Da 1 a 19 di 19
| Autore | Intervento |
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 Prof. Riccardo Percudani
docente |
Dalle sequenze allineate di emoglobina alpha e beta in uomo, topo e cavallo (vedi esercizio precedente), calcolare:
Il rate di sostituzione tra le emoblobine alfa e tra le emoglobine beta, espresso in sostituzioni/sito*My e in PAM/My.
Il tempo di divergenza tra alfa e beta assumendo l'orologio molecolare.
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ELISA MARELLI
studente |
alpha: 1*10-3 sostituzioni*sito/mln anni= 0,1 PAM
beta: 1,7*10-3 sostituzioni*sito/mln anni= 0,17 pam
divergenza alpha: 78,5
divergenza beta: 80,88
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EMANUELE BIGNARDI
studente |
Il rate di sostituzione tra le emoblobine alfa e tra le emoglobine beta, espresso in sostituzioni/sito*My e in PAM/My.
Rate Alpha-Alpha = 1x10-3 sost/sito*My (1x10-1 PAM/My)
Rate Alpha-Beta = 1,7x10-3 sost/sito*My (1,7x10-1 PAM/My)
Il tempo di divergenza tra alfa e beta assumendo l'orologio molecolare.
T= 498My
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ERICA FIORINI
studente |
- Il rate di sostituzione tra le emoblobine alfa e tra le emoglobine beta, espresso in sostituzioni/sito*My e in PAM/My:
CONSIDERIAMO 80My
MEDIA HBA (0,148 + 0,139 + 0,183) / 3 = 0,157
MEDIA HBB (0,328 + 0,229 + 0,267) / 3 = 0,275
R(hba) = 0,157 / 2*80 = 9,81*10^-4 sostituzioni/sito*My = 9,81*10^-2 PAM/My
R(hbb) = 0,275 / 2*80 = 1,72*10^-3 sostituzioni/sito*My = 1,72*10^-1 PAM/My
- Il tempo di divergenza tra alfa e beta assumendo l'orologio molecolare:
media dei due rate = 1,35*10^-3
media delle mutazioni = 0,957
T = 0,957/2*1,35*10^-3 = 354,32My
Erica Fiorini, Aletheia Blasi, Laura Marchi
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MIZAR FRANCESCA OLIVA
studente |
Dalle sequenze allineate di emoglobina alpha e beta in uomo, topo e cavallo (vedi esercizio precedente), calcolare:
Il rate di sostituzione tra le emoglobine alfa e tra le emoglobine beta, espresso in sostituzioni/sito*My e in PAM/My.
Rate Alpha
0.47/80 My = 5.9*10-3 mutazioni/(sito*My) [0.59 PAM]
Rate Beta
0.824/80 My = 1*10-2 mutazioni/(sito*My) [1 PAM]
Il tempo di divergenza tra alfa e beta assumendo l'orologio molecolare.
Considerando il Rate Alfa
T = 0.967/ (2*5.9*10-3) = 81.9 = 80 My
Considerando il Rate Beta
T= 0.967/(2*10-2) = 48.3 = 50 My
Mizar Oliva, Maurizio Gerace, Maria Antonietta Principalli.
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ANASTASIA CONTI
studente |
Dalle sequenze allineate di emoglobina alpha e beta in uomo, topo e cavallo (vedi esercizio precedente), calcolare:
Il rate di sostituzione tra le emoblobine alfa e tra le emoglobine beta, espresso in sostituzioni/sito*My e in PAM/My.
rate Hba = 9.8 *10-4 sostituzioni / (sito*My)
rate Hbb = 1.72*10-3 sostituzioni / (sito *My)
rate Hba e Hbb = 5,98* 10-3 sostituzioni/ ( sito * My)
rate Hba = 9.8 *10-2 PAM/ My
rate Hbb = 1.72*10-1 PAM/My
rate Hba e Hbb = 5,98* 10-1 PAM/My
Il tempo di divergenza tra alfa e beta assumendo l'orologio molecolare.
0,957/ 2* 5,98 * 10-3 = 79,75 My
Valentina Franzoso e Anastasia Conti
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MARIALAURA MARCHETTI
studente |
Il rate di sostituzione tra le emoblobine alfa e tra le emoglobine beta, espresso in sostituzioni/sito*My e in PAM/My.
