Forum: Risultati della ricerca

Classe delle Lauree in Scienze Biologiche

Forum: Risultati della ricerca

Da 1 a 29 di 29

Forum > AB - Corso 2010/2011 (M-Z) > Esercizio evoluzione

Autore

Intervento

Prof. Riccardo Percudani
docente

	Esercizio evoluzione	Rispondi
	19/10/2010 13:09	Invia email

Considerate le sequenze:

>HBB_HUMAN  - Homo sapiens
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKV
KAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGK
EFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
>HBA_GORGO - Gorilla gorilla
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGDYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAV
AHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKY
R
>HBB_BALAC Hemoglobin beta chain - Balaenoptera acutorostrata
HLTAEEKSAVTALWAKVNVEEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFEAFGDLSTADAVMKNPKV
KAHGKKVLASFSDGLKHLDDLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVIVLARHFGK
EFTPELQAAYQKVVAGVANALAHKYH

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla :
Homo - Balenottera:
Balenottera - Gorilla:

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?

MARINA VANGELI
studente

	Re: Esercizio evoluzione	Rispondi
	Replay #1 - 19/10/2010 13:57	Invia email

>HBB_HUMAN  - Homo sapiens
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKV
KAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGK
EFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
>HBA_GORGO - Gorilla gorilla
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGDYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAV
AHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKY
R
>HBB_BALAC Hemoglobin beta chain - Balaenoptera acutorostrata
HLTAEEKSAVTALWAKVNVEEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFEAFGDLSTADAVMKNPKV
KAHGKKVLASFSDGLKHLDDLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVIVLARHFGK
EFTPELQAAYQKVVAGVANALAHKYH

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla :
Homo - Balenottera:
Balenottera - Gorilla:

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?

ILARIA MINATO
studente

	Re: Esercizio evoluzione	Rispondi
	Replay #1 - 19/10/2010 14:02	Invia email

Considerate le sequenze:

>HBB_HUMAN  - Homo sapiens
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKV
KAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGK
EFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
>HBA_GORGO - Gorilla gorilla
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGDYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAV
AHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKY
R
>HBB_BALAC Hemoglobin beta chain - Balaenoptera acutorostrata
HLTAEEKSAVTALWAKVNVEEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFEAFGDLSTADAVMKNPKV
KAHGKKVLASFSDGLKHLDDLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVIVLARHFGK
EFTPELQAAYQKVVAGVANALAHKYH

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla :41%
Homo - Balenottera:89%
Balenottera - Gorilla:38%

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?paraloghi,perchè i rapporti tra i geni non rispettano i valori attesi dalla speciazione e quindi siamo in presenza di almeno un gene paralogo (gorilla)

Prof. Riccardo Percudani
docente

	Re: Esercizio evoluzione	Rispondi
	Replay #1 - 19/10/2010 14:03	Invia email

>HBB_HUMAN  - Homo sapiens
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKV
KAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGK
EFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
>HBA_GORGO - Gorilla gorilla
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGDYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAV
AHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKY
R
>HBB_BALAC Hemoglobin beta chain - Balaenoptera acutorostrata
HLTAEEKSAVTALWAKVNVEEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFEAFGDLSTADAVMKNPKV
KAHGKKVLASFSDGLKHLDDLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVIVLARHFGK
EFTPELQAAYQKVVAGVANALAHKYH

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla : 41%
Homo - Balenottera: 89%
Balenottera - Gorilla: 38%

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?

Silvia Tommasi
studente

	Re: Esercizio evoluzione	Rispondi
	Replay #1 - 19/10/2010 14:03	Invia email

Considerate le sequenze:

>HBB_HUMAN  - Homo sapiens
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKV
KAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGK
EFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
>HBA_GORGO - Gorilla gorilla
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGDYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAV
AHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKY
R
>HBB_BALAC Hemoglobin beta chain - Balaenoptera acutorostrata
HLTAEEKSAVTALWAKVNVEEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFEAFGDLSTADAVMKNPKV
KAHGKKVLASFSDGLKHLDDLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVIVLARHFGK
EFTPELQAAYQKVVAGVANALAHKYH

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla : 41%
Homo - Balenottera: 89%
Balenottera - Gorilla: 38%

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?sono ortologhi hbb dell'uomo con hbb della balena, mentre sono paraloghi le sequenze dell'uomo e della balena rispetto a hba del gorilla.

