Classe delle Lauree in Scienze Biologiche
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Forum > AB - Corso 2010/2011 (A-L) > Esercizio banchedati

AutoreIntervento
Prof. Riccardo Percudani
docente
Esercizio banchedatiRispondi
26/10/2010 09:58Invia email

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_ARATH

1) Riportare la descrizione della proteina

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

 

MATTHIAS BOZZA
studente
Re: Esercizio banchedatiRispondi
Replay #1 - 26/10/2010 12:48Invia email

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_ARATH

1) Riportare la descrizione della proteina

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

1) Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin.

2) Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress)

3) 309 AA 927 nucleotidi

4) 307-309 SKL

 

Matthias Bozza

Alex bersellini Farinotti

 

GIADA CAVIOLA
studente
Re: Esercizio banchedatiRispondi
Replay #1 - 26/10/2010 12:54Invia email

Esercizio banchedati Rispondi
26/10/2010 09:58 Invia email

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_ARATH

1) Riportare la descrizione della proteina

Uricasi

Lunghezza sequenza 309 aa

Peso molecolare 34,881 Da

Catalizza l'ossidazione dell'acido urico a 5-idrossiurato che si decompone spontaneamente ad una forma allantonica

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

Arabidopsis thaliana, Mouse ear cress

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

aa 309

nucleotiditi 927

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

targeting 307-309 SKL

 

 

ANGELO ANTONIO DE FABRIZIO
studente
Re: Esercizio banchedatiRispondi
Replay #2 - 26/10/2010 12:54Invia email

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_ARATH

1) Riportare la descrizione della proteina

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

 

1) Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin.

2) Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress)

3)Sequence length309 AA. & 927 + 3 (930)

4) Il segnale di targeting è nella sequenza 307-309 (SKL)

 

EMANUELE FERRARI
studente
Re: Esercizio banchedatiRispondi
Replay #1 - 26/10/2010 12:54Invia email

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_ARATH

1) Riportare la descrizione della proteina

General annotation (Comments)

Function

Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin.

Catalytic activity

Urate + O2 + H2O = 5-hydroxyisourate + H2O2.

Pathway

Purine metabolism; urate degradation; (S)-allantoin from urate: step 1/3.

Subcellular location

Peroxisome Potential.

Sequence similarities

Belongs to the uricase family.

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

309 aa - 927 nt

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

307 - 309 SKL

ferrari emanuele

abondio paolo

 

ARIANNA BROLLI
studente
Re: Esercizio banchedatiRispondi
Replay #2 - 26/10/2010 12:54Invia email

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_ARATH

1) Riportare la descrizione della proteina

General annotation (Comments)

Function

Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin.

Catalytic activity

Urate + O2 + H2O = 5-hydroxyisourate + H2O2.

Pathway

Purine metabolism; urate degradation; (S)-allantoin from urate: step 1/3.

Subcellular location

Peroxisome Potential.

Sequence similarities

Belongs to the uricase family.

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

 309per3 nt

 

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

307-309

MAQEADGIRL DQRHGKARVR VGRVWRHAHD GSHHFVEWNV SISLLSHCLS SYRLDDNSDI 

70 80 90 100 110 120
VATDTIKNTV YVKAKECGDR LSVEEFAILI GKHFCSFYPQ VFTAIVNIIE KPWERVSIDG

130 140 150 160 170 180
KPHLHGFKLG SENHTTEARV EKSGALNLTS GIGGLALLKT TQSGFERFVR DKYTILPETR

190 200 210 220 230 240
ERMLATEVNA SWRYSYESVA SIPTKGLYFS EKFMDVKKVL MDTFFGPPET GVYSPSVQRT

250 260 270 280 290 300
LYLMGSAVLK RFADVSSIHL KMPNIHFLPV NLSTKENPSM VKFKDDVYLP TDEPHGSIEA

310
TLSRITSKL


chiara bocconi e arianna brolli

 

Prof. Riccardo Percudani
docente
Re: Esercizio banchedatiRispondi
Replay #1 - 26/10/2010 12:54Invia email

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_ARATH

1) Riportare la descrizione della proteina

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

1) La proteina è un'uricasi, catalizza l'ossidazione dell'acido urico a 5-idrossiurato, che poi si decompone spontaneamente alla forma allantonica.