R Hb alfa= 2.9*10-3 sostituzioni/sito*My, 0.29 PAM/My
R Hb beta= 4.1*10-3 sostituzioni/sito*My, 0.41 PAM/My
Il tempo di divergenza tra alfa e beta assumendo l'orologio molecolare.
t= 86.8 My
Giovanna Coceano e Marialaura Marchetti
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ALESSIA SAVI
studente |
HBA_HOMO 0.000 0.148 0.139 0.899 0.989 1.013
HBA_MUS 0.148 0.000 0.183 0.921 0.989 1.013
HBA_CAVALLO 0.139 0.183 0.000 0.921 0.899 0.966
HBB_HOMO 0.899 0.921 0.921 0.000 0.229 0.267
HBB_MUS 0.989 0.989 0.899 0.229 0.000 0.328
HBB_CAVALLO 1.013 1.013 0.966 0.267 0.328 0.000
Media HBa: 0,157
Rate: 0,157/160=9,8*10-4 Mutazioni/sito*My = 0,098 PAM/My
Media HBb: 0,275
Rate: 0,275/160=1,71*10-4 Mutazioni/sito*My = 0,0171 PAM/My
Media HBa-HBb: 0,957
Rate: 0,957/160=5,98*10-3 Mutazioni/sito*My = 0,598 PAM/My
Tempo: 0,957/(2*5,98*10-3)=0,957/0,012=80,42 My
Alessia Savi
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Prof. Riccardo Percudani
docente |
Rate Hb:
media Hba: 0,157/160 My = 1*10-3
media Hbb: 0,275/160 My = 1,7 *10-3
Tempo di divergenza:
Hba: 0,96/2*10-3= 480 My
Hbb: 0,96/2*1,7*10-3= 275 My
Irene Venditti
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ADELE BUSICO
studente |
Dalle sequenze allineate di emoglobina alpha e beta in uomo, topo e cavallo (vedi esercizio precedente), calcolare:
Il rate di sostituzione tra le emoblobine alfa e tra le emoglobine beta, espresso in sostituzioni/sito*My e in PAM/My.
9.8*10-4 sostituzioni/sito*My (alfa) = 9,8 *10-2 PAM/My
1.7*10-3 sostituzioni/sito*My (beta) = 0.17 PAM/My
Il tempo di divergenza tra alfa e beta assumendo l'orologio molecolare.
0.957/2* 1,3*10-3= 368 milioni di anni (risultato media tra i due rate)
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STEFANIA CICERONE
studente |
HbA:
Media
(0.148+0.139+0.183)/3=0.157
0.157/160 My= 1*10-3 distanza tra le HbA dei tre organismi
HbB:
Media
(0.229+0.267+0.328)/3= 0.275
0.275/160= 1.7*10-3
Rate tra HbA e HbB= 1*10-3
Tempo di divergenza=
HbA
(0.9+0.9+0.9+1+1+0.9+1+1+1)/9=0.86
0.86/2*10-3=430 My
HbB:
0.86/3.4*10-3=253 My
Stefania Cicerone
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VALERIA LA ROSA
studente |
rate di sostituzione tra le emoblobine alfa e tra le emoglobine beta, espresso in sostituzioni/sito*My e in PAM/My.
Emoglobine alfa
(0,148+0.139+0.183)/3=0.157
0.157/160 My=9.8*10-4=10-3
Emoglobine beta
Media
(0.229+0.267+0.328)/3=0.275
0.275/160 My=1.7*10-3
Rate tra Hba e Hbb=10-3
Il tempo di divergenza tra alfa e beta assumendo l'orologio molecolare.
Emoglobine alfa: 0,86/2*10-3=430 My
Emoglobine beta:0,86/2*1,7*10-3=253 My
Valeria La Rosa e Giannatempo Ludovica
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BEATRICE FERMI
studente |
Dalle sequenze allineate di emoglobina alpha e beta in uomo, topo e cavallo (vedi esercizio precedente), calcolare:
Il rate di sostituzione tra le emoblobine alfa e tra le emoglobine beta, espresso in sostituzioni/sito*My e in PAM/My.