SILVIA PEDRAZZI
studente

	Re: Esercizio evoluzione	Rispondi
	Replay #2 - 19/10/2010 14:05	Invia email

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla : 41%
Homo - Balenottera: 89%
Balenottera - Gorilla: 38%

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?

paraloghi a causa dell elevata differenza percentuale che mi indica una differente via evolutiva.

SIMONE PANARESE
studente

	Re: Esercizio evoluzione	Rispondi
	Replay #2 - 19/10/2010 14:05	Invia email

Considerate le sequenze:

>HBB_HUMAN  - Homo sapiens
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKV
KAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGK
EFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
>HBA_GORGO - Gorilla gorilla
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGDYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAV
AHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKY
R
>HBB_BALAC Hemoglobin beta chain - Balaenoptera acutorostrata
HLTAEEKSAVTALWAKVNVEEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFEAFGDLSTADAVMKNPKV
KAHGKKVLASFSDGLKHLDDLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVIVLARHFGK
EFTPELQAAYQKVVAGVANALAHKYH

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla :41%
Homo - Balenottera:89%
Balenottera - Gorilla:38%

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?

geni ortologhi perchè sono hanno gli stessi geni con funzioni diverse

ALICE MASSERDOTTI
studente

	Re: Esercizio evoluzione	Rispondi
	Replay #1 - 19/10/2010 14:05	Invia email

Considerate le sequenze:

>HBB_HUMAN  - Homo sapiens
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKV
KAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGK
EFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
>HBA_GORGO - Gorilla gorilla
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGDYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAV
AHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKY
R
>HBB_BALAC Hemoglobin beta chain - Balaenoptera acutorostrata
HLTAEEKSAVTALWAKVNVEEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFEAFGDLSTADAVMKNPKV
KAHGKKVLASFSDGLKHLDDLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVIVLARHFGK
EFTPELQAAYQKVVAGVANALAHKYH

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla :41%
Homo - Balenottera:89%
Balenottera - Gorilla:38%

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?

i geni sono parologhi perchè le percentuali d'identità calcolate mostrano che l' homo ha più affinità con la balenottera che con il gorilla, ma dal punto di vista evolutivo l'homo è più vicino al gorilla rispetto che alla balenottera.

BRUNO MAURO
studente

	Re: Esercizio evoluzione	Rispondi
	Replay #1 - 19/10/2010 14:05	Invia email

>HBB_HUMAN  - Homo sapiens
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKV
KAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGK
EFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
>HBA_GORGO - Gorilla gorilla
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGDYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAV
AHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKY
R
>HBB_BALAC Hemoglobin beta chain - Balaenoptera acutorostrata
HLTAEEKSAVTALWAKVNVEEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFEAFGDLSTADAVMKNPKV
KAHGKKVLASFSDGLKHLDDLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVIVLARHFGK
EFTPELQAAYQKVVAGVANALAHKYH

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla : 41%
Homo - Balenottera: 89%
Balenottera - Gorilla: 38%

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?

I geni paraloghi, cioè geni presenti all’interno dello stesso genoma che codificano per prodotti diversi ma originano da un unico gene ancestrale.

GIADA PRATICO'
studente

	Re: Esercizio evoluzione	Rispondi
	Replay #1 - 19/10/2010 14:06	Invia email

>HBB_HUMAN  - Homo sapiens
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKV
KAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGK
EFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
>HBA_GORGO - Gorilla gorilla
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGDYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAV
AHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKY
R
>HBB_BALAC Hemoglobin beta chain - Balaenoptera acutorostrata
HLTAEEKSAVTALWAKVNVEEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFEAFGDLSTADAVMKNPKV
KAHGKKVLASFSDGLKHLDDLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVIVLARHFGK
EFTPELQAAYQKVVAGVANALAHKYH

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla :41%
Homo - Balenottera:89%
Balenottera - Gorilla:38%

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? sono paraloghi. Per quale motivo? Sono geni paraloghi perchè i dati ricavati non sono in accordo con la storia evolutiva.

