Classe delle Lauree in Scienze Biologiche
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Forum > Esercizi corso 2007/2008 > Esercizio banchedati

AutoreIntervento
Prof. Riccardo Percudani
docente
Esercizio banchedatiRispondi
16/10/2007 09:54Invia email

Trovare in SwissProt la sequenza URIC_PAPHA

1) Riportare la descrizione della proteina
2) Riportare l'organismo di appartenenza (nome scientifico e nome comune)
3) Scrivere la lunghezza in aminoacidi e la lunghezza in nucleotidi della regione codificante
4) Trovare nella "Feature table" il segnale di targeting. Riportare la posizione nella proteina e la sequenza in amino acidi

 

STEFANO GAVIOLI
studente
Re: Esercizio banchedatiRispondi
Replay #1 - 16/10/2007 13:07Invia email

 1)Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate which spontaneously decompose to form allantoin

 

2)papio hamadryas  l'amadriade è un primate della famiglia cercopithecidae

3)304 AA/  915nucleotidi

4)302-304 (SRL)

volmir chiarello

gavioli stefano

 

 

LUDOVICA BARATTA
studente
Re: Esercizio banchedatiRispondi
Replay #1 - 16/10/2007 13:08Invia email

1-è una uricasi che catalizza l'ossidazione dell'acido urico

2-proviene  da Papio hamadryas (babbuino)

3-la sequenza ha lunghezza di 304 amminoacidi,quindi di 915 nucleotidi(con stop)

4-da 302 a 304 e in codice ad una lettera SRL

GUARNIERI GIADA

IVALDI  CHIARA 

BARATTA LUDOVICA 

 

Irene Venditti
studente
Re: Esercizio banchedatiRispondi
Replay #1 - 16/10/2007 13:08Invia email

La proteina catalizza l'ossiadazione dell'acido urico a 5-idrossisourato.

Appartiene a Papio Hamadryas (Babbuino).

Lunghezza 304 aa. Lunghezza in nucleotidi codificante 309bp.

Il segnale di targeting va da 302 a 304 la sequenza in amminoacidi è Ser Arg Leu.

 

 

Assunta Graziano 

 

 

 

SABRINA DURANTI
studente
Re: Esercizio banchedatiRispondi
Replay #1 - 16/10/2007 13:09Invia email

  • FUNCTION: Catalizza l' ossidazione dell' acido urico e si decompone spontaneamente in C4H6N4O3.

Deriva da Papio hamadryas cioè un babbuino

 Sono 304 amminoacidi e sono 915 nucleotidi

La posizione del target nella proteina è 302 303 304 ed è SRL e la sequenza di amminoacidi è ser arg leu

 

SABRINA DURANTI
studente
Re: Esercizio banchedatiRispondi
Replay #1 - 16/10/2007 13:09Invia email

  • FUNCTION: Catalizza l' ossidazione dell' acido urico e si decompone spontaneamente in C4H6N4O3.

Deriva da Papio hamadryas cioè un babbuino

 Sono 304 amminoacidi e sono 915 nucleotidi

La posizione del target nella proteina è 302 303 304 ed è SRL e la sequenza di amminoacidi è ser arg leu

 

con collaborazione di pieroni greta tamarri giacomo e di dia gianni pio antonio 

 

Valentina Russo
studente
Re: Esercizio banchedatiRispondi
Replay #1 - 16/10/2007 13:10Invia email

1) enzima che catalizza l'ossidazione dell'acido urico

2) papio hamadryas- hamadryas baboon: babbuino

3) 304 aa - 915 nucleotidi 

4) a) da 302 a 304 b)SRL , Ser Arg Leu

Russo Valentina

Silvia Livelli

Ilaria Crescente

Corinna Iacovello 

 

CHRISTIAN MILANI
studente
Re: Esercizio banchedatiRispondi
Replay #1 - 16/10/2007 13:10Invia email

 1)Proteina che catalizza l'ossidazione dell'acido urico a 5-hydroxyisourate che si decompone spontaneamente alla forma allotoinica.