R HBA 0.157/160= 9.8*10-4 sostituzioni/sito*My= 9.8*10-2 PAM/My
R HBB 0.275/160= 1.7*10-3 sostituzioni/sito*My= 1.7*10-1 PAM/My
R HB= 1.34*10-3 sostituzioni/sito*My
Il tempo di divergenza tra alfa e beta assumendo l'orologio molecolare.
T=0.95/2*9.8*10-4= 484,7 My
T=0.95/2*1.7*10-3= 279 My
Beatrice Fermi e Angela La Torre
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LAURA GAVARINI
studente |
HBA 0,157
HBB = 0,275
R(hba) = 0,157 / 2*80 = 9,81*10^-4 sostituzioni/sito*My = 9,81*10^-2 PAM/My
R(hbb) = 0,275 / 2*80 = 1,72*10^-3 sostituzioni/sito*My = 1,72*10^-1 PAM/My
media due rate = 1,35*10^-3
media mutazioni = 0,957
T = 0,957/2*1,35*10^-3 = 354,32My
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ROBERTA BONAFEDE
studente |
Dalle sequenze allineate di emoglobina alpha e beta in uomo, topo e cavallo (vedi esercizio precedente), calcolare:
Il rate di sostituzione tra le emoblobine alfa e tra le emoglobine beta, espresso in sostituzioni/sito*My e in PAM/My.
-tra le emoglobine alfa: 9.8 * 10-4 sostituzioni/(sito* My) e 9.8 * 10-2 PAM/My
-tra le emoglobine beta: 1.72 * 10-3 sostituzioni/(sito* My) e 1.72 * 10-1 PAM/My
Il tempo di divergenza tra alfa e beta assumendo l'orologio molecolare.
T = 354,32 My
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Barbara Montali
studente |
rate tra emoglobine alfa: 1*10-3 (PAM: 0,1)
rate tra emoglobine beta: 2*10-3 (PAM: 0,2)
tempo di divergenza tra alfa e beta: 319 my
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MALIHEH ASADZADEH
studente |
Dalle sequenze allineate di emoglobina alpha e beta in uomo, topo e cavallo (vedi esercizio precedente), calcolare:
Il rate di sostituzione tra le emoblobine alfa e tra le emoglobine beta, espresso in sostituzioni/sito*My e in PAM/My.
R:
a: 0,157/160 My = 1*10-3
b: 0,275/160 My = 1,7 *10-3
Il tempo di divergenza tra alfa e beta assumendo l'orologio molecolare.
T:
a: 0,96/2*10-3= 480 My
b: 0,96/2*1,7*10-3= 275 My
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MARIA PIACENTI
studente |
- Il rate di sostituzione tra le emoblobine alfa e tra le emoglobine beta, espresso in sostituzioni/sito*My e in PAM/My:
MEDIA HBA (0,148 + 0,139 + 0,183) / 3 = 0,157
MEDIA HBB (0,328 + 0,229 + 0,267) / 3 = 0,275
RHba= 0,157 / 2*80 = 9,81*10-4 sostituzioni/sito*My = 9,81*10-2 PAM/My
RHbb = 0,275 / 2*80 = 1,72*10-3 sostituzioni/sito*My = 1,72*10-1 PAM/My
- Il tempo di divergenza tra alfa e beta assumendo l'orologio molecolare:
MEDIA dei due rate = 1,35*10^-3
MEDIA delle mutazioni = 0,957
T = 0,957/2*1,35*10-3 = 354,32My
Maria Piacenti e Andrea Lori
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Michele Giacobini
studente |
rate di sostituzione tra le emoblobine alfa e tra le emoglobine beta:
Rate Emog_Alfa=(0.139+0.148+0.183)/3*(80*2)=9.81*10^-4 Sostituzioni/sito*My [=9.81*10^-2 PAM/My]
Rate Emog_Beta=(0.229+0.267+0.338)/3*(80*2)=1.72*10^-3 Sostituzioni/sito*My [=1.72*10^-1 PAM/My]
Media Rate=(9.81*10^-4 + 1.72*10^-3)/2=1.35*10^-3 Sostituzioni/sito*My
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