GIULIA SGARIOTO
studente

	Re: Esercizio evoluzione	Rispondi
	Replay #2 - 19/10/2010 14:06	Invia email

Considerate le sequenze:

>HBB_HUMAN  - Homo sapiens
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKV
KAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGK
EFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
>HBA_GORGO - Gorilla gorilla
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGDYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAV
AHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKY
R
>HBB_BALAC Hemoglobin beta chain - Balaenoptera acutorostrata
HLTAEEKSAVTALWAKVNVEEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFEAFGDLSTADAVMKNPKV
KAHGKKVLASFSDGLKHLDDLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVIVLARHFGK
EFTPELQAAYQKVVAGVANALAHKYH

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla :89%

Homo - Balenottera:41%

Balenottera - Gorilla:38%

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?

Sono paraloghi perchè c'è un'elevata differenza tra le sequenze

GIULIA MOSCA
studente

	Re: Esercizio evoluzione	Rispondi
	Replay #2 - 19/10/2010 14:06	Invia email

>HBB_HUMAN  - Homo sapiens
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKV
KAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGK
EFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
>HBA_GORGO - Gorilla gorilla
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGDYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAV
AHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKY
R
>HBB_BALAC Hemoglobin beta chain - Balaenoptera acutorostrata
HLTAEEKSAVTALWAKVNVEEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFEAFGDLSTADAVMKNPKV
KAHGKKVLASFSDGLKHLDDLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVIVLARHFGK
EFTPELQAAYQKVVAGVANALAHKYH

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla :41%
Homo - Balenottera:89%
Balenottera - Gorilla:38%

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?sono paraloghi perchè il rapporto tra uomo gorilla è il più basso.

MIRKO FRANCESCO SIERI
studente

	Re: Esercizio evoluzione	Rispondi
	Replay #1 - 19/10/2010 14:07	Invia email

>HBB_HUMAN  - Homo sapiens
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKV
KAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGK
EFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
>HBA_GORGO - Gorilla gorilla
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGDYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAV
AHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKY
R
>HBB_BALAC Hemoglobin beta chain - Balaenoptera acutorostrata
HLTAEEKSAVTALWAKVNVEEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFEAFGDLSTADAVMKNPKV
KAHGKKVLASFSDGLKHLDDLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVIVLARHFGK
EFTPELQAAYQKVVAGVANALAHKYH

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla :41%
Homo - Balenottera:89%
Balenottera - Gorilla:38%

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?

In questo caso non siamo in presenza di geni ortologhi perchè la storia evolutiva non corrisponde alla speciazione.. c'è almeno un gene paralogo

FRANCESCA ZICCA
studente

	Re: Esercizio evoluzione	Rispondi
	Replay #1 - 19/10/2010 14:07	Invia email

>HBB_HUMAN  - Homo sapiens
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKV
KAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGK
EFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
>HBA_GORGO - Gorilla gorilla
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGDYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAV
AHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKY
R
>HBB_BALAC Hemoglobin beta chain - Balaenoptera acutorostrata
HLTAEEKSAVTALWAKVNVEEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFEAFGDLSTADAVMKNPKV
KAHGKKVLASFSDGLKHLDDLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVIVLARHFGK
EFTPELQAAYQKVVAGVANALAHKYH

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla :
Homo - Balenottera:
Balenottera - Gorilla:

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?

1)Tra uomo e gorilla è 41%

tra uomo e balenottera è 89%

tra balenottera e gorilla è 38%.

2) Sono parologhi perchè l'identità è minore della somiglianza.

Francesca Zicca e Michele Pastorelli.

