Fate una ricerca di omologia usando il database Refseq con il seguente peptide:
VEALYLVCGERGFFYTPKTRREAEDLQVGQVE
1) A quale tipo di proteina corrisponde questa sequenza? 2) Si trovano somiglianze significative nel cane? 3) Riportare le sequenze complete trovate in uomo e topo
Fate una ricerca di omologia usando il database Refseq con il seguente peptide:
VEALYLVCGERGFFYTPKTRREAEDLQVGQVE
1) A quale tipo di proteina corrisponde questa sequenza? 2) Si trovano somiglianze significative nel cane? 3) Riportare le sequenze complete trovate in uomo e topo
Fate una ricerca di omologia usando il database Refseq con il seguente peptide:
VEALYLVCGERGFFYTPKTRREAEDLQVGQVE
1) A quale tipo di proteina corrisponde questa sequenza? precursore insulina 2) Si trovano somiglianze significative nel cane? sì: canis = 1e-07 3) Riportare le sequenze complete trovate in uomo e topo
Fate una ricerca di omologia usando il database Refseq con il seguente peptide:
VEALYLVCGERGFFYTPKTRREAEDLQVGQVE
1) A quale tipo di proteina corrisponde questa sequenza? precursore insulina 2) Si trovano somiglianze significative nel cane? sì: canis = 1e-07 3) Riportare le sequenze complete trovate in uomo e topo
1) A quale tipo di proteina corrisponde questa sequenza? proinsulin precursor 2) Si trovano somiglianze significative nel cane? Sì, si trovano somiglianze significative nel cane, e= 1e-07 3) Riportare le sequenze complete trovate in uomo e topo >gi|4557671|ref|NP_000198.1| proinsulin precursor [Homo sapiens] MALWMRLLPLLALLALWGPDPAAAFVNQHLCGSHLVEALYLVCGERGFFYTPKTRREAEDLQVGQVELGG GPGAGSLQPLALEGSLQKRGIVEQCCTSICSLYQLENYCN
>gi|117606345|ref|NP_032412.3| insulin I precursor [Mus musculus] MALLVHFLPLLALLALWEPKPTQAFVKQHLCGPHLVEALYLVCGERGFFYTPKSRREVEDPQVEQLELGG SPGDLQTLALEVARQKRGIVDQCCTSICSLYQLENYCN
1) A quale tipo di proteina corrisponde questa sequenza? proinsulin precursor 2) Si trovano somiglianze significative nel cane? sì,con significatività di 1e-07
3) Riportare le sequenze complete trovate in uomo e topo UOMO
Fate una ricerca di omologia usando il database Refseq con il seguente peptide:
VEALYLVCGERGFFYTPKTRREAEDLQVGQVE
1) A quale tipo di proteina corrisponde questa sequenza? proinsulin precursor è UN PRECURSORE DELL'INSULINA
2) Si trovano somiglianze significative nel cane? Canis lupus familiaris con significatività di 1e-07
3) Riportare le sequenze complete trovate in uomo e topo Mus Musculus >gi|117606345|ref|NP_032412.3| insulin I precursor [Mus musculus] MALLVHFLPLLALLALWEPKPTQAFVKQHLCGPHLVEALYLVCGERGFFYTPKSRREVEDPQVEQLELGG SPGDLQTLALEVARQKRGIVDQCCTSICSLYQLENYCN
Homo sapiens >gi|4557671|ref|NP_000198.1| proinsulin precursor [Homo sapiens] MALWMRLLPLLALLALWGPDPAAAFVNQHLCGSHLVEALYLVCGERGFFYTPKTRREAEDLQVGQVELGG GPGAGSLQPLALEGSLQKRGIVEQCCTSICSLYQLENYCN
La sequenza peptidica corrisponde ad un precursore dell'insulina.
Esiste una sequenza omologa in canis con una significatività di 1e-7
La sequenza omologa in Mus musculus è
>gi|117606345|ref|NP_032412.3| insulin I precursor [Mus musculus] MALLVHFLPLLALLALWEPKPTQAFVKQHLCGPHLVEALYLVCGERGFFYTPKSRREVEDPQVEQLELGG SPGDLQTLALEVARQKRGIVDQCCTSICSLYQLENYCN
la sequenza omologa in Homo sapiens >gi|4557671|ref|NP_000198.1| proinsulin precursor [Homo sapiens] MALWMRLLPLLALLALWGPDPAAAFVNQHLCGSHLVEALYLVCGERGFFYTPKTRREAEDLQVGQVELGG GPGAGSLQPLALEGSLQKRGIVEQCCTSICSLYQLENYCN
1)la sequenza peptidica corrisponde ad un precursore della proinsulina
2) esiste una somiglianza significativa con il cane con un Expect = 1e-07, 3) >gi|4557671|ref|NP_000198.1| proinsulin precursor [Homo sapiens] MALWMRLLPLLALLALWGPDPAAAFVNQHLCGSHLVEALYLVCGERGFFYTPKTRREAEDLQVGQVELGG GPGAGSLQPLALEGSLQKRGIVEQCCTSICSLYQLENYCN
>gi|117606345|ref|NP_032412.3| insulin I precursor [Mus musculus] MALLVHFLPLLALLALWEPKPTQAFVKQHLCGPHLVEALYLVCGERGFFYTPKSRREVEDPQVEQLELGG SPGDLQTLALEVARQKRGIVDQCCTSICSLYQLENYCN
Fate una ricerca di omologia usando il database Refseq con il seguente peptide:
VEALYLVCGERGFFYTPKTRREAEDLQVGQVE
1) A quale tipo di proteina corrisponde questa sequenza? 2) Si trovano somiglianze significative nel cane? 3) Riportare le sequenze complete trovate in uomo e topo
1)Proinsulin precursor-precursore dell'insulina;
2)si,1e-07;
3)
>gi|117606345|ref|NP_032412.3| insulin I precursor [Mus musculus] MALLVHFLPLLALLALWEPKPTQAFVKQHLCGPHLVEALYLVCGERGFFYTPKSRREVEDPQVEQLELGG SPGDLQTLALEVARQKRGIVDQCCTSICSLYQLENYCN
>gi|117606345|ref|NP_032412.3| insulin I precursor [Mus musculus] MALLVHFLPLLALLALWEPKPTQAFVKQHLCGPHLVEALYLVCGERGFFYTPKSRREVEDPQVEQLELGG SPGDLQTLALEVARQKRGIVDQCCTSICSLYQLENYCN lezzi ludovica e simone landi
Fate una ricerca di omologia usando il database Refseq con il seguente peptide:
VEALYLVCGERGFFYTPKTRREAEDLQVGQVE
1) A quale tipo di proteina corrisponde questa sequenza? 2) Si trovano somiglianze significative nel cane? 3) Riportare le sequenze complete trovate in uomo e topo
Fate una ricerca di omologia usando il database Refseq con il seguente peptide:
VEALYLVCGERGFFYTPKTRREAEDLQVGQVE
1) A quale tipo di proteina corrisponde questa sequenza? 2) Si trovano somiglianze significative nel cane? 3) Riportare le sequenze complete trovate in uomo e topo
1) corrisponde al precursore dell'insulina 2) si la sigificatività è di 1e-7 3) >gi|117606345|ref|NP_032412.3| insulin I precursor [Mus musculus] MALLVHFLPLLALLALWEPKPTQAFVKQHLCGPHLVEALYLVCGERGFFYTPKSRREVEDPQVEQLELGG SPGDLQTLALEVARQKRGIVDQCCTSICSLYQLENYCN
