Da 1 a 26 di 26
| Autore | Intervento |
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 Prof. Riccardo Percudani
docente |
Trovare in Swissprot la proteina corrispondente all'identificativo DNLI1_YEAST
1) Qual'è la funzione della proteina?
2) Riportare peso molecolare e coefficiente di estinzione. Scrivere se la proteina è acida, basica o neutra.
3) Fare una ricerca in Prosite e riportare i Pattern contenuti nella proteina.
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ANDREA ZAGARELLA
studente |
1) Qual'è la funzione della proteina?
DNA ligase that seals nicks in double-stranded DNA during DNA replication, DNA recombination and DNA repair. The mitochondrial form is required for mitochondrial DNA maintenance but is non-essential while the nuclear form is essential for cell viability.
2) Riportare peso molecolare e coefficiente di estinzione. Scrivere se la proteina è acida, basica o neutra.
Molecular weight: 84828.2
Extinction coefficients are in units of M-1 cm-1, at 280 nm measured in water.
Ext. coefficient 51770
Abs 0.1% (=1 g/l) 0.610, assuming all pairs of Cys residues form cystines
Ext. coefficient 50770
Abs 0.1% (=1 g/l) 0.599, assuming all Cys residues are reduced
La proteina risulta basica
3) Fare una ricerca in Prosite e riportare i Pattern contenuti nella proteina.
2, PS00697 DNA_LIGASE_A1 ATP-dependent DNA ligase AMP-binding site :
417 - 425: EYKYDGERA
PS00333 DNA_LIGASE_A2 ATP-dependent DNA ligase signature 2 :
571 - 598: EGLMVKmlegpeshYEpskrs.Rnwl..KLK
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ANDREA ZAGARELLA
studente |
1) Qual'è la funzione della proteina?
DNA ligase that seals nicks in double-stranded DNA during DNA replication, DNA recombination and DNA repair. The mitochondrial form is required for mitochondrial DNA maintenance but is non-essential while the nuclear form is essential for cell viability.
2) Riportare peso molecolare e coefficiente di estinzione. Scrivere se la proteina è acida, basica o neutra.
Molecular weight: 84828.2
Extinction coefficients are in units of M-1 cm-1, at 280 nm measured in water.
Ext. coefficient 51770
Abs 0.1% (=1 g/l) 0.610, assuming all pairs of Cys residues form cystines
Ext. coefficient 50770
Abs 0.1% (=1 g/l) 0.599, assuming all Cys residues are reduced
La proteina risulta basica
3) Fare una ricerca in Prosite e riportare i Pattern contenuti nella proteina.
2, PS00697 DNA_LIGASE_A1 ATP-dependent DNA ligase AMP-binding site :
417 - 425: EYKYDGERA
PS00333 DNA_LIGASE_A2 ATP-dependent DNA ligase signature 2 :
571 - 598: EGLMVKmlegpeshYEpskrs.Rnwl..KLK
michele pastorelli
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MATTEO PEDEGANI
studente |
Trovare in Swissprot la proteina corrispondente all'identificativo DNLI1_YEAST
1) Qual'è la funzione della proteina?
DNA ligasi
2) Riportare peso molecolare e coefficiente di estinzione. Scrivere se la proteina è acida, basica o neutra.
Peso molecolare 84828
coefficiente d'estinzione 51770
La proteina è neutra (P.I. 7,44)
3) Fare una ricerca in Prosite e riportare i Pattern contenuti nella proteina.
DNA_LIGASE_A1 [EDQH] - {K} - K - {VEDI} - [DN] - G - {GLYN} - R - [GACIVM]
DNA_LIGASE_A2 E - G - [LIVMA] - [LIVM] - [LIVMA] - [KR] - x(5,8) - [YW] - [QNEKTI] - x(2,6) - [KRH] - x(3,5) - K - [LIVMFY] - K
Matteo Pedegani e Davide Sarra
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LAURA MALTRAVERSI
studente |
Trovare in Swissprot la proteina corrispondente all'identificativo DNLI1_YEAST
1) Qual'è la funzione della proteina?