SILVIA PERINI
studente

	Re: Esercizio evoluzione	Rispondi
	Replay #1 - 19/10/2010 14:07	Invia email

Considerate le sequenze:

>HBB_HUMAN  - Homo sapiens
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKV
KAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGK
EFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
>HBA_GORGO - Gorilla gorilla
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGDYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAV
AHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKY
R
>HBB_BALAC Hemoglobin beta chain - Balaenoptera acutorostrata
HLTAEEKSAVTALWAKVNVEEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFEAFGDLSTADAVMKNPKV
KAHGKKVLASFSDGLKHLDDLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVIVLARHFGK
EFTPELQAAYQKVVAGVANALAHKYH

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla : 41%
Homo - Balenottera:89%
Balenottera - Gorilla:38%

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?Sono paraloghi perché i rapporti di somiglianza dei geni non sono in accordo con la speciazione. Uomo e gorilla dovrebbero avere più sequenze simili, avendo un ancestore comune vicino nel tempo

GIORGIA SALSI
studente

	Re: Esercizio evoluzione	Rispondi
	Replay #1 - 19/10/2010 14:08	Invia email

>HBB_HUMAN  - Homo sapiens
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKV
KAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGK
EFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
>HBA_GORGO - Gorilla gorilla
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGDYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAV
AHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKY
R
>HBB_BALAC Hemoglobin beta chain - Balaenoptera acutorostrata
HLTAEEKSAVTALWAKVNVEEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFEAFGDLSTADAVMKNPKV
KAHGKKVLASFSDGLKHLDDLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVIVLARHFGK
EFTPELQAAYQKVVAGVANALAHKYH

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla : 41%
Homo - Balenottera: 89%
Balenottera - Gorilla: 38%

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?

essendo la sequenza ortologa una espressione di geni in sintonia con la storia evolutiva, questi dovrebbero essere geni paraloghi.

questo perchè se fossero ortologhi la percentuale maggiore di identità sarebbe tra uomo e gorilla essendo questi più vicini dal punto di vista evolutivo.

MARIKA TONARELLI
studente

	Re: Esercizio evoluzione	Rispondi
	Replay #1 - 19/10/2010 14:08	Invia email

Considerate le sequenze:

>HBB_HUMAN  - Homo sapiens
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKV
KAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGK
EFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
>HBA_GORGO - Gorilla gorilla
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGDYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAV
AHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKY
R
>HBB_BALAC Hemoglobin beta chain - Balaenoptera acutorostrata
HLTAEEKSAVTALWAKVNVEEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFEAFGDLSTADAVMKNPKV
KAHGKKVLASFSDGLKHLDDLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVIVLARHFGK
EFTPELQAAYQKVVAGVANALAHKYH

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla : 41%
Homo - Balenottera:89%
Balenottera - Gorilla:38%

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?

le sequenze di uomo e balenottera sono ortologhe perchè sono molto simili; uomo gorilla e balenottera gorilla hanno sequenze paraloghe perchè sono meno simili.

marika tonarelli, giulia fregnan, ilaria paganini

SIMONE PANARESE
studente

	Re: Esercizio evoluzione	Rispondi
	Replay #2 - 19/10/2010 14:08	Invia email

>HBB_HUMAN  - Homo sapiens
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKV
KAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGK
EFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
>HBA_GORGO - Gorilla gorilla
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGDYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAV
AHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKY
R
>HBB_BALAC Hemoglobin beta chain - Balaenoptera acutorostrata
HLTAEEKSAVTALWAKVNVEEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFEAFGDLSTADAVMKNPKV
KAHGKKVLASFSDGLKHLDDLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVIVLARHFGK
EFTPELQAAYQKVVAGVANALAHKYH

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla :41%
Homo - Balenottera:89%
Balenottera - Gorilla:38%

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?

paraloghi, a causa dell elevata differenza percentuale che mi indica una differente via evolutiva.

MARIA TERESA COLANGELO
studente

	Re: Esercizio evoluzione	Rispondi
	Replay #1 - 19/10/2010 14:09	Invia email

Considerate le sequenze:

>HBB_HUMAN  - Homo sapiens
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKV
KAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGK
EFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
>HBA_GORGO - Gorilla gorilla
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGDYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAV
AHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKY
R
>HBB_BALAC Hemoglobin beta chain - Balaenoptera acutorostrata
HLTAEEKSAVTALWAKVNVEEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFEAFGDLSTADAVMKNPKV
KAHGKKVLASFSDGLKHLDDLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVIVLARHFGK
EFTPELQAAYQKVVAGVANALAHKYH

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla :41%
Homo - Balenottera:89%
Balenottera - Gorilla:38%

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?paraloghi

ENRICO TAGLIAFERRI
studente

	Re: Esercizio evoluzione	Rispondi
	Replay #2 - 19/10/2010 14:09	Invia email

Le sequenze amminoacidiche tra balena e uomo sono molto simili (89%), si tratta quindi di ortologia dato che si tratta di sequenze di beta-emoglobina.

