subcellular location	Peroxisome.
Post-translational modification	Acetylation of Lys-118, Lys-164 and Lys-290 is observed in liver mitochondria from fasted mice but not from fed mice.
Sequence similarities	Belongs to the uricase family.





2) Mus musculus - Topo 3) 2-303 in amminoacidi e 909 in nucleotidi codificanti 4) 301-303 ( SRL)

ELDA ISUFI
studente

	Re: Esercizio banchedati
	Replay #2 - 27/10/2009 14:24

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_MOUSE

1) Riportare la descrizione della proteina

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

1)Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin.

2)Mus musculus(mouse)

3) 303 aa, 909 nucleotidi(+ 3 di stop)

4)Posizione:301-303 Sequenza srl

ILARIA TAGLIANI
studente

	Re: Esercizio banchedati
	Replay #1 - 27/10/2009 14:24

1) catalizza l'ossidazione dell'acido urico in 5-idrossiisurato che si decompone spontaneamente per formare allantoina.

2) il nome scientifico dell'organismo è Mus musculus, nome comune topo.

3) la lunghezza della sequenza amminoacidica è di 303 aa, la lunghezza in nucleotidi della regione codificante è 909 nucleotidi.

4) il segnale di targeting è SRL. La posizione nella proteina è da 301 a 303.

Rossi Valentina e Ilaria Tagliani

Elena Paini
studente

	Re: Esercizio banchedati
	Replay #2 - 27/10/2009 14:30

1) Riportare la descrizione della proteina

Catalizza l'ossidazione dell' acido urico a 5-idrossiisourato, che spontaneamente si decompone per formare allantoina.

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

Mus musculus (Mouse) Topo

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

303AA 909 nucletidi (912 con stop)

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

301 – 303

SRL    

Elena Paini

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