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Forum > Corso 2009/2010 > Esercizio Banchedati

AutoreIntervento
Prof. Riccardo Percudani
docente
Esercizio Banchedati
27/10/2009 11:20

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_ARATH

1) Riportare la descrizione della proteina

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

 

PIETRO CRAVEDI
studente
Re: Esercizio Banchedati
Replay #1 - 27/10/2009 12:51

DESCRIZIONE

"Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin."

"Catalizza l'ossidazione dell'acido urico a 5-idrossiisourato, che spontaneamente si decompone ad allantoina."

 

ORGANISMO

Arabidopsis thaliana - arabetta comune

 

LUNGHEZZA

309 aa - 927 nucleotidi + codone di stop

 

SEGNALE DI TARGETING

posizione: 307-309

sequenza: SKL

 

LUCA GARGIULO
studente
Re: Esercizio Banchedati
Replay #1 - 27/10/2009 12:53

1) Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin.

 

2) Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress)

 

3) 309 AA; 927 nucleotidi + 3 dello stop codon

 

4) sequenza targeting 307 - 309: SKL

 

GARGIULO LUCA

 

DENISE LANDOLFI
studente
Re: Esercizio Banchedati
Replay #2 - 27/10/2009 12:53

la proteina indicata è una uricasi

l'organismo da cui proviene è Arabidopsis thaliana

il nome comune è  Mouse-ear cress

la lunghezza in AA

 

JACOPO SACQUEGNO
studente
Re: Esercizio Banchedati
Replay #3 - 27/10/2009 12:54

1) Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin.

 

2) Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress)

 

3) 309 AA; 927 nucleotidi + 3 dello stop codon

 

4) sequenza targeting 307 - 309: SKL

 

SACQUEGNO JACOPO

 

ALESSANDRA BIONDI
studente
Re: Esercizio Banchedati
Replay #1 - 27/10/2009 12:54

1) Riportare la descrizione della proteina

La proteina è coinvolta nel metabolismo delle purine, situata nei perissosomi.

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

In AA è 309, in nucleotidi 930

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

Posizione 310, sequenza AA SKL

 

Alessandra Biondi

Ilaria Azzini

 

DANIELA MANDALARI
studente
Re: Esercizio Banchedati
Replay #1 - 27/10/2009 12:55

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_ARATH

1) Riportare la descrizione della proteina

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

 

1)Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin

2) arabidopsis thaliana

3) 309aa- 927in nucleotidi + eventuale codone di stop + 3 -930

4)307-309  skl

Daniela Mandalari Francesca Paola Scardina

 

ILARIA AZZINI
studente
Re: Esercizio Banchedati
Replay #2 - 27/10/2009 12:56

1) Riportare la descrizione della proteina

La proteina è coinvolta nel metabolismo delle purine, situata nei perissosomi.

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

In AA è 309, in nucleotidi 930

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

Posizione 310, sequenza AA SKL

 

Alessandra Biondi

Ilaria Azzini

 

BEATRICE MONTI
studente
Re: Esercizio Banchedati
Replay #1 - 27/10/2009 12:57

descrizione:

Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin

organismo di appartenenza:

 Arabidopsis thaliana: scientifico

Mouse-ear cress : comune

 

nucleotidi: 309

amminoacidi: 927

 

307 – 309 - SKL

 

 

 

MICOL GILBERTI
studente
Re: Esercizio Banchedati
Replay #2 - 27/10/2009 12:57

1) Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin.

 "Catalizza l'ossidazione dell'acido urico a 5-idrossiisourato che spontaneamente si decompone per formare allantoina"

2) Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) "arabetta comune"

 

3) 309 AA; 927 nucleotidi + 3 dello stop codon

 

4) sequenza targeting 307 - 309: SKL

 

GILBERTI MICOL

 

SERENA MONTALBANO
studente
Re: Esercizio Banchedati
Replay #1 - 27/10/2009 12:57

Arabidopsis thaliana(mpose-ear cress)

Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin.