2) Appartiene ad Arabidopsis thaliana (topo)

3) E' lunga 309 aa, 930 nucleotidi.

4) 307-309 , cioè SKL

Bonini Aleksandra

 

LORENZO BERTOLONE
studente
Re: Esercizio banchedatiRispondi
Replay #2 - 26/10/2010 12:54Invia email

1) Riportare la descrizione della proteina
Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin.



2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)
Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress)




3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante
309 AA.
927 (+3) NT


4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi
posizione 307-309
sequenza AA: SKL

 

Piscitelli Valerio Francesco

 

TOMMASO LIUZZI
studente
Re: Esercizio banchedatiRispondi
Replay #1 - 26/10/2010 12:54Invia email

proteina Uricase che catalizza l'ossidazione dell'acido urico in 5-hydroxyisourate

 

Arabidopsis thaliana ( arabetta comune)

 

309 AA e 930 nucleotidi codificanti

 

307-309, con seq. aminoacidica SKL

 

 

TOMMASO LIUZZI-NUNZIO LAPOLLA

 

CATERINA BASILE
studente
Re: Esercizio banchedatiRispondi
Replay #1 - 26/10/2010 12:54Invia email

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_ARATH

1) Riportare la descrizione della proteina

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

 

1- uricasi,catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin.

2- Arabidopsis thaliana, Mouse-ear cress

3- 309 AA, 930 nucleotidi

4- 307-309, SKL

 

Basile Caterina, Alessandra Formai

 

 

GIULIA GIANNINI
studente
Re: Esercizio banchedatiRispondi
Replay #2 - 26/10/2010 12:55Invia email

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_ARATH

1) Riportare la descrizione della proteina

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

 

1) catalizza l'ossidazione dell'acido urico

2)Arabidopsis thaliana

Arabetta comune

3) 309 aa

927 nucleotidi

4)307-309

SKL

 

 

GIULIA MARIA GRECO
studente
Re: Esercizio banchedatiRispondi
Replay #1 - 26/10/2010 12:55Invia email

 

Esercizio banchedati Rispondi
26/10/2010 09:58 Invia email

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_ARATH

1) Riportare la descrizione della proteina

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

 

Recommended name:
Uricase

EC=1.7.3.3

Alternative name(s):
Nodulin-35 homolog
Urate oxidase

Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) [Complete proteome]

 

309AA x3

307-309 SKL

 

ANDREA DINOI
studente
Re: Esercizio banchedatiRispondi
Replay #2 - 26/10/2010 12:55Invia email

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_ARATH

1) Riportare la descrizione della proteina

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

 

1) Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin.

2) Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress)

3)Sequence length309 AA. & 927 + 3 (930)

4) Il segnale di targeting è nella sequenza 307-309 (SKL)

 

ISADORA BORELLI
studente
Re: Esercizio banchedatiRispondi
Replay #1 - 26/10/2010 12:56Invia email

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_ARATH

1) Riportare la descrizione della proteina

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

 

1. la proteina una uricasi, catalizza l-ossidazione dell-acido urico 5/idrossiurato

2. Arabidopsis thaliana arabetta comune

3. 309 AA 927 +3

4. 307 -309  SKL

 

 

 

ROSSELLA BONAFEDE
studente
Re: Esercizio banchedatiRispondi
Replay #1 - 26/10/2010 12:56Invia email

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_ARATH

1) Riportare la descrizione della proteina

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

1:Catalizza l'ossidazione dell'acido urico a 5-idrossiurato che si decompone spontaneamente a formare allantoina

2:Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress)

3:309 AA, 930

4: 307-309 SKL

 

ILARIA BOTRUGNO
studente
Re: Esercizio banchedatiRispondi
Replay #1 - 26/10/2010 12:57Invia email

trovare in SwissProt la sequenza URIC_ARATH

1) Riportare la descrizione della proteina

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

 

1 la proteina è un'uricasi che catalizza l'ossidazione dell'acido urico a 5-idrossiurato.