Invece le sequenze amminoacidiche tra gorilla e uomo sono piuttosto differenti (41%), in questo caso sono sequenze paraloghe, infatti è il confronto tra una alfa-emoglobina e una beta-emoglobina.

Per lo stesso motivo sono differenti le sequenze tra balena e gorilla (38%), geni quindi paraloghi.

MARINA VINCENTI
studente

	Re: Esercizio evoluzione	Rispondi
	Replay #1 - 19/10/2010 14:11	Invia email

Considerate le sequenze:

>HBB_HUMAN  - Homo sapiens
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKV
KAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGK
EFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
>HBA_GORGO - Gorilla gorilla
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGDYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAV
AHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKY
R
>HBB_BALAC Hemoglobin beta chain - Balaenoptera acutorostrata
HLTAEEKSAVTALWAKVNVEEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFEAFGDLSTADAVMKNPKV
KAHGKKVLASFSDGLKHLDDLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVIVLARHFGK
EFTPELQAAYQKVVAGVANALAHKYH

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla :41%
Homo - Balenottera:89%
Balenottera - Gorilla:38%

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?I

I geni sono paraloghi, in quanto possono avere funzioni uguali o simili ma spesso diverse.

GIULIA MARIA NOCCHI
studente

	Re: Esercizio evoluzione	Rispondi
	Replay #2 - 19/10/2010 14:12	Invia email

>HBB_HUMAN  - Homo sapiens
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKV
KAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGK
EFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
>HBA_GORGO - Gorilla gorilla
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGDYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAV
AHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKY
R
>HBB_BALAC Hemoglobin beta chain - Balaenoptera acutorostrata
HLTAEEKSAVTALWAKVNVEEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFEAFGDLSTADAVMKNPKV
KAHGKKVLASFSDGLKHLDDLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVIVLARHFGK
EFTPELQAAYQKVVAGVANALAHKYH

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla :41%
Homo - Balenottera:89%
Balenottera - Gorilla:38%

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?l-uomo e il gorilla sono paraloghi in quanto dal gene A avviene una duplicazione, possono avere funzioni simili. Mentre con la balena sono ortologhi in quanto i geni derivano da speciazione ossia separazione della specie.

LUCIA MAURELLA
studente

	Re: Esercizio evoluzione	Rispondi
	Replay #2 - 19/10/2010 14:13	Invia email

>HBB_HUMAN  - Homo sapiens
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKV
KAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGK
EFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
>HBA_GORGO - Gorilla gorilla
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGDYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAV
AHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKY
R
>HBB_BALAC Hemoglobin beta chain - Balaenoptera acutorostrata
HLTAEEKSAVTALWAKVNVEEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFEAFGDLSTADAVMKNPKV
KAHGKKVLASFSDGLKHLDDLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVIVLARHFGK
EFTPELQAAYQKVVAGVANALAHKYH

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.

Homo - Gorilla :41%

Homo - Balenottera: 89%
Balenottera - Gorilla:38%

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?

NICOLA MARI
studente

	Re: Esercizio evoluzione	Rispondi
	Replay #2 - 19/10/2010 14:13	Invia email

>HBB_HUMAN - Homo sapiens
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKV
KAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGK
EFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
>HBA_GORGO - Gorilla gorilla
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGDYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAV
AHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKY
R
>HBB_BALAC Hemoglobin beta chain - Balaenoptera acutorostrata
HLTAEEKSAVTALWAKVNVEEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFEAFGDLSTADAVMKNPKV
KAHGKKVLASFSDGLKHLDDLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVIVLARHFGK
EFTPELQAAYQKVVAGVANALAHKYH

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla :41%
Homo - Balenottera:49%
Balenottera - Gorilla:21%

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?

