| Autore | Intervento |
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 Prof. Riccardo Percudani
docente |
Fare una ricerca di omologia nella banca dati di proteine usando la transtiretina di pecora (NP_001009800).
1) quante sono le sequenze con somiglianza significativa (E<10-5)?
2) quale è la percentuale di identità e di somiglianza con la sequenza più significativa di uomo?
3) Sono presenti sequenze omologhe nei batteri?
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CECILIA NOLLI
studente |
Fare una ricerca di omologia nella banca dati di proteine usando la transtiretina di pecora (NP_001009800).
1) quante sono le sequenze con somiglianza significativa (E<10-5)? 240 seq.
2) quale è la percentuale di identità e di somiglianza con la sequenza più significativa di uomo? 85%, 93%
3) Sono presenti sequenze omologhe nei batteri? sì
Alessandra Biondi
Gloria Spagnoli
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DAVIDE SARRA
studente |
Fare una ricerca di omologia nella banca dati di proteine usando la transtiretina di pecora (NP_001009800).
1) quante sono le sequenze con somiglianza significativa (E<10-5)? 240
2) quale è la percentuale di identità e di somiglianza con la sequenza più significativa di uomo? identità=85% somiglianza= 93%
3) Sono presenti sequenze omologhe nei batteri? sì (per esempio Escherichia coli B171 ha un valore di 1e-06)
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MARIA PIZZIMENTI
studente |
1) quante sono le sequenze con somiglianza significativa (E<10-5)?240
2) quale è la percentuale di identità e di somiglianza con la sequenza più significativa di uomo? 93%
3) Sono presenti sequenze omologhe nei batteri?si
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ALESSANDRA MUSIARI
studente |
1) quante sono le sequenze con somiglianza significativa (E<10-5)? 240
2) quale è la percentuale di identità e di somiglianza con la sequenza più significativa di uomo? identita 85% somiglianza 93%
Sono presenti sequenze omologhe nei batteri? si per esempio in E Coli con E 7e-11
Laura Maltraversi
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BRUNELLA VENEZIA
studente |
Prima domanda: 240 seq.
Seconda domanda: identità 85%,somiglianza 93%
Terza domanda: SI
GRAZIA NARDELLA
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ESTER OLIVA
studente |
1) 240
2) Identities = 126/147 (85%) - Positives = 138/147 (93%)
3) sì per esempio: Escherichia coli: 7e-11
Arianna Molinari - Oliva Ester
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GIADA MONICA
studente |
1) quante sono le sequenze con somiglianza significativa (E<10-5)?
2) quale è la percentuale di identità e di somiglianza con la sequenza più significativa di uomo?
3) Sono presenti sequenze omologhe nei batteri?
1)240;
2)identità 85%,somiglianza 93%
3)si ad esempio in Escherichia Coli ha un valore di 1e-06
Monica Giada
Aliani Chiara
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ANNALISA SISTO
studente |
1) quante sono le sequenze con somiglianza significativa (E<10-5)? 240
2) quale è la percentuale di identità e di somiglianza con la sequenza più significativa di uomo? La percentuale di identità è dell' 85% e quella somiglianza del 93%
3) Sono presenti sequenze omologhe nei batteri? Si ad esempio escherichia coli ha una significatività del valore di 7e-11.
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STEFANO BRANCA
studente |
1) quante sono le sequenze con somiglianza significativa (E<10-5)?
le proteine con somiglianza significativa sono 240.
2) quale è la percentuale di identità e di somiglianza con la sequenza più significativa di uomo?
la percentuale è 93%.
3) Sono presenti sequenze omologhe nei batteri?
si, sono presenti.
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SHARON FABIOLA SCOLARI
studente |
Fare una ricerca di omologia nella banca dati di proteine usando la transtiretina di pecora (NP_001009800).
1) quante sono le sequenze con somiglianza significativa (E<10-5)?
2) quale è la percentuale di identità e di somiglianza con la sequenza più significativa di uomo?
3) Sono presenti sequenze omologhe nei batteri?