 

 

2)

Papio hamadryas (Hamadryas baboon) [TaxID: 9557] 


3) lunghezza in AA: 304 aa Lunghezza in Nucleotidi 915

 

4) Posizione 302-304, sequenza: SRL

 

Cinzia Meli
studente
Re: Esercizio banchedatiRispondi
Replay #1 - 16/10/2007 13:10Invia email

1)Protein name Uricase

Funzione: catalizza l'ossidazione dell'acido urico(in 5-hydroxyisourate) 

2)Organismo:

 
  

 Papio hamadryas (Hamadryas baboon)

Nome comune: Amadriade (fa parte della famiglia Cercopithecidae)

3)304 aa , 915 nucleotidi (compreso il codone di stop)

4) 302_304

     

seq. in aa: ser arg leu

Vicini Simona

Fantozzi Elena 

 

STEFANO MOLINARI
studente
Re: Esercizio banchedatiRispondi
Replay #1 - 16/10/2007 13:10Invia email

1)Catalizza l'ossidazione dell'acido urico a5-idrossiurato

2) Papio Hamadryas , per gli amici Babbuino

3) 304 AA,  912 nucleotidi , 915 con codone stop

4) posizione 302-304 , sequenza: 1 MADYHNNYKK NDELEFVRTG YGKDMVKVLH IQRDGKYHSI KEVATSVQLT LSSKKDYLHG    60
   61 DNSDIIPTDT IKNTVHVLAK FKGIKSIEAF GVNICEYFLS SFNHVIRAQV YVEEIPWKRL   120
  121 EKNGVKHVHA FIHTPTGTHF CEVEQLRSGP PVIHSGIKDL KVLKTTQSGF EGFIKDQFTT   180
  181 LPEVKDRCFA TQVYCKWRYH QCRDVDFEAT WGTIRDLVLE KFAGPYDKGE YSPSVQKTLY   240
  241 DIQVLSLSRV PEIEDMEISL PNIHYFNIDM SKMGLINKEE VLLPLDNPYG KITGTVKRKL   300
  301 SSRL

 

Amidani Davide & Nardi Alex 

 

MARIA DI IASIO
studente
Re: Esercizio banchedatiRispondi
Replay #1 - 16/10/2007 13:10Invia email

1 Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate which spontaneously decompose to form allantoin.

2Homologous vertebrate genes database

3 304 aa e 912 nucl

302   304  3     Microbody targeting signal
SRL

 

MARIA DI IASIO
studente
Re: Esercizio banchedatiRispondi
Replay #1 - 16/10/2007 13:10Invia email

1 Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate which spontaneously decompose to form allantoin.

2Homologous vertebrate genes database

3 304 aa e 912 nucl

302   304  3     Microbody targeting signal

SRL

GRAZIA COTUGNO E MARIA DIIASIO

 

MARIA DI IASIO
studente
Re: Esercizio banchedatiRispondi
Replay #1 - 16/10/2007 13:10Invia email

1 Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate which spontaneously decompose to form allantoin

2 BABBUINO 

3 304 aa e 912 nucl

302   304  3     Microbody targeting signal

SRL

GRAZIA COTUGNO E MARIA DIIASIO

 

GIOVANNI FRATTA
studente
Re: Esercizio banchedatiRispondi
Replay #1 - 16/10/2007 13:10Invia email

1) catalizza l'ossidazione dall'acido urico al 5 idrossiurato che decompone spontaneamente alla forma allantoin

2) Papio Hamadryas - babbuino 

3) la lunghezza della proteina è di 304 amminoacidi e di 915 nucleotidi copreso il codone di stop  

4) il segnale di targeting è tra gli AA 302 e 304 e la sequenza in AA è Serina Arginina Leucina

 

                                    Giovanni Fratta e Ilaria Fortunati 

 

