| Autore | Intervento |
|---|
 Prof. Riccardo Percudani
docente |
>HBB_HUMAN - Homo sapiens
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKV
KAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGK
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>HBA_GORGO - Gorilla gorilla
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AHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKY
R
>HBB_MACRU Macropus rufus (Red kangaroo)
VHLTAEEKNAITSLWGKVAIEQTGGEALGRLLIVYPWTSRFFDHFGDLSNAKAVMGNPKV
LAHGAKVLVAFGDAIKNLDNLKGTFAKLSELHCDKLHVDPENFKLLGNIIVICLAEHFGK
EFTIDTQVAWQKLVAGVANALAHKYH
>HBB_BALAC Hemoglobin subunit beta (Hemoglobin beta chain) (Beta-globin)
VHLTAEEKSAVTALWAKVNVEEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFEAFGDLSTADAVMKNPKVKAHGKKVLAS
FSDGLKHLDDLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVIVLARHFGKEFTPELQAAYQKVVAGVANA
LAHKYH
>HBB_PIG Hemoglobin subunit beta (Hemoglobin beta chain) (Beta-globin)
MVHLSAEEKEAVLGLWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSNADAVMGNPKVKAHGKKVLQ
SFSDGLKHLDNLKGTFAKLSELHCDQLHVDPENFRLLGNVIVVVLARRLGHDFNPNVQAAFQKVVAGVAN
ALAHKYH
1) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e gorilla?
2) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e maiale?
3) Ritenete che le sequenze siano ortologhe o paraloghe?
4) Quale sequenza poterbbe essere usata come outgroup?
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LUCA STRAGLIATI
studente |
>HBB_HUMAN - Homo sapiens
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKV
KAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGK
EFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
>HBA_GORGO - Gorilla gorilla
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGDYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAV
AHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKY
R
>HBB_MACRU Macropus rufus (Red kangaroo)
VHLTAEEKNAITSLWGKVAIEQTGGEALGRLLIVYPWTSRFFDHFGDLSNAKAVMGNPKV
LAHGAKVLVAFGDAIKNLDNLKGTFAKLSELHCDKLHVDPENFKLLGNIIVICLAEHFGK
EFTIDTQVAWQKLVAGVANALAHKYH
>HBB_BALAC Hemoglobin subunit beta (Hemoglobin beta chain) (Beta-globin)
VHLTAEEKSAVTALWAKVNVEEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFEAFGDLSTADAVMKNPKVKAHGKKVLAS
FSDGLKHLDDLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVIVLARHFGKEFTPELQAAYQKVVAGVANA
LAHKYH
>HBB_PIG Hemoglobin subunit beta (Hemoglobin beta chain) (Beta-globin)
MVHLSAEEKEAVLGLWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSNADAVMGNPKVKAHGKKVLQ
SFSDGLKHLDNLKGTFAKLSELHCDQLHVDPENFRLLGNVIVVVLARRLGHDFNPNVQAAFQKVVAGVAN
ALAHKYH
1) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e gorilla?
distanza tra HBA GORGO e HBB HUMAN è di 100 PAM
2) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e maiale?
distanza tra HBB HUMAN e HBB PIG è di 20 PAM
3) Ritenete che le sequenze siano ortologhe o paraloghe?
tra le HBB esiste una probabile relazione di ortologia.
fra la HBA e le HBB esiste una probabile relazione di paralogia.
4) Quale sequenza poterbbe essere usata come outgroup?
HBA GORGO
Luca Stragliati
Adriana Vitiello
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ALESSIO SARDELLA
studente |
1) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e gorilla?
90-100
2) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e maiale?
15-20
3) Ritenete che le sequenze siano ortologhe o paraloghe?
-le sequenze HBB sono tra loro ortologhe perchè
le loro differenze sono dovute a speciazione
-le sequenze HBB con HBA di gorilla son paraloghe
perchè le loro differenze sono dovute
ad un evento di duplicazione
4) Quale sequenza poterbbe essere usata come outgroup?
HBA di gorilla
Sardella Alessio
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EMILIO PERFETTO
studente |
1) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e gorilla?
2) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e maiale?
3) Ritenete che le sequenze siano ortologhe o paraloghe?
4) Quale sequenza poterbbe essere usata come outgroup?
1) 10 pam
2) 2 pam
3) le sequenze HBBHOMO E HBAGORGO SONO PARALOGHE IN QUANTO CI SONO DELLE DIFFERENZE RILEVANTI. LA SEQUENZA HBBHOMO E QUELLA HBBPIG SONO ORTOLOGHE
4) HBA GORGO PUO' ESSERE USATO COME OUTGROUP, è INTUIBILE DAL GRAFICO IN QUANTO LA DISTANZA E' RILEVANTE.
EMILIO PERFETTO
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ALICE SALVIATI
studente |
1) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e gorilla?
Circa 95.
2) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e maiale?
Circa 18.
3) Ritenete che le sequenze siano ortologhe o paraloghe?
HBA e HBB sono paraloghe, mentre le HBB tra di loro sono ortologhe.
4) Quale sequenza potrebbe essere usata come outgroup?
HBA GORGO.
Alice Salviati
Ilaria Tagliani
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GLORIA SPAGNOLI
studente |
1) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e gorilla?
100 PAM
2) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e maiale?
20 PAM
3) Ritenete che le sequenze siano ortologhe o paraloghe?
HBA GORGO E HBB HUMAN sono paraloghe
4) Quale sequenza poterbbe essere usata come outgroup?