é una dna ligasi che chiude il doppio filamento di dna, durante la replicazione del dna, la ricombinazione e la riparazione
2) Riportare peso molecolare e coefficiente di estinzione. Scrivere se la proteina è acida, basica o neutra.
P.M. 84828,2 é BASICA (P.I. 7,4) , coeff. estinzione 51770
3) Fare una ricerca in Prosite e riportare i Pattern contenuti nella proteina.
Dna ligasi A1 : [EDQH] - {K} - K - {VEDI} - [DN] - G - {GLYN} - R - [GACIVM]
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Dna ligasi a2: E - G - [LIVMA] - [LIVM] - [LIVMA] - [KR] - x(5,8) - [YW] - [QNEKTI] - x(2,6) - [KRH] - x(3,5) - K - [LIVMFY] - K
Martina Inoretti
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LUCA STRAGLIATI
studente |
Trovare in Swissprot la proteina corrispondente all'identificativo DNLI1_YEAST
1) Qual'è la funzione della proteina?
DNA ligasi I
2) Riportare peso molecolare e coefficiente di estinzione. Scrivere se la proteina è acida, basica o neutra.
PM=84.8 kDa
coefficiente di estinzione=51770
La proteina è neutra ( pI= 7.44)
3) Fare una ricerca in Prosite e riportare i Pattern contenuti nella proteina.
ATP-dependent DNA ligase AMP-binding site:EYKYDGERA
ATP-dependent DNA ligase signature 2:EGLMVKMLEGPESHYEPSKRSRNWLKLK
Adriana Vitiello
Luca Stragliati
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ALESSIO SARDELLA
studente |
Trovare in Swissprot la proteina corrispondente all'identificativo DNLI1_YEAST
1) Qual'è la funzione della proteina?
DNA ligase 1
2) Riportare peso molecolare e coefficiente di estinzione. Scrivere se la proteina è acida, basica o neutra.
Molecular weight: 84828.2
Ext. coefficient: 50770
Theoretical pI: 7.44 la proteina è neutra
3) Fare una ricerca in Prosite e riportare
i Pattern contenuti nella proteina.
DNA_LIGASE_A1 ,ATP-dependent DNA ligase AMP-binding site= EYKYDGERA
DNA_LIGASE_A2, ATP-dependent DNA ligase signature 2 = EGLMVKMLEGPESHYEPSKRSRNWLKLK
Sardella Alessio
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MARIA CARLA TERESI
studente |
Trovare in Swissprot la proteina corrispondente all'identificativo DNLI1_YEAST
1) Qual'è la funzione della proteina?é Una DNA ligasi 1
2) Riportare peso molecolare e coefficiente di estinzione. Scrivere se la proteina è acida, basica o neutra.
84,8 KDa, coefficiente di estinzione 51770,la proteina è neutra
3) Fare una ricerca in Prosite e riportare i Pattern contenuti nella proteina.
sono presenti 2 pattern
Dna ligasi A1
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Dna ligasi A2
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[EDQH] - {K} - K - {VEDI} - [DN] - G - {GLYN} - R - [GACIVM]
E - G - [LIVMA] - [LIVM] - [LIVMA] - [KR] - x(5,8) - [YW] - [QNEKTI] - x(2,6) - [KRH] - x(3,5) - K - [LIVMFY] - K
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CECILIA NOLLI
studente |
1) Qual'è la funzione della proteina? DNA ligasi che interviene durante replicazione, riparazione e ricombinazione del DNA
2) Riportare peso molecolare e coefficiente di estinzione. Scrivere se la proteina è acida, basica o neutra. PM 84828,2 (85kD), pI=7.44 perciò la proteina è neutra. coeff. di estinzione=51770
3) Fare una ricerca in Prosite e riportare i Pattern contenuti nella proteina.