Lunghezza 309aa-927+3codone di stop

Targeting 307-309 Sequenza skl

Serena montalbano

 

 

ALESSIA MARMORINO
studente
Re: Esercizio Banchedati
Replay #1 - 27/10/2009 12:58

Descrizione:Catalizza l'ossidazione dell'acido urico a 5-hydroxyisourate, che spontaneamente si decompone nella forma di Allantoina

organismo di appartenenza: nome scientifico:Arabidopsis thaliana detta comunemente arabetta comune

la lunghezza in aminoacidi:309

lunghezza in nucleotidi: 927 piu il codone di stop

il segnale di targeting sequenza amminoacidi: SKL

la posizione è 307-309

 

Alessia Marmorino e Ilaria Clarizio

 

TOMMASO LIUZZI
studente
Re: Esercizio Banchedati
Replay #1 - 27/10/2009 12:58

1) Riportare la descrizione della proteina

Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin.

Presenta 309 AA.

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

309 AA. 927 nucleotidi + un codone di stop

4)Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

307 – 309 

Sequenza SKL

 

ROBERTA BARONE
studente
Re: Esercizio Banchedati
Replay #1 - 27/10/2009 12:58

1.Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin.

2.Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) arabetta comune

3.309aa nucleot:927(309x3)

4.307-309       

SKL

Leandra Canzoneri
Laura Gobbi
Roberta Barone

 

LUCA STRAGLIATI
studente
Re: Esercizio Banchedati
Replay #1 - 27/10/2009 12:58

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_ARATH

1) Riportare la descrizione della proteina

ossidoreduttasi localizzata nei perossisomi coinvolta nal metabolismo delle purine

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

nome scientifico: Arabidopsis thaliana

nome comune: arabetta comune (mouse-ear cress)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

309 AA

927 nucleotidi

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

posizione nella proteina: 307-309

sequenza target: SKL

 

Luca Stragliati

Alessio Sardella

 

DENISE LANDOLFI
studente
Re: Esercizio Banchedati
Replay #2 - 27/10/2009 12:58

Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin

catalizza l'ossidazione di acido urico a 5-idrossiisourato che spontaneamente si decompone per formara allantoina

la proteina indicata è una uricasi

l'organismo da cui proviene è Arabidopsis thaliana

il nome comune è  Mouse-ear cress

la lunghezza in AA è 309

la lunghezza in nucleotidi codificanti è 927

la sequenza targeting si trova alla posizione 307-309 nella proteina; la sequenza di aminoacidi è skl

 

ALESSANDRA D'ARELLI
studente
Re: Esercizio Banchedati
Replay #1 - 27/10/2009 12:58

 

1) The proteine is an uricase(or  Urate oxidase) and catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin.

2)Arabidopsis thaliana- arabetta comune

3)  Sequence length :309 AA

     Nucleotides number: 927+codone di stop

4)The position in the protein is 307-309 and the aminoacids sequence is SKL

 

 

FRANCESCO DIROMA
studente
Re: Esercizio Banchedati
Replay #1 - 27/10/2009 12:59

Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress)

la sequenza codificante di aa è di 309, mentre la sequenza di nucleotidi è di 927 piu il codpne di stop.

Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin.

gli aa interessati sono  SKL.

 

SILVIA LAZZERINI
studente
Re: Esercizio Banchedati
Replay #1 - 27/10/2009 12:59

Descrizione della proteina:Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin.

Nome dell'organismo: Arabidopsis thaliana - arabetta comune

lunghezza aa:309

lunghezza nucleotidi:957

Segnale di targeting-posizione:307-309   -sequenza:SKL

 

DANIELE BULGARI
studente
Re: Esercizio Banchedati
Replay #1 - 27/10/2009 12:59

1) Riportare la descrizione della proteina

Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin.