1) 240
2) precursore della transtiretina
Identità = 126/147 (85%), Somiglianza = 138/147 (93%)
3) sì (gamma proteobacterium - 5e-13)
Stracci Fabio
Sharon Fabiola Scolari
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ALESSANDRO PINELLI
studente |
3) Sì,
ref|ZP_03086232.1| hydroxyisourate hydrolase [Escherichia ... 70 7e-11
1) 240 seq.
2) 85% - 93%
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MARIA CARLA TERESI
studente |
1) quante sono le sequenze con somiglianza significativa (E<10-5)? 240
2) quale è la percentuale di identità e di somiglianza con la sequenza più significativa di uomo? 85% identità 93% somiglianza
3) Sono presenti sequenze omologhe nei batteri? si Escherichia coli E=10-7
Alice Zuccoli
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ILARIA AZZINI
studente |
1) quante sono le sequenze con somiglianza significativa (E<10-5)? 240
2) quale è la percentuale di identità e di somiglianza con la
sequenza più significativa di uomo? La percentuale di identità è dell'
85% e quella somiglianza del 93%
3) Sono presenti sequenze omologhe nei batteri? Si ad esempio escherichia coli ha una significatività del valore di 7e-11.
azzini ilaria
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MATTIA AGOSTI
studente |
Fare una ricerca di omologia nella banca dati di proteine usando la transtiretina di pecora (NP_001009800).
1) quante sono le sequenze con somiglianza significativa (E<10-5)?
Le sequenze sono 240;
2) quale è la percentuale di identità e di somiglianza con la sequenza più significativa di uomo?
La percentuale d'identità è 85%; la percentuale di somiglianza è 93%;
3) Sono presenti sequenze omologhe nei batteri?
Sì.
Agosti Mattia; Fabio Pezzoni.
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EGLANTINA CELISLAMI
studente |
Fare una ricerca di omologia nella banca dati di proteine usando la transtiretina di pecora (NP_001009800).
1) quante sono le sequenze con somiglianza significativa (E<10-5)?
sono 240
2) quale è la percentuale di identità e di somiglianza con la sequenza più significativa di uomo?
85%
3) Sono presenti sequenze omologhe nei batteri?
si sono presenti
GENE ID: 8256495 FIC_01071 | Transthyretin-like periplasmic protein
[Flavobacteriaceae bacterium 3519-10]
Score = 43.1 bits (100), Expect = 0.008, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 29/103 (28%), Positives = 46/103 (44%), Gaps = 4/103 (3%)
Lucia Isetti
eglantina celislami
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ELISA RATTOTTI
studente |
Fare una ricerca di omologia nella banca dati di proteine usando la transtiretina di pecora (NP_001009800).
1) quante sono le sequenze con somiglianza significativa (E<10-5)?
2) quale è la percentuale di identità e di somiglianza con la sequenza più significativa di uomo?
3) Sono presenti sequenze omologhe nei batteri?
1_ Le sequenze con somiglianza significativa sono 240
2_ Identità: 126/147 (85%), somiglianza: 138/147 (93%)
3_ Sì, ad esempio in Escherichia coli
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VANESSA CATALDI
studente |
1 sono 240
2 d identita sono 85% mentre di somiglianza 93%
3 si con e. coli
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CLAUDIA ROMANELLI
studente |
1) quante sono le sequenze con somiglianza significativa (E<10-5)? Sono 240
2) quale è la percentuale di identità e di somiglianza con la sequenza più significativa di uomo? identità=85% somiglianza=93%
3) Sono presenti sequenze omologhe nei batteri? sì per esempio Escherichia Coli B171 che ha un valore di 1e-06
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SILVIA REVERBERI
studente |
Serena Rabaglia
Fare una ricerca di omologia nella banca dati di proteine usando la transtiretina di pecora (NP_001009800).
1) quante sono le sequenze con somiglianza significativa (E<10-5)? Le sequenze sono 240
2) quale è la percentuale di identità e di somiglianza con la sequenza più significativa di uomo? La percentuale di identità è 85%. Quella di somiglianza è 93%.