EYKYDGERA DNA ligasi 1
EGLMVKmlegpeshYEpskrs.Rnwl..KL DNA ligasi 2
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GLORIA SPAGNOLI
studente |
Trovare in Swissprot la proteina corrispondente all'identificativo DNLI1_YEAST
1) Qual'è la funzione della proteina?
DNA ligasi 1, interviene nella replicazione, nella ricombinazione e nella riparazione del DNA.
2) Riportare peso molecolare e coefficiente di estinzione. Scrivere se la proteina è acida, basica o neutra.
84828, 51770
la proteina è neutra (pI=7,44)
3) Fare una ricerca in Prosite e riportare i Pattern contenuti nella proteina.
la sequenza corrispondente alla DNA ligasi 1 è EYKYDGERA (pattern[EDQH] - {K} - K - {VEDI} - [DN] - G - {GLYN} - R - [GACIVM]), quella corrispondente alla DNA ligasi 2 è EGLMVKmlegpeshYEpskrs.Rnwl..KLK.(pattern E - G - [LIVMA] - [LIVM] - [LIVMA] - [KR] - x(5,8) - [YW] - [QNEKTI] - x(2,6) - [KRH] - x(3,5) - K - [LIVMFY] - K)
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FRANCESCA SANDRINI
studente |
Trovare in Swissprot la proteina corrispondente all'identificativo DNLI1_YEAST
1) Qual è la funzione della proteina?
dna ligasi che ripara i nick del doppio filamento durante la replicazione,ricombinazione e il riparo del dna.
2) Riportare peso molecolare e coefficiente di estinzione. Scrivere se la proteina è acida, basica o neutra.
Molecular weight: 84828.2
Ext. coefficient 51770
pi: 7.44 neutra
3) Fare una ricerca in Prosite e riportare i Pattern contenuti nella proteina.
[EDQH] - {K} - K - {VEDI} - [DN] - G - {GLYN} - R - [GACIVM]
E - G - [LIVMA] - [LIVM] - [LIVMA] - [KR] - x(5,8) - [YW] - [QNEKTI] - x(2,6) - [KRH] - x(3,5) - K - [LIVMFY] - K
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SILVIA REVERBERI
studente |
DNLI1_YEAST
- Questa proteina è una DNA ligasi
- Peso molecolare : 84.8 KDa
- coefficiente di estinzione: 51770
- la proteina è neutra
- Pattern contenuti nella proteina:
- [EDQH] - {K} - K - {VEDI} - [DN] - G - {GLYN} - R - [GACIVM]
-
E - G - [LIVMA] - [LIVM] - [LIVMA] - [KR] - x(5,8) - [YW] - [QNEKTI] - x(2,6) - [KRH] - x(3,5) - K - [LIVMFY] - K
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MARIA PIZZIMENTI
studente |
Trovare in Swissprot la proteina corrispondente all'identificativo DNLI1_YEAST
1) Qual'è la funzione della proteina?
la proteina è una DNA ligasi I
2) Riportare peso molecolare e coefficiente di estinzione. Scrivere se la proteina è acida, basica o neutra.
Peso Molecolare = 80076.5
Coefficiente di estinzione = 51645
La proteina è acida, punto isoelettrico 5,90
3) Fare una ricerca in Prosite e riportare i Pattern contenuti nella proteina.
DNA_LIGASE_A1, ATP-dependent DNA ligase AMP-binding site
PATTERN è
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[EDQH] - {K} - K - {VEDI} - [DN] - G - {GLYN} - R - [GACIVM]
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DNA_LIGASE_A2, ATP-dependent DNA ligase signature 2
PATTERN è
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E - G - [LIVMA] - [LIVM] - [LIVMA] - [KR] - x(5,8) - [YW] - [QNEKTI] - x(2,6) - [KRH] - x(3,5) - K - [LIVMFY] - K
Paladino Orsola Letizia
Pizzimenti Maria
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STEFANO BRANCA
studente |
Trovare in Swissprot la proteina corrispondente all'identificativo DNLI1_YEAST
1) Qual'è la funzione della proteina?