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

Arabidopsis thaliana, arabetta comune (o semplicemente Arabidopsis

)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

309 AA 927 nucleotidi + codone stop

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

 

SKL  307 – 309

christian bozzetti, daniele bulgari

 

ILARIA CLARIZIO
studente
Re: Esercizio Banchedati
Replay #2 - 27/10/2009 12:59

Descrizione:Catalizza l'ossidazione dell'acido urico a 5-hydroxyisourate, che spontaneamente si decompone nella forma di Allantoina

organismo di appartenenza: nome scientifico:Arabidopsis thaliana detta comunemente arabetta comune

la lunghezza in aminoacidi:309

lunghezza in nucleotidi: 927 piu il codone di stop

il segnale di targeting sequenza amminoacidi: SKL

la posizione è 307-309

 

 

 

Ilaria Clarizio e Alessia Marmorino

 

GIULIANA CIRILLO
studente
Re: Esercizio Banchedati
Replay #2 - 27/10/2009 12:59

Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin

catalizza l'ossidazione di acido urico a 5-idrossiisourato che spontaneamente si decompone per formara allantoina

la proteina indicata è una uricasi

l'organismo da cui proviene è Arabidopsis thaliana

il nome comune è  Mouse-ear cress

la lunghezza in AA è 309

la lunghezza in nucleotidi codificanti è 927

la sequenza targeting si trova alla posizione 307-309 nella proteina; la sequenza di aminoacidi è skl

 

ANTONELLA FALCONIERI
studente
Re: Esercizio Banchedati
Replay #2 - 27/10/2009 12:59

1) E' una proteina presente nei perossisomi,coinvolta nel metabolismo delle purine funziona attraverso  ossidoriduttasi

2) nome scientifico: Aradopsis thaliana

    nome comune: arabetta comune

3) 309 aa quindi 927 nucleotidi + possibili 3 codoni di stop

4) 307-309  skl

annalisa bruno e falconieri antonella

 

FEDERICA CASSINELLI
studente
Re: Esercizio Banchedati
Replay #1 - 27/10/2009 12:59

domande:

 

1 descrizione: 

Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin.

 

2 nome scientifico: Arabidopsis thaliana

   nome comune: arabetta comune

 

3 lungnezza amminoacidi: 309

    lunghezza nucleotidi: 927

 

4 segnale di targeting:   

   posizione: 307-309   

   sequenza in amminoacidi: SKL

 

Veronica Belloni   Claudia Cannetiello   Federica Cassinelli

 

MARIA CHIARA GUIDONE
studente
Re: Esercizio Banchedati
Replay #1 - 27/10/2009 13:00

1) Function:Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin.

2) scientific name: Arabidopsis thaliana

    Common name: Mouse-ear cress

3) Sequence length: 309 AA

     per trovare la lunghezza in nucleotidi devo moltipilicare il numero degli AA per    3,  quindi 309x3=927nucleotidi

4) posizione nella proteina: 307-309

    sequenza in AA: SKL

 

Maria Chiara Guidone

Elisa Ironi

 

SILVIA LAZZERINI
studente
Re: Esercizio Banchedati
Replay #1 - 27/10/2009 13:00

Descrizione della proteina:Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin.

Nome dell'organismo: Arabidopsis thaliana - arabetta comune

lunghezza aa:309

lunghezza nucleotidi:927

Segnale di targeting-posizione:307-309   -sequenza:SKL

 

CHIARA ALIANI
studente
Re: Esercizio Banchedati
Replay #2 - 27/10/2009 13:01

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_ARATH

1) Riportare la descrizione della proteina

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

 

1)Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin.

2)Arabidopsis thaliana- arabetta comune.

3) 309 amminoacidi. 927 nucleotidi più il codone di stop.

4) 307-309. SKL

chiara aliani   monica giada

 

CHIARA LAZZARINI
studente
Re: Esercizio Banchedati
Replay #3 - 27/10/2009 13:01

Arabidopsis thaliana (mouse-ear cress)

Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin.