FEDERICA DALL'AGLIO
studente
Re: Esercizio banchedatiRispondi
Replay #1 - 16/10/2007 13:11Invia email

funzione:catalizza l'ossidazione dellacido urico a 5-idrossisurato che spontaneamente si decompone in allantoina

Nome comune: babbuino 

Scientifico: Papio hamadryas

Lunghezza in AA:304

In nucleotidi 915

Segnale targeting: da 302 a 304 In AA SRL

 

Denis Ferrari,Iembo Maria Lucia 

 

Prof. Riccardo Percudani
docente
Re: Esercizio banchedatiRispondi
Replay #1 - 16/10/2007 13:12Invia email

1) Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate which spontaneously         decompose to form allantoin.

Catalizza l'ossidazione dell'acido urico a 5-idrossiurato

 

2)

 
Papio hamadryas (Hamadryas baboon) [TaxID: 9557] 

 Amadriade

3)340 AA;  1023 nucleotidi

 

4) SRL; posizione 302-304

 

Martino Mozzi 

 

 

SONIA VACCARO
studente
Re: Esercizio banchedatiRispondi
Replay #1 - 16/10/2007 13:12Invia email

CATALIZZA L'OSSIDAZIONE DELL' ACIDO URICO AL 5 IDROSSIURATO CON UNA SPONTANEA DECOMPOSIZIONE ALLA FORMA " ALLONTOIN".

 

LA LUNGHEZZA DELLA PROTEINA IN AMINOACIDI è 304 IN NUCLEOTIDI è (304*3+3)QUINDI 915.

 

IL SEGNALE DI TARGETING è LA POSIZIONE 302-304.

LE PROTEINE SONO SERINA, ARGININA ,LEUCINA.

 

L'ORGANISMO DI APPARTENENZA è IL BABBUINO

 

 

SONIA VACCARO CLAUDIA PAVIA 

 

 

DANIELA CERESINI
studente
Re: Esercizio banchedatiRispondi
Replay #1 - 16/10/2007 13:12Invia email

funzione: Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate which spontaneously decompose to form allantoin

organismo:Papio hamadryas (Hamadryas baboon). Amadriade

lunghezza in amminoacidi : 304

lunghezza in nucleotidi: 915

sequenza targeting : tra 302 e 304; serina, arginina, leucina 

 

Ceresini Daniela, Tiziana Cassano 

 

Chiara Dallavalle
studente
Re: Esercizio banchedatiRispondi
Replay #1 - 16/10/2007 13:13Invia email

1)Descrizione proteina: Catalizza la reazione dell'acido urico

2)Nome scientifico e nome comune: babbuino

Papio hamadryas (Hamadryas baboon)
 
 

 

 

3) 304 AA, 1023 nucleotidi

 

4)segnale di targeting SRL posizione 302-304 

 

ChiaraDallavalle

Veronica Azzato

Federica Battaglia

Riccardo Nicoli 

 

CHIARA AMARI
studente
Re: Esercizio banchedatiRispondi
Replay #1 - 16/10/2007 13:13Invia email

1  catalizza l'ossidazione dell'acido urico per 5-Hydroxy sourate

2  appartiene agli eucariti, è un cercopiteco papio babbuino verde

3  lunghezza aminoacidi 304- lunghezza nucleotidi 915

4 viene trasportata nei perossisomi

 

maroli andrea chiara amari 

 

FEDERICA RAFFAELLI
studente
Re: Esercizio banchedatiRispondi
Replay #1 - 16/10/2007 13:13Invia email

La funzione di questa proteina è quella di catalizzare l' ossidazione dell' acido urico a 5'-idrossi iurato.

Deriva dall' organismo Papio Hamadryas (Hamadryas baboon).