DNA ligase 1 precursor
2) Riportare peso molecolare e coefficiente di estinzione. Scrivere se la proteina è acida, basica o neutra.
peso molecolare=80076.5
coefficiente di estinzione=51645
la proteina è acida
punto isoelettrico 5.90
3) Fare una ricerca in Prosite e riportare i Pattern contenuti nella proteina.
ATP-dependent DNA ligase AMP-binding site (PATTERN) =[EDQH] - {K} - K - {VEDI} - [DN] - G - {GLYN} - R - [GACIVM]
ATP-dependent DNA ligase signature 2 =E - G - [LIVMA] - [LIVM] - [LIVMA] - [KR] - x(5,8) - [YW] - [QNEKTI] - x(2,6) - [KRH] - x(3,5) - K - [LIVMFY] - K
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EMILIO PERFETTO
studente |
Trovare in Swissprot la proteina corrispondente all'identificativo DNLI1_YEAST
1) Qual'è la funzione della proteina?
2) Riportare peso molecolare e coefficiente di estinzione. Scrivere se la proteina è acida, basica o neutra.
3) Fare una ricerca in Prosite e riportare i Pattern contenuti nella proteina.
1) è una dna ligasi che interveniene nella replicazione, nella ricombinazione e nella riparazione del DNA.
2)
PM= 84828.2
La proteina è neutra
il coefficente di estinzione è = 51770
3) 2 pattern
DNA_LIGASE_A1
ATP-dependent DNA ligase AMP-binding site
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E - G - [LIVMA] - [LIVM] - [LIVMA] - [KR] - x(5,8) - [YW] - [QNEKTI] - x(2,6) - [KRH] - x(3,5) - K - [LIVMFY] - K |
DNA_LIGASE_A2
ATP-dependent DNA ligase signature 2
:
[EDQH] - {K} - K - {VEDI} - [DN] - G - {GLYN} - R - [GACIVM]
PERFETTO EMILIO
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LUDOVICA LEZZI
studente |
Trovare in Swissprot la proteina corrispondente all'identificativo DNLI1_YEAST
1) Qual è la funzione della proteina?
dna ligasi che ripara i nick del doppio filamento durante la replicazione,ricombinazione e il riparo del dna.
2) Riportare peso molecolare e coefficiente di estinzione. Scrivere se la proteina è acida, basica o neutra.
Molecular weight: 84828.2
Ext. coefficient 51770
pi: 7.44 neutra
3) Fare una ricerca in Prosite e riportare i Pattern contenuti nella proteina.
[EDQH] - {K} - K - {VEDI} - [DN] - G - {GLYN} - R - [GACIVM]
E - G - [LIVMA] - [LIVM] - [LIVMA] - [KR] - x(5,8) - [YW] - [QNEKTI] - x(2,6) - [KRH] - x(3,5) - K - [LIVMFY] - K
Chiara Pasquini e Ludovica Lezzi
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FRANCESCA SANDRINI
studente |
Trovare in Swissprot la proteina corrispondente all'identificativo DNLI1_YEAST
1) Qual è la funzione della proteina?
dna ligasi che ripara i nick del doppio filamento durante la replicazione,ricombinazione e il riparo del dna.
2) Riportare peso molecolare e coefficiente di estinzione. Scrivere se la proteina è acida, basica o neutra.
Molecular weight: 84828.2
Ext. coefficient 51770
pi: 7.44 neutra
3) Fare una ricerca in Prosite e riportare i Pattern contenuti nella proteina.
[EDQH] - {K} - K - {VEDI} - [DN] - G - {GLYN} - R - [GACIVM]
E - G - [LIVMA] - [LIVM] - [LIVMA] - [KR] - x(5,8) - [YW] - [QNEKTI] - x(2,6) - [KRH] - x(3,5) - K - [LIVMFY] - K
MARTINA GALLI
ALICE ZUCCOLI
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ANTONINO SAMMARTANO
studente |
Trovare in Swissprot la proteina corrispondente all'identificativo DNLI1_YEAST
1) Qual'è la funzione della proteina?