2 Arabidopsis thaliana  (arabetta comune)

3 309 AA

   309 x 3= 927 + 3= 930 sequenza nucleotidica più codoni di stop


4 307-309. la sequenza è SKL

 

  

ilaria botrugno

enrica citignola

roberta brigido

 

 

 

ELISABETTA BERTINO
studente
Re: Esercizio banchedatiRispondi
Replay #2 - 26/10/2010 12:57Invia email

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_ARATH

1) Riportare la descrizione della proteina

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

 

1)Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin.

2)Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress)

 

3)309 aminoacidi, 927 nucleotidi

 

4)307-309, sequenza SKL

 

ELISA UGHINI
studente
Re: Esercizio banchedatiRispondi
Replay #1 - 26/10/2010 12:57Invia email

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_ARATH

1) Riportare la descrizione della proteina

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

 

1)Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin.

2)Arabidopsis thaliana ( mouse-ear cress)

3)309 AA;927 nucleotidi

4) Posizione: 307-309

Sequenza in aa: SKL

 

Ughini Elisa e Giovenali Greta

 

 

SILVIA BONATTI
studente
Re: Esercizio banchedatiRispondi
Replay #1 - 26/10/2010 12:58Invia email

organismo: Arabidopsis thaliana (mouse-ear cress)

descrizione: catalizza l'ossidazione dell'acido urico

numero aminoacidi:309

numero nucleotidi:921

segnale di targeting: 307-309

 

FEDERICA CATTINI
studente
Re: Esercizio banchedatiRispondi
Replay #3 - 26/10/2010 12:58Invia email

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_ARATH

1) Riportare la descrizione della proteina
Uricase.Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin.

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)
Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante
309 AA, 927 nucleotidi

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi
307-309 SKL

 

Federica Cattini e Chiara Griffoni

 

MARIKA ALLEGRI
studente
Re: Esercizio banchedatiRispondi
Replay #2 - 26/10/2010 12:59Invia email

1) Recommended name:
Uricase

EC=1.7.3.3

Alternative name(s):
Nodulin-35 homolog
Urate oxidase
3) 309 AA 
3a) 309 x 3= seq. nucleotidica
3b
MAQEADGIRL DQRHGKARVR VGRVWRHAHD GSHHFVEWNV SISLLSHCLS SYRLDDNSDI

        70         80         90        100        110        120 
VATDTIKNTV YVKAKECGDR LSVEEFAILI GKHFCSFYPQ VFTAIVNIIE KPWERVSIDG 

       130        140        150        160        170        180 
KPHLHGFKLG SENHTTEARV EKSGALNLTS GIGGLALLKT TQSGFERFVR DKYTILPETR 

       190        200        210        220        230        240 
ERMLATEVNA SWRYSYESVA SIPTKGLYFS EKFMDVKKVL MDTFFGPPET GVYSPSVQRT 

       250        260        270        280        290        300 
LYLMGSAVLK RFADVSSIHL KMPNIHFLPV NLSTKENPSM VKFKDDVYLP TDEPHGSIEA 


TLSRITSKL 


 

 

CHIARA CASTELLINI
studente
Re: Esercizio banchedatiRispondi
Replay #2 - 26/10/2010 12:59Invia email

1) La proteina è costituita da 309 aa e catalizza l'ossidazione dell'acido urico

2) Nome scientifico: Arabidopsis Thaliana (topo)

3)è costituito da 309 aa e 930 nucleotidi

 

ALESSIA RITA PUCE
studente
Re: Esercizio banchedatiRispondi
Replay #2 - 26/10/2010 12:59Invia email

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_ARATH

1) Riportare la descrizione della proteina

Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

Recommended name:

Uricase
EC=1.7.3.3

Alternative name(s):
Nodulin-35 homolog
Urate oxidase

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

309 AA; 927+3

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

307-309  SKL

 

 

 

 

puce alessia rita & iervasi elena

 

MARIA CARMELA GROIA
studente
Re: Esercizio banchedatiRispondi
Replay #2 - 26/10/2010 12:59Invia email

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_ARATH

1) Riportare la descrizione della proteina

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

1) Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin.

2) Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress)

3) 309 AA.