Lunghezza aa 309, 927 nucleotidi +3codone stop.

targeting 307-309

sequenza in aa skl

 

GABRIELLA COTTONE
studente
Re: Esercizio Banchedati
Replay #2 - 27/10/2009 13:01

descrizione della proteina: Uricasi

organismo d'origine: arabidopsis thaliana

lunghezza in amminoacidi: 309

lunghezza in nucleotidi della regione codificante:927

segnale di targeting: 307-309 SKL


 

ELISA AMBROGGI
studente
Re: Esercizio Banchedati
Replay #1 - 27/10/2009 13:01

1)Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin.

2)Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) arabetta comune

 

3)309 aa. lunghezza in nucleotidi della regione codificante è 927

4)il segnale di targeting è nella posizione 307- 309, e la sequenza di amminoacidi è SKL

 

Elisa Ambroggi, Ghielmi Caterina

 

ROSSANA ITALIANO
studente
Re: Esercizio Banchedati
Replay #1 - 27/10/2009 13:02

1) La proteina è implicata nel metabolismo delle purine. E' presente nei perossisomi ed è un'ossidoriduttasi (quindi è un'enzima).

2) Arabidopsis Thaliana, detta Arabetta comune.

3) 309 amminoacidi, 927 nucleotidi (oppure 930 se consideriamo il codone di stop)

 

4) Il segnale di targeting è l'ultimo amminoacido. La sequenza amminoacidica è SKL.

 

BEATRICE DOSI
studente
Re: Esercizio Banchedati
Replay #2 - 27/10/2009 13:02

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_ARATH

1) Riportare la descrizione della proteina

Sequence length309 AA.

Mass (Da) :34,881

Molecular function :  urate oxidase activity (enzima, appartenente alla classe delle ossidoreduttasi)

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

Arabidopsis thaliana (arabetta comune)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

lunghezza in nucleotidi :309 aa x 3 = 927 +3 = 930

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

307 – 309

SKL 


Beatrice Dosi, Alessia Verani.

 

 


 

LUDOVICA LEZZI
studente
Re: Esercizio Banchedati
Replay #1 - 27/10/2009 13:02

1 Riportare la descrizione della proteina

La proteina è un ossidoriduttasi, quindi un enzima che catalizza le reazioni di ossido riduzione (ossidazione acido urico) coinvolte nel metabolismo delle purine. E' presente nei perossisomi.

 

2 Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune

Nome scientifico: Arabidopsis thaliana

Nome comune: Arabetta comune

3 Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

309 aa

Nucleotidi: 309*3= 927

4Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

Il segnale di targeting è sull'aminoacido 310 SLK (sequenza amminoacidica)

 

 

Lezzi Ludovica

Botrugno Ilaria

 

 

 

SILVIA MIATELLO
studente
Re: Esercizio Banchedati
Replay #1 - 27/10/2009 13:02

1) Riportare la descrizione della proteina

Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin.

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune

common name mouse-ear cress

scientific name arabidopsis thaliana

 

 

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

ci sono 309 AA e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante è di 927.

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

la posizione è da 307 a 309 e gli AA sono SKL

Silvia Miatello e Thekla Leone

 

 

MARIA CHIARA VENUTI
studente
Re: Esercizio Banchedati
Replay #1 - 27/10/2009 13:02

1) Descrizione proteina: Uricase. Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin.

2) Organismo di appartenenza: nome scentifico: Arabidopsis thaliana, nome comune: Arabetta comune.

3) Lunghezza in aminoacidi: 309aa. lunghezza in nucleotidi della regione codificante: (309*3)+3(codone di stop)=927 +3= 930.

4) Targeting signal:posizione nella proteina: 307-309. sequenza in aa: SKL

 

Alice Zuccoli.

 

 

VALENTINA CARBOGNANI
studente
Re: Esercizio Banchedati
Replay #1 - 27/10/2009 13:02

1.Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin.

2.nome scientifico=Arabidopsis thaliana

   nome comune=Mouse-ear cress

3.lunghezza amminoacidi= 309

   lunghezza nucleotidica=927

   più codone di stop= 927+3= 930

4.il segnale di targheting è 307-309,e la sequenza amminoacidica è skl

valentina carbognani. simone landi.