DNA LIGASI 1
2) Riportare peso molecolare e coefficiente di estinzione. Scrivere se la proteina è acida, basica o neutra.
Peso molecolare:84.8KDa
La proteina è neutra 7.44
Coeff.di estinzione:51770
3) Fare una ricerca in Prosite e riportare i Pattern contenuti nella proteina.
[EDQH] - {K} - K - {VEDI} - [DN] - G - {GLYN} - R - [GACIVM]
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E - G - [LIVMA] - [LIVM] - [LIVMA] - [KR] - x(5,8) - [YW] - [QNEKTI] - x(2,6) - [KRH] - x(3,5) - K - [LIVMFY] - K
MILIOTO ELISA
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ROBERTA BARONE
studente |
Trovare in Swissprot la proteina corrispondente all'identificativo DNLI1_YEAST
1) Qual'è la funzione della proteina?
2) Riportare peso molecolare e coefficiente di estinzione. Scrivere se la proteina è acida, basica o neutra.
3) Fare una ricerca in Prosite e riportare i Pattern contenuti nella proteina.
1. DNA ligase that seals nicks in double-stranded DNA during DNA
replication, DNA recombination and DNA repair. The mitochondrial form
is required for mitochondrial DNA maintenance but is non-essential
while the nuclear form is essential for cell viability.
2.peso molecolare:84,8kD coeff.di estinzione:51770.LA PROTEINA è NEUTRA.
| 3.I PATTERN SONO: |
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[EDQH] - {K} - K - {VEDI} - [DN] - G - {GLYN} - R - [GACIVM]
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E - G - [LIVMA] - [LIVM] - [LIVMA] - [KR] - x(5,8) - [YW] - [QNEKTI] - x(2,6) - [KRH] - x(3,5) - K - [LIVMFY] - K |
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GIUSI LANZILOTTI
ROBERTA BARONE
MARIACHIARA VENUTI
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LAURA RAFFELINI
studente |
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1) Qual'è la funzione della proteina?
La proteina è una DNA ligasi
2) Riportare peso molecolare e coefficiente di estinzione. Scrivere se la proteina è acida, basica o neutra.
Peso molecolare: 84828.2 Dalton
Coefficiente di estinzione: 51770
La proteina è neutra
3) Fare una ricerca in Prosite e riportare i Pattern contenuti nella proteina.
Pattern contenuti:
[EDQH] - {K} - K - {VEDI} - [DN] - G - {GLYN} - R - [GACIVM]
E - G - [LIVMA] - [LIVM] - [LIVMA] - [KR] - x(5,8) - [YW] - [QNEKTI] - x(2,6) - [KRH] - x(3,5) - K - [LIVMFY] - K
Laura Raffelini
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SERENA RABAGLIA
studente |
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1) Qual'è la funzione della proteina?
precursore della DNA ligasi 1
2) Riportare peso molecolare e coefficiente di estinzione. Scrivere se la proteina è acida, basica o neutra.
Peso Molrecolare: 84828.2
Coefficente di estinzione: 51770
Punto Isoelettrco: 7.44 proteina neutra
3) Fare una ricerca in Prosite e riportare i Pattern contenuti nella proteina.
[EDQH] - {K} - K - {VEDI} - [DN] - G - {GLYN} - R - [GACIVM]
E - G - [LIVMA] - [LIVM] - [LIVMA] - [KR] - x(5,8) - [YW] - [QNEKTI] - x(2,6) - [KRH] - x(3,5) - K - [LIVMFY] - K
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LUCIA ISETTI
studente |
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1) Qual'è la funzione della proteina?
La proteina è una DNA ligasi che interviene durante la replicazione, la ricombinazione o la riparazione del DNA
DNA ligase that seals nicks in double-stranded DNA during DNA
replication, DNA recombination and DNA repair. The mitochondrial form
is required for mitochondrial DNA maintenance but is non-essential
while the nuclear form is essential for cell viability.