3) Sono presenti sequenze omologhe nei batteri?
Si, ad esempio abbiamo trovato Escherichia Coli
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YLENIA AURA MINAFO'
studente |
1)240
2)identità=85%;somiglianza=93%
3)si sono presenti
Ylenia Aura Minafò;Angela Sansone
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FABIO PERINI
studente |
1) 288
2) 93%
3) Sì
Fabio Perini & Elisa Ambroggi & Beatrice Dosi
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SILVIA GUGLIERI
studente |
Fare una ricerca di omologia nella banca dati di proteine usando la transtiretina di pecora (NP_001009800).
1) quante sono le sequenze con somiglianza significativa (E<10-5)?
2) quale è la percentuale di identità e di somiglianza con la sequenza più significativa di uomo?
3) Sono presenti sequenze omologhe nei batteri?
1_ Le sequenze con somiglianza significativa sono 240
2_ Identità: 126/147 (85%), somiglianza: 138/147 (93%)
3_ Sì, ad esempio in Escherichia coli
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ORSOLA LETIZIA PALADINO
studente |
1) quante sono le sequenze con somiglianza significativa (E<10-5)?
240
2) quale è la percentuale di identità e di somiglianza con la sequenza più significativa di uomo?
Identità = 125/147 (85%), somiglianza = 138/147 (93%)
3) Sono presenti sequenze omologhe nei batteri?
per esempio Escherichia coli che ha un valore di significatività di 2e-07
Volpe angela e Paladino Orsola Letizia
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LAURA RAFFELINI
studente |
Fare una ricerca di omologia nella banca dati di proteine usando la transtiretina di pecora (NP_001009800).
1) quante sono le sequenze con somiglianza significativa (E<10-5)? 240 sequenze
2) quale è la percentuale di identità e di somiglianza con la sequenza più significativa di uomo? identità 85%, 93%
3) Sono presenti sequenze omologhe nei batteri? si ( per esempio Escheria Coli)
la
LAURA RAFFELINI, SCARDINA FRANCESCA PAOLA
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ALESSIO SARDELLA
studente |
Fare una ricerca di omologia nella banca dati di proteine usando la transtiretina di pecora (NP_001009800).
1) quante sono le sequenze con somiglianza significativa (E<10-5)? sono 240 con 10-5 escluso
2) quale è la percentuale di identità e di somiglianza con la sequenza più significativa di uomo?
Identities = 126/147 (85%)
Positives = 138/147 (93%)
3) Sono presenti sequenze omologhe nei batteri?
si, il primo batterio ha :
Identities = 41/108 (37%), Positives = 62/108 (57%)
alessio sardella
elisa taccia
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LUCA STRAGLIATI
studente |
Fare una ricerca di omologia nella banca dati di proteine usando la transtiretina di pecora (NP_001009800).
1) quante sono le sequenze con somiglianza significativa (E<10-5)?
240
2) quale è la percentuale di identità e di somiglianza con la sequenza più significativa di uomo?
identità nucleotidica 84%
Identità AA = 126/147 (85%), Positives = 138/147 (93%)
3) Sono presenti sequenze omologhe nei batteri?
Sinorhizobium meliloti 1021
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Elena Paini
studente |
1) quante sono le sequenze con somiglianza significativa (E<10-5)? 240
2) quale è la percentuale di identità e di somiglianza con la sequenza più significativa di uomo? identità85% somiglianza 93%
3) Sono presenti sequenze omologhe nei batteri? sì
Elena Paini
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ALICE SALVIATI
studente |
1) quante sono le sequenze con somiglianza significativa (E<10-5)?
Le sequenze omologhe sono 242.
2) quale è la percentuale di identità e di somiglianza con la sequenza più significativa di uomo?
Identities = 126/147 (85%), Positives = 138/147 (93%) per transthyretin precursor di Homo sapiens.
3) Sono presenti sequenze omologhe nei batteri?
Sì, per esempio Escherichia coli e Mycobacterium marinum.
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