tutti paraloghi

MARINA VANGELI
studente

	Re: Esercizio evoluzione	Rispondi
	Replay #3 - 19/10/2010 14:14	Invia email

>HBB_HUMAN  - Homo sapiens
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKV
KAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGK
EFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
>HBA_GORGO - Gorilla gorilla
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGDYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAV
AHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKY
R
>HBB_BALAC Hemoglobin beta chain - Balaenoptera acutorostrata
HLTAEEKSAVTALWAKVNVEEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFEAFGDLSTADAVMKNPKV
KAHGKKVLASFSDGLKHLDDLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVIVLARHFGK
EFTPELQAAYQKVVAGVANALAHKYH

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla : 41%
Homo - Balenottera: 89%
Balenottera - Gorilla: 38%

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?Sono paraloghi perchè i rapporti di somiglianza tra geni non coincidono con la storia evolutiva.

MARTINA SAVI
studente

	Re: Esercizio evoluzione	Rispondi
	Replay #2 - 19/10/2010 14:15	Invia email

>HBB_HUMAN  - Homo sapiens
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKV
KAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGK
EFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
>HBA_GORGO - Gorilla gorilla
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGDYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAV
AHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKY
R
>HBB_BALAC Hemoglobin beta chain - Balaenoptera acutorostrata
HLTAEEKSAVTALWAKVNVEEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFEAFGDLSTADAVMKNPKV
KAHGKKVLASFSDGLKHLDDLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVIVLARHFGK
EFTPELQAAYQKVVAGVANALAHKYH

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla :41%
Homo - Balenottera:89%
Balenottera - Gorilla:38%

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?

sono paraloghi perchè la storia evolutiva evidenzia maggiore somiglianza nel pool genico ma in realtà dai dati emerge il contrario, ossia l'uomo si avvicina maggiormente alla balena per quanto riguarda l'identità .

VERONICA MUTTI
studente

	Re: Esercizio evoluzione	Rispondi
	Replay #3 - 19/10/2010 14:15	Invia email

HOMO E GORILLA= 41%

HOMO E BALENOTTERA= 89%

BALENOTTERA E GORILLA= 38%

PER NOI UOMO E GORILLA HANNO GENI PARALOGHI

UOMO E BALENOTTERA SONO ORTOLOGHI

perchè l'uoma e la balenottera hanno l'emoglobina beta e gorilla alfa.

ALESSIA MILIZIANO
studente

	Re: Esercizio evoluzione	Rispondi
	Replay #3 - 19/10/2010 14:17	Invia email

>HBB_HUMAN  - Homo sapiens
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKV
KAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGK
EFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
>HBA_GORGO - Gorilla gorilla
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGDYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAV
AHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKY
R
>HBB_BALAC Hemoglobin beta chain - Balaenoptera acutorostrata
HLTAEEKSAVTALWAKVNVEEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFEAFGDLSTADAVMKNPKV
KAHGKKVLASFSDGLKHLDDLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVIVLARHFGK
EFTPELQAAYQKVVAGVANALAHKYH

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla :41%
Homo - Balenottera:89%
Balenottera - Gorilla:38%

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?

CHIARA BOTTAZZINI
studente

	Re: Esercizio evoluzione	Rispondi
	Replay #2 - 19/10/2010 14:20	Invia email

Considerate le sequenze:

>HBB_HUMAN  - Homo sapiens
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKV
KAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGK
EFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
>HBA_GORGO - Gorilla gorilla
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGDYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAV
AHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKY
R
>HBB_BALAC Hemoglobin beta chain - Balaenoptera acutorostrata
HLTAEEKSAVTALWAKVNVEEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFEAFGDLSTADAVMKNPKV
KAHGKKVLASFSDGLKHLDDLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVIVLARHFGK
EFTPELQAAYQKVVAGVANALAHKYH

1) Allineare le sequenze e indicare le % di identità.
Homo - Gorilla :
Homo - Balenottera:
Balenottera - Gorilla:

2) pensate che i geni siano ortologhi o paraloghi? Per quale motivo?

1a) 41%

1b)89%

1c) 38%

2) Tra l' uomo e il gorilla e anche tra la balenottera e il gorilla le sequenze sono ortologhe perchè la percentuale di somiglianza è bassa rispetto all' 89 % che si presenta tra uomo e balenottera in cui le sequenze sono paraloghe.