2) Riportare peso molecolare e coefficiente di estinzione. Scrivere se la proteina è acida, basica o neutra.
Peso molecolare 84.8 K Da
coefficiente di estinzione 51770
la proteina è neutra, tendente al basico P.I. 7.44
3) Fare una ricerca in Prosite e riportare i Pattern contenuti nella proteina.
[EDQH] - {K} - K - {VEDI} - [DN] - G - {GLYN} - R - [GACIVM]
E - G - [LIVMA] - [LIVM] - [LIVMA] - [KR] - x(5,8) - [YW] - [QNEKTI] - x(2,6) - [KRH] - x(3,5) - K - [LIVMFY] - K
Isetti Lucia
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ESTER OLIVA
studente |
Trovare in Swissprot la proteina corrispondente all'identificativo DNLI1_YEAST
1) Qual'è la funzione della proteina?
2) Riportare peso molecolare e coefficiente di estinzione. Scrivere se la proteina è acida, basica o neutra.
3) Fare una ricerca in Prosite e riportare i Pattern contenuti nella proteina.
1) la proteina è una DNA ligasi 1
2) peso molecolare: 84828.2
coefficente di estinzione 51770
Coefficente di estinzione 50770 (assumendo che tutte le cisteine siano ridotte)
| pattern: |
E - G - [LIVMA] - [LIVM] - [LIVMA] - [KR] - x(5,8) - [YW] - [QNEKTI] - x(2,6) - [KRH] - x(3,5) - K - [LIVMFY] - K |
Ester Oliva
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EGLANTINA CELISLAMI
studente |
1) Qual'è la funzione della proteina?
2) Riportare peso molecolare e coefficiente di estinzione. Scrivere se la proteina è acida, basica o neutra.
3) Fare una ricerca in Prosite e riportare i Pattern contenuti nella proteina.
1) E una proteina DNA LIGASI
2) IL peso molecolare 84,8 K DA, il coefficiente di estinzione è 51770,la proteina è neutra,il punto isoeletrico è 7.44
| 3) |
[EDQH] - {K} - K - {VEDI} - [DN] - G - {GLYN} - R - [GACIVM]
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SHARON FABIOLA SCOLARI
studente |
Trovare in Swissprot la proteina corrispondente all'identificativo DNLI1_YEAST
1) Qual'è la funzione della proteina?
2) Riportare peso molecolare e coefficiente di estinzione. Scrivere se la proteina è acida, basica o neutra.
3) Fare una ricerca in Prosite e riportare i Pattern contenuti nella proteina.
1) è una DNAligasi I, sigilla i nick nel DNA a doppia elica del DNA durante la
replicazione, la ricombinazione del DNA e di riparazione del DNA.
2) peso molecolare 85 KDalton
coefficiente di estinzione 51770
La proteina è neutra
3) [EDQH] - {K} - K - {VEDI} - [DN] - G - {GLYN} - R - [GACIVM]
che nella proteina si trova come :
EYKYDGERA nella DNA ligasi A1 e come EGLMVKmlegpeshYEpskrs.Rnwl..KLK nella DNA ligasi A2
Ilaria Tagliani
Sharon Fabiola Scolari
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ALICE SALVIATI
studente |
Trovare in Swissprot la proteina corrispondente all'identificativo DNLI1_YEAST
1) Qual'è la funzione della proteina?
E' una DNA ligasi che sigilla i nick nel DNA a doppia elica durante la replicazione.
2) Riportare peso molecolare e coefficiente di estinzione. Scrivere se la proteina è acida, basica o neutra.
Peso molecolare = 84828.2 Dalton o 84.8 kDa; coefficiente di estinzione = 51770; la proteina è neutra con pI = 7,44.
3) Fare una ricerca in Prosite e riportare i Pattern contenuti nella proteina.
[EDQH] - {K} - K - {VEDI} - [DN] - G - {GLYN} - R - [GACIVM]
nella DNA ligasi A1: EYKYDGERA
Alice Salviati
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