4) 930

307 - 309

SKL 

groia mariacarmela

 sonia figuccia

 

ROSANNA GARRIPOLI
studente
Re: Esercizio banchedatiRispondi
Replay #3 - 26/10/2010 13:00Invia email

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_ARATH

1) Riportare la descrizione della proteina

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi



1.Descrizione proteina: catalizza l'ossidazione dell'acido urico a 5-hydroxyisourate.

2.l organismo di appartenenza è l'Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress).

3.LA LUNG IN AA è:309  .QUELLA LUNGHEZZA IN NUCLEOTIDI è :1-309

4.
MAQEADGIRL DQRHGKARVR VGRVWRHAHD GSHHFVEWNV SISLLSHCLS SYRLDDNSDI

        70         80         90        100        110        120
VATDTIKNTV YVKAKECGDR LSVEEFAILI GKHFCSFYPQ VFTAIVNIIE KPWERVSIDG

       130        140        150        160        170        180
KPHLHGFKLG SENHTTEARV EKSGALNLTS GIGGLALLKT TQSGFERFVR DKYTILPETR

       190        200        210        220        230        240
ERMLATEVNA SWRYSYESVA SIPTKGLYFS EKFMDVKKVL MDTFFGPPET GVYSPSVQRT

       250        260        270        280        290        300
LYLMGSAVLK RFADVSSIHL KMPNIHFLPV NLSTKENPSM VKFKDDVYLP TDEPHGSIEA

       310
TLSRITSKL



VERONICA LA TORRE E GARRIPOLI ROSANNA

 

AGATA FAROLDI
studente
Re: Esercizio banchedatiRispondi
Replay #3 - 26/10/2010 13:01Invia email

2.Arabidopsis thaliana(Mouse-ear cress)

1.Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin

3.309 AA

927 (+3) nucleotidi

4.sequenza segnale: 307-309 

307-309  SKL


 

LEANDRA CANZONERI
studente
Re: Esercizio banchedatiRispondi
Replay #2 - 26/10/2010 13:01Invia email

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_ARATH

1) Riportare la descrizione della proteina

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

 

 

1)E' un enzima  che catalizza l'ossidazione dell' acido urico.

2) Il nome scientifico è ARABIDOPSIS THALIANA,il nome comune è arabetta comune.

3)La lunghezza in aa è 309,quella in nucleotidi è 309 moltiplicato per 3.

4) la posizione è 307-309 e la sequenza è skl.

 

LEANDRA CANZONERI

ANNALISA BRUNO

 

 

SILVIA REVERBERI
studente
Re: Esercizio banchedatiRispondi
Replay #1 - 26/10/2010 13:01Invia email

Bottoli Laura

Reverberi Silvia

 

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_ARATH

1) Riportare la descrizione della proteina

L'urato ossidasi è un enzima, appartenente alla classe delle ossidoreduttasi, che è presente nei perossisomi di molti organismi (ma non dell'uomo) ed è attivo nel catabolismo delle purine.Catalizza l'ossidazione dell'acido urico a 5-idrossiurato.

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

La lunghezza in aa è 309.

La lunghezza in nucleotidi è 927.

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

La posizione è 307-309 e la sequenza in aa è SKL

 

 

Elena Paini
studente
Re: Esercizio banchedatiRispondi
Replay #2 - 26/10/2010 13:02Invia email

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_ARATH

1) Riportare la descrizione della proteina

uricasi:catalizza l'ossidazione dell'acido urico

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

309 aa 

927/930 nucleotidi

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

307-309 SKL

 

RITA FIORI
studente
Re: Esercizio banchedatiRispondi
Replay #3 - 26/10/2010 18:04Invia email

 

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_ARATH

1) Riportare la descrizione della proteina

2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)

3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante

4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

Risposte:

1) Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin.

2) Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress)

3) 309 aminoacidi, 927 nucleotidi

4) 307-309, sequenza SKL

 

 

 

ANGELA GILARDONI
studente
Re: Esercizio banchedatiRispondi
Replay #4 - 26/10/2010 22:50Invia email

1)Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin

2)Arabidopsis thaliana, nome comune mouse ear cress

3)309 aa, 927 nucleotidi

4)307-309, SKL

Angela Gilardoni

 

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