304 AA; 304 * 3 + 3 = 915 nucleotidi

Il segnale targeting è collocato in posizione 302 - 304 e ha sequenza SRL

 

Federica Raffaelli & Giulia Tanzi 

 

LUCA COLOMBI
studente
Re: Esercizio banchedatiRispondi
Replay #1 - 16/10/2007 13:13Invia email

FUNZIONE: Catalizza l'ossidazione di acido urico

Nome scientifico: Papio 

Nome comune: Babbuino

Lunghezza amminoacidi: 304

Lunghezza nucleotidi: 912   con codone di STOP 915 

Posizione targeting: 302-304  sequenza: SRL

 

Colombi Luca & Tasso Vanessa 

 

SARA CORELLI
studente
Re: Esercizio banchedatiRispondi
Replay #2 - 16/10/2007 13:15Invia email

 

1.Uricase Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate which spontaneously decompose to form allantoin

 

 
2.Papio hamadryas (Hamadryas baboon)  ,babbuino
 

 3.lunghezza in amminoacidi: 304

    lunghezza in nucleotidi:  915

 4.non lo sappiamo

 

corelli sara e bettati letizia 

 

SARA DI DOMENICO
studente
Re: Esercizio banchedatiRispondi
Replay #2 - 16/10/2007 13:15Invia email

1. catalizza l' ossidazione dell' acido urico, ha attività catalitica, si trova nei perossisomi, appartiene alla famiglia delle uricase.

2. Papio Hamadryas (Babbuino Hamadryas)

3. 304 aa e 915 nucleotidi

 4. da 302 a 304 corrisponde a SRL

 

 

Alice Strazer e Sara Di Domenico. 

 

FEDERICA RUFFO
studente
Re: Esercizio banchedatiRispondi
Replay #2 - 16/10/2007 13:15Invia email

catalizza l'ossidazione dell'acido urico a 5-idrossiurato

 Papio hamadryas(babbuino )

304 AA e 915 nucleotidi

il segnale di targeting si trova tra gli amminoacidi 302 e 304 e la sequenza è SRL 

 

Ruffo Federica 

Leo Mariachiara 

 

CHRISTIAN MILANI
studente
Re: Esercizio banchedatiRispondi
Replay #2 - 16/10/2007 13:16Invia email

Esercizio svolto da Milani Christian e Delfante Jessica.

 

SERGIO GIANNOTTI
studente
Re: Esercizio banchedatiRispondi
Replay #3 - 16/10/2007 13:17Invia email

1)catalizza l'ossidazione dell'acido ureico

2)babuino

3) 304 aa ;  915 nucleotidi

4) posizione targeting 302-304 nella proteina  ; sequenza di amminoacidi SRL: SerArgLue

 

 Sergio Giannotti

Immacolata Giordano

Raffaele Tummolo 

 

SERENA HAJI MOHAMED
studente
Re: Esercizio banchedatiRispondi
Replay #3 - 16/10/2007 13:18Invia email

CATALYZES THE OXIDATION OF URIC ACID TO 5-HIDROXYISOURATE WHICH SPONTANEOUSLY DECOMPOSED TO FORM ALLANTOIN

 

NOME SCIENTIFICO: EC 1.7.3.3 URATE OXIDASE

NOME COMUNE : URICASE

LUNGHEZZA AMMINOACIDI: 304

LUNGHEZZA NUCLEOTIDI: 304 PER 3=942 SENZA IL CODONE DI STOP. CON IL CODONE DI STOP 945

TARGETING: posizione proteina 302 304 sequenza aa :SRL

SERENA HAJI

MARTINA SPERINDè

ANITA MANFREDI 

 

 

GIULIA GAIBAZZI
studente
Re: Esercizio banchedatiRispondi
Replay #3 - 16/10/2007 13:19Invia email

Uricase
Synonyms EC 1.7.3.3
Urate oxidase
Gene name
 Name: UOX
From
Papio hamadryas (Hamadryas baboon) [TaxID: 9557] 
Taxonomy Eukaryota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi; Mammalia; Eutheria; Euarchontoglires; Primates; Haplorrhini; Catarrhini; Cercopithecidae; Cercopithecinae; Papio.
Protein existence 2: Evidence at transcript level;