HBA GORGO
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CECILIA NOLLI
studente |
1) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e gorilla? 100 PAM
2) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e maiale? 20 PAM
3) Ritenete che le sequenze siano ortologhe o paraloghe? HBA_gorgo-HBB_human sono paraloghe
4) Quale sequenza poterbbe essere usata come outgroup? HBA_GORGO
Chiara Coruzzi
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LAURA MALTRAVERSI
studente |
1) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e gorilla?100 pam
2) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e maiale?20 pam
3) Ritenete che le sequenze siano ortologhe o paraloghe? HBA gorilla e HBB uomo sono paraloghe.
4) Quale sequenza poterbbe essere usata come outgroup? HBA di gorilla
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ELISA MILIOTO
studente |
1) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e gorilla?
2) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e maiale?
3) Ritenete che le sequenze siano ortologhe o paraloghe?
4) Quale sequenza poterbbe essere usata come outgroup?
1)100
2)15
3)le sequenze homo e gorilla sono paraloghe
4)HBA homo
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MONIKA BACO
studente |
1) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e gorilla?
2) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e maiale?
3) Ritenete che le sequenze siano ortologhe o paraloghe?
4) Quale sequenza poterbbe essere usata come outgroup?
1)100
2)20
3)hbb human e hba gorgo sono paraloghe,le altre ortologhe
4)hba gorgo
baco monika/isufi elda
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SILVIA REVERBERI
studente |
Serena Rabaglia
La distanza è 90
La distanza è 20
La sequenza di gorilla è paraloga mentre le altre sembrerebbero ortologhe
La sequenza da usare come outgroup è quella di HBA_GORGO
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MARTINA GALLI
studente |
1) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e gorilla?
2) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e maiale?
3) Ritenete che le sequenze siano ortologhe o paraloghe?
4) Quale sequenza poterbbe essere usata come outgroup?
1) la distanza è 100 pam
2) la distanza è 20 pam
3) le sequenze uomo gorilla sono paraloghe
4) HBA gorgo in quanto è la più distante.
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SHARON FABIOLA SCOLARI
studente |
1) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e gorilla?
2) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e maiale?
3) Ritenete che le sequenze siano ortologhe o paraloghe?
4) Quale sequenza potrebbe essere usata come outgroup?
1) distanza uomo-gorilla in PAM 95%
2) distanza uomo-maiale in PAM 17%
3)HBB ed HBA sono paraloghe, mentre tra HBB sono ortologhe
4) HBA Gorgo
Scolari Sharon Fabiola
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ALICE ZUCCOLI
studente |
1) la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e gorilla è 10*0.1*100=100
2) la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e maiale è 2*0.1*100=20
3) le sequenze sonodi uomo e gorilla sono paraloghe. tutte le beta sono ortologhe
4) la sequenza che poterbbe essere usata come outgroup è quella di HBA GORGO perchè è l' unica alfa, e si nota una divergenza evidente
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ORSOLA LETIZIA PALADINO
studente |
1) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e gorilla?
0.1x10=1 per sito,
1x100=100 pam
2) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e maiale?
0.1x2=0.2 per sito
0.2x100=20 pam
3) Ritenete che le sequenze siano ortologhe o paraloghe?
la sequenza hba gorgo è una sequenza paraloga in quanto risulta essere molto
lontana rispetto alle altre sequenze;mentre le altre sequenze sono
tutte ortologhe
4) Quale sequenza poterbbe essere usata come outgroup?
hba gorgo
paladino orsola letizia
angela volpe
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GIUSEPPE BALZANI
studente |
1) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e gorilla?
1) 100 pam
2) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e maiale?
2) 20 pam
3) Ritenete che le sequenze siano ortologhe o paraloghe?
3) hbbhomo-hbagorgo sono paraloghe in quanto sono troppo distanti
per essere ortologhe
4) Quale sequenza poterbbe essere usata come outgroup?
4) hba gorgo
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LAURA RAFFELINI
studente |
1) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e gorilla?
150 PAM
2) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e maiale?
30 PAM
3) Ritenete che le sequenze siano ortologhe o paraloghe?
Le sequenze HBB con HBA sono paraloghe. Le sequenze HBB sono ortologhe.
4) Quale sequenza poterbbe essere usata come outgroup?
HBA GORGO
Laura raffelini
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LUCIA ISETTI
studente |
1) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e gorilla?
Distanza PAM 100
2) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e maiale?
Distanza PAM 15
3) Ritenete che le sequenze siano ortologhe o paraloghe?
Tra le sequenze HBB e HBA sequenze paraloghe
Tra le sequenze HBB e HBB sequenze ortologhe
4) Quale sequenza poterbbe essere usata come outgroup?
La sequenza HBA Gorgo , appare filogeneticamente più distante dalle altre
Lucia Isetti
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EGLANTINA CELISLAMI
studente |
1) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e gorilla? in pam(in 100 siti)0,9x100= 90
2) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e maiale? 15
3) Ritenete che le sequenze siano ortologhe o paraloghe? le sequenze HBA sono paraloghe e HBB omologhe
4) Quale sequenza poterbbe essere usata come outgroup? HBA GORGO
eglantina celislami
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ANNALISA SISTO
studente |
1) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e gorilla?
2) Qual'è la distanza in PAM tra le sequenze di uomo e maiale?
3) Ritenete che le sequenze siano ortologhe o paraloghe?
4) Quale sequenza poterbbe essere usata come outgroup?
1)100 PAM
2)20 PAM
3)Le sequenza HBA_GORGO e HBB_HUMAN sono paraloghe perchè la distanza con le altre è notevole. Le sequenze HBB sono invece ortologhe perchè molto vicine tra loro.
4) La sequenza outgroup è l'HBA_GORGO perchè la distanza dalle altre sequenze è notevole.
Annalisa Sisto
Giulia Pescara
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