 

LUCA BARBATO
studente
Re: Esercizio Banchedati
Replay #1 - 27/10/2009 13:02

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_ARATH

1) Riportare la descrizione della proteina

Il nome della proteina è URICASE. La funzione di questa proteina catalizza l'ossidazione dell'acido urico a 5-idrossisourato, che spontaneamente si decompone in una forma 

2) Riportare l'organismo di appartenenza nome scientifico e nome comune)+

Arabidopsis thaliana   ARABETTA COMUNE

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

Lunghezza in aminoacidi 309 e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante è di 930 nucleotidi

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

 

 

 

LUCA BARBATO

MONIA FRONZUTI

 

MARTINA INORETTI
studente
Re: Esercizio Banchedati
Replay #2 - 27/10/2009 13:05

1) Riportare la descrizione della proteina

Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

Arabidopsis thaliana, detta comunemente arabetta comune

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

Lunghezza aa: 309

Lunghezza nucleotidi: 309 x 3 = 927

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

La posizione nella proteina é 307- 309

La sequenza di aa: slk

Chiara Coruzzi

 

CLAUDIA ROMANELLI
studente
Re: Esercizio Banchedati
Replay #3 - 27/10/2009 14:41

1) Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin.

  Catalizza l'ossidazione dell'acido urico a 5-idrossiisourato, che spontaneamente si decompone ad allantoina.

2) Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress)

3) 309 aa - 927 nucleotidi + codone di stop

4) posizione: 307-309   sequenza:  SKL

 

 

OLGA CHIESA
studente
Re: Esercizio Banchedati
Replay #4 - 27/10/2009 16:30

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_ARATH

1) Riportare la descrizione della proteina

Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

Nome Scientifico: Arabidopsis thaliana 

Nome Comune: Mouse-ear cress

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

309 amminoacidi;

927 nucleotidi più 3 dello stop codon

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amminoacidi

posizione: 307-309

sequenza: SKL

 

 

Valentina Berni
studente
Re: Esercizio Banchedati
Replay #5 - 28/10/2009 00:54

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_DROPS

1) Riportare la descrizione della proteina

Protein P22673(URIC_DROPS)

Uricase and alternative name is urato oxidase acid to 5-hydoxysourate, which spontaneously decomposes to form allantoin

function: catalyze the oxidation of uric

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

Name: Drosophila pseudoobscura (fruit fly-moscerino della frutta-)

 

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

n.aminoacidi : lenght , 346 AA

 

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

targeting : 344-346 and 3 lenght

        10 20         30         40         50         60
MFATPLRQPT NASGARPAVS MDGQETPFQY EITDHGYGKD AVKVLHVSRK GPVHTIQEFE

        70         80         90        100        110        120
VGTHLKLYSK KDYYQGNNSD IVATDSQKNT VYLLAKKYGI ESPEKFALML GQHFLNKYSH

       130        140        150        160        170        180
VEEAHVHVET YPWQRVCQEE TKSVNNQGQG SCNNFTSIDN RSLHNHAFIF TPTALHYCDV

       190        200        210        220        230        240
VIRRTDPKQT VITGIKGLRV LKTTQSSFVN FVNDEFRSLP DQYDRIFSTV VDCSWEYSDT

       250        260        270        280        290        300
ETVNFSRAWQ TVKNIILRNF AGDPQVGVSS PSVQHTLYLS EKQVLDVIPQ VSVISMTMPN

       310        320        330        340
KHYFNFDTKP FQKIVPGDNN EVFIPVDKPH GTIYAQLARK NISSHL

 

SIMONE LANDI
studente
Re: Esercizio Banchedati
Replay #6 - 29/10/2009 21:53

1-Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin.

2- scientific name:Arabidopsis thaliana common name:Mouse-ear cress

3- lunghezza in amminoacidi: 309  lunghezza in nucleotidi:927

4-la posizione è 307-309 e la sequenza in amminoacidi è: SKL

 

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