Length: 304 AA ,posizione 302 304

sequenza slr

 

Vasini enea e gIULIA gaibazzi 

 

ALEXIA SALOMONI
studente
Re: Esercizio banchedatiRispondi
Replay #3 - 16/10/2007 13:20Invia email

1 Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate which spontaneously decompose to form allantoin.
Urate + O2 + H2O = 5-hydroxyisourate + H2O2.
Peroxisome.
Belongs to the uricase family.     
2 Papio hamadryas (Hamadryas baboon)  BABBUINO  
3 304AA 915NT
4 SRL DA 302 A 304

 

ANNA RITA LIUZZI
studente
Re: Esercizio banchedatiRispondi
Replay #3 - 16/10/2007 13:22Invia email

1)FUNCTION: Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate which spontaneously decompose to form allantoin.
CATALYTIC ACTIVITY: Urate + O2 + H2O = 5-hydroxyisourate + H2O2.
SUBCELLULAR LOCATION: Peroxisome.
SIMILARITY: Belongs to the uricase family.
 
2)Uricase
Synonyms EC 1.7.3.3

Gene name  Name:  UOX
 
From Papio hamadryas babuino (Hamadryas baboon)  [TaxID: 9557]  
 
Taxonomy Eukaryota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi; Mammalia; Eutheria; Euarchontoglires; Primates; Haplorrhini; Catarrhini; Cercopithecidae; Cercopithecinae; Papio. 
 
3)  lunghezza 303 aa.918 nucleotidi
4) 302 304 nella proteina , srl 1-301 amminoacidi

 

MONICA CAMPANINI
studente
Re: Esercizio banchedatiRispondi
Replay #4 - 16/10/2007 13:24Invia email

catalyzes the oxydation of uric acid to 5hydroxysourate

localizzata nei perossisomi

Papio Hamadryas ( Hamadryas Baboon) Babuino

 304 aa 909 nucleotidi

Il segnale targeting è la sequenza srl localizzata fra 302 304

la proteina deve andare nel nucleo

 

Michela Remistani Gaia Viola Monica Campanini 

 

VALENTINA MARCHICA
studente
Re: Esercizio banchedatiRispondi
Replay #4 - 16/10/2007 13:25Invia email

Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate which spontaneously decompose to form allantoin.

catalizza l'ossidazione dell'acido urico.

papio hamadryas(hamadryas baboon) o meglio conosciuto come amadriade (babbuino)

304 aa

915 nucleotidi con codone di stop

da 302 a 304 ser arg leu
 marchica valentina
oliviero anna
tatavitto sara

 

Mariagrazia Pia Cataldi
studente
Re: Esercizio banchedatiRispondi
Replay #5 - 23/10/2007 11:02Invia email

Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate which spontaneously decompose to form allantoin

Papio hamadryas (hamadryas baboon) TAXD:9557

Lunghezza in aminoacidi:340aa

Lunghezza sequenza codificante:1023

SRL da 302 a 30 

Cataldi Mariagrazia e Cataldi Valentina

 

MARIA FRATACCI
studente
Re: Esercizio banchedatiRispondi
Replay #6 - 16/01/2009 21:35Invia email

 1 la proteina è l'uricasi e catalizza l'ossidazione dell'acido urico in 5-idrossiurato,che si decompone spontaneamente in allantoina.

2 si trova nell'organismo Papio Hamadryas( babbuino)

3 è lunga 304 aa, quindi 915 nucleotidi totali(contanto anche i codoni stop)

4 la sequenza di targeting si trova tra 302-304 aa

 

 

VANESSA CATALDI
studente
Re: Esercizio banchedatiRispondi
Replay #7 - 27/10/2009 13:03Invia email

 

1 Catalyzes the oxidation of uric acid to 5-hydroxyisourate, which spontaneously decomposes to form allantoin.

2 Name: UOX

nome scentifico:Papio hamadryas

nome comune:Hamadryas baboon

3  309 aminoacidi moltiplicato